trminanȚi izii ai ativitĂȚii pptilor itotoxi În sistm · caracteristici generale ale peptidelor...
TRANSCRIPT
DETERMINANȚI FIZICI AI
ACTIVITĂȚII PEPTIDELOR
CITOTOXICE ÎN SISTEME
LIPIDICE RECONSTITUITE
Coordonator, Doctorand,
Prof. Dr. Tudor LUCHIAN Sorana Elena IFTEMI
- 2015 –
UNIVERSITATEA „ALEXANDRU IOAN CUZA” din IAŞI
ŞCOALA DOCTORALĂ A FACULTĂŢII DE FIZICĂ
UNIVERSITATEA „ALEXANDRU IOAN CUZA” DIN IAȘI
Școala Doctorală a Facultății de Fizică
Vă facem cunoscut că în data de 30 septembrie 2015, ora
10:00, în sala de conferințe „FERDINAND”, domna Sorana IFTEMI,
va susține în ședință publică teza de doctorat:
„Determinanți fizici ai activității peptidelor citotoxice în sisteme
lipidice reconstituite”
în vederea obținerii titlului științific de doctor în domeniul fundamental
Științe Exacte, domeniul Fizică.
Comisia de examinare a tezei:
Prof. Dr. Diana MARDARE Preşedinte
Directorul Şcolii Doctorale de
Fizică
Universitatea “Alexandru Ioan
Cuza”, Iaşi
Prof. Dr. Tudor LUCHIAN Coordonator ştiinţific
Facultatea de Fizică
Universitatea “Alexandru Ioan
Cuza”, Iaşi
Prof. Dr. Nicoleta DUMITRAŞCU Referent
Facultatea de Fizică
Universitatea “Alexandru Ioan
Cuza”, Iaşi
Prof. Univ. Dr. Leontin DAVID Referent
Universitatea Babeș Bolyai,
Facultatea de Fizică, Cluj-
Napoca
Conf. Dr. Dragoş GRIGORIU Referent
Universitatea de Medicină şi
Farmacie
„Gr. T. Popa”, Iaşi
Vă invităm pe această cale să participați la ședința publică a tezei.
1
CUPRINS
I. Motivaţia studiului interacţiunii dintre peptide
membranar active și sisteme
lipo-proteice....................................................................3
II. Peptidele membranar active și interacțiunea lor cu
membranele lipidice artificiale
1. Caracteristici structurale și funcționale ale membranelor
lipidice artificiale.............................................................5
2. Caracteristici generale ale peptidelor membranar
active................................................................................9
3. Mecanismele de destabilizare a membranelor lipidice
artificiale de către peptidele membranar active
....................................................................................... 13
4. Influența nepotrivirii hidrofobe dintre peptide și
bistraturi lipidice planare asupra formării porilor
transmembranari.............................................................16
III. Rolul peptidelor amiloid β în neurofiziologia
sistemului nervos uman
1. Caracteristici generale ale peptidelor amiloid
β.....................................................................................18
2. Implicarea peptidelor amiloid β în apariția și progresul
bolilor
neurodegenerative..........................................................20
3. Efectul metalelor de tranziție asupra conformației
peptidelor amiloidice......................................................23
2
IV. Detalii structurale și funcționale ale peptidelor
utilizate în cadrul studiilor experimentale desfășurate
1. Particularități ale peptidei antimicrobiene trichogin
GAIV.............................................................................35
2. Particularități ale fragmentului 1-16 al peptidei amiloid β
secretată de organismul uman și
murin............................................................................. 40
3. Particularități ale mutanților Aβ1, Aβ4H13dH
,
Aβ5H6dH
..........................................................................43
V. Tehnici și metode de investigație a interacțiunilor
dintre peptide membranar active și sisteme lipo-
proteice
1. Metoda Montal-Mueller de realizare a membranelor
lipidice artificiale...........................................................46
2. Înregistrări electrofiziologice la nivel de “singură
moleculă” ale curentului ionic mediat de pori
membranari……………………………………………48
3. Utilizarea porului proteic de α-hemolizină ca nanosenzor
în studiul interacțiunilor peptide – substrat
metalic…………………………………………………50
4. Analiza statistică a cineticii de interacțiune dintre peptide
și un singur por proteic de α-
