secventializarea singer vali

2
- una din primele metode de secvenţializare a fost descrisă în 1977 de Frederick Sanger care a primit cel de-al doilea p remiu Nobel pentru descoperirea sa Metoda enzimatica Sanger consta din replicarea ADN-ului monocatenar incepand de la un punct precis de initiere, replicarea fiind apoi intrerupta in functie de baza existenta in secventa de analizat de catre dideoxinucleotide. Metoda de secven iere Sange r: ț 1. un ablon si mp lu de AD N, ș . un primer ADN , !. en zi ma ADN po li me ra z" , #. deo xin ucl eoz ide tri fos fat e normale $dN %&' (. di- deo xin ucl eoz idetrifos fat e modifi cat e $ddN%&' : ddA, ddC, ddG, ddT) cele din urm" ter min)nd prematur elongarea irului AD N. ș ddN%&-urilor le lipsesc grupul *idroxil $+' de la cap"tul !, deci nu pot forma leg"tura necesar" dintre dou" nucleotide, ceea ce mpiedic" polimeraza ADN s" extind" ADN-ul. ddN%&-urile sunt etic*etate radioactiv sau fluorescent pentru a putea fi detectate automat de c"tre  ma ini le de secven ier e ș ț . Mostra ADN este mp"r it" n patru rea c ii separate, con in)nd f iecare toate cel e patru ț ț ț deoxinucleotide $dA%& , d/%&, d0%& i d%%&' i enzima ADN polimer az". n fiecar e ș ș dintre reac ii este ad"ugat" doar una dintre cele patru di-deoxinucleotide $ddA %& , ț dd/%&, dd0%&, sau dd%%&', n timp ce celelalte nucleotide sunt nemodificate. Di- deoxinucleotidele modificate sunt ad"ugate n exces, n cantit" i de aproximativ 122 de ț ori mai mari dec)t deoxinucleotidele normale. &e scurt, este nevoie de pat ru reac ii ț separate pentru a testa cele patru ddN%&. Dup" mai multe runde d e extensie a ablonului ADN, fragmentele rezultate de ADN sunt denaturate prin expunere la c"ldur" ș i sunt separate conform m"rimii prin procedura de ș  electroforez" pe gel . Metoda “Dye-terminator Secven ierea 3D4e-t erminat or5 utiliz eaz" etic*etarea lan ului terminal al ddN%&s, care ț ț permit e s ecven ierea ntr-o si ngur" reac ie. ț ț 6iecare lant terminal din cei patru este etic*etat cu coloranti fluorescenti, care emit lumin" la diferite lungimi de unda.

Upload: valentina-redinciuc

Post on 09-Mar-2016

214 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

secventiere

TRANSCRIPT

7/21/2019 SecventializaRea SINGER Vali

http://slidepdf.com/reader/full/secventializarea-singer-vali 1/2

- una din primele metode de secvenţializare a fost descrisă în 1977 de Frederick Sanger care a primit cel de-al doilea p remiu Nobel pentru descoperirea sa

Metoda enzimatica Sanger consta din replicarea ADN-ului monocatenar incepand de la un punct precis de initiere, replicarea fiind apoi intrerupta in functie de baza existenta insecventa de analizat de catre dideoxinucleotide.

Metoda de secven iere Sanger:ț

1. un ablon simplu de ADN,ș

. un primer ADN, !. enzima ADN polimeraz",#. deoxinucleozidetrifosfate normale $dN%&'(. di-deoxinucleozidetrifosfate modificate $ddN%&': ddA, ddC, ddG, ddT)

cele din urm" termin)nd prematur elongarea irului ADN.ș

ddN%&-urilor le lipsesc grupul *idroxil $+ ' de la cap"tul ! , deci nu pot forma leg"tura necesar" dintre dou" nucleotide, ceea ce mpiedic" polimeraza ADN s" extind" ADN-ul.

ddN%&-urile sunt etic*etate radioactiv sau fluorescent pentru a putea fi detectate automat de c"tre ma inile de secven iereș ț .

Mostra ADN este mp"r it" n patru reac ii separate, con in)nd fiecare toate cele patruț ț țdeoxinucleotide $dA%&, d/%&, d0%& i d%%&' i enzima ADN polimeraz". n fiecareș șdintre reac ii este ad"ugat" doar una dintre cele patru di-deoxinucleotide $ddA%&,țdd/%&, dd0%&, sau dd%%&', n timp ce celelalte nucleotide sunt nemodificate. Di-deoxinucleotidele modificate sunt ad"ugate n exces, n cantit" i de aproximativ 122 dețori mai mari dec)t deoxinucleotidele normale. &e scurt, este nevoie de patru reac iițseparate pentru a testa cele patru ddN%&. Dup" mai multe runde de extensie aablonului ADN, fragmentele rezultate de ADN sunt denaturate prin expunere la c"ldur"și sunt separate conform m"rimii prin procedura deș electroforez" pe gel.

Metoda “Dye-terminator”Secven ierea 3D4e-terminator5 utilizeaz" etic*etarea lan ului terminal al ddN%&s, careț ț

permite secven ierea ntr-o singur" reac ie.ț ț6iecare lant terminal din cei patru este etic*etat cu coloranti fluorescenti, care emitlumin" la diferite lungimi de unda.

7/21/2019 SecventializaRea SINGER Vali

http://slidepdf.com/reader/full/secventializarea-singer-vali 2/2

Fig. 12.2. Secvenţierea ADN prin metoda dideoxi (Singer)

1. Sanger 6, 0oulson A7 $1 mai 189('. A rapid met*od for determining se;uencesin DNA b4 primed s4nt*esis <it* DNA pol4merase5.J. Mol. Biol. 94 $!': ##1=>.

. a b Sanger 6, Nic?len S, 0oulson A7 $1 decembrie 1899'. DNA se;uencing <it*c*ain-terminating in*ibitors5.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74 $1 ': (#@!=9.