c1_metode de izolare

Upload: roman-mioara

Post on 03-Feb-2018

225 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    1/39

    Procedee chimice, microbiologicei toxicolo ice avansatede control i analiz

    . . . .

    [email protected]

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    2/39

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    3/39

    METODE MICROBIOLOGICE CLASICE VS. METODE RAPIDE

    I AUTOMATIZATE.

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    4/39

    IZOLAREA MICROORGANISMELOR N CULTURI

    Tehnicile de izolare presupun o serie de operatii:

    prelevare probe biologice din medii naturale

    inoculare in medii de cultura specifice

    studiul coloniilor izolate

    repicare pentru obtinerea culturilor pure

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    5/39

    Culturi pure de microorganismeCulturi pure de microorganisme

    Cultur: populaie de microorganisme

    cultivatn condi ii predefinite Culturpur culturalctuitdintr-un

    singur tip e microorganism

    Culturmixt culturformatdin maimu e un s ngur p e m croorgan sm

    zo are a m croorgan sme ordin culturi mixte

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    6/39

    Culturmixt Culturpur

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    7/39

    Culturmixt

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    8/39

    Cultura pura:

    Biomasa de celule rezultata rin re roducerea unei sin ure celuleaflata ntr-unmediu nutritiv sterilcuvolum limitat.

    O cultura ura contine celule a artinand unei sin ure s ecii

    respectiv unei singure tulpini.

    M t d l i

    etode clasice:

    I. Metode bazate pe separarea fizico chimica a celulelor

    II. Metode biologice

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    9/39

    I Procedee fizice de izolare

    1. Metode prin raspandire

    a. Metoda Koch specifica izolarii drojdiilor

    Recoltarea microorganismelor din mediinaturale

    Fixarea distantat a celulelor, prin

    raspandire, in mediu nutritiv

    Obtinerea coloniilor izolate prin

    mu p carea ce u e or

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    10/39

    a. Metoda Koch specifica izolarii drojdiilor

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    11/39

    b. Metode scarificate

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    12/39

    Tehnica striurilor

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    13/39

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    14/39

    c. Metoda Drigalski

    Metoda de raspandire

    in placi

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    15/39

    2. Metode de diluare

    tehnica dilutiilor decimale

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    16/39

    a Metoda Lindner

    Izolarea drojdiilor

    Metoda precisa Sub control microscopic

    Se realizeaza dilutii cores unzatoare

    Se plaseaz 9 picaturi pe o lamela sterila care se plaseaz cu picaturile in jospe o lama cu excavatie

    Se identific pictura care conine o singura celula

    Se absoarbe cu o hartie de filtru steril i se introduce ntr-o eprubeta cu

    mediu steril; termostatare; cultura pura

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    17/39

    a Metoda Naumov

    Izolarea culturilor pure de mucegai

    eto a spec c ;

    e reco teaz o cantitate re usa e su strat io ogic; se rea izeaza i utiicorespunzatoare

    Se plaseaz picaturi pe capacul interior al unei placi Petri; se adauga

    mediu fluidificat si temperat; se termostateaz;

    Se identific pictura de mediu care conine colonia dorit

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    18/39

    II Metode biologice

    a. Metoda Burri

    e separa m croorgan sme e n unc e e necesaru e ox genSe inoculeazmicroorganismele n mediu cu agar(fluidificat i temperat)Mediul se transfern tub dre t si se solidificn ozi ie vertical

    Medii recomandate: carne-ficat agar

    Tripticaz- glucoz-extract de drojdie

    Citirea rezultatelor

    MO aerobe la suprafata mediului drept

    MO facultativ aerobe pe toatnalimea tubului

    MO microaerofile- pe ultima 1/3 din nalimea tubului

    MO strict anaerobe pe 2/3 din inaltimea tubului

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    19/39

    b. Folosirea mediilor selective

    Favorizeaza dezvoltarea unui grup restrans

    de microorganisme ce apartinSubstane cu efect antifungic: (actidiona,

    aceleeasi speciinistatin), sau antibacterian ( polimixin,penicilin)

    Se pot utiliza o serie de substante

    chimice cu efect inhibitor fatde

    celelalte microorganisme

    Ex. pentru izolarea

    sterptomicetelor: medii cu amidon

    i licerol sursa de carbon i

    argininsau azotati (sursa de azot)

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    20/39

    MediMediii dede culturcultur selectivselectivee

    Staphylococcus aureus

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    21/39

    MediMediii dede culturcultur selectivselectiveePrezenta/Absenta E.coli si coliformilor inprobe de 100mL apa

    AquaCHROM ECC

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    22/39

    MediMediii dede culturcultur pentrupentru diferentiereadiferentierea tulpinilortulpinilor

    ChromA ar

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    23/39

    MediMediii dede culturcultur selectivselective si diferentialee si diferentiale

    EMB - Eosin meth lene blue a ar

    Coloranti- eozina si albastru de metil, ce inhiba dezvoltarea

    bacteriilor G(+)

    La tulpinile care pot fermenta lactoza se observo

    modificare a culorii coloniilor

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    24/39

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    25/39

    Verificarea purittii culturilor izolate

    Studiul caracterelor macroscopice

    Studiul caracterelor microscopice

    Probleme la aplicarea tehnicii striurilor

    Neomo enizarea e rubetei cu biomasa inainte de recoltare nu este

    prelevata biomasa

    Utilizarea ansei neracite la prelevarea biomasei sunt omorate

    microorganisme e

    Nesterilizarea ansei intre etapele de efectuare a striilor nu se vor forma

    colonii

    Efectuarea unui numar mic de striuri nu se vor forma colonii

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    26/39

    Probleme de izolare manual

    Contaminarea placiiprin scoaterea completa a capacului, apropierea fetei

    e p aca pentru a ve ea cum au ost rea izate striuri e

    coloniicontaminarea culturii

    Tehnica de recoltare deficitara din partea operatorului contaminarea

    culturii

    Expunerea biomasei la mediul inconjurator contaminarea culturii

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    27/39

    PrelevatorPrelevator dede coloniicolonii Colony PickierColony Pickier

    PMPM--1s1s MicrotecMicrotec Sistem de banc compact

    s em comp e au oma za eprelevare a coloniilor

    Sistem automat de schimbare a acului(ANCS)

    de pixeli)

    Sistem automat de trasabilitate pentrucolonii (transfer in format Excel)

    Transfer automat de colonii lipsit decontaminare

    Imbunatateste eficienta in laborator

    Reduce cheltuielile de munca pentrusarcini de rutina si stress-ul de efectuare aunei munci repetitive

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    28/39

    SetariSetari inin programulprogramul dede prelevareprelevare aa

    coloniilorcoloniilor

    Numar de godeuri

    utilizate (96, 384) Numar de oscilatii ale

    acului

    Conditii de prelevare

    Stabilirea pozitiei de

    start si a godeurilorcu pro e oar e(blank wells)

    Parametrii desterilizare a acului

    Adancimea depatrundere a acului

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    29/39

    Sistem de schimbare automata a aculuiSistem de schimbare automata a acului

    - periere

    - c at re cu etano

    - incalzire la 400C

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    30/39

    SistemulSistemul PickoloPickolo dede prelevareprelevare

    . -

    http://www.youtube.com/watch?v=iK65vJyvmJc2. Robot Bacteria Colony Picking

    http://www.youtube.com/watch?v=WJ-qVBjVDB8

    .

    http://www.youtube.com/watch?v=udx6eQKdJHk&feature=related

    4. SciRobotics Pickolo: Colony-picker for Tecan robots by Robiotec Ltd.http://www.youtube.com/watch?v=oI5ws2xP6ig&feature=related

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    31/39

    Se ia in considerare:

    -forma coloniilor,- marimea coloniilor

    - distanta dintre colonii

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    32/39

    SistemulSistemul PickoloPickolo de prelevare automata ade prelevare automata a

    coloniilorcoloniilor -- Analiza imaginiiAnaliza imaginii

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    33/39

    Tehnici indirecte de evaluare a numarului de microorganisme

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    34/39

    Numararea cu citometre

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    35/39

    Metode directe de numarare a bacteriilor

    Se calculeaza :

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    36/39

    Diluare/numarare prin intermediul inoculatorului spiralDiluare/numarare prin intermediul inoculatorului spiral

    Inoculator Spiral

    (Interscience)

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    37/39

    DiluareDiluare clasicaclasica vs.vs. diluarediluare automataautomata

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    38/39

  • 7/21/2019 C1_Metode de Izolare

    39/39

    NumarareaNumararea microorganismelormicroorganismelor cucu inoculatorulinoculatorul spiralspiral

    Aplicatiregula lui 20.

    Numarati coloniile din sectoare situate diametral

    opuspentru a minimiza erorile de numarare.

    Calculati numarul de microorganisme cuformula:

    VCCN :)21( +=