hemolizină......................................................................52
VI. Rezultate experimentale și concluzii
VI.1. Studiul activității membranare a peptidei
antimicrobiene trichogin GAIV....................................57
3
1.1. Nepotrivirea hidrofobă dintre peptida trichogin
GAIV și bistraturi lipidice
planare..................................................................57
1.2. Modelul matematic utilizat pentru determinarea
numarului minim de monomeri necesari formării
unui por
transmembranar....................................................66
VI.2. Investigații la nivel de “singură moleculă” ale
interacțiunii dintre peptida Aβ(1-16) de origine umană și
metale de tranziție …………………………………….70
1.3. Utilizarea nanoporului de α-hemolizină ca detector
molecular al modificărilor induse de ionii metalici
(Cu2+
, Fe2+
, Zn3+
, Al3+
) în conformația peptidei
Aβ(1-16) de origine
umană................................................................... 71
1.4. Studiu comparativ al peptidelor Aβ(1-16) de origine
umană și Aβ(1-16) de origine murină în interacțiunea
cu ionii de
Cu2+
.......................................................................83
VI.3. Utilizarea porului proteic de α-hemolizină în
detecția interacțiunilor stereoselective dintre Cu2+
și
enantiomerul aminoacidului histidină........................105
1.5. Investigarea la nivel de “singură moleculă” a
schimbărilor conformaționale ale mutanților Aβ1,
Aβ4H13dH
, Aβ5H6dH
în urma interacțiunii cu ionii de
Cu2+
.....................................................................105
1.6. Determinarea constantelor de reacție și a
constantelor de disociere ...................................118
Referințe.............................................................................130
4
I. Motivaţia studiului interacţiunii dintre peptide
membranar active și sisteme lipo-proteice
Peptidele membranar active sunt implicate în apărarea
imună împotriva infecţiilor microbiene, acestea fiind prezente de
la plante şi insecte până la vertebratele superioare. Aceste
peptide naturale conţin în structura bazică 12-50 de aminoacizi,
existând astăzi în bazele de date peste 800 de asemenea
compuşi. Aceste peptide se pot ataşa şi insera în membranele
lipidice formând pori, datorită compoziţiei lor în aminoacizi,
amfipaticităţii, încărcărcării cationice şi dimensiunii lor1,2
.
II. Peptidele membranar active și interacțiunea lor cu
membranele lipidice artificiale
II.1. Caracteristici structurale și funcționale ale
membranelor lipidice artificiale
Membranele celulelor biologice sunt structuri cu rolul de
izolare a celulei de către mediul înconjurător, menţinând
diferenţe esenţiale între compoziţia mediului intracelular şi cel
extracelular. Membrana celulară controlează procesele de intrare
a nutrienţilor în celulă precum şi cele de eliminare a produşilor
neutilizabili, generează diferenţe de concentraţii ionice între
mediul extern şi intern al celulei şi participă în procesele de
comunicare celulară acţionând ca un senzor al semnalelor
celulare externe3.
5
II.2. Caracteristici generale ale peptidelor membranar
active
Peptidele membranar active sunt structuri bazice compuse
din 12-50 de aminoacizi.
Caracteristicile structurale importante ale peptidelor
membranar active sunt: sarcina electrică netă, helicitatea,
hidrofobicitatea intrinsecă, momentul hidrofob şi mărimea
domeniilor polare respectiv hidrofobe asupra efectului de
permeabilizare a membranelor.
II.3. Mecanismele de destabilizare a membranelor lipidice
artificiale de către peptidele membranar active
Peptidele prezente în soluţie sunt în general împachetate
aleatoriu, acestea se absorb la interfaţa lipide/mediu apos formând
structuri de α-helix. În momentul în care se atinge o concentraţie
critică a peptidelor absorbite, acestea se inseră în bistrat formând
pori tranzienţi care conduc la scurgerea materialului intracelular şi
în final la moartea celulei4. Figura II.3.1 redă o reprezentare
schematică a acestui mecanism.
