rezumatul tezei de doctorat ph.d. thesis summaryold.unitbv.ro/portals/31/sustineri de...
TRANSCRIPT
MINISTERUL EDUCAȚIEI, CERCETĂRII, TINERETULUI ȘI SPORTULUI
UNIVERSITATEA „TRANSILVANIA” DIN BRAȘOV
Facultatea de Silvicultură și Exploatări Forestiere
Ing. Raul Gheorghe RADU
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.)
Karst.] din România cu ajutorul markerilor biochimici primari
Genetic diversity evaluation in Romanian natural populations of Norway spruce
[Picea abies (L.) Karst] using primary biochemical markers
REZUMATUL TEZEI DE DOCTORAT
Ph.D. THESIS Summary
Conducător științific:
Prof.univ.dr.ing. Neculae ȘOFLETEA
Brașov, 2013
MINISTERUL EDUCAŢIEI NAȚIONALE
UNIVERSITATEA ”TRANSILVANIA” DIN BRAŞOV
Brașov, b-dul Eroilor 29, 500036, tel. 0040-268-413000, fax 0040-268-410525
RECTORAT
Către…………………………………………………………………………….
Vă aducem la cunoştinţă că în ziua de marţi, 11.10.2013, ora 13.00, la FACULTATEA DE
SILVICULTURĂ ȘI EXPLOATĂRI FORESTIERE, corp S, în sala SI.2, va avea loc susținerea publică a
tezei de doctorat intitulată: EVALUAREA DIVERSITĂȚII GENETICE ÎN POPULAȚII NATURALE DE
MOLID [PICEA ABIES (L.) KARST] DIN ROMÂNIA CU AJUTORUL MARKERILOR BIOCHIMICI
PRIMARI elaborată de ing. RADU Gheorghe Raul, în vederea obținerii titlului de DOCTOR, în domeniul
SILVICULTURĂ.
COMISIA DE DOCTORAT
Numită prin
Ordinul Rectorului Universității ”Transilvania” din Brașov
Nr. 5999 din 10.09.2013
PREȘEDINTE: Prof. univ. dr. ing. Gheorghe SPÂRCHEZ
PRODECAN – Facultatea de Silvicultură și Exploatări Forestiere
Universitatea ”Transilvania” din Brașov
CONDUCĂTOR ȘTIINȚIFIC: Prof. univ. dr. ing. Neculae ŞOFLETEA
Universitatea ”Transilvania” din Brașov
REFERENȚI: Conf. univ. dr. Liviu FĂRTĂIŞ
Universitatea Ştefan cel Mare Suceava
Cercet. șt. gr. II, dr. ing. Flaviu POPESCU
I.C.A.S. București, Stațiunea Simeria
Conf. univ. dr. ing. Alexandru-Lucian CURTU
Universitatea ”Transilvania” din Brașov
Eventualele aprecieri sau observații asupra conținutului lucrării vă rugăm să le transmiteți în timp
util, pe adresa: Facultatea de Silvicultură și Exploatări Forestiere din Brașov, str. Șirul Beethoven, nr. 1,
500123, la numărul de fax: 0268 475705 sau pe e-mail: [email protected].
Totodată vă invităm să participați la şedinţa publică de susținere a tezei de doctorat.
Vă mulțumesc
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.] din România cu ajutorul
markerilor biochimici primari
1
Cuprins
Cuvânt înainte ...................................................................................................................5.............5
Capitolul 1. Introducere ...................................................................................................6.............6
Capitolul 2. Stadiul actual al cunoștințelor privind evaluarea diversității genetice a molidului
cu ajutorul markerilor genetici primari .........................................................................7.............8
2.1. Aspecte privind originea și evoluția molidului ......................................................7.............8
2.2. Principalele caracteristici ecologice, diversitatea ecotipică și rasială ................8..............9
2.2.1. Morfologia și ecologia .....................................................................................8.............9
2.2.2. Diversitatea ecotipică și rasială .......................................................................9............11
2.3. Conservarea resurselor genetice de molid ............................................................10.........13
2.4. Estimarea variației genetice cu ajutorul markerilor biochimici primari (izoenzimele)11..15
2.5. Evaluarea structurii genetice spațiale a populațiilor ...........................................11..........16
2.6. Rezultate ale studiilor privind evaluarea variabilității genetice a molidului cu ajutorul
markerilor biochimici primari .....................................................................................12..........18
Capitolul 3. Scopul și obiectivele cercetărilor ................................................................13.........27
3.1. Scopul cercetărilor ................................................................................................13..........27
3.2. Obiectivele urmărite .............................................................................................14..........27
Capitolul 4. Materialul și metodele de cercetare ..........................................................14..........28
4.1. Localizarea cercetărilor .......................................................................................14..........28
4.2. Recoltarea materialului de cercetare ...................................................................15..........34
4.3. Metoda de lucru în laborator ...............................................................................16..........35
4.4. Analiza și interpretarea parametrilor diversității genetice ..................................17..........39
4.5. Structura spațială a variației genetice .................................................................18..........44
4.5.1. Metode utilizate pentru analiza spațială a structurii genetice ........................18...........44
4.5.2. Utilizarea sistemelor informatice geografice (GIS) în analiza structurii genetice
spațiale ......................................................................................................................19..........45
Capitolul 5. Rezultatele cercetărilor ..............................................................................20..........46
5.1. Evaluarea diversității genetice în populații autohtone de molid din cuprinsul rețelei
NATURA 2000 cu ajutorul markerilor biochimici primari .........................................20..........46
5.1.1. Lecturarea zimogramelor ................................................................................20.........46
5.1.2. Frecvența și distribuția alelelor în cadrul populațiilor de molid .....................20.........56
5.1.3. Analiza variabilității genetice izoenzimatice ..................................................22.........70
5.1.3.1. Date sintetice genotipice și alelice ........................................................22..........70
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.] din România cu ajutorul
markerilor biochimici primari
2
5.1.3.2. Structura genetică în interiorul populațiilor ..........................................23...........73
5.1.3.3. Structura genetică interpopulațională ...................................................27...........77
5.1.4. Discuții ...........................................................................................................30...........82
5.2. Analize comparative ale diversității genetice între populații individualizate biotipic și/sau
ecotipic ........................................................................................................................33..........86
5.2.1. Studiu comparativ între populația de turbărie, populația biotipului de molid cu coroană
columnară (Picea abies var. columnaris) și populația de molid cu coroană piramidală (Picea
abies var pyramidalis) din metapopulația Apuseni .................................................33............86
5.2.2. Analize genetice comparative între populații aflate la altitudini diferite din aceeași zonă
geografică ................................................................................................................35............90
5.2.3. Discuții ...........................................................................................................37...........94
5.3. Structuri genetice microspațiale pentru locii izoenzimatic .................................38...........96
5.3.1. Structura genetică microspațială în metapopulația Postăvarul ......................39...........96
5.3.2. Structura genetică microspațială în populația Nemira ...................................45.........106
5.3.3. Discuții ...........................................................................................................48.........114
Capitolul 6. Concluzii generale și contribuții personale .............................................51..........117
6.1. Concluzii generale ...............................................................................................51.........117
6.2. Contribuții personale ...........................................................................................54.........122
Diseminarea rezultatelor ................................................................................................55.........124
Bibliografie ......................................................................................................................56.........125
Rezumat ...........................................................................................................................62.........134
Curriculum Vitae ............................................................................................................64.........136
Anexa ................................................................................................................................-...........138
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.] din România cu ajutorul
markerilor biochimici primari
3
Content
Foreword ..…………………………………………………………………...…………5....…...….5
Chapter 1. Introduction ……………………………………………………………….6.….....…..6
Chapter 2. Current state of knowledge of genetic diversity evaluation of Norway spruce by
the means of allozyme genetic markers ………………………………………………7….…......8
2.1. Origin and evolution of Norway spruce ……………………………………….7.………....8
2.2. The main ecological characteristics, ecotype and racial diversity ………........8…...….....9
2.2.1. Morphology and ecology ………………………………………………......8..…......…9
2.2.2. Ecotype and racial diversity ………………………………………………..9....…......11
2.3. Conservation of Norway spruce genetic resources in România ……………….10............13
2.4. Genetic variability of Norway spruce, analyzed with genetic markers ………..11............15
2.5. Spatial genetic structures of populations ……………………………………...11….........16
2.6. Result of genetic variability of Norway spruce, analyzed with genetic markers in others
studies ……………………………………………………………………………….12….......18
Chapter 3. Aim and objectives of the study ………………………………………….13….......27
3.1. Aim of study ………………………………………………………….…………13…....…27
3.2. Objectives ………………………………………………………………………14...........27
Chapter 4. Material and methods …………………………………………………….14…........28
4.1. Site location …………………………………………………....………………14............28
4.2. The collection and preservation of biological samples ………………………..15............34
4.3. Methods used in laboratory …………………………………………..………..16............35
4.4. The analyses and interpretation methodologies of genetic parameters ……….17............39
4.5. Spatial structure of genetic diversity …………………………………………..18............44
4.5.1. Methods of spatial structure analyses ………………………………………18...........44
4.5.2 The use of GIS tehnologyes to determine the spatial genetic structure ……19............45
Chapter 5. Results …………………………………………………………….............20............46
5.1. Genetic diversity of Norway spruce autochthonous populations from NATURA 2000 sites,
analyzed with genetic markers ………………………………………………………20.......…46
5.1.1. Zymograms interpretation …………………………………………………20........…46
5.1.2. Alleles frequencies and distribution of Norway spruce …………………...20............56
5.1.3. Isozyme genetic diversity ………………………………………………….22............70
5.1.3.1. Genotypic and allelic synthetic data …………………………………23........…70
5.1.3.2. Genetic diversity within populations ………………………………..27.….......73
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.] din România cu ajutorul
markerilor biochimici primari
4
5.1.3.3. Genetic diversity between populations ………………………………30.….......77
5.1.4. Discussions …………………………………………………………………33...........82
5.2. Genetic diversity comparative analyses among biotype and/or ecotype individualized33.86
5.2.1. Comparative studies of genetic diversity between peat bog ecotype population, narrow
crown spruce population and pyramidal crown spruce population from Apuseni
metapopulation ……………………………………………………...………...….33.........…86
5.2.2. Comparative studies of genetic diversity between high and low altitudinal populations
from the same geographic area ……………………………….………………......35............90
5.2.3. Discussions …………………………………………………………….......37........…94
5.3. Microspatial genetic structures ……………………………………………......37............96
5.3.1. Microspatial genetic structures in Postăvaru metapopulation ……………..38.….......96
5.3.2. Microspatial genetic structures in Nemira metapopulation …………….....39.…......106
5.3.3. Discussions …………………………………………………………….......45...........114
Chapter 6. General conclusions and personal contributions ………………….........48..........117
6.1. General conclusions ………………………………………………………........51..........117
6.2. Personal contributions ………………………………………………………....51..........122
Results dissemination ……………………………………………………………….....54.........124
References ………………………………………………………………………….......55..........125
Abstract ………………………………………………………..……………….……....56..........134
Curriculum Vitae ………………………………………………………………….......62..........136
Annex ……………………………………………………………………………….......64.........138
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.] din România cu ajutorul
markerilor biochimici primari
5
Cuvânt înainte
Teza de doctorat a fost elaborată sub îndrumarea domnului prof. univ. dr. ing. Neculae
ȘOFLETEA, căruia îi adresez sincere mulțumiri pentru întregul sprijin acordat. Pentru că m-a
acceptat ca doctorand, pentru înțelegerea, încurajarea și susținerea permanentă, îi rămân profund
recunoscător.
De asemenea adresez sincere mulțumiri domnului conf. dr. ing. Alexandru Ioan CURTU
pentru sprijinul acordat, pentru încurajări, pentru punerea la dispoziție a materialelor științifice
pentru analiza izoenzimelor și pentru instruirea și îndrumarea permanentă în laborator asupra
protocoalelor de lucru.
Mulţumesc totodată tuturor membrilor comisiilor şi tuturor profesorilor din cadrul
Departamentului de Silvicultură al Facultăţii de Silvicultură şi Exploatări Forestiere, pentru
amabilitatea de a consulta lucrarea şi de a formula recomandări pentru îmbunătăţirea acesteia.
Adresez mulţumiri tuturor colegilor doctoranzi din cadrul Departamentului de Genetică
forestieră pentru încurajări și sprijin.
Nu în ultimul rând, vreau să îi mulţumesc soţiei mele, Melania, pentru înţelegere,
sprijin şi încurajări.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
6
1. Introducere
Pentru o gestionare sustenabilă a resurselor forestiere, pe lângă o cunoaștere a caracteristicilor
ecologice și silviculturale este absolut necesară și cunoșterea caracteristicilor genetice ale unei
populații. Estimarea variabilității genetice pentru populațiile și speciile reprezentative autohtone
devine o sarcină primordială pentru construirea strategiilor de conservare durabilă în contextul
influențelor antropice în continuă creștere precum și a schimbărilor climatice. Cunoașterea
variabilității genetice reprezintă un important indicator al estimării biodiversității unei populaţii
(Reed and Frankham, 2003; Hughes et al., 2008). Chiar dacă în studiile efectuate în ultimii ani s-au
folosit în special markeri ADN, izoenzimele sunt încă foarte folosite ca markeri genetici în
determinarea variației genetice, aceasta fiind una din cele mai puţin costisitoare metode (Crawford,
1989). Izoenzimele sunt makeri codominanţi ce descriu un nivel relativ ridicat de polimorfism
genetic (Hamrick et al., 1992), fiind folosiți la descrierea modelelor geografice de variaţie a
diversității genetice având aplicabilitate în programele de conservare a resurselor genetice (Vicario
et al., 1995), evaluând impactul managementului forestier asupra diversității genetice (Curtu et al.,
2009 în Hosius, 1993; Hussendӧrfer, 1996).
Molidul este una din cele mai importante specii forestiere la nivel european, în România
afându-se pe locul al doilea după fag. În prezent este considerată principala specie pentru stocarea
carbonului din Carpați (Dutcă et al., 2009). Arealul natural şi de cultură reprezintă circa 24% din
suprafaţa totală a domeniului forestier (Șofletea și Curtu, 2007).
Numeroasele studii referitoare la variația genetică a molidului, realizate în ultimele decade au
contribuit la o sporire a informațiilor asupra structurii genetice a acestuia. Cele mai importante
studii au fost realizate în special în Europa Centrală (Giannini et al., 1991; Muller-Stark, 1995;
Goncharenko et al., 1995; Achere et al., 2005), dar și în statele Baltice (Krutovakii și Bergman,
1995; Kravchenko et al., 2008; Korshikov și Privalikihin, 2007). Studiile privind variația genetică
a molidului realizate în România au indicat un nivel moderat ce pare a fi o caracteristică a
molidului din acestă zonă a Europei. Cele mai recente analize desfășurate în arborete din țara
noastră fiind ale doamnei Ing. Maria Teodosiu în populațiile de molid din Obcinele Bucovinei
(Teodosiu, 2011).
Analizând diversitatea genetică într-un context spaţial putem înțelege mai bine dinamica
populaţiilor iar rezultatele pot avea aplicabilitate în managementul ecologic (Escudero et al.,
2003), dinamica spaţială a genotipurilor fiind influenţată de schimbările de mediu și activităţiile
umane (Knowles et al.,1992). Pentru analiza structurilor genetice la nivel microspațial conceptul
de autocorelaţie spaţială nu este o nou în domeniul cercetării evoluţiei şi ecologiei (Sokal şi Oden,
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
7
1978), find o metodă din ce în ce mai folosită. Recent, odată cu evoluția tehnicilor de prelucrare a
datelor şi a softurilor spaţiale statistice s-au creat oportunităţi privind evaluarea diversității
genetice la nivel spaţial (Manel et al., 2003; Sheldeman și Zonnevels, 2010). În cadrul acestor
metodologii noi de lucru includem si evaluarea distribuției spațiale a diversității genetice cu
ajutorul Sistemelor Informatice Geografice (GIS), putându-se realiza interpolarea parametrilor
genetici între populaţii precum şi la nivel microspațial între indivizi (Kozack et al., 2008; Hoffman
et al., 2003).
Pornind de la necesitatea descrierii variabilității genetice a molidului din România s-au ales 11
populații autohtone. Acestea sunt localizate în șase zone geografice reprezentative pentru arealul
natural al molidului din România.