Figura II.3.1. Reprezentare schematică a etapelor de interacţiune dintre
peptide şi bistratul lipidic membranar. Cu roşu sunt reprezentate peptidele cu
structură secundară de α-helix (adaptare după [5]).
6
Până în prezent s-au descoperit şi caracterizat două tipuri
de pori transmembranari: porii clasici şi porii toroidali. Porii
clasici denumiţi şi „barrel-stave” au interiorul constituit doar din
părţile polare ale peptidelor, iar în cazul porilor toroidali, structura
interioară conţine şi capete polare ale lipidelor ce intră în
compoziţia membranei lipidice.
Figura II.3.2. Schema reprezentativă a modelelor de pori
transmembranari, modelul porilor clasici (A) şi modelul porilor toroidali (B)
(adaptare după http://hwhuang.rice.edu/).
III. Rolul peptidelor amiloid β în neurofiziologia
sistemului nervos uman
III.2. Implicarea peptidelor amiloid β în apariția și
progresul bolilor neurodegenerative
Împachetarea greşită a peptidelor amiloid-β conduce la
alterarea funcţiilor, astfel acestea interacţionează între ele sau cu
alţi compuşi formând structuri insolubile cu aspect fibrilar. Astfel
de structuri au fost asociate cu patologia a mai multor afecţiuni
umane. Acumulările în cantităţi anormale ale peptidelor
amiloidice sub formă fibrilară conduc la amiloidoză.
7
Aceste acumulări fibrilare de proteine amiloidice joacă un rol
important în apariţia bolilor neurdegenerative cum ar fi boala
Alzheimer, Parkinson, diabetul de tipul II ş.a.m.d.
În boala Alzheimer, proteinele tau sunt anormale,
microtubulii fiind afectaţi, astfel neuronii nu mai pot funcționa
normal (figura III.2.2).
Figura III.2.2. Reprezentarea schematică a neuronului sănătos (stânga sus) şi a
neuronului afectat de boala Alzeimer (stânga jos) [adaptare după
https://arcpointelkgrovevillage.wordpress.com].
8
III.3. Efectul metalelor de tranziție asupra conformației
peptidelor amiloidice
Studiile anterioare au arătat faptul că inducerea bolilor
neurodegenerative de către peptidele amiloid-β constă în formarea
de canale ionice de către oligomerii amiloidici5.
Una dintre ipotezele existente care încearcă să explice
apariţia bolilor neurodegenerative, pune accent pe acumulările
anormale de metale cum ar fi Cu2+
, Zn2+
, Fe3+
, Al3+
la nivel
neuronal, care conduc la apariţia agregatelor proteice toxice6,7
.
IV. Detalii structurale și funcționale ale peptidelor
utilizate în cadrul studiilor experimentale
desfășurate
IV.1. Particularități ale peptidei antimicrobiene trichogin
GAIV
Trichogin GAIV reprezintă componenta principală a
familiei lipopetaibol și a fost izolată din Trichoderma
longibrachiatum.
Peptida trichogin GA IV are în structura sa 11 aminoacizi,
secvența primară fiind următoarea: Oct-Aib1-Gly
2-Leu
3-Aib
4-
Gly5-Gly
6-Leu
7-Aib
8-Gly
9-Ile
10-Lol
11, unde Oct este n-octanoil și
Lol este leucinol.
Studii anterioare au arătat că peptida trichogin GAIV, la
fel ca și peptida alameticină (Alm) care face parte din aceeași
familie, formează pori clasici („barrel-stave”)8.
Se presupune că prezența lanțului acil la capătul N-terminal
joacă un rol esențial în activitatea sa9.
9
IV.2. Particularități ale fragmentului 1-16 al peptidei
amiloid β secretată de organismul uman
În experimentele efectuate în cadrul acestui studiu, am
utilizat fragmentul peptidic Aβ(1-16) de origine umană, a cărei
secvență de aminoacizi este următoarea:
Asp1-Ala
2-Glu
3-Phe
4-Arg
5-His
6-Asp
7-Ser
8-Gly
9-Tyr
10-Glu
11-
Val12
-His13
-His14
-Gln15
-Lys16
Figura IV.2.1. Structura secundară idealizată a fragmentului peptidic Aβ(1-16)
de origine umană [modelat în programul HyperChem].
V. Tehnici și metode de investigație a interacțiunilor
dintre peptide membranar active și sisteme lipo-
proteice
V.1. Metoda Montal-Mueller de realizare a membranelor
lipidice artificiale
Pentru realizarea bistraturilor lipidice artificiale în cadrul
experimentelor, am utilizat metoda Montal-Mueller3.
În figura V.1.1 Este reprezentată metoda Montal-Mueller
de realizare a bistraturilor lipidice.
10
Figura V.1.1. Metoda Montal-Mueller de realizare a bistraturilor lipidice
artificiale. (a) se adaugă soluție electrofiziologică, nivelul acesteia fiind sub
orificiul foliei de teflon ce desparte cele două cavități ale cuvei; (b) se adaugă
lipide în ambele cavități ale cuvei și se așteaptă câteva minute; (c) și (d) se
adaugă soluție electrofiziologică astfel încât se ridică nivelul soluției în cuvă;
(e) se formează bistratul lipidic artificial la nivelul aperturii foliei de teflon care
a fost tratată anterior cu o soluție de hexadecan-pentan (10%, v/v) pentru a
mări gradul de hidrofobicitate a foliei de teflon [10].
VI. Rezultate experimentale
VI.1. Studiul activității membranare a peptidei
antimicrobiene trichogin GAIV
În cadrul acestor experimente am utilizat tehnici de
electrofiziologie la nivel de „singură moleculă” pentru a elucida
mecanismul de interacțiune a peptidei trichogin GAIV cu
membrana lipidică planară formată din lipide zwitterionice.
VI.1.1. Nepotrivirea hidrofobă dintre peptida trichogin
GAIV și bistraturi lipidice planare
În figura VI.1.1.1 sunt reprezentate fluctuațiile de curent
ionic datorate activității peptidei trichogin GAIV în bistratul
lipidic, la variații de diferențe de potențial, arătându-se
schimbările reversibile ale conductanței membranei din starea
11
„închis”, notată cu C (closed) în diferite stări conductive notate cu
O1 și O2 (O - open).
Figura VI.1.1.1. (a) Fluctuații de curent ionic înregistrate în urma adăugării a 5
µM de peptidă trichogin GAIV în partea cis a membranei lipidice. Diagrame a
dependenței de diferența de potențial a curentului ionic pentru prima stare
conductivă O1 (b) și a doua stare conductivă O2 (c) arătând comportamentul
ohmic a astfel de canale [11].
12
Concluzii
În urma analizelor uni-moleculare a înregistrărilor
electrice asociate activității membranare a peptidei trichogin GA
IV, am observat existența unei prime stări conductive, notată cu
O1, valoarea dublă a amplitudinii pentru cea de a doua stare
conductivă O2, reflectă apariţia concomitentă a doi pori formaţi de
peptida trichogin GA IV.
Numărul minim de monomeri de trichogin GA IV necesari
formării unui singur canal ionic este N=3.
Spre deosebire de alte peptide (spre exemplu alameticina),
activitatea peptidei trichogin GA IV este vizibilă atât la aplicarea
de potenţial pozitiv cât şi la aplicarea de potenţial negativ.
Activitatea electrică a porilor formați de către peptida
trichogin Ga IV este dependentă de diferența de potențial, în
sensul că densitatea de putere a fluctuaţiilor de curent electric
induse în membrana reconstituită este corelată cantitativ cu
valoarea tensiunii aplicate.
VI.2. Investigații la nivel de “singură moleculă” ale
interacțiunii dintre peptida Aβ(1-16) de origine
umană și metale de tranziție
VI.2.1. Utilizarea nanoporului de α-hemolizină ca detector
molecular al modificărilor induse de ionii metalici
(Cu2+
, Fe2+
, Zn3+
, Al3+
) în conformația peptidei Aβ(1-16)
de origine umană.
În cadrul acestui experiment, am utilizat porul proteic de α-
HL ca detector molecular pentru a investiga modificările
13
conformaționale ale fragmentului peptidic Aβ(1-16) de origine
umană, în urma interacțiunii acestuia cu diferiți ioni metalici:
Cu2+
, Fe2+
, Zn3+
, Al3+
.
Rezultate experimentale și discuții
În primul set de experimente am investigat la nivel
unimolecular interacțiunile dintre peptida Aβ(1-16) de origine
umană și porul proteic de α-HL, în absența si în prezenta ionilor
metalici.
După inserția unui singur por de α-HL, aplicând mai apoi o
diferențe de potențial negativă, este facilitat transportul
electroforetic al peptidei Aβ(1-16) prin porul proteic, interacțiunile
dintre peptidă și por fiind observate prin fluctuațiile de curent
ionic induse de blocajul porului proteic de către peptidă.
Adăugarea în sistem a ionilor de Cu2+
, Zn2+
, Fe3+
și Al3+
,
conduce la modificări ale cineticii evenimentelor de blocaj ale
porului de către peptidă, în comparație cu cinetica evenimentelor
de blocaj ale porului în absența ionilor metalici (figura VI.2.1.2,
panelul b-d).
Am observat că intervalul de timp corespunzător
evenimentelor de blocaj al porului de către o singură peptidă (τoff)
(figura VI.2.1.4, panelul a) și valorile timpilor dintre două
evenimente consecutive de blocaj al porului de către peptidă (τon)
(figura VI.2.1.4, panelul b), cresc odată cu creșterea concentrației
de ioni metalici în cazul ionilor Cu2+
și Zn2+
. În schimb, în cazul
ionilor de Fe3+
și Al3+
nu se observă schimbări relevante ai acestor
timpi.
14
Figura VI.2.1.2. Reprezentări ale fluctuațiilor de curent ionic datorate
interacțiunii reversibile a peptidei Aβ(1-16) cu porul de α-HL în absența de ioni
metalici (a) și prezența de ioni de Cu2+
(b), Zn2+
(c), Fe3+
(d) și Al3+
(e) [12].
Figura VI.2.1.4. Reprezentarea timpilor τoff și τon funcție de concentrația de
metale adăugată în sistem. [13].
Concluzii
Rezultatele obținute în cadrul acestor experimente,
demonstrează potențialul analizei cinetice la nivel de „singură
moleculă” a interacțiunilor dintre peptida Aβ și ionii metalici,
15
bazate pe analiza curentului ionic prin porul proteic de α-HL
inserat în bistratul lipidic, datorat interacțiunii dintre peptida
liberă sau peptida complexată cu porul proteic. Din analiza timpilor de blocaj al porului de către peptidă
(τoff) și a intervalelor de timp dintre evenimentele consecutive de
blocaj (τon), în prezența ionilor metalici (Cu2+
și Zn2+
) care au o
afinitate ridicată pentru peptide, a fost posibilă cuantificarea
constantelor de disociere corespunzătoare interacțiunii dintre
peptide și ionii de Cu2+
, respectiv ionii de Zn2+
.
VI.2.2. Studiu comparativ al peptidelor Aβ(1-16) de origine
umană și Aβ(1-16) de origine murină în interacțiunea
cu ionii de Cu2+
În acest studiu am învestigat interacțiunile la nivel de
„singură moleculă” între fragmentul peptidic Aβ(1-16) de origine
umană (Aβ(1-16)uman) și Aβ(1-16) de origine murină (Aβ(1-16)murin) cu
ionii de Cu2+
, prin intermediul unui singur por proteic de α-HL,
inserat în bistratul lipidic artificial, despre care se știe că
facilitează transportul controlat al peptidelor și ionilor de-a lungul
membranei lipidice.
Rezultate experimentale
La adăugarea de peptidă în partea trans a membranei
lipidice, în care a fost inserat anterior un por proteic de α-HL și la
aplicarea unei diferențe de potențial, aceasta se deplasează
electroforetic prin porul proteic inducând blocaje reversibile ale
porului, a căror fluctuații de curent ionic au anumite valori ale
amplitudinii.
16
Analiza cinetică a evenimentelor de blocaj al porului de
către peptidă, a arătat că intervalul de timp mediu dintre două
evenimente de blocaj consecutive (τon) corespunzătoare
interacțiunilor dintre peptida liberă cu porul de α-HL sau peptida
complexată cu porul proteic (figura VI.2.2.1), precum și timpul
mediu de rezidență a peptidei în porul proteic (τoff), cresc odată cu
creșterea concentrației de ioni de Cu2+ adăugată în sistem (în
partea trans a membranei lipidice).
Figura VI.2.2.1. Fluctuații de curent ionic datorate interacțiunii dintre peptida
Aβ(1-16)uman și porul proteic de α-HL în absența (panelul a) și în prezența ionilor
de Cu2+
(panelul b-d) [13].
Din datele obținute din experimentele de control, în care s-
au urmărit interacțiunile dintre peptida liberă și porul proteic, a
fost posibilă reprezentarea timpilor (τon) și (τoff) în funcție de
diferența de potențial aplicată.
17
Figura VI.2.2.4. Reprezentarea ratelor rateon și rateoff funcție de concentrația
de peptidă Aβ(1-16) de origine umană și murină[13].
În contrast cu datele experimentale obținute în
experimentele cu peptida Aβ(1-16)uman (figura VI.2.2.1), o creștere a
concentrației de ioni de Cu2+
adăugată în partea trans a bistratului
lipidic, conduce la o frecvență mai mare a evenimentelor de
blocaj, asociate cu interacțiunea peptidei Aβ(1-16) de origine
murină cu lumenul porului proteic.
Concluzii
Constanta ratei de asociere pentru peptida Aβ(1-16)murin
necomplexată are o valoare aproape dublă în comparație cu
peptida Aβ(1-16)uman necomplexată, această diferență fiind datorată
18
orientării preferențiale ale peptidelor de origine murină și umană
în interacțiunea cu porul proteic de α-HL.
Din datele experimentale obținute aici este clar faptul că
ionii de Cu2+
influențează mai mult interacțiunile dintre peptida
Aβ(1-16)uman cu porul proteic de α-HL, în comparație cu peptida
Aβ(1-16)murin.
În studiile de față am pus în evidență potențialul utilizării
porului proteic de α-HL ca detector molecular al modificărilor
induse de către diferiți ioni metalici în conformația fragmentelor
amiloidice.
Folosind astfel de peptide specifice, rezultatele din aceste
experimente pot contribui la dezvoltarea unei metode ușoare de
detecție și recunoaștere a ionilor sau ale moleculelor de
dimensiune mică (spre exemplu inhibitori ai oligomerizării
peptidei Aβ) utilizând nanopori proteici.
VI.3. Utilizarea porului proteic de α-hemolizină în
detecția interacțiunilor stereoselective dintre Cu2+
și enantiomerul aminoacidului histidină
VI.3.1. Investigarea la nivel de “singură moleculă” a
schimbărilor conformaționale ale mutanților Aβ1,
Aβ4H13dH
, Aβ5H6dH
în urma interacțiunii cu ionii de
Cu2+
În cadrul acestor experimente am utilizat porul proteic de
α-HL ca nanosenzor în detecția interacțiunii dintre mutanții
peptidelor amiloidice și ionii de Cu2+
, pentru a investiga efectul
pe care il au ionii de Cu2+
în urma formării situsurilor de legătură
cu aminoacizii de L,D-histidină din secvența peptidelor.
19
Adăugarea de peptide în sistem conduce la blocaje de
curent ionic ale porului proteic, determinarea valorilor curentului
ionic fiind posibilă în urma analizei amplitudinii curenului ionic
datorat interacțiunii peptidelor cu porul proteic.
Prin analiza valorilor medii ale timpului τon (care
reprezintă intervalul de timp dintre două evenimente consecutive
de blocaj al curentului ionic, datorat interacțiunii peptidei cu porul
proteic) și τoff (care este timpul de rezidență a peptidei în porul
proteic), se pot determina valorile ratei de asociere (rateON) și a
ratei de disociere (rateOFF) (figura VI.3.2) care descriu
interacțiunile reversibile dintre peptide și porul proteic.
Figura VI.3.1 Fluctuații de curent ionic datorate interacțiunii peptidelor Aβ1,
Aβ4H13dH
și Aβ5H6dH
în absența (panelul a,e,i) și în prezența ionilor de Cu2+
la
diferite concentrații adăugate în partea trans a membranei lipidice, la o
diferență de potențial aplicată de -70 mV [14].
20
Modificările induse de către ionii de Cu2+
asupra activității
peptidei sunt reversibile, acest fapt fiind observat din activitatea
peptidei care, la adăugarea de EDTA în partea trans a membranei
lipidice, în prezența ionilor de cupru, este similară cu activitatea
în cazul în care evenimentele erau datorate interacțiunii peptidei
cu porul proteic, în lipsa ionilor de cupru.
Figura VI.3.2. Reprezentarea dependenței ratei de asociere rateON și a ratei de
disociere rateOFF funcție de concentrația de peptidă utilizată (Aβ1, Aβ4H13dH
,
Aβ5H6dH
) [14].
Concluzii
Acest studiu este primul raport în care s-a demonstrat
faptul că nanoporul proteic servește drept senzor la nivel de
„singură moleculă” ce detectează afinitatea metalelor la diferite
medii chirale, date de enantiomerii aminoacizilor.
Orientarea inelelor de L,D-imidazol și coordonarea
legăturilor de către metale induc o schimbare conformațională a
21
peptidelor în urma interacțiunii cu metalele, fiind alterată
afinitatea peptidelor pentru porul de α-HL.
Afinitatea ionilor de Cu2+
pentru peptidele testate, este mai
mare atunci când enantionerul L-His este înlocuit cu D-His, acest
efect fiind mai mare atunci când modificările au loc la
aminoacidul His din poziția 6.
Datele prezentate subliniază potențialul porului de α-HL
de a diferenția peptide cu compoziție chimică identică, a căror
situsuri de legături conțin enantiomeri de aminoacizi în diferite
poziții în structura primară, prin analiza cinetică a evenimentelor
de blocaj a peptidelor cu porul de α-HL.
Prezența ionilor metalici se poate observa prin detecția
schimbărilor conformaționale ale peptidelor induse de către
metale, în interacțiunea cu porul de α-HL.
22
Bibliografie selectivă
[1] J. I. Kourie et al, Am. J. Physiol. Cell Physiol. 2000, 278,
1063-1087.
[2] M. S. P. Sansom et al., Eur. Biophys. J. 1991, 20, 229-240.
[3] T. Luchian, Electrofiziologie moleculară. Teorie și
aplicații, Ed. Sedcom Libris, 2006, Iași.
[4] S. K. Kandasamy et al., Chemistry and Physics of Lipids.
2004, 132, 113-132.
[5] R. Capone et al., Neurotox Res. 2009, 16, 1-13.
[6] D. H. O'Day, M. A. Myre, Biochem Biophys Res Commun.
2004, 320, 1051-1054.
[7] A. I. Bush, R.E. Tanzi, Neurotherapeutics 2008, 5, 421-
432.
[8] M. S. P. Sansom, Eur. Biophys. J. 1993, 22, 105-124.
[9] C. Toniolo et al., Cell. Mol. Life Sci. 2001, 58, 1179-1188. [10] T. Gutsmann, et al., Nature Protocols. 2015, 10, 188–198. [11] S. Iftemi et al., Chemistry&Biodiversity, 2014, 11, 1069-
1077. [12] A. Asandei et al., J. Membrane Biol. 2014, 247, 523-530. [13] A. Asandei et al., Langmuir 2013, 29, 15634–15642. [14] I. Schiopu et al., Langmuir. 2015, 31, 387-396.