2. Stadiul actual al cunoștinţelor privind evaluarea diversităţii genetice a molidului cu
ajutorul markerilor genetici primari
2.1 Aspecte privind originea și evoluția molidului
În Pliocen molidul devine o specie importantă ce domină vegetația Europei alături de Picea
abies ssp. obovata și Picea omorika, ocupând un areal geografic mai răspândit decât cel
contemporan (Oszast, 1973, din Tjoelker et al., 2007). Pe continentul European și Nord American
repetatele cicluri glaciare și interglaciare au condus la ample modificări ale arealului
(Hewitt,1996). Aceste modificări ale arealului au jucat un rol important în modelarea diversității
genetice (Tollefsrud et al., 2008). Caracterul fragmentat de azi al arealului molidului pe continentul
european, mai ales în partea centrală, este o consecință a distribuției acestor refugii glaciare
(Tjoelker et al., 2007).
Distribuția molidului în Europa a variat mult de la ultima etapă a glaciațiunii iar în zilele
noastre molidul poate fi împărțit în trei mari grupe, ce corespund refugiilor de unde a început
recolonizarea: Baltico-Nordică, Alpină și Hercino Carpatică (Lagercrantz și Ryman, 1990). Un
studiu având ca subiect polenul fosil la molid, prin analiza ADN-ului mitocondrial, a indicat cel
puțin șapte zone de refugiu glaciar al molidului în spațiul european în timpul ultimei glaciațiuni: în
câmpiile din Rusia, sud-estul Alpilor, sudul Masivului Boemian, nordul Alpilor Dinarici, nordul
Carpaților, sudul Carpaților și sud-vestul munților Balcani (Tollefsrud et al., 2008). Ca urmare a
diferitelor rute glaciare de colonizare, se constată diferențe ale variației genetice între zonele
arealului molidului. Zona nordică a arealului european, probabil fiind colonizată dintr-un singur
refugiu glaciar, prezintă o diferențiere mai mică genetică între populații, contrar zonei Central
Europene în care recolonizarea s-a realizat din mai multe centre, existând, mai ales în zona Alpilor,
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
8
diferențe genetice mari între populații. Carpații estici și munții de sud ai Bulgariei au fost probabil
surse adiționale de expansiune în Holocen, identificându-se valori mai scăzute ale variației
genetice (Latalowa și Van der Knaap, 2006; Feurdean et al., 2007).
2.2. Principalele caracteristici ecologice, diversitatea fenotipică și rasială
2.2.1. Morfologia și ecologia
Genul Picea A. Dietr. aparține familiei Pinaceae, o familie ce include și alți taxoni importanți ai
coniferelor cum ar fi cei din genurile Pinus, Abies și Larix. Morfologia molidului este în strânsă
legătură cu sistematica, genetica și ecologia lui. Specia are un polimorfism ridicat corespunzând cu
vasta împrăștiere a arealului natural din Scandinavia si Siberia până în sudul Europei (Przybylski
în Tjoelker et al., 2007). Molidul este una din cele mai răspândite specii din Europa. În coordonate
geografice acesta se întinde de la 41o15’ latitudine N până la 72
o15’ lat. N acoperind 31 de grade.
În longitudine se întinde de la 5o15’ E până la 154
o E (Tjoelker et al., 2007). În altitudine urcă până
la peste 2000m în Alpii Italieni, și coboară până la nivelul mării. Molidul apare în lanțurile
muntoase din centrul și sud-estul Europei, ținuturile joase din estul Europei și Peninsula
Scandinavă (Boratynska în Tjelker et al., 2007).
Figura 2.1 Arealul natural și de cultură al molidului în România (Șofletea și Curtu, 2007)
Natural and artificial distribution of Picea abies in România (Șofletea and Curtu, 2007)
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
9
Distribuția arealului natural și de cultură al Molidului în România se prezintă în figura 2.1. În
Romania în urma managementului defectuos arealul de cultură s-a extins mult față de arealul
natural, problema extinderii molidului înafara arealului natural se observă și în figura 2.1. În
prezent se estimiază că aproximativ 360000 ha de plantații de molid sunt instalate înafara arealului
(Șofletea și Curtu, 2007) rezultând arborete afectate de doborâturi de vânt, rupturi de zăpadă și
atacuri ale insectelor.
În România, molidul este considerat o specie de bază, ocupând peste 24 % (1.407.000 ha) din
suprafaţa pădurilor şi peste 35 % din volumul total al lemnului pe picior (Şofletea şi Curtu, 2007).
Suprafaţa cea mai mare a molidișurilor este concentrată în Carpaţii Orientali (figura 2.1), mai ales
în bazinele superioare ale Bistriţei, Vişeului, Someşului, Oltului, Trotuşului. În zona Carpaţilor de
Curbură arealul său se îngusteză, iar în Carpaţii Meridionali se fragmenteză considerabil,
concentrându-se în zonele înalte (Şofletea şi Curtu, 2007).
2.2.2. Diversitatea ecotipică și rasială
Molidul prezintă o mare variație intraspecifică. Numărul variantelor intraspecifice morfologice
și fiziologice descrise este cel mai mare dintre speciile genului, existând aproximativ 140 de
varietăți și forme (cultivate) cunoscute (Tjoelker et al., 2007). Cel mai important aspect al
taxonomiei speciei îl reprezintă relația dintre molidul comun (Picea abies) și molidul siberian
(Picea obovata). Studiile privind taxonomia speciei le-au tratat pe de o parte ca specii diferite
(Farjon, 2001), dar și ca subspecie geografică pentru molidul siberian.
Diferite forme ale coroanei sunt deseori întâlnite în populațiile montane. Molidul columnar are
o coroana îngustă și acoperă porțiuni mai mari din trunchi. Aceste exemplare întâlnite în
populațiile de înaltă altitudine sunt presupuse a fi mai eficiente în interceptarea razelor solare la
poziții joase ale soarelui, pentru o mai bună producție de biomasă (Pulkkinen, 1991). Corelațiile
morfo-ecologice-biologice la molid sunt evidente, multe dintre ele fiind foarte expresive. Coroana
piramidală până la columnară, cu vârful ascuțit la vârste înaintate, constituie o bună adaptare
pentru a mări rezistența molidului față de zăpezile abundente din aria sa de răspândire. Excelente
performanțe adaptative a dobândit în acest sens molidul columnar (Picea abies var. columnaris
(Jacques) Rehd.), întâlnit în Apuseni, unde se știe că zăpezile sunt abundente (Pârnuță, 1998).
În funcţie de caracteristicile climatice şi edafice locale se pot diferenţia o serie de populaţii
diferențiate adaptativ sub aspectul climatipului şi edafotipului (Stănescu et al., 1997), cum ar fi:
molidişurile adaptate la cantităţi reduse de precipitaţii, dar rezistent la climat aspru; molidişurile
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
10
din ţinuturile vestice ale ţării (munţii Poiana Ruscă), adaptate la un climat termic moderat;
molidişurile de mare altitudine; molidişurile de mică altitudine; molidişurile situate pe stâncării (în
special pe cele calcaroase); molidul de luncă, adaptat la un regim pedohidrologic special și
molidişurile de turbărie.
2.3. Conservarea resurselor genetice de molid
Exploatările excesive, poluarea mediului și modificările climatice amenință diversitatea
pădurilor. De-a lungul cursului filogenezei, arborii forestieri au dezvoltat strategii impresionante
pentru supraviețuire. Aceștia sunt caracterizați de o longevitate ridicată, produc o mare cantitate de
progenituri, dar care sunt supuși mai ales în primii ani de viață unei selecții severe. Datorită acestor
aspecte arborii vor putea supraviețui doar printr-o adaptare la schimbările mediului. Evoluția
mediului de azi întinde sistemul genetic la limită, fiind nevoie de o mai mare adaptare genetică a
speciilor pentru supraviețuirea lor, conservarea diversității genetice devine primordială (Hattemer,
1995). Scopul conservării resurselor genetice forestiere este de a asigura adaptabilitatea
populațiilor și speciilor într-un mediu în continuă schimbare, prin menținerea unui nivel
corespunzător de variabilitate genetică (Enescu et al., 1997).
În România în perioada 1993-1996 în cadrul I.C.A.S. s-au desfășurat lucrări pentru identificarea
și descrierea Resurselor Genetice Forestiere prin întocmirea Catalogului Național al Resurselor
Genetice Forestiere, Partea I, ediția 1996 (Lalu, 1996). Mai recent, ca urmare a necesității
revizuirii catalogului elaborat în 1996, pe baza rezultatelor științifice obținute în cadrul proiectului
COREGE FOREST și a datelor de specialitate din literatura autohtonă și internațională s-a elaborat
noua ediție a Catalogului Național al Resurselor Genetice (Pârnuță et al., 2011).
Situația resurselor genetice forestiere la molid din România este prezentată în tabelul 2.1.
Tabelul 2.1. Situația resurselor genetice forestiere la molid pe sectoare ecologice (după Pârnuță, 2011)
Norvay spruce forest genetic resouces by forest formations (after Pârnuță, 2011)
Nr.
crt.
Simbol
sector Denumirea formației forestiere
Numărul
nucleelor de
conservare
Suprafața %
1 10 Molidișuri 31
2514.4 19.46
2 1Be Molidișuri de limită altitudinală superioară, pure
sau în amestec
2
3 1Ce Molidișuri pe soluri mlăștinoase 1
4 1D Laricete și lariceto-molidișuri 3
5 1E Cembrete și cembreto-molidișuri 3
6 20 Păduri de amestec de fag cu rășinoase 48
7 30 Făgete montane 1
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
11
2.4. Estimarea variaţiei genetice cu ajutorul markerilor biochimici primari
(izoenzimele)
Studiul variabilității genetice cu ajutorul izoenzimelor permite o evaluare indirectă a statutului
resurselor genetice, deoarece izoenzimele reprezintă produși ai funcționării și decodificării genelor.
Acești markeri genetici permit estimarea heterozigoției, rata mutaților, fluxul de gene și
diferențierea genetică, astfel oferindu-se un răspuns mai obiectiv privind numărul optim al unei
populații și distribuția ei. Izoenzimele sunt de obicei rezultatul duplicării genelor. În timpul
evoluției, dacă funcția noii variante rămâne identică față de cea originală, atunci este foarte
probabil ca una sau cealaltă să se piardă prin acumularea mutaților, rezultând o pseudogenă. Dar
dacă mutația nu împiedică imediat enzima să funcționeze, ba chiar îi modifică funcția, atunci
ambele variante pot fi favorizate de selecția naturală și devin specializate în diferite funcții. Totuși
o reală amplitudine a diversității genetice utilizând un număr fix de markeri genetici izoenzimatici
este dificil de cuantificat. În ciuda acestor limitări, markerii izoenzimatici sunt valoroși în studiile
de conservare, ajutând la evaluarea diversității genetice a populațiilor. Ca atare, izoenzimele sunt
indicatori ai diversității genetice ce și-au dovedit valoarea în numeroase studii (Geburek, 1997;
Hamrick et al.,1992; Crawford, 1989). Aceștia se utilizează și în descrierea unor modele de
variație, în monitorizarea schimbărilor genetice din procesul evolutiv (Luo et al., 2005; Vicario et
al., 1995). Evidențierea structurii genetice între indivizi și între populații este esențială pentru
dezvoltarea strategiilor durabile în managementul și conservarea resurselor genetice (Luo et al.,
2005).
2.5. Evaluarea structurii genetice spaţiale a populaţiilor
Analiza diversității genetice într-un context spațial poate oferi o mai bună înțelegere a dinamici
populației iar rezultatele pot fi aplicate și în conservarea genetică (Escudero et al., 2003).
Distribuția spațială a genotipurilor este un produs al influenței mediului, inclusiv a modificărilor
cauzate de activitățile umane (Knowles et al., 1992). Conceptul de autocorelaţie spaţială nu este
unul nou în domeniul cercetării evoluţiei şi ecologiei (Sokal şi Oden, 1978), fiind o metodă din ce
în ce mai folosită în identificarea structurii spaţiale a genotipurilor. Mai nou, odată cu evoluația
tehnicilor de prelucrare a datelor şi a softurilor spaţiale statistice s-au creat oportunităţi pentru
aplicarea analizelor de diversitate genetică la nivel microspațial (Manel et al., 2003; Sheldeman et
al., 2010). Sistemele Informatice Geografice (GIS) oferă noi oportunităţi de calcul și interpretare a
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
12
variaţiei genetice la nivel spaţial, putându-se realiza o interpolare a parametrilor genetici între
populaţii, precum şi la nivel microspațial între indivizi (Kozack et al., 2008; Hoffman et al., 2003).
O mai bună cuantificare și evidențiere a interacțiunii între genom și mediu, în timp și spațiu, duce
la o mai bună înțelegere a dinamicii și evoluției.
Structura genetică a unei populații a fost în primul rând studiată prin estimarea deviației față de
așteptările panmictice pentru frecvența alelelor sau, testând heterogenitatea frecvențelor alelice
între populații (Heywood, 1991), ceea ce implică faptul că informația genetică la nivel de individ
este grupată în diferite modele spațiale de natură biologică (populații, subpopulații) -Escudero et
al., 2003.
Un important studiu realizat la molid de către Maria Teodosiu (Teodosiu, 2011) a indicat pentru
prima dată existența unei structuri genetice spațiale în populațiile de molid din România.
Autocorelația spațială a fost studiată prin analiza globală, iar rezultatele au fost concretizate într-o
corelogramă. Studiul autocorelației spațiale în populațiile de molid din România a arătat influența
ecosistemului asupra tiparelor de distribuție spațială a genotipurilor (Teodosiu, 2011).
2.6. Rezultate ale studiilor privind evaluarea variabilității genetice a molidului cu
ajutorul markerilor biochimici primari
Pe plan internaţional, studiile genetice asupra molidului sunt foarte numeroase, ele referindu-se
la o serie întreagă de aspecte, cum ar fi: diversitatea genetică, modelele macro şi microspaţiale de
variaţie, sistemul de încrucişare, dezechilibrul genic evaluat pentru perechi de gene etc. (e.g.
Geburek et al.,1998, Perry et al., 1999). La speciile de arbori s-a observat o variație mai mică a
aloenzimelor comparativ cu animalele sau alte tipuri de plante (Hamrick et al., 1992), iar
polimorfismul rezultat în urma cercetărilor este cu preponderență în interiorul populațiilor, între
populații evidențiindu-se o diferențiere foarte slabă (Hamrick et al., 1992, Muller-Starck et al.,
1995, Hamrick 2004).
În țara noastră, contribuţii la studiul variabilităţii genetice a molidului cu ajutorul markerilor
izoenzimatici, în populaţii montane din Masivul Postăvarul, au fost aduse de către Stănescu şi
Şofletea (1992). Analize mai noi au fost desfășurate în Piatra Craiului (Curtu, 2003). De asemenea,
au fost desfășurate importante studii privind variabilitatea genetică a molidului în populații de
molid din Obcinele Bucovinei (Teodosiu, 2011).
Structura genetică a molidului şi variația izoenzimelor a fost studiată de către Lagercrantz şi
Ryman (1990). Aceştia au realizat studiul în 70 de populaţii naturale din cadrul arealului molidului
din Europa. Studiul a vizat 22 de loci izoenzimatici. La fel ca majoritatea rășinoaselor, molidul a
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
13
arătat o mare variabilitate genetică, dar o mică diferenţiere între populaţii. Media heterozigoției per
populație este de 0.115. Aproximativ 5% din diferenţierile genetice sunt între populaţii iar distanţa
genetică este sub 0.04 în toate cazurile. Se sugerează faptul că structura populaţiilor reflectă
evenimente istorice recente corelate cu ultima glaciaţiune, iar molidul este încă în proces de
adaptare şi diferenţiere. Într-o concluzie, autorii indică o împărţire geografică a variaţiei alelelor,
afimând faptul că peste 80% din variaţia frecvenţei acestora se explică prin poziţia geografică.
În Carpaţii Ucrainieni, Korshikov şi Privalikhin (2007), au studiat structura genetică în
populaţii de Picea abies. S-a studiat diversitatea genetică şi diferențierea a nouă populaţii de molid
cu ajutorul analizei izoenzimelor. S-au analizat 20 de loci la nouă sisteme izoenzimatice şi s-au
identificat 71 de variante ale alelelor.
Variabilitatea genetică a molidului este studiată de Giannini et al. (1991) în populaţiile din
Italia la 21 de loci pentru care s-a calculat un nivel al heterozigoției He=0.165.
În populaţiile naturale din Letonia structura genetică, diversitatea şi diferenţierea molidului au
fost studiate de Goncharenko et al. (2005). Studiul s-a realizat în 5 populaţii naturale și pentru 16
sisteme izoenzimatice ce au codificat 26 de loci.
Muller-Starck (1995) a studiat 20 populaţii autohtone localizate în zone montane şi submontane
ale Elveţiei.
La 15 proveniențe ce fac parte din programul internațional IUFRO 1964/1968, Kannenberg și
Gross, 1999 a studiat variabilitatea genetică. Studiul s-a realizat la 10 enzime având un total de 19
loci. Proveniențele acopereau o largă răspândire a arealului (sudul Franței, nordul Greciei, Carpații,
Slovacia, estul Poloniei, vestul Siberiei și Scandinavia).
3. Scopul și obiectivele cercetărilor
3.1. Scopul cercetărilor
Scopul temei de cercetare îl reprezintă studiul variației genetice a molidului [Picea abies (L.)
Karst] din populații autohtone cuprinse în rețeaua NATURA 2000, cu ajutorul markerilor
biochimici primari (izoenzime). Distribuția geografică a populațiilor/metapopulațiilor eșantionate
permite evaluarea diversitații genetice globale a molidului din Carpații României la nivel
populațional și interpopulațional, în vederea certificării valorii genetice a acestora și a furnizării
datelor genetice care să fie folosite în stabilirea și derularea măsurilor de management pe termen
lung în aceste arii protejate, care să asigure conservarea resurselor genetice forestiere.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
14
În evaluarea distribuției variației genetice a molidului la nivel european, pentru zona Carpaților
României nu existau suficiente date genetice, studiul diversității genetice și evaluarea prin markeri
cu putere mare de analiză fiind într-o fază incipientă.
De asemenea, datele obținute privind nivelul diversității intra și intepopulaționale vor putea fi
folosite pentru fundamentarea cercetărilor viitoare de ameliorare genetică a molidului, ori pentru
formularea de recomandări în controlul transferului de materiale forestiere de reproducere în
România.
3.2. Obiectivele urmărite
Pentru atingerea scopului enunțat s-au stabilit patru obiective de cercetare, după cum urmează:
- evaluarea diversității genetice intra și interpopulaționale în populaţii/metapopulații
autohtone reprezentative de molid cu ajutorul markerilor biochimici primari (izoenzime);
- analiza comparativă a structurii genetice a molidului în populații departajate altitudinal,
pentru a cuantifica posibile influențe ale gradientului altitudinal asupra variației genetice
izoenzimatice;
- analiza comparativă a structurii genetice a molidului din metapopulația Apuseni între
populații statistice particularizate sub aspect ecotipic (molidul de turbărie) și biotipic (Picea abies
var. columnaris), în comparație cu molidul cu coroană normală (Picea abies var. pyramidalis);
- analiza structurii genetice la nivel microspațial, prin studiul autocorelației spațiale globale
și locale, respectiv prin implementarea metodelor GIS.
4. Materialul şi metodele de cercetare
4.1. Localizarea cercetărilor
Pentru atingerea obiectivelor propuse s-a recoltat material biologic din 11 populații autohtone
de molid. Acestea sunt repartizate în șase zone geografice de studiu, reprezentative pentru arealul
molidului în România (figura 4.1.)
Pentru studiul variabilității genetice s-a avut în vedere ca arboretele eșantionate să fie mature,
bine conformate și sănătoase. S-au ales populații de altitudine mare pentru arealul natural al
molidului din România, acestea fiind mai puțin influențate de factorul antropic și implicit având un
grad mare de naturalețe. Cele 11 populații selectate pentru studiul variabilității genetice sunt
incluse în ariile protejate din rețeaua NATURA 2000.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
15
Populațiile și metapopulațiile eșantionate în cadrul studiului sunt distribuite relativ uniform
după cum urmează: i) două populații în Metapopulația Maramureș; ii) o populație în Munții
Nemira; iii) două populații în metapopulația Postăvarul; iv) două populații în munții Parân; v) o
populație în Munții Poiana Ruscă și vi) trei populații în Munții Apuseni.
Figura 4.1. Distribuția geografică a populațiilor/metapopulațiilor analizate
Geographical distribution for the analyzed populations/metapopulations
Pentru analiza comparativă a variabilității genetice în populații individualizate ecotipic și/sau
biotipic, din interiorul a patru zone de studiu denumite în continuare metapopulații, s-au recoltat
probe dintr-un total de nouă populații. Astfel, în metapopulațiile Maramureș, Postăvarul și Parâng
s-au eșantionat arborii din câte două populații aflate la altitudini diferite. În cea de-a patra
metapopulație (Apuseni) s-au studiat trei populații statistice: i) o populație de molid de turbărie –
APS-1; ii) o populație de molid columnar (Picea abies var. columnaris); iii) o populație de molid
cu coroană normală (Picea abies var pyramidalis). Populațiile din cadrul unei metapopulații se află
la distanțe de aproximativ 2 km una față de alta.
Analiza structurii genetice microspațiale s-a realizat la trei populații: Postăvarul-culme, Poiana
Mică (ambele făcând parte din metapopulația Postăvarul) și populați Nemira.
4.2. Recoltarea materialului de cercetare
Din fiecare populație studiată s-a recoltat material biologic, lujeri de 10-20 cm bogați în
muguri, din arbori bine conformați cu o stare de sănătate bună. Recoltarea probelor s-a realizat în
perioadele de repaus vegetativ din 2009 până în 2011. Probele biologice s-au recoltat cu ajutorul
unei foarfeci telescopice de 7 m. Numărul de arbori din care s-a recoltat material biologic a variat
între 30 de exemplare în populația de molid cu coroana columnară din Munții Apuseni (valoare
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
16
minimă determinată de raritatea exemplarelor acestui biotip) și 100 exemplare în populația Nemira
(MNR). Un număr de 30 de arbori per populație se consideră suficient pentru surprinderea unui
procent ridicat al variației genetice (Leberg, 2002), dar în cercetările noastre mărimea
eșantionajului a fost în cele mai multe cazuri de 50-60 probe/populație. În total s-au recoltat probe
biologice pentru analize genetice din 695 arbori de molid.
Pentru a evita sau reduce posibilitatea recoltării de probe din arbori proveniți din regenerarea
din sămânță a aceluiași exemplar mamă, s-au ales arbori aflați la distanțe de 30-50 m unii față de
alții sau chiar mai mult. Acest principiu de bază s-a avut în vedere pentru toate populațiile studiate.
Din totalul de 11 populații studiate la trei dintre ele (Nemira - NMR, Postăvarul culme - PST-1 și
Poiana Mică - PST-2) pentru studierea structurii genetice microspațiale arborii au fost cartați cu
ajutorul unui GPS cu o precizie de 3-7 m.
4.3. Metoda de lucru în laborator
Extragerea și evidențierea izoenzimelor are la bază procesul de electroforeză, care reprezintă
metoda de separare și analiză a moleculelor proteice în funcție de mărimea și încărcătura lor
electrică sub influența unui câmp electric uniform. Diferența în mobilitate a enzimelor poate fi
direct legată de modificări, mutația unui locus genic cauzată de schimbări în lanțul aminoacizilor
(Slatkin și Arter, 1991).
Deoarece izoenzimele prezintă sensibilitate pentru mediul de migrare, analiza izoenzimatică
s-a realizat prin procesul de electroforeză în plan orizontal, prin două sisteme de evidenţiere a
izoenzimelor: i)Tris; ii)Ashton. Protocolul de extragere, interpretare și codificare a izoenzimelor
prin metoda de electroforeză orizontală a fost cel standard (Konnert şi Werner, 2004). S-au analizat
în total 12 sisteme izoenzimatice: Phosphoglucozo-izomeraza (PGI) E.C.5.3.1.9.,
Leucinaminopeptidaza (LAP) E.C.3.4.11.1, Aspartataminotransferaza sau
glutamatoxaloacetatranaminaza (AAT, GOT) E.C.2.6.1.1, Glutamatdehidrogenaza (GDH)
E.C.1.4.1.2, Menadionreductaza (MNR) E.C.1.6.99.2, Formiatdehidrogenaza (FDH) E.C.1.2.1.2
pentru sistemul enzimatic Ashton (ph=8,1) și Aconitaza (ACO) E.C.4.2.1.3, Isocitratdehidrogenaza
(IDH) E.C.1.1.1.42, Malatdehidrogenaza (MDH) E.C.1.1.1.37, Phosphogluzomutaza (PGM)
E.C.2.7.5.1, Shikimatdehidrogenaza (SKDH) E.C.1.1.1.25, 6-Phosphogluconatdehidrogenaza (6-
PGDH) E.C.1.1.1.44 pentru sistemul enzimatic Tris (pH=7,0). Ca urmare a analizei și interpretării
zimogramelor a 12 sisteme enzimatice pentru o parte din ele s-au constatat dificultăți de
interpretare a benzilor electroforetice. Astfel pentru analizele și calculul parametrilor diversității
genetice s-au folosit datele din analiza a doar șapte sisteme enzimatice, ce au indicat un nivel
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
17
ridicat de încredere în interpretarea benzilor electroforetice. Pentru analiza acestor sisteme
enzimatice s-au identificat 12 loci ce sunt codificați de 38 de variante alelice. Aceștia sunt
prezentatați în tabelul 4.1.
Metoda de laborator a electroforezei, colorarea și identificarea izoenzimelor presupune o
metodologie de lucru amplă, realizată pe durata a 6-7 ore pentru un ciclu electroforetic. Întreaga
metodologie și succesiune a etapelor de lucru a fost cea standard (Konnert și Werner, 2004).
Tabelul 4.1. Sistemele enzimatice studiate
Studied enzyme systems
Nr.
Crt. Sistemul enzimatic
Nomenclatura
E.C.
Locusul
genic
Sistemul de
separare
1 Phosphoglucozo-izomeraza (PGI) E.C.5.3.1.9 Pgi-A
Ashton
Pgi-B
2 Glutamatoxaloacetatranaminaza
(GOT) E.C.2.6.1.1
Got-A
Got-B
Got-C
3 Glutamatdehidrogenaza (GDH) E.C.1.4.1.2 Gdh-A
4 Formiatdehidrogenaza (FDH) E.C.1.2.1.2 Fdh-A
5 Isocitratdehidrogenaza (IDH) E.C.1.1.1.42 Idh-A
Tris Idh-B
6 Phosphogluzomutaza (PGM) E.C.2.7.5.1 Pgm-A
Pgm-B
7 Shikimatdehidrogenaza (SKDH) E.C.1.1.1.25 Skdh-A
4.4. Analiza și interpretarea parametrilor variabilității și diversităţii genetice
Studiul diversității genetice pentru populațiile de molid implică descrierea variației genetice
inter și intrapopulaționale, estimarea relațiilor genetice între populații și în final redarea expresiei
acestor relații.
Descrierea variației genetice în interiorul populațiilor s-a realizat prin calcularea
principalilor parametrii ai variației genetice (proporția locilor polimorfi (P), numărul mediu de
alele pe locus (Na), numărul efectiv de alele pe locus (Ne), heterozigoția așteptată (Ho),
heterozigoția observată (He), indicele de fixare, echilibrul Hardy-Weinberg, indicele bogăției
alelelor (A)) pentru fiecare populație în parte. Majoritatea indicilor (frecvența alelelor, P -
proporția locilor polimorfi, Na - numărul mediu de alele per locus, Ne - numărul efectiv de alele
per locus, Ho - heterozigoția observată, He - heterozigoția așteptată și F - indicele de fixare) s-au
calculat cu ajutorul softului GenAlEx 6.2 (Peakall și Smouse, 2006). Indicele bogăției alelelor (A)
s-a determinat cu ajutorul softului FSTAT 2.9.3.2 (Goudet, 1995). Acesta estimează numărul de
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
18
alele independent de mărimea populației. Deviația standard de la starea de echilibru Hardy-
Weinberg s-a estimat folosind testul 2 , realizat cu ajutorul softului POPGENE 1.3.1 (Yeh și
Yang, 1999).
Analiza variației genetice între populații s-a realizat prin calcularea unor serii de parametri
genetici (parametrii statistici F (Wright, 1965), analiza moleculară a variației genetice (AMOVA))
care estimează nivelul de variație genetică între populații și în interiorul populațiilor. Cu ajutorul
softului GenAlex 6.2, parametrii statistici F (Wright, 1965) s-au calculat pentru fiecare locus la
fiecare populație. Prin analiza moleculară a varianței (AMOVA) s-a examinat distribuția variației
moleculare în două componente: în interiorul populațiilor și între populații. Valorile indicelui de
diferențiere Fst s-a calculat ca medie totală pentru toate populațiile studiate cu ajutorul softului
Arlequin 3.5.1.2 (Exoffier et al., 2005). Valorile Fst s-au testat prin permutarea genotipurilor
individuale între populații. Valoarea P s-a calculat pentru 10000 de permutări.
Estimarea relațiilor genetice între populații s-a realizat prin calcularea distanțelor genetice
conform Cavalli-Sforza și Edwards.
Distanțele genetice reprezintă gradul deosebirii structurilor genetice a două sau mai multe
populații. Pentru calcularea distanțelor genetice s-a folosit metoda Cavalli-Sforza și Edwards.
Reprezentarea expresiilor relațiilor genetice s-a realizat prin procesul de grupare a
populațiilor în categorii bazate pe relațiile genetice comune. Expresia relațiilor genetice s-a realizat
prin construirea dendrogramei UPGMA folosind POPULATION 1:2.3.2 (Langella, 1999) și
estimarea izolării prin distanță a populațiilor cu ajutorul testului Mantel folosind GenAlEx 6.2
(Peakall și Smouse, 2006).
Dendrograma UPGMA s-a construit prin gruparea ierarhică a populațiilor pe baza distanțelor
genetice Cavalli-Sforza și Edwards.
Testul Mantel evaluează corelația dintre două matrici de distanțe (distanțe genetice și distanțe
geografice). Valoarea nulă indică inexistența unei corelați între cele două matrici. Coeficientul de
corelație Pearson (r) se folosește pentru a estima nivelul de încredere al corelației. Valoarea
coeficientului „r” variază între -1 și 1.
4.5. Structura spaţială a variaţiei genetice
4.5.1. Metode utilizate pentru analiza spațială a structurii genetice
Metoda autocorelaţiei genetice spaţiale analizează gradul de dependenţă între variațiile alelelor
arborilor analizaţi dintr-un spaţiu geografic. Testele de analiză spaţială includ în mod clasic
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
19
indicele Moran şi Geary. Distribuţia microspaţială a locilor s-a determinat prin metoda
autocorelatiei, prin calcularea coeficientului de autocorelare „r” care este foarte apropiat de
indicele statistic Moran I.
Autocorelaţia spaţială a fost determinată printr-o serie extinsă de analize realizate cu programul
GenAlEx 6.41 (Peakall şi Smouse, 2006). Indicele de corelaţie „r”, care arată legătura dintre
distanțele genetice şi cele geografice a fost calculat prin intermediul a două teste statistice:
autocorelaţia spaţială globală şi analiza locală a autocorelației spaţiale raportată la o suprafaţă
bidimensională (2DLSA).
Autocorelaţia spaţială globală determină apropierea genetică dintre perechi de indivizi separaţi
geografic pe clase de distanţe. Coeficientul de autocorelaţie spațială „r” are valori între -1 şi 1 şi
este asemănător indicelui Moran I. Metoda presupune permutarea aleatorie a tuturor indivizilor
dintr-o clasă geografică sub aspectul inexistenței unei structuri spațiale. Rezultatele obținute sunt
însumate într-o corelogramă.
Analiza locală a autocorelației spaţiale raportată la o suprafaţă bidimensională (2DLSA)
extinde metoda de investigare a autocorelaţiei la nivel local, de individ. Metoda este similară cu
procedurile şi testele statistice introduse de Anselin (Anselin, 1995) şi extinse de Ord şi Getis
(Ord şi Getis, 1995) şi Sokal (Sokal et al., 1998). Aceasta, spre deosebire de autocorelația spațială
globală, se calculează pentru grupuri de indivizi dintr-o populaţie, care se regăsesc în jurul unei
valori pivot. Această metodă poate surprinde grupări ale genotipurilor și în lipsa prezenței unei
autocorelații spațiale semnificative globale.
4.5.2. Utilizarea sistemelor informatice geografice (GIS) în analiza structurii genetice
spaţiale
Analiza structuri genetice spațiale s-a studiat cu ajutorul testului Anselin Local Moran’s I cu
ajutorul softului ArcGis (Mitchell, 2005; Anselin, 1995). Această metodă permite identificarea
unor zone de aglomerare ale indivizilor ce prezintă valori similare. În cazul studiului nostru această
valoare s-a stabilit prin gruparea locilor studiați pentru fiecare exemplar, formându-se un șir
genetic unic format din 24 de caractere. Aceste genotipuri s-au ordonat și li s-a alocat un număr
unic. Pentru fiecare valoare a autocorelației spațiale identificată la nivel de individ s-a calculat
gradul de semnificație statistic (P). Testul autocorelației spațiale Anselin Moran’s I identifică atât
corelațiile pozitive ale autocorelației spațiale cât și cele negative. Valorile negative indică un model
spațial dispersat, pe când cele apropiate de zero sunt specifice unei distribuții genetice spațiale
randomizate.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
20
5. Rezultatele cercetărilor
5.1. Evaluarea diversității genetice în populații autohtone de molid din cuprinsul
rețelei NATURA 2000 cu ajutorul markerilor biochimici primari
5.1.1. Lecturarea zimogramelor
Procesul de electroforeză permite diferențierea variantelor izoenzimatice în funcție de distanța
de migrare între cei doi poli ai electrolitului, dependentă de masa moleculară a enzimelor. În acest
mod, lecturarea zimogramelor are ca rezultat realizarea corespondenței exacte dintre izoenzime și
alele. Astfel, prin analiza materialului extras din muguri (2n) arborii vor fi pentru locii genici
codificatori fie homozigoți (A1A1, A2A2), fie heterozigoți (A1A2). Datorită particularităților
sistemelor enzimatice și a structurii enzimelor (monomere, dimere, polimere), calitatea interpretării
datelor a variat de la un sistem la altul. Totuși, cazurile de incertitudine au fost eliminate fie prin
includerea în baza de date doar a sistemelor enzimatice cu lecturare clară, fie prin recalibrarea
datelor efectuată prin utilizarea de probe de referință, ori prin evaluări de intercorelare. Pentru
analiza variabilității izoenzimatice s-au interpretat aproximativ 220 de zimograme.
Figura 5.1. Exemplu de zimogramă la sistemul enzimatic GOT
Zymograme example for GOT enzymatic system
5.1.2. Frecvența și distribuția alelelor în cadrul populațiilor de molid
În urma analizei electroforetice, pentru evaluarea comparativă a diversității genetice între
populațiile studiate, doar șapte sisteme enzimatice au arătat un grad ridicat al calității
interpretării zimogramelor. Acestea vor fi folosite în continuare în calculul parametrilor
genetici: Formiatdehidrogenaza (FDH) E.C.1.2.1.2., Glutamatdehidrogenaza (GDH)
E.C.1.4.1.2., Aspartataminotransferaza (GOT) E.C.2.6.1.1., Isocitratdehidrogenaza (IDH)
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
21
E.C. 1.1.1.42., Phosphoglucoza-Isomeraza (PGI) E.C.5.3.1.9., Phosphoglucomutaza (PGM)
E.C.2.7.5.1., Shikimatdenidrogenaza (SKDH) E.C.1.1.1.25. (tabelul 5.1).
La nivelul acestor șapte sisteme izoenzimatice s-au interpretat în total 12 loci genici: Fdh-A,
Gdh-A, Goa-A, Got-B, Got-C, Idh-A, Idh-B, Pgi-A, Pgi-B, Pgm-A, Pgm-B, Skdh-A, codificați de
38 de variante alelice. Din acestea, 15 (39.4%) sunt comune la toate populațiile studiate. Locii cu
cele mai multe variante alelice au fost Pgm-A și Pgi- B, cu câte 4 alele iar Skdh-A cu 5 variante
alelice.
Tabelul 5.1. Frecvențele relative ale alelelor pentru fiecare locus la toate populațiile studiate
Alleles relative frequencies for each locus for all studied populations
Locus Alela APS-1 APS-2 APS-3 NMR PRG-1 PRG-2 PRS PST-1 PST-2 MMS-1 MMS-2
Fdh-A 1 0.000 0.000 0.017 0.000 0.017 0.025 0.008 0.000 0.000 0.006 0.000 2 1.000 1.000 0.983 1.000 0.983 0.975 0.992 1.000 1.000 0.994 1.000
Gdh-A
2 0.950 0.933 0.983 0.965 0.950 0.933 0.953 0.951 0.990 0.976 0.987
3 0.050 0.050 0.017 0.035 0.050 0.067 0.047 0.049 0.010 0.024 0.013
4 0.000 0.017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Got-A
2 0.008 0.033 0.008 0.015 0.000 0.000 0.023 0.020 0.000 0.000 0.006
3 0.983 0.967 0.992 0.985 1.000 1.000 0.961 0.980 1.000 1.000 0.994
4 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.016 0.000 0.000 0.000 0.000
Got-B
1 0.000 0.000 0.008 0.015 0.017 0.000 0.000 0.000 0.010 0.024 0.026
2 0.992 1.000 0.992 0.950 0.967 1.000 1.000 1.000 0.990 0.976 0.968
3 0.008 0.000 0.000 0.035 0.017 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.006
Got-C
2 0.458 0.433 0.322 0.425 0.367 0.417 0.422 0.431 0.410 0.458 0.474
4 0.517 0.517 0.661 0.570 0.625 0.575 0.578 0.529 0.570 0.542 0.526
5 0.025 0.050 0.017 0.005 0.008 0.008 0.000 0.039 0.020 0.000 0.000
Idh-A
2 0.050 0.017 0.042 0.035 0.000 0.008 0.016 0.029 0.000 0.042 0.038
3 0.950 0.983 0.958 0.965 1.000 0.992 0.977 0.971 1.000 0.958 0.962
4 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
Idh-B
2 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.010 0.000 0.000
3 1.000 1.000 0.992 0.990 1.000 0.992 0.992 0.971 0.960 0.994 1.000
4 0.000 0.000 0.008 0.010 0.000 0.008 0.008 0.029 0.030 0.006 0.000
Pgi-A 2 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 1.000 0.990 1.000 1.000 1.000
3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.010 0.000 0.000 0.000
Pgi-B
1 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.030 0.030 0.026
2 0.333 0.483 0.237 0.300 0.367 0.483 0.336 0.206 0.300 0.259 0.321
3 0.658 0.517 0.754 0.690 0.633 0.508 0.648 0.775 0.660 0.699 0.641
4 0.000 0.000 0.008 0.010 0.000 0.000 0.016 0.020 0.010 0.012 0.013
Pgm-A
1 0.042 0.083 0.093 0.015 0.050 0.000 0.000 0.020 0.000 0.006 0.000
2 0.950 0.900 0.890 0.945 0.950 0.992 0.984 0.980 0.990 0.958 0.955
3 0.008 0.017 0.017 0.035 0.000 0.008 0.016 0.000 0.010 0.036 0.026
4 0.000 0.000 0.000 0.005 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.019
Pgm-B
1 0.025 0.000 0.000 0.000 0.000 0.033 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
2 0.975 1.000 1.000 1.000 1.000 0.967 0.992 0.990 0.990 0.988 0.974
3 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.010 0.010 0.012 0.026
Skdh-A
1 0.017 0.033 0.076 0.020 0.000 0.042 0.000 0.029 0.010 0.054 0.064
2 0.008 0.033 0.008 0.010 0.017 0.075 0.023 0.000 0.000 0.000 0.006
3 0.950 0.917 0.907 0.960 0.975 0.875 0.945 0.971 0.990 0.946 0.923
5 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.008 0.000 0.000 0.000 0.000
6 0.025 0.017 0.008 0.010 0.008 0.008 0.023 0.000 0.000 0.000 0.006
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
22
Per ansamblul celor 11 populații, nici un locus genic dintre cei interpretați nu a fost monomorf,
însă la locusul Pgi-A, alela A4 a prezentat variație doar în populația de culme Postăvarul (PST-1).
Pe de altă parte, separat în cazul populațiilor/metapopulațiilor au fost identificate cazuri de
monomorfism. Astfel, în populațiile APS-2 și PRG-1, a fost găsit cel mai ridicat număr de loci
monomorfi, iar cel mai scăzut număr de loci monomorfi (2) a fost identificat în populațiile APS-3,
PRS, PST-1 și MMS-1.
5.1.3. Analiza variabilității genetice izoenzimatice
5.1.3.1. Date sintetice genotipice și alelice
Ca urmare a adiționării genotipurilor identificate pentru toți locii analizați, pentru fiecare
exemplar a rezultat structura sa genetică de ansamblu, sub forma unui șir de genotipuri specifice
celor șapte sisteme enzimatice evaluate. Analiza acestor genotipuri cumulate la nivel individual a
arătat că pentru cei 695 arbori din eșantionul de studiu, există 116 (16,7%) variante genetice unice
(la nivelul celor 12 loci analizați). Patru combinații de genotipuri au fost cele mai frecvent
identificate la 62% din indivizii analizați. Pe baza numărului de genotipuri unice identificate în
fiecare locație de studiu s-a calculat un indicator ca raport între acest număr și mărimea
eșantionului din populația/metapopulația respectivă, în funcție de care s-a construit distribuția
geografică a acestor genotipuri unice cumulate (figura 5.2). Se constată că frecvența acestora este
mai mare pentru Munții Poiana Ruscă și Munții Apuseni, adică în zonele în care probabil s-a
realizat o izolare reproductivă mai mare față de fluxul genic din alte areale carpatice. Valoarea cea
mai mică a rezultat pentru metapopulația Munții Maramureșului, ceea ce indică o panmixie amplă
în zona respectivă în care este implicat fluxul de gene din zona Carpaților Nordici.
Figura 5.2. Distribuția spațială a
frecvenței genotipurilor unice
Spatial distribution of unique
genotypes frequencies
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
23
Pe de altă parte, cercetările efectuate au condus la identificarea în patru populații a cinci alele
particulare: alela Gdh-A-4 în populația de molid columnar APS-2; Idh-A-4 și Skdh-A-5 în
populația PRS; Pgi-A-3 în populația de culme PST-1 și Idh-B-2 în populația de joasă altitudine
PST-2.
Valorile parametrilor genetici pentru fiecare locus sunt prezentate în tabelul 5.2. Astfel, numărul
mediu de alele per locus (Na) a variat între 1.091 la locusul Pgi-A și 3.364 la locusul Skdh-A.
Numărul efectiv de alele pe locus (Ne) a înregistrat cea mai mică valoare tot la locusul Pgi-A
(1.002), respectiv valoarea cea mai mare s-a calculat la locusul Got-C (2.008). Valorile
heterozigoției așteptate, echivalentă cu diversitatea genetică, au păstrat același raport, cea mai
scăzută valoare fiind evidențiată la locusul Pgi-A (0.002) iar locusul Got-C a avut cea mai ridicată
valoare (0.501), fiind urmat de locusul Pgi-B (0.451). Indicele de fixare F a fost negativ la toți locii
studiați, indicând un exces de heterozigoți. Cea mai mare valoare a indicelui de fixare (F=-0.070)
s-a identificat la locusul Pgi-B.
Exceptând locusul Pgi-A, care a prezentat doar două variante alelice, din care una a fost
identificată la un singur exemplar, locii studiați au avut un nivel al heterozigoției cuprins între
1.3% (Fdh-A) și 50.0% (Got-C).
Tabelul 5.2. Parametrii diversității genetice calculați la nivelul locusului alelic
Genetic diversity parameters for each alelic locus level
Loci Na Ne Ho He F Fdh-A 1.455 1.013 0.013 0.013 -0.015 Gdh-A 2.091 1.082 0.078 0.074 -0.040 Got-A 1.818 1.026 0.025 0.025 -0.018 Got-B 1.909 1.031 0.030 0.029 -0.021 Got-C 2.727 2.008 0.509 0.501 -0.017 Idh-A 1.909 1.054 0.052 0.050 -0.032 Idh-B 1.727 1.021 0.020 0.020 -0.015 Pgi-A 1.091 1.002 0.002 0.002 -0.010 Pgi-B 3.091 1.834 0.482 0.451 -0.070
Pgm-A 2.636 1.099 0.092 0.087 -0.043 Pgm-B 1.636 1.023 0.022 0.022 -0.018 Skdh-A 3.364 1.128 0.117 0.110 -0.049
Na- numărul de alele per locus; Ne- numărul efectiv de alele per locus; Ho- heterozigoția observată; He-
heterozigoția așteptată; F- indicele de fixare.
5.1.3.2. Structura genetică în interiorul populațiilor
Pentru analiza comparativă a diversității genetice în cele 11 populații de molid, au fost calculați
cei mai importanți parametri ai diversității genetice, prezentați în tabelul 5.3. Cele 11 populații se
grupează în șase locații de studiu (zone geografice din arealul natural al molidului în România),
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
24
astfel că unele dintre aceste analizele s-au făcut atât la nivelul a 2-3 populații locale, cât și cumulat,
pentru metapopulația respectivă.
În medie, proporția de loci polimorfici pentru cele 11 populații a fost de 74.2% și a variat între
58.3% (APS-2 și PRG-1) și 83.3% (APS-3, PST-1, MMS-1 și PRS). Așa cum era de așteptat, se
constată o creștere a valorilor pentru acest parametru în populațiile formate dintr-un număr mai
mare de exemplare.
Pentru a elimina efectele mărimii diferite a eșantionajului în populațiile analizate, s-a calculat
parametrul statistic bogăția alelică (A). Cele mai mari valori au fost găsite în populația molidului
columnar APS-2 (2.00) și în populația molidului de turbărie APS-1 (1.94), ambele localizate în
metapopulația Apuseni. Cele mai mici valori ale parametrului bogăției alelice au fost identificate în
populațiile PRG-1 (1.67) și PST-2 (1.74).
În ceea ce privește nivelul heterozigoției așteptate (He), care desemnează mărimea diversității
genetice, un parametru foarte important pentru identificarea, conservarea și ameliorarea resurselor
genetice forestiere, rezultatele sunt extrem de interesante. În primul rând pentru faptul că valoarea
cea mai mare (He=0.134) s-a înregistrat în populația statistică de molid columnar din Munții
Apuseni (APS-2), în pofida faptului că acest biotip se regăsește prin exemplare sporadice în masa
cvasicontinuă de molid comun. Nivelul mediu al heterozigoției este de 11.5% în cele 11 populații,
fiind mai redus cu 14.2% față de valoarea cea mai mare înregistrată în populația APS-2. Cea mai
mică valoare a diversității genetice a fost înregistrată în populația de joasă altitudine din Masivul
Postăvarul (PST-2, He=0.096), fiind inferioară cu 16.5% față de media celor 11 populații, respectiv
cu 28.3% față de populația cu valoarea He cea mai mare.
Valoarea medie a indicelui de fixare indică un mic deficit de homozigoți pe ansamblul
populațiilor studiate (F=-0.033), dar și la nivelul fiecăreia dintre ele (tabelul 5.3.). Cea mai mare
deviație de la echilibrul Hardy-Weinberg (8.2% deficit de homozigoți ) a fost înregistrată în
populația de molid columnar din Munții Apuseni (APS-2).
Considerând populațiile dintr-o zonă geografică ca făcând parte dintr-o singură metapopulație,
afirmație plauzibilă datorită continuității arealului molidului în zonele geografice studiate, s-au
calculat parametrii diversității genetice și în cazul acestui sistem de referință. Așa cum era
previzibil, ca efect al colectivităților statistice majorate, în toate cele 4 metapopulații (APS, PRG,
PST și MMS), valorile proporțiilor locilor polimorfi și valoarea numărului de alele per locus a
crescut. Nu s-a modificat însă valoarea indicelui bogăției alelice, ceea ce reconfirmă utilitatea
determinării și interpretării acestuia în cazurile de variație a mărimii eșantionajului de analiză.
Cea mai mare diversitate genetică s-a identificat în metapopulația Apuseni, indicele
heterozigoției având o valoare de 0.125 (figura 5.3). Aceasta fiind urmată de metapopulația Parâng,
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
25
populația Nemira și metapopulația Maramures. Cele mai mici valori fiind identificate în populația
Poiana Ruscă și metapopulația Postăvarul. Valoarea medie a indicelui heterozigoției (He) calculate
pentru cele 6 regiuni de areal a fost însă identică cu cea determinată pentru ansamblul celor 11
populații, confirmându-se astfel corectitudinea determinărilor parametrilor genetici.
Analiza bogăției alelelor (A), parametru ce nu ține cont de mărimea populației, ne indică cele
mai ridicate valori în metapopulația Apuseni și populația Nemira. Deși nivelul valorii
heterozigoției a fost unul ridicat pentru metapopulația PRG aceasta se alătură metapopulației PST
și împreună indică cea mai scăzută valoare a bogăției alelelor (figura 5.4).
Indicele de fixare (F) calculat ca medie între cele șase zone de studiu a indicat un deficit mai
scăzut al homozigoților (F=-0.026) față de valoarea medie calculată pentru varianta de studiu cu 11
populații. Cea mai mare abatere de la echilibrul Hardy-Weinberg (3.7%) între cele șase locații a
fost înregistrată în cazul molidului din Munții Poiana Ruscă (PRS).
Populația cea mai apropiată de starea de echilibru Hardy-Weinberg a fost APS-2 cu o abatere
de doar 1.6%.
Tabelul 5.3. Parametrii diversității genetice calculați pentru fiecare populație și metapopulație
Genetic diversity parameters for each population and metapopulation
P sau M N P(%) Na Ne A Ho He F
APS-1 60 75.0% 2.250 1.205 1.944 0.126 0.122 -0.036
APS-2 30 58.3% 2.000 1.237 2.000 0.150 0.134 -0.082
APS-3 60 83.3% 2.250 1.176 1.922 0.123 0.117 -0.039
#APS 150 91.6% 2.667 1.205 1.955 0.130 0.125 -0.031
PRG-1 60 58.3% 1.833 1.178 1.665 0.113 0.106 -0.042
PRG-2 60 75.0% 2.083 1.218 1.816 0.133 0.126 -0.039
#PRG 120 83.3% 2.333 1.200 1.740 0.123 0.118 -0.030
PST-1 50 83.3% 2.000 1.175 1.870 0.109 0.106 -0.031
PST-2 50 66.6% 2.000 1.176 1.743 0.098 0.096 -0.016
#PST 100 91.6% 2.333 1.175 1.807 0.104 0.102 -0.017
MMS-1 83 83.3% 2.083 1.185 1.810 0.110 0.112 -0.013
MMS-2 78 75.0% 2.250 1.203 1.912 0.119 0.120 -0.016
#MMS 161 91.6% 2.500 1.194 1.861 0.114 0.116 -0.012
NMR 100 75.0% 2.333 1.187 1.923 0.119 0.116 -0.029
PRS 65 83.3% 2.250 1.188 1.897 0.121 0.112 -0.037
Media 63.2* 74.2%* 2.121* 1.193* 1.864* 0.120* 0.115* -0.033*
115.8** 86.1%** 2.403** 1.192** 1.864** 0.119** 0.115** -0.026*
* media valorilor parametrilor genetici între populații; ** media valorilor parametrilor genetici între
locațiile de studiu; # metapopulații
Na- numărul de alele per locus; Ne- numărul efectiv de alele per locus; Ho- heterozigoția observată; He-
heterozigoția așteptată; F- indicele de fixare.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
26
Figura 5.3. Distribuția spațială a marimii heterozigoției (He)
Heterozygosity spatial distribution
Figura 5.4. Distribuția spațială a bogăției alelelor (A)
Allelic richeness spatial distribution
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
27
5.1.3.3. Structura genetică interpopulațională
Diferențierea genetică a populațiilor s-a studiat prin estimarea indicelui Fst (Weir și Cockerham,
1984). Valoarea medie pentru populațiile de molid la nivelul ansamblului teritoriului Carpațiilor
României a fost foarte redusă (Fst=0.0092), sugerând existența unui nivel apreciabil de
uniformitate genetică la nivelul locilor enzimatici. Dealtfel, această constatare conduce la
concluzia că locii analizați sunt cu un nivel ridicat de neutralitate, conținând ca atare o valoare
selectivă redusă. Valorile indicelui de diferențiere Fst au fost calculate atât între cele 11 populații
statistice de molid, cât și între cele șase zone geografice de areal (tabelul 5.4.). Se observă o
variație a indicelui Fst de la numai 0.002 între populațiile din Munții Maramureș, până la 0.016
între populația de vale din Munții Parâng-PRG-2 și populația molidului cu coroană normală din
Munții Apuseni-APS-3. Valori mai mari ale diferențierii genetice (Fst=0.014 - 0.015) au fost
înregistrate între cele două populații din Masivul Postăvarul și populația molidului columnar din
Munții Apuseni (APS-2). Populația molidului columnar din Munții Apuseni (APS-2) s-a situat cel
mai aproape din punct de vedere genetic față de populația Poiana Ruscă (Fst=0.007).
Valorile recalculate ale indicelui de diferențiere între cele șase zone de studiu au variat numai
între 0.003 și 0.007, indicând un nivel ridicat de uniformitate la nivelul locilor izoenzimatici
analizați. Valorile Fst au indicat cel mai ridicat grad de diferențiere între metapopulațiile PRG și
NMR, PST și MMS (Fst=0.007).
Tabelul 5.4. Valorile indicelui de diferențiere Fst
Parweise Fst values for populations and for regions APS-1 0.000 ***** *APS *NMR *PRG *PRS *PST *MMS
APS-2 0.007 0.000 ***** 0.000 0.003 0.005 0.004 0.005 0.003 *APS
APS-3 0.008 0.013 0.000 ***** 0.000 0.007 0.004 0.004 0.003 *NMR
NMR 0.004 0.010 0.007 0.000 ***** 0.000 0.004 0.007 0.007 *PRG
PRG-1 0.007 0.010 0.010 0.006 0.000 ***** 0.000 0.004 0.005 *PRS
PRG-2 0.009 0.010 0.016 0.012 0.010 0.000 ***** 0.000 0.005 *PST
PRS 0.004 0.007 0.009 0.004 0.006 0.007 0.000 ***** 0.000 *MMS
PST-1 0.006 0.014 0.008 0.005 0.010 0.015 0.005 0.000 *****
PST-2 0.010 0.015 0.012 0.008 0.009 0.013 0.007 0.007 0.000 *****
MMS-1 0.004 0.011 0.006 0.003 0.008 0.012 0.005 0.005 0.007 0.000 *****
MMS-2 0.005 0.011 0.008 0.004 0.010 0.010 0.006 0.008 0.008 0.002 0.000
APS-1 APS-2 APS-3 NMR PRG-1 PRG-2 PRS PST-1 PST-2 MMS-1 MMS-2
*Valori calculate prin gruparea populațiilor pe regiuni geografice din arealul studiat
În tabelul 5.5. sunt prezentate valorile Fst calculate la 10000 de permutări pentru fiecare locus.
Se poate observa la locii Pgi-B, Pgm-A și Skdh-A prezența celor mai mari valori ale indicelui de
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
28
diferențiere Fst, indicând importanța acestor loci în diferențierea populațiilor. Valoarea medie Fst a
fost de 0.0092, indicând faptul că mai puțin de 1% din variația genetică este datorată diferențierii
între populații.
Structura diversității genetice în interiorul și între
populații a fost estimată cu ajutorul testului AMOVA
(figura 5.5), construit pe baza distanțelor genetice Nei, cu
ajutorul softului GenAlEx. Analiza moleculară a varianței
s-a efectuat atât între cele 11 populații studiate (a), cât și
între cele 6 regiuni geografice de existență a
populațiilor/metapopulațiilor (b). Testul AMOVA confirmă
valorile mici ale diferențierii între populații, de maxim 2%.
Prin luarea în calcul a metapopulațiilor se observă un nivel
chiar mai mic de diferențiere, de numai 1%, valoare
concordantă cu cea determinată pentru Fst.
a b
Figura 5.5. Analiza varianței moleculare (AMOVA)
Analysis of molecular variance (AMOVA)
Chiar dacă Fst și AMOVA au indicat nivele reduse de diferențiere genetică, s-a considerat utilă
o analiză de tip „cluster”, pe baza căreia se pot surprinde afinitățile genetice determinate de istoria
evoluției postglaciare a molidului din Carpații României. Astfel, dendrograma UPGMA (figura
5.6) construită prin calcularea distantelor genetice Cavalli-Sforza arată modul de grupare și
Între populații
2%
În interiorul populațiil
or98%
AMOVA-între populații- Între
regiuni1%
În interior
99%
AMOVA-între regiuni-
Tabelul 5.5. Valorile indicelui de
diferențiere Fst calculate la nivelul
fiecărui locus
Fst values for each locus
Locus Fst P(10000permutări)
Fdh-A 0.0043 0.40
Gdh-A 0.0025 0.60
Got-A 0.0050 0.31
Got-B 0.0089 0.06
Got-C 0.0002 0.90
Idh-A 0.0035 0.48
Idh-B 0.0056 0.25
Pgi-A 0.0021 0.73
Pgi-B 0.0188 0.00
Pgm-A 0.0175 0.00
Pgm-B 0.0079 0.08
Skdh-
A
0.0129 0.00
Media 0.0092 0.00
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
29
afinitățile genetice dintre populații la nivelul locilor genici studiați. Analiza a fost făcută la 10000
de permutări. Deși indicele de diferențiere a populațiilor Fst a arătat că populațiile sunt
asemănătoare din punct de vedere genetic în proporție de 99%, metoda de grupare ierarhică
(UPGMA) a populațiilor a reușit totuși să surprindă o grupare a populațiilor în trei ramuri. Un prim
grup este format din cinci populații (PRG-1, PRG-2, APS-1, APS-2 și PRS) cu areal în
partea de vest și sud-vest a Carpaților, un altul, excepție făcând populația APS-3, este localizat în
partea de est a Carpaților României,
iar al treilea este format din cele două
populații din Masivul Postăvarul. În
cadrul dendrogramei UPGMA, cu
excepția populațiilor (PRG-2 și PRS)
care s-au grupat împreună, cele mai
mici diferențe genetice au fost arătate
între populații apropiate geografic
(PST-1 și PST-2, MMS-1 și MMS-2,
APS-1 și APS-2). Totuși, doar în cazul
a două ramuri valorile „boostrap” au
depășit pragul statistic de 50% (figura
5.6)
În același context al analizei
structurilor genetice rezultate la nivel
macrospațial, corespondența dintre distanțele geografice și cele genetice a fost verificată prin
efectuarea testului Mantel, realizat la 9999 de permutări. Gradul izolării prin distanță s-a analizat
atât între cele 11 populații (figura 5.7 - a), cât și între cele șase zone geografice (figura 5.7 - b). Din
ecuația dreptei de regresie și a coeficientului R2
se observă că doar 4.6% din distanțele genetice
dintre populații sunt influențate de distanțele geografice (R2
=0.0456, p=0.080), în primul caz,
respectiv în proporție de numai 1,4% în cel de-al doilea caz. Valoarea mai mare a corelației între
distanțele genetice și cele geografice între cele 11 populații pare a fi neașteptată. Totuși, această
situație poate fi determinată de analiza realizată gradiental la nivelul metapopulațiilor PST, MMS
și PRG, între care au rezultat unele mici diferențe, acestea putând fi generate de presiunea selectivă
diferită în populații de mare și de mică altitudine din aceeași metapopulație.
Analizând corespondența distanțelor geografice cu cele genetice între cele patru metapopulații
(APS, PRG, PST, și MMS) și cele două populații (PRS, NMR) se poate observa o corelație mai
scăzută decât în cazul celor 11 populații R2=0.0135 (p=0.280).
Figura 5.6. Dendrograma UPGMA calculată pe baza
distanțelor genetice Cavally-Sforza
Unweighted Pair Group Method whith Arithmetic Mean
(UPGMA) based on Cavally-Sforza genetic distances
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
30
Valoarea coeficientului de corelație Pearson (R) s-a calculat pentru ambele cazuri între
distanțele genetice Cavalli-Sforza și distanțele geografice, metapopulațiile aflându-se la distanțe
cuprinse între 100 și 300 km.
a) între populații b) între regiuni
Figura 5.7. Corelația dintre distanțele genetice Cavalli-Sforza și distanțele geografice între
populații/metapopulații. Testul Mantel
Corelation between Cavalli-Sforza genetic distances and geographic distances for
populations/metapopulation. Mantel Test
5.1.4 Discuții
Nivelul diversității genetice identificat în populațiile de molid din România este similar cu cel
raportat la conifere (Hamrick et al., 1992). Totuși valorile identificate de noi sunt mai mici decât în
alte populații de molid din România (Teodosiu, 2011; Teodosiu în Mihai, 2009) precum și din
Carpații Ukainieni (Korshikov și Privalikhin, 2007). Comparațiile între rezultatele obținute în
diferite studii trebuie totuși făcute cu reținere deoarece fiecare analiză se bazează pe un set diferit
de markeri genetici și alele, etc. (Lagercrantz și Ryman, 1990). Deși numărul de loci (12) folosit în
cazul de față pentru descrierea variabilității genetice a molidului din România este mai mic
comparativ cu alte studii, cum sunt cele raportate de Lagercrantz și Ryman (1990), Krutovskii și
Bergmann (1995), proporția locilor polimorfi și numărul de alele per locus nu diferă foarte mult.
Ca și în alte studii, nivelul variației genetice s-a observat cu preponderență în interiorul
populațiilor, fiind foarte redus între acestea (Lewandowki și Burczyk, 2002; Korshikov și
Privalikhin, 2007; Goncharenko et al., 1995; Kravchenko et al., 2008).
S-au identificat cinci alele rare în populațiile de molid din România. Două alele (Idh-A-4 și
Skdh-A-5) au fost identificate în populația izolată din Poiana Ruscă, alte două în populațiile din
Masivul Postăvarul și una în populația molidului columnar din munții Apuseni (APS-1). Prezența
y = 1027,9x + 144,88R² = 0,0135
0,000
50,000
100,000
150,000
200,000
250,000
300,000
350,000
0,000 0,050 0,100
Dis
tan
țele
ge
ogr
afic
e
Distanțele genetice Cavalli-Sforza
Y
Linear (Y)
y = 1921,6x + 51,468R² = 0,0456
0,000
50,000
100,000
150,000
200,000
250,000
300,000
350,000
0,000 0,050 0,100
Dis
tan
țele
ge
ogr
afic
e
Distanțele genetice Cavalli-Sforza
Y
Linear (Y)
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
31
alelelor rare și particularitatea frecvențelor alelice din metapopulația Postăvarul poate explica
poziția separată din dendograma UPGMA a populațiilor din zona respectivă. Ca și în alte populații
din Europa (ex. 20 de populații din Elveția - Muller-Starck, 1995), în special locusul Skdh-A dar și
locii Pgm-B și Fdh-A indică modele de variație geografică. Unele alele rare identificate în urma
analizei frecvențelor alelice au fost găsite și în alte populații de molid, mai ales în cele din Europa
Centrală. Astfel: i) alela rară identificată în metapopulația APS (Gdh-A-4) a fost raportată și în opt
din nouă populații din Carpații Ucrainieni (Korshikov și Privalikhin, 2007); ii) în programul de
testare a 15 proveniențe IUFRO, alela Skdh-A-5 identificată în populația PRS a fost observată în
una din proveniențe și Idh-B-2 la patru proveniențe (Kannenberg și Gross, 1999).
Numărul de alele per locus (Na) a variat de la 1.80 la 2.60. Aceste valori sunt mai ridicate decât
în alte studii ce au analizat populații din România. Astfel, în nouă populații din Obcinele Bucovinei
numărul de alele per locus a variat de la 1.70 la 2.10 (Teodosiu, 2011); aceste valori sunt similare,
totuși, cu cele determinate de noi în populațiile din Maramureș. Valori similare pentru numărul de
alele per locus au fost raportate de Korshikov și Privalikhin (2007) pentru nouă populații din
Carpații Ucrainieni (valoarea Na a variat între 2.10 și 2.65), precum și pentru populații din Munții
Alpi și Alpii Dinarici (Giannini et al., 1991; Ballian et al., 2007). Valori mai ridicate ale
parametrului Na, de până la 2.5, au fost identificate în populații din Elveția, precum și în populații
din nordul Europei, din Ucraina, Suedia și Rusia (Muller-Starck, 1995; Krutovskii si Bergmann,
1995; Goncharenko et al., 1995).
Indicele bogăției alelelor (A) este unul din cel mai folosit indicator al structurii și variației
genetice (Leberg, 2002). Acesta indică un numărul așteptat de alele dintr-un eșantion de o mărime
arbitrară. Calculul indicelui bogăției alelelor s-a efectuat în cazul nostru pentru o populație
standard de 30 de exemplare, valoare impusă de mărimea eșantionului analizat în populația
statistică de molid columnar din Munții Apuseni. Valoarea cea mai ridicată s-a calculat pentru
metapopulația APS, în special la molidul columnar din populația APS-2. În acest context, este
notabil că cea mai mare valoare a indicelui bogăției alelelor (A=2.0) a fost corelată cu cea mai
mare valoare a diversității genetice (He=0.134) identificată în aceeași populație.
Valoarea medie a heterozigoției așteptate (He=0.115) este similară cu cea identificată la 70 de
populații din întregul areal natural al molidului în Europa (Lagercrantz și Ryman, 1990). Aceeași
valoare a diversității genetice a fost găsită și în Carpații din Slovacia, unde valoarea heterozigoției
a variat între 0.09 și 0.111 (Krajmerova și Langauer, 2000), și în Munții Šumava (Mánec, 1999).
Valorile indicelui heterozigoției identificate la populațiile studiate precum și la cele apropiate
geografic din Carpații Ucrainieni indică o variabilitate genetică mai mică a molidului din aceste
zone geografice, comparativ cu alte părți ale Europei (Korshikov și Privalikhin, 2007). Valori mai
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
32
ridicate ale diversității genetice (He=0.135-0.156) au fost găsite în Serbia de către Milovanovic și
Sijaric-Nikolic (2010) și în Alpii Dinarici din Bosnia, He= 0.127-0.138 (Oršanić et al., 2007).
Valori ridicate au fost de asemenea identificate și în populațiile din Italia, Germania, Suedia, Rusia
și Letonia (Krutovsky și Bergmann, 1995; Goncharenco et al., 1995).
Nivelul heterozigoției identificat în populațiile studiate poate avea legătură cu istoria acestor
populații (ex. recolonizarea postglacială), așa cum a semnalat și Muller-Starck (1995). În studiile
de recolonizare postglaciară a molidului în Europa, bazate pe variația alozimelor și analize de
polen fosil, s-a sugerat ipoteza unei colonizări vestice (europene). Aceasta se pare că s-ar fi realizat
din trei refugii glaciare: unul localizat în zona Moscovei de azi, altul în Munții Carpați (Polonia de
azi) și un al treilea în Alpii Dinarici (Lagercrantz și Rymann, 1990). Existența unui refugiu glaciar
în Munții Carpați a fost evidențiată printr-o răspândire timpurie a molidului în România (11000-
10500 ani BP), din locații situate în nord-vestul și nordul Carpaților, existând posibilitatea
prezenței unui refugiu glaciar în lanțul sudic al Carpaților, în zona Transilvaniei de azi (Feurdean et
al., 2011). În cele șase locații studiate, se poate observa cea mai mare valoare a heterozigoției în
partea de nord-vest a Carpaților, în zona Munților Apuseni, ceea ce ar putea să indice existența
unui refugiu glaciar în zona respectivă. Acest lucru trebuie însă dovedit prin cercetări specifice.
Cea mai mică valoare a heterozigoției a fost identificată în metapopulația PST din Carpații de
Curbură.
Ca și la alte specii de conifere, diversitatea genetică se regăsește preponderent în interiorul
populațiilor. În consecință, valoarea parametrului Fst indică o mică diferențiere între populații. De
asemenea, testul varianței moleculare AMOVA arată că doar 1% din diferențierea genetică la molid
se regăsește între populații. Valori similare au fost identificate în populațiile din Carpații Ucrainieni
- Fst=0.017 (Korshikov și Privalikhin, 2007) și în Letonia, unde Fst a variat între 0.017-0.018
(Goncharenko et al, 1995). O valoare mai mare (Fst=0.018) față de media rezultată din cercetările
noastre (Fst=0.0092) a fost comunicată pentru populațiile naturale din nordul Carpaților României
(Teodosiu, 2011). De asemenea valori mai mari ale diferențierii genetice au fost raportate în
populațiile din Rusia (Fst=0.230), Slovacia (Fst=0.028), Italia (Fst=0.042) și Serbia (Fst=0.050)
(Kravchenko et al., 2008; Krajmerova și Langauer, 2000; Giannini et al., 1991; Milovanovic și
Nikolic, 2010). Cea mai mare contribuție la diferențierea intraspecifică este bazată pe frecvența
alelelor a trei loci Pgi-B, Pgm-A și Skdh-A.
Distanțele genetice descrise în dendrograma UPGMA arată mici diferențe genetice între
populațiile din aceeași metapopulație, ce confirmă un nivel ridicat de schimb de gene între
populațiile din aceeași zonă, fără însă ca acestea să-și piardă total individualitatea. Un nivel ridicat
al schimbului de gene era de așteptat având în vedere distanța relativ mică dintre acestea 2-4 km.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
33
Studii ale fluxului de gene la molid confirmă o valoare de 50% a polenului observat într-o
populație ca fiind provenit din populații vecine, și de până la 4 km (Xie și Knowles, 1994). Acest
fapt are implicații practice, justificând și pe această cale necesitatea constituirii regiunilor
ecologice de utilizare în cultură a materialelor forestiere de reproducere. Deși valori mai mari ale
distanțelor genetice s-au întâlnit între populațiile aflate la o distanță mai mare una de cealaltă,
rezultatele testului Mantel nu au confirmat ipoteza izolării totale prin distanță. Situație
asemănătoare a fost arătată pentru 29 de populații din Austria. Valorea indicelui de corelație
(r=0.178) între populații aflate până la 450 km distanță nu a indicat prezența unei corelații pozitive
între distanțele genetice și cele geografice. În cazul populațiilor studiate de noi se poate observa o
mai mare corelație a distanțelor geografice cu cele genetice între populații față de metapopulații.
Analiza distribuției UPGMA între populații a arătat existența unui grup vestic format din
metapopulațiile APS și PRG și populația PRS și un grup estic format din NMR și MMS. O poziție
separată în dendrogramă o ocupă metapopulația PST, probabil ca efect al prezenței alelelor rare cu
frecvență mai mare, ce poate indica o prezență antropică prin plantare de material biologic înrudit.
Lipsa diferențierii spațiale între populații este caracteristică coniferelor (Giannini et al., 1991) și
indică o rată mare de încrucișare, fecundare și flux mare de gene pe tot arealul continu al
molidului. Marea densitate din populațiile de molid acționează ca factor de contracarare a efectelor
driftului genetic (Krutovskii și Bergmann, 1995).
5.2. Analize comparative ale diversității genetice între populații individualizate biotipic
și/sau ecotipic
5.2.1 Studiu comparativ între populația ecotipului de turbărie, populația biotipului
de molid cu coroană columnară (Picea abies var. columnaris) și populația de molid cu
coroană piramidală (Picea abies var. pyramidalis) din metapopulația Apuseni
În urma analizelor de variație a markerilor genetici izoenzimatici s-a realizat un studiu
comparativ între trei populații din Munții Apuseni. Populațiile eșantionate se află la distanțe de
aproximativ 3 km una față de cealaltă și se deosebesc sub aspect biotipic și ecotipic. Astfel în
metapopulația Apuseni (APS) s-a studiat o populație ecotipică de turbărie (APS-1), o populație a
molidului cu coroană columnară (Picea abies var. columnaris) – APS-2 și o populație de molid cu
coroană normală (Picea abies var. pyramidalis) – APS-3. Pentru estimarea parametrilor genetici
s-au studiat 12 loci, la care s-au identificat 32 de variante alelice. Dintre aceștia, cu excepția
locusului Pgi-A care a fost monomorf, restul locilor au prezentat variație alelică. Din studiul
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
34
frecvenței alelelor se observă o mai mare pondere a frecvențelor alelelor rare în populația
molidului columnar (APS-2). Astfel, alela Gdh-A-4 a fost identificată doar în populația APS-2, iar
frecvențele alelelor Got-A-2, Got-C-5, Pgi-B-2 și Skdh-A-2 sunt vizibil mai mari în această
populație.
Parametrii diversității genetice intrapopulaționale s-au estimat la nivelul fiecărui locus, pentru
fiecare populație în parte. În toate cele trei populații valorile cele mai ridicare ale parametrilor
genetici au fost identificate la locii Got-C și Pgi-B. Deși în populația molidului cu coroană
columnară s-au identificat cinci loci fără variație genetică, față de trei identificați în molidul de
turbărie și respectiv doi în molidul cu coroană piramidală, valorile parametrilor genetici au arătat
preponderent valori mai ridicate la acestă populație. Abaterea cea mai mare față de echilibrul
Hardy-Weinberg (26%) s-a identificat la locusul Pgi-B în populația molidului columnar.
Studiul comparativ al datelor din tabelul 5.6. a indicat valori medii mai mici ale heterozigoției
(He) și ale bogăției alelelor (A) la molidul cu coroana normală (Picea abies var. pyramidalis).
Indicele heterozigoției (He) calculat pentru populația molidului columnar a fost cu 1.7% mai mare
decât cel calculat pentru populația molidului cu coroană normală (APS-3), respectiv cu 1.2% mai
mare față de valoarea heterozigoției identificată în populația molidului de turbărie. Valorile
indicelui bogăției alelelor sunt în corelație cu cele ale heterozigoției (He), identificându-se cea mai
mare valoare în populația de molid columnar - APS-2. De asemenea, valoarea cea mai mare a
indicelui de fixare F s-a înregistrat tot în populația APS-2, indicând un exces de heterozigoți de
8.2% față de starea de echilibru Hardy-Weinberg.
Tabelul 5.6. Media valorilor parametrilor genetici calculați pentru trei populații din metapopulația Apuseni
Mean genetic diversity parameters for three populations from Apuseni metapopulation
P sau M N P(%) Na Ne A Ho He F
APS-1 60 75.00% 2.250 1.205 1.944 0.126 0.122 -0.036
APS-2 30 58.33% 2.000 1.237 2.000 0.150 0.134 -0.082
APS-3 60 83.33% 2.250 1.176 1.922 0.123 0.117 -0.039
APS 150 72.22% 2.167 2.106 1.955 0.133 0.124 -0.049
P sau M - populația/metapopulația; P - proporția locilor polimorfi; Na – numărul mediu de alele per locus;
Ne – numărul efectiv de alele per locus; A – bogăția alelelor; Ho – heterozigoția observată; He –
heterozigoția așteptată; F – indicele de fixare.
Valoarea indicelui de diferențiere mediu calculată între populații dar și pentru fiecare locus în
parte, alături de numărul de migranți (Nm) sunt prezentați în tabelul 5.7. Indicele de diferențiere
Fst a indicat existența unui procent de 98.8% din totalul diversității genetice în interiorul
populațiilor. Dintre locii analizați cea mai mare pondere în diferențierea genetică a populațiilor se
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
35
constată la locusul Pgi-B (Fst=0.043). Calcularea indicelui nivelului mediu de migranți Nm (27.7)
indică o rată ridicată a fluxului de gene între populațiile studiate, ceea ce este de așteptat în
condițiile de alăturare sau de interferență de habitat dintre colectivitățile statistice studiate.
Calcularea distanțelor genetice Nei la cele
trei populații a indicat un grad mai mare de
diferențiere (DNei=0.008) între populațiile
APS-2 (molidul columnar) și APS-3 (molidul
cu coroană normală). Între populația
molidului de turbărie și cea a molidului cu
coroană normală s-a calculat o distanță
genetică mai mică (0.003), ceea ce conduce la
concluzia că nișa ecologică de turbărie este
explorată și valorificată de anumiți
descendenți ai molidului cu coroană normală,
care prezintă valoare adaptativă față de
condițiile specifice de tinov. Dealtfel,
fenotipic, exemplarele de tinov prezintă coroană după modelul molidului comun.
Ca urmare a indicelui de diferențiere, analiza moleculară a variantei moleculare (AMOVA)
efectuată între cele trei populații a indicat o diferențiere genetică de doar 2% între populații, cea
mai mare cantitate a diversității genetice aflându-se în interiorul populațiilor. Chiar și la acest nivel
redus de repartizare a varianței moleculare, trebuie remarcată existența acesteia între cele trei
populații statistice, validându-se și pe această cale specificitatea biotipică ori adaptativă a acestora.
5.2.2. Analize genetice comparative între populații aflate la altitudini
diferite din aceeași zonă geografică
Unul din obiectivele cercetărilor întreprinse a constat în realizarea unui studiu comparativ între
populații aflate la diferite altitudini din aceeași metapopulație. Și în acest caz analiza a inclus cei
12 loci codificatori de izoenzime, pentru care s-au identificat 34 de variante alelice. Cercetările au
inclus șase populații/metapopulații PRG, PST și MMS.
Din analiza frecvențelor alelice (tabelul 5.1) s-a observat doar la locusul Pgm-A-1 o
diferențiere în funcție de altitudine. Astfel alela A1 a locusului Pgm s-a identificat doar în
populațiile de mare altitudine, denumite în cercetările noaste de culme. În metapopulația Parâng
Tabelul 5.7. Indicele de diferențiere Fst și numărul
mediu de migranți pentru trei populații din
metapopulația Apuseni la fiecare locus
Fst values for three populations from Apuseni
metapopulation for each locus
Locus Fst Nm
Fdh-A 0.011 21.7
Gdh-A 0.009 29.0
Got-A 0.007 36.5
Got-B 0.004 59.0
Got-C 0.016 15.2
Idh-A 0.006 42.8
Idh-B 0.006 43.9
Pgi-A #N/A #N/A
Pgi-B 0.043 5.6
Pgm-A 0.008 33.0
Pgm-B 0.017 14.6
Skdh-A 0.008 30.6
Mean 0.012 27.7
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
36
s-au identificat doi loci monomorfici (Got-A și Pgi-A), în metapopulația Postăvarul un singur locus
a fost monomorf iar în metapopulația Maramureș monomorfism a prezentat locusul Pgi-A.
Din analiza valorilor diversității genetice a rezultat că nu se poate deduce un model gradiental
general valabil (tabelul 5.8). Astfel, dacă populațiile de vale din două locații (PRG și MMS) au
avut o mai mare valoare a heterozigoției așteptate decât cele de culme, dimpotrivă, în Masivul
Postăvarul, populația de culme a prezentat valori mai ridicate ale acesteia.
În metapopulația Parâng diferența de altitudine dintre cele două populații a fost de 430 m, iar
între acestea a rezultat o diferență a heterozigoției de 2%. Indicele de fixare a indicat în ambele
populații un deficit de homozigoți, o valoare ușor mai ridicată fiind observată în populația de
culme.
Referitor la metapopulația Maramureș, valorile heterozigoției așteptate (He) s-au diferențiat cu
0.8%, diferența de altitudine fiind de aproximativ 530 m. Deși diferența de altitudine este mai mare
cu aproximativ 100 m fată de situația din metapopulația Parâng, diferența dintre valorile
heterozigoției (He) este mai mică.
Contrar situației identificate în metapopulațiile PRG și MMS, în Masivul Postăvarul populația
de culme PST-1 are valori mai ridicate în ce privește nivelul heterozigoției așteptate (He) și a
bogăției alelelor (A) față de populația de vale, populația Poiana Mică (PST-2) având cele mai
scăzute valori ale parametrilor genetici dintre toate populațiile studiate.
Tabelul 5.8. Valori medii ale parametrilor diversității genetice în populații gradientale de molid
Average values of genetic diversity parameters in spruce gradient populations
P or M N P(%) Na Ne A Ho He F
PRG-1 60 58.33% 1.833 1.178 1.665 0.113 0.106 -0.042 PRG-2 60 75.00% 2.083 1.218 1.816 0.133 0.126 -0.039
PRG 120 66.67% 1.958 1.198 1.74 0.123 0.116 -0.04
PST-1 50 83.33% 2 1.175 1.87 0.109 0.106 -0.031 PST-2 50 66.67% 2 1.176 1.743 0.098 0.096 -0.016
PST 100 75.00% 2 1.175 1.807 0.104 0.101 -0.024
MMS-1 83 83.33% 2.083 1.185 1.81 0.11 0.112 -0.013 MMS-2 78 75.00% 2.25 1.203 1.912 0.119 0.12 -0.016
MMS 161 79.17% 2.167 1.194 1.861 0.115 0.116 -0.015
Indicele de diferențiere Fst calculat la nivelul fiecărei metapopulații, pentru fiecare locus, a fost
calculat în tabelul 5.9, rezultând valori medii interpopulaționale mai mici de 1%.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
37
Structura variabilității genetice între
populațiile din cele trei metapopulații a
fost analizată efectuând testul AMOVA.
Analizând structura genetica
izeonzimatică în cele trei metapopulații
se observă că cea mai mare parte a
diferențierii genetice se află în
interiorul populațiilor. Cea mai mare
diferențiere genetică (3%) s-a arătat
între cele două populații gradientale din
metapopulația Parâng. În metapopulația
Postăvarul diferența este de 1 % iar
între cele două populații din Maramureș
testul molecular al variantei indică lipsa diferențierii genetice între populații. Testul varianței
moleculare s-a realizat în urma calculării distanțelor genetice Nei cu ajutorul softului GenAlEx.
5.2.3. Discuții
În urma analizei frecvenței alelelor s-a observat apariția alelei Pgm-A-1 doar în populațiile de
culme. Evaluarea exemplarelor din populații aflate la diferite nivele altitudinal, indică o mai mare
heterozigoție și o mai mare bogăție a alelelor în două populații de vale din metapopulațiile MMS și
PRG. În contrast, în metapopulația PST, populația de vale (PST-2) a avut cea mai mică valoare a
diversității genetice dintre cele 11 populații studiate. În toate cele trei metapopulații diferențele
dintre valorile heretozigoției populațiilor gradientale au fost însă foarte mici, de numai 1-2%
(0.009 în MMS, 0.011 în PST și 0.020 în PRG), ceea ce indică un flux de gene ridicat între
populațiile de joasă și mare altitudine din aceeași locație, neindicâand prezenta unei bariere
naturale reproductive. Valorile mai ridicate ale heterozigoției în populațiile de joasă altitudine din
metapopulațiile MMS și PRG ar putea fi explicate și prin posibila introducere de material semincer
din populații cu un nivel scăzut de diversitate genetică (Curtu et al., 2009), dar în același timp
diferențierea genetică mai scăzută în populațiile de mare altitudine se datorează probabil unor
condiții mai limitative având o acțiune selectivă. În studii diferite, realizate în populații de molid
din Europa, variabilitatea genetică la populațiile aflate la altitudini diferite a arătat de asemenea
rezultate contradictorii. În populațiile din Alpii Elveției, un număr mai mare de heterozigoți au
Tabelul 5.9. Indicele de diferențiere Fst între cuplurile de
populații gradientale, pe loci genici analizați
Fst differentiation index between pairs of gradient
populations at each locus
Fst
Locus Parâng Postăvarul Maramureș
Fdh-A 0.001 #N/A 0.003
Gdh-A 0.001 0.013 0.002
Got-A #N/A 0.01 0.003
Got-B 0.013 0.005 0
Got-C 0.003 0.001 0
Idh-A 0.004 0.015 0
Idh-B 0.004 0.001 0.003
Pgi-A #N/A 0.005 #N/A
Pgi-B 0.015 0.014 0.004
Pgm-A 0.019 0.005 0.002
Pgm-B 0.017 0 0.002
Skdh-A 0.027 0.005 0.001
Media 0.01 0.007 0.002
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
38
apărut în populațiile de mare altitudine (Muller-Starck, 1995). Totuși, în populațiile din Carpații
Ucrainieni diversitatea genetică între două locații a arătat rezultate diferite, și nu s-a putut indica o
legătură între frecvența alelelor și altitudine (Korshikov si Privalikhin, 2007). În cazul a două
metapopulații studiate (MMS și PRG), populațiile aflate la joasă altitudine (denumite de noi- „de
vale”) au înregistrat valori mai mari pentru bogăția alelelor, ceea ce indică o mai mică presiune a
selecției în populațiile de joasă altitudine în comparație cu cele de la limita altitudinală superioară.
În contrast, în metapopulația PST, populația de joasă altitudine a arătat o valoare mai scăzută a
bogăției alelelor, fiind cea mai mică valoare identificată la populațiile studiate. Această situație
poate fi, probabil, generată de originea materialului de plantat, provenit dintr-un număr mic de
arbori seminceri.
Deși numărul de indivizi eșantionat în populația de molid columnar din Munții Apuseni este
mic, nivelul heterozigoției a fost cel mai mare la nivelul populațiilor eșantionate. O posibilă
explicație poate fi legată de o combinație de factori a sistemului de reproducere implicat în geneza
acestui biotip, în combinație cu acțiunea exercitată de selecția naturală, care este posibil să
prezerve un nivel ridicat al heterozigoției. Studii asupra biotipului de molid columnar au arătat o
mai mare rezistență la zăpadă și vânt și o mai mare rată de supraviețuire (Părnuță, 2008). O mai
mare variabilitate genetică a fost dealtfel indicată și prin studiul caracterelor calitative ale hibrizilor
de molid columnar în populații din România (Părnuță, 2008).
5.3. Structuri genetice microspațiale pentru loci izoenzimatici
Structura genetică microspațială, reprezentând modelul de variație genetică observat între
indivizii din aceeași populație, s-a studiat prin mai multe metode la nivelul a trei populații: două
din Masivul Postăvarul (PST-1 și PST-2) și una din Munții Nemira (NMR). La baza calculelor
analizei structurii spațiale a stat comparația dintre matricele distanțelor genetice și cele geografice.
Analiza genotipurilor la nivelul fiecărui individ dintr-o anumită populație a fost posibilă prin
înregistrarea coordonatelor geografice cu ajutorul unui GPS.
Indicele autocorelației spațiale s-a estimat la nivelul întregii populații (numită autocorelația
spațială globală), precum și local, investigând prezența aglomerării genotipurilor autocorelate la
nivel microspațial. Ambele metode au presupus utilizarea softului statistic GenAlEx 6.2., care
adoptă proceduri de investigare dezvoltate de Anselin (1995), extinse de Getis și Ord (1995) și
Sokal et al. (1998). Modelele grafice de variație genetică în interiorul populațiilor au fost elaborate
cu ajutorul tehnologiilor sistemelor informatice geografice (GIS) prin analiza Anselin Moran I, cu
ajutorul softului ArcGis.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
39
5.3.1. Structura genetică microspațială în metapopulația Postăvarul
Pentru cele două populații din metapopulația Postăvarul, existența modelelor genetice spațiale
s-a investigat prin realizarea a două corelograme, în urma analizei autocorelației genetice globale.
Această analiză arată variația indicelui autocorelației spațiale față de nivelul unui prag de
încredere, între perechi de indivizi dintr-o clasă geografică.
Pentru populația Postăvarul rezultatul
testului autocorelației spațiale a fost
însumat în corelograma din figura 5.8.
Analiza spațială s-a efectuat la zece clase
de distanțe geografice egale, pe o distanță
totală de 640 m. Indicele autocorelației (r)
variază pe parcursul întregii distanțe,
având două valori de maxim, dar fără să
fie depășit pragul superior de încredere
statistic.
Cea mai ridicată valoare a indicelui de
autocorelație a fost identificată în a opta clasă de distanță (r=0.066). La nivelul întregii populații
indicele autocorelației înregistrează două vârfuri ale valorii negative în jurul claselor 1-2 și
respectiv 5-6, și pozitive în jurul claselor 4 și 8-9. Pe parcursul întregii populații valoarea indicelui
autocorelației este fluctuantă, fiind indicată lipsa unui model de corelație spațială a genotipurilor.
În populația Poiana Mică testul autocorelației spațiale globale s-a realizat la 10 clase de distanță
egale, pe o distanță de 1200 m (figura 5.9). Valoarea cea mai ridicată a indicelui de autocorelație
s-a înregistrat la clasa a zecea de distanță. Variația indicelui „r” a arătat valori negative în jurul
claselor 1-2 și valori pozitive la clasele 3 și 10. La niciuna din clasele de distanță valoarea indicelui
„r” nu depășește intervalul de încredere. Din compararea datelor din cele două populații din
Masivul Postăvarul se poate observa cum amplitudinea variației valorii indicelui „r” este mai mică
în populația de joasă altitudine (PST-2) față de cea de culme (PST-1).
Figura 5.9 Corelograma autocorelației
spațiale globale în populația Poiana Mică
Corelogram of global spațial
autocorrelation in Poiana Mică population
Figura 5.8 Corelograma autocorelației spațiale în populația
Postăvarul
Corelogram of spațial autocorrelation in Potăvarul
population
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
40
Prin realizarea testului autocorelației spațiale locale analiza s-a îndreptat spre grupuri de
indivizi, și nu pe clase de distanță ca în cazul anterior al analizei autocorelației genetice globale, a
căror frecvență alelică a fost comparată în jurul unei valori pivot. Acestă analiză calculează
valoarea indicelui de autocorelație pentru fiecare individ față de ceilalți, iar rezultatele sunt
prezentate pe un plan 2D. În urma testului autocorelației spațiale locale (2D LSA) valorile
indicelui de autocorelație au fost semnificative din punct de vedere al probabilității la 7 indivizi.
Raportarea lor pe un plan 2D indică prezența a două grupuri de exemplare la care s-au identificat
valori semnificative statistic ale autocorelației spațiale (figura 5.10).
(simbolul "+" reprezintă arborii
la care s-a determinat o valoare
semnificativa din punct de
vedere al probabilității a
indicelui autocorelației spațiale)
(the "+" symbol represents the
trees where significant values
in terms of probability of
spatial autocorrelation index
were determined)
Figura 5.10 Corelograma autocorelației spațiale locale bidimensionale
în metapopulația Postăvarul
Corelogram of local 2D spațial autocorrelation in Postăvarul
metapopulation
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
41
În populația de culme PST-1, au fost evidențiați patru indivizi marcați cu semnul „+”, la care
indicele autocorelației are valori semnificative. Trei sunt localizați în zona de S-E, la o altitudine
de 1740 m, iar al patrulea la N, la o distanță de 300 m față de celelalte trei, la altitudinea de 1650m.
În populația Poiana Mică (PST-2), indicele autocorelației a avut valori semnificative la trei
indivizi. Aceștia sunt localizați în zona de vest a populației la o altitudine de 930 m. Cele două
grupuri la care s-au identificat valori semnificative ale autocorelației se află la o distanță de
aproximativ 2 km și o diferență de nivel de 800 m.
Analiza structurii spațiale a variației genetice s-a studiat și cu ajutorul unei metode de lucru care
se bazează pe aplicații ale sistemelor geografice informatice (GIS). Este o metodă relativ nouă,
pentru estimarea structurilor genetice spațiale dar întâlnită în studiile internaționale (Kozack et al.,
2008; Hoffman et al., 2003). Prin introducerea acestei metode s-a dorit investigarea structurii
variației genetice în interiorul populației, pentru identificarea modelelor de grupare a exemplarelor
la nivel de microhabitat. Pentru identificarea corelațiilor genetice spațiale, fiecărui arbore i s-a
atribuit o clasă genotipică folosind combinaţiile tuturor perechilor de alele studiate, rezultând un
șir de 24 de caractere (ex. 225522223322243333223312). Acestea au fost sortate în ordine
crescătoare şi numerotate cu cifre de la 1 la 56, întrucât din totalul de 101 arbori s-au identificat 56
de genotipuri unice. Fiecărui genotip identificat i s-a calculat un procent de apariţie în cadrul celor
101 arbori. Metoda folosită este asemănătoare celei utilizate de Ondrej şi Karel, (2009). S-a
calculat indicele Moran I pentru fiecare arbore din interiorul populaţiei, pe baza numărului de
identificare a tipului genetic. În urma analizei s-au identificat trei zone de grupare a arborilor, două
în populaţia Postăvarul-culme şi a treia în populaţia Poiana Mică. Două din modelele de grupare a
arborilor identificate sunt în concordanţă cu rezultatele testului autocorelaţiei spaţiale locale
efectuate cu softul GenAlEx (figura 5.11). În total, de data aceasta, autocorelaţia s-a identificat la
12 exemplare, 8 în populaţia Postăvarul-culme și respectiv 4 în populaţia Poiana Mică. În figură
se observă corelarea pozitivă a arborilor în două zone din populația PST-1, care coincid altitudinii
celei mai ridicate a populaţiei. Corelaţiile pozitive sunt evidenţiate în jurul exemplarelor ce fac
parte din clase de genotipuri apropiate de valoarea 50. Acestea se caracterizează prin alele cu
frecvenţă mare de apariție în populaţie, cu o valoare mai mare a cifrei de notare a tipului genetic
(cum ar fi alelele, Got-C-4 si Pgi-B-3). În acestă populație se pot observa şi corelaţii negative la
trei arbori, evidențiați în figura 5.11 cu culoarea albastră.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
42
Figura 5.11 Harta distribuției autocorelației spațiale Anselin Moran I în metapopulația Postăvarul
Anselin Moran I spatial autocorrelation in Postăvarul metapopulation
În populaţia de vale, Poiana Mică, corelaţia pozitivă a genotipurilor a fost identificată în zona de
vest a populaţiei. Indicii de identificare genetici în jurul cărora s-a identificat corelaţia spaţială au
avut valori cuprinse între 2 și 6, fiind caracterizaţi de alele, de asemenea, cu frecvenţă mare de
apariţie în populaţie şi cu o valoare mai mică de notare (cum ar fi Got-C-2, Pgi-B-2).
Distribuția corelată a genotipurilor în cuprinsul populațiilor din masivul Postăvarul a fost
evidențiată, ca atare, la trei loci: Got-C, Pgi-B, Lap-B. Aceștia având cele mai ridicate valori ale
heterozigoției, sunt și cei care influențează distribuția geografică a genotipurilor în cele două
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
43
populații. La locusul Got-B (figura 5.12) se poate observa o acumulare a genotipului 44 în zonele
de sud și sud-est ale populației de culme. Altitudinea în aceste două zone este mai mare. În
populația Poiana Mica dispersia genotipurilor observate la locusul Got-C este în general mai
uniformă, dar totuși se manifestă tendința de constituire a unor grupuri (familiale).
Figura 5.12 Harta distribuției genotipurilor locusului Got-C în metapopulația Postăvarul
Genotips distributions map of Got-C locus in Postăvarul Metapopulation
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
44
Distribuția alelelor locusului Pgi-B (figura 5.13) este mai omogenă, neputând fi observate
grupări ale unei alele doar în anumite zone din arealul cercetat. Totuși, se poate observa prezența
mai mare a genotipurilor 13 și 22 în populația din Poiana Mică. Alela B1 este întâlnita la trei
indivizi doar în populația de joasă altitudine. Pe de altă parte, și de această dată se constată tendința
de constituire de microgrupuri care includ arbori cu aceeași structură alelică (de exemplu, cele ale
homozigoților 33 din populația de culme), a căror existență ar putea fi pusă în legătură cu structuri
de tip familial.
Figura 5.13 Harta distribuției genotipurilor locusului Pgi-B în metapopulația Postăvarul
Genotips distributions map of Pgi-B locus in Postăvarul Metapopulation
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
45
++
+
+
+
.
.
..
..
.
.
.
..
.
.
... ..
.
.
.
.
.
..
.
.
.
. .
.
.
.
.
.
.
..
.
.
.
.
. .
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
.
..
.
.
..
.
.
.. .
.
.
.
.
.
..
.
.
.
.
..
.
.
.
. .
.
.
.
.
.
.
..
.
.
.
516600
516800
517000
517200
517400
517600
517800
518000
518200
603800 604000 604200 604400 604600
Y
X
2D LSA (+ P<=0.05)
Y
5.3.2. Structura genetică microspațială în populaţia Nemira
Având ca puncte de plecare alelele
identificate și combinațiile genotipice
generate, precum și coordonatele geografice
înregistrate pentru fiecare individ, s-a
analizat și în acest caz distribuția genetică
spațială pentru cei 100 de arbori din
populația Nemira.
Distribuția spațială a locilor a fost
studiată mai întâi prin analiza
autocorelației spațiale globale, ale cărei
rezultate sunt prezentate în corelograma
din figura 5.14. Autocorelația spațială
globală s-a studiat la 10 clase egale departajate pe distanța a 1300 m. Valoarea indicelui „r”
(simbolizată cu linie albastră) indică două zone de maxim ale abaterii de la valoarea nulă, în jurul
claselor de distanță 3-4 și 7-8. Distribuția valorii indicelui r nu a indicat o abatere semnificativă de
la valoarea nulă, astfel încât nu a rezultat existența autocorelației spațiale la niciuna din clasele de
distanță. Cea mai mare valoare a indicelui autocorelației a fost de 0.010, în intervalul claselor 7-8.
Valoarea cea mai mică a indicelui „r” s-a calculat pentru clasa a 10-a de distanță.
(simbolul „+” reprezintă arborii la care s-a
determinat o valoare semnificativa din punct
de vedere al probabilității indicelui
autocorelației spațiale);
(the "+" symbol represents the trees where
significant values in terms of probability of
spatial autocorrelation index were
determined)
Figura 5.15 Corelograma autocorelației
spațiale locale bidimensionale în populația
Nemira
Corelogram of local 2D spațial
autocorrelation in Nemira population
Figura 5.14. Corelograma autocorelației spațiale globale
în populația Nemira
Corelogram of global spațial autocorrelation in Nemira
population
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
46
Luând în considerare poziția geografică a fiecărui individ din populația Nemira, în studiul
autocorelației spațiale locale a rezultat corelograma din figura 5.15. Această analiză denumită 2D
LSA (Analiza Spațială Locală 2D) a arătat prezența autocorelației spațiale la cinci arbori. Trei
dintre aceștia sunt distribuiți în zona de nord-vest, ceilalți doi fiind localizați în zona centrală a
populației. Topografia terenului în populația Nemira indică o variație a altitudinii de la sud la nord.
Studiul autocorelației spațiale în
populația Nemira s-a realizat și prin
analiza Anselin Moran I cu ajutorul
softului ArcGis. Harta autocorelației
spațiale (figura 5.16) s-a realizat pe
baza unui șir unic la fiecare arbore,
format din combinațiile genotipice ale
locilor studiați. Din harta tematică se
poate observa că acesta nu mai
surprinde aceeași situație ca în cazul
analizei 2D LSA. De această dată,
valori semnificative ale autocorelației
au rezultat pentru 6 arbori. Dintre
aceștia, doar doi coincid cu cei la care
s-a semnalat prezența autocorelației
spațiale locale (2D LSA). Analiza
Cluster Outliner indică prezența
autocorelației spațiale în zona centrală
a populației la două grupuri și la un
arbore din partea de sud a populației.
Figura 5.16 Harta distribuției autocorelației spațiale Anselin
Moran I în populația Nemira
Anselin Moran I spațial autocorrelation in Nemira
population
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
47
Din analiza autocorelației spațiale
la fiecare locus se observă, totuși,
structuri genetice spațiale în
interiorul populației. Astfel, rezultatul
cel mai concludent se constată la
locusul Pgi-B, pentru care prezența
autocorelației spațiale este
caracteristică exemplarelor situate în
partea de nord-vest a populației
(figura 5.17). Aceste structuri
genetice spațiale coincid celor
rezultate în urma analizei 2D LSA.
Cea mai mare influență asupra distribuției spațiale în interiorul populației o au locii cu un nivel
ridicat al heterozigoției, ca și în cazul metapopulației Postăvarul.
La locusul Pgi-B (figura 5.18) se poate observa o aglomerare a genotipurilor 33 în zona de
nord-vest a populației, ce coincide unei altitudini de aproximativ 1300 m.
În ceea ce privește locusul Got-C (figura 5.19), distribuția genotipurilor acestuia are un caracter
mai dispersat, mai ales pentru homozigoții 44 și heterozigoții 24. În cazul homozigoților 22 se
constată o slabă tendință de grupare în zona de nord.
Figura 5.17 Harta distribuției autocorelației spațiale Anselin
Moran I în populația Nemira la locusul Pgi-B
Anselin Moran I spațial autocorrelation in Nemira population
for Pgi-B locus
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
48
Figura 5.18. Harta distribuției genotipurilor
locusului Pgi-B în populația Nemira
Genotips distributions map of Pgi-B locus in Nemira
population
Figura 5.19 Harta distribuției genotipurilor locusului
Got-C în populația Nemira
Genotips distributions map of Got-C locus in
Nemira population
5.3.3. Discuții
Analiza structurii genetice într-un context spațial poate aduce noi informații pentru a înțelege
mai bine dinamica populațiilor iar rezultatele pot avea aplicabilitate în managementul ecologic
(Escudero et al., 2003). Distribuția spațială a genotipurilor poate fi influențată de schimbările de
mediu și activitățile umane (Knowles et al., 1992). Totuși, în populațiile naturale aceasta este
preponderent influențată de sistemul de reproducere al speciei, însușirii biologice specifice (ca de
exemplu dispersia semințelor), și nu în ultimul rând de valoarea adaptativă a genotipurilor. Acest
ultim aspect se consideră că are o influență mică în cazul genotipurilor corespondente locilor
izoenzimatici, ca urmare a caracterului preponderent neutral al acestora.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
49
Prin studiul autocorelației spațiale în interiorul unei populații se surprinde modul de organizare
al pădurii naturale și dinamica temporală a structurii genetice (Teodosiu, 2011). La speciile de
arbori cu areal continuu, așa cum este cel al molidului în România, autocorelația spațială în
interiorul populației apare atunci când fluxul de gene și metoda de propagare a semințelor este
restricționată. În realitate, la populațiile arborilor se poate observa o structură genetică spațială
slabă, fapt ce poate fi întărit chiar și de limitele modelelor statistice de a evidenția autocorelația
spațială (Peakal și Smouse, 2006).
La populațiile studiate în urma analizei structurii genetice spațiale, s-a evidențiat o slabă
grupare a genotipurilor în interiorul populațiilor, rezultate ce sunt descrise în literatură în studii ale
autocorelației spațiale la molid (Leonardi et al., 1996; Teodosiu., 2011). Structura genetică spațială
s-a studiat pentru fiecare populație prin trei metode. Indicele autocorelației spațiale globale calculat
cu ajutorul softului GenAlEx nu a avut valori semnificative la nici una din populațiile studiate.
Acesta, în cadrul fiecărei populații, la primele clase de distanțe a avut valori negative, indicând o
distribuție randomizată a genotipurilor mai accentuată la arborii aflați la distanțe mai mici. Totuși,
această valoare negativă nu este semnificativă din punct de vedere statistic, iar o valoare pozitivă
ar evidenția o structură familială, care este caracteristică mai ales la speciile cu reproducere
vegetativă (Hamrick și Nason, 1996).
Prin analiza autocorelației spațiale globale, la nici una din populații corelograma nu a indicat un
model clar conturat de distribuție a genotipurilor. Totuși, în metapopulația Postăvarul, corelograma
a indicat o fluctuație a valorilor pozitive și negative față de valorarea nulă în mai multe cazuri, pe
distanța de 640 m. Același traseu se poate observa și în populațiile Poiana Mică din Masivul
Postăvarul și în populația din Munții Nemira. O posibilă explicație pentru rezultatele obținute ar
putea fi caracterul global al testului, la nivelul întregii suprafețe de studiu, acesta neputând
surprinde aglomerările mici de genotipuri din interiorul populațiilor (Anselin., 1995; Sokal et al.,
1998). Această metodă compară grupuri de indivizi a căror diferențiere geografică se integrează
într-o anume clasă de distanță. Aglomerările de genotipuri la nivel microspațial pot apărea sau nu
și în lipsa autocorelației spațiale globale (Anselin, 1995; Sokal et al., 1998).
Dacă prin analiza autocorelației spațiale globale efectuate cu ajutorul softului GenAlEx nu s-a
identificat nici o structură spațială, la nivel local, prin analiza 2D LSA efectuată cu același soft,
s-au identificat arbori cu valori pozitive din punct de vedere statistic specifice conturării unor
situați de autocorelație spațială, în fiecare populație studiată. Această metodologie a avut în vedere
compararea unor grupuri de arbori din jurul unei valori pivot. Astfel, în metapopulația Postăvarul
autocorelația spațială a fost identificată la șapte arbori, care s-au împărțit în două grupuri, unul în
câte fiecare populație. Dacă în zona de culme grupul se delimitează față de ceilalți arbori, aflându-
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
50
se la o altitudine mai mare cu aproximativ 100 m, apariția grupului din cea de-a doua populație
(Poiana Mică) pare a fi întâmplătoare. Totuși, o influență o poate avea metoda de recoltare a
arborilor studiați, putând fi observat faptul că indivizi din populația Poiana Mică la care s-au
identificat valori pozitive ale autocorelației spațiale fac parte dintr-un trup de pădure separat, aflat
la mică distanță de ceilalți indivizi. O altă explicație a apariției autocorelației spațiale în acest caz
poate fi și influența factorului antropic, prin plantarea de material semincer înrudit. Această
afirmație poate fi susținută și de valorile mici ale parametrilor diversității genetice identificate în
populația Poiana Mică din Masivul Postăvarul.
În populația Nemira s-a identificat prezența autocorelației spațiale la cinci indivizi, din care se
observă un grup situat în zona de nord a populației la altitudinea cea mai mare. Și în populația
Nemira se observă prezența autocorelației spațiale la indivizii aflații la altitudinea cea mai ridicată.
Deși schimbul de gene și rata de încrucișare este mare la molid, în populațiile artificiale s-a
observat că dispersia medie a polenului este de numai 6.8 m față de arborele mamă (Burczyk et al.,
2004).
Folosirea hărților tematice GIS pentru analiza distribuției spațiale a genotipurilor poate fi
folositoare, creând un cadru mai larg de analiză și corelare a diferiților parametri ce influențează
populația. Astfel, Sistemele Informatice Geografice (GIS) pot oferi posibilități noi de calcul a
variației genetice la nivel spațial (Kozack et al., 2008; Hoffman et al., 2003). Studiul autocorelației
spațiale prin analiza Anselin Moran I cu ajutorul softului ArcGis indică rezultate asemănătoare
testelor realizate cu GenAlEx. În special în metapopulația Postăvarul rezultatele au fost în cea mai
mare parte identice. Diferențe mai mari s-au arătat în studiul populației Nemira, unde analiza GIS a
coincis pentru o singură zonă, identificată prin testul 2D LSA și nu a reușit să arate o corelație
pozitivă pentru grupul de la limita altitudinală. Totuși, hărțile de distribuție geografică a
genotipurilor identifică ușoare tendințe de grupare a acestora în funcție de altitudine.
Având în vedere puterea relativ scăzută de diferențiere a markerilor izoenzimatici la nivel
microspațial, prezența autocorelației spațiale a fost totuși semnalată în fiecare populație studiată,
dar la un nivel discret de exprimare. Se știe că majoritatea markerilor genetici nu sunt influențați
de factorii ecologici, izoenzimele având caracter de markeri neutrali. De aceea, o posibilă
explicație pentru prezența autocorelației spațiale este influența topografiei terenului asupra
dispersiei semințelor și a polenului, rezultând astfel un model de distribuție a genotipurilor în
interiorul unei populații. De asemenea, pe lângă aceste aspecte dependente de biologia speciei mai
trebuie avute în vedere și cele legate de managementul silvic. Totuși, o determinare exactă a
procesului ce stă la baza existenței structurilor spațiale este foarte dificilă. Dacă influența selecției
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
51
sau a izolării prin distanță este cauza prezenței autocorelației spațiale și dacă autocorelația spațială
este capabilă să distingă între cele două, este discutabil (Sokal și Oden, 1998).
6. Concluzii generale și contribuții personale
6.1. Concluzii generale
Acestă lucrare și-a propus studiul variabilității și structurii genetice spațiale în populații naturale
de molid distribuite dea lungul lanțului Carpatic, cu ajutorul markerilor genetici izoenzimatici și
studiul comparativ al unor populații individualizate biotipic și/sau ecotipic. Din analizele efectuate
s-au desprins următoarele concluzii grupate după direcțiile pentru care s-au desfășurat cercetările:
A. Concluzii rezultate din analiza diversității genetice izoenzimatice în populații autohtone de
molid
Cu privire la structura genotipică și frecvențele alelice:
1. Valorile frecvențelor alelice în populațiile studiate se înscriu în limitele comunicate în
studii efectuate în alte zone geografice, comunicate în literatura de specialitate.
2. În cadrul populațiilor studiate s-au identificat cinci alele rare (câte două în metapopulațiile
PRS și PST), acestea fiind identificate pentru prima dată în populațiile din România: Gdh-
A-4, Idh-A-4, Skdh-A-5, Pgi-A-3, Idh-B-2.
3. În studiul comparativ al populațiilor diferențiate în funcție de altitudine din aceeași locație,
alela Pgm-A-1 a fost identificată doar în populațiile de culme, ceea ce poate indica o
implicare a acesteia în adaptarea la condițiile particulare de mediu din zonele respective.
4. În studiul comparativ al populațiilor din metapopulația Apuseni se remarcă prezența alelei
Got-A-2 și o frecvență vizibil mai ridicată a alelelor Got-A-2, Got-C-5, Pgi-B-2 și Skdh-A-
2 în populația de molid columnar (Picea abies var. columnaris), față de celelalte două
populații.
Cu privire la diversitatea genetică intrapopulațională:
5. Deși numărul de loci analizați (12) a fost mai mic decât în unele studii din Europa, valorile
proporției locilor polimorfi și numărul de alele per locus au avut valori similare, ceea ce
indică un nivel ridicat al variabilității la nivelul locilor genici considerați individual.
6. Nivelul valorilor frecvențelor alelelor la molidul carpatic este, totuși, unul moderat,
comparabil cu valorile identificate în studii similare realizate în alte zone din Europa.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
52
7. Valoarea medie a heterozigoției calculată la cele 11 populații este identică cu cea calculată
de Lagercrantz și Ryman pentru 70 de populații de molid distribuite în tot arealul european.
8. Considerând populațiile din aceeași zonă de studiu ca fiind o singură populație, valorile
medii ale heterozigoției (He) și bogăției alelelor (A) clasează metapopulația Apuseni pe
prima poziție în ceea privește nivelul diversității genetice între cele șase zone de studiu.
9. Valorile ridicate ale variației genetice din metapopulația APS indică prezența unui nucleu
cu valori mai ridicate ale diversității genetice în Munții Apuseni.
10. Cea mai mică valoare a diversității genetice a fost înregistrată în populația de joasă
altitudine din Masivul Postăvarul (PST-2, He=0.096), fiind inferioară cu 16.5% față de
media celor 11 populații, respectiv cu 28.3% față de populația cu valoarea indicelui He cea
mai mare.
11. Valoarea mică a diversității genetice în populația de mică altitudine (Poiana Mică) din
Postăvarul pune în discuție caracterul natural al acesteia; este posibil ca structura genetică
actuală a acestei populații să fie influențată de intervenții antropice anterioare cu acțiune
erozivă, ori prin transfer de materiale de reproducere recoltate de la un număr redus de
genitori.
12. Calculul parametrilor genetici la nivel de populație ne indică populația de molid columnar
Picea abies var. columnaris ca având cel mai ridicat nivel al variabilității genetice între cele
11 populații studiate.
13. Structura genetică a fiecărui locus din fiecare populație, investigată prin testarea deviației
de la structura Hardy-Weinberg, nu a indicat abateri semnificative de la starea de echilibru.
Cu privire la structura genetică interpopulațională:
14. Indicele de diferențiere Fst, calculat la fiecare locus cât și ca medie între populații, a indicat
o valoare mai mică (0,0092) decât în alte studii realizate în Europa, indicând probabil
originea comună a molidului din Carpații românești din aceeași locație de refugiu glaciar.
15. Valorile indicelui de diferențiere cele mai apropiate față de cea calculată în acest studiu
s-au identificat în populațiile din Carpații Ucrainieni și din Obcinele Bucovinei.
16. Nivelul diferențierii genetice între populații este confirmat prin testul AMOVA, care a
indicat existența a mai puțin de 1% din variația genetică observată între populații, restul de
99% fiind identificat în interiorul populațiilor, indicând pe termen lung un flux ridicat de
gene între populațiile studiate.
17. Prezența preponderentă în interiorul populațiilor a variabilității genetice scoate în evidență
importanța deosebită a cunoașterii acesteia pentru identificarea populațiilor valoroase, dar
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
53
și a exemplarelor valoroase, cu implicații în derularea programelor de ameliorare și
conservarea resurselor genetice de molid.
18. Dendrograma UPGMA construită pe baza distanțelor genetice Cavalli-Sforza a indicat o
separare a populațiilor în trei grupuri: unul în partea de vest a Carpațiilor, altul în partea de
est iar populațiile din Masivul Postăvarul s-au grupat separat. Totuși, rezultatele nu sunt
semnificative din punct de vedere statistic. Dealtfel, nici testul Mantel nu a indicat existența
unui model geografic de repartizare a diversității genetice.
19. Analiza UPGMA a indicat gruparea separată a populațiilor din Masivul Postăvarul de restul
populațiilor, probabil ca urmare a influenței antropice în această metapopulație.
20. Distanțele genetice ce au stat la baza calculării dendrogramei UPGMA au indicat valori mai
mici între populațiile apropiate geografic, ceea ce indică intensitatea mai mare a schimbului
de gene dintre acestea pe termen lung.
21. În urma analizei testului Mantel nu s-a confirmat ipoteza izolării prin distanță a
populațiilor, valoarea indicelui de corelație Pearson având valori nesemnificative din punct
de vedere statistic.
B. Concluzii rezultate din analiza comparativă a diversității genetice între populații
particularizate sub aspect ecotipic și /sau biotipic
22. În urma analizei comparative a populațiilor din Munții Apuseni sub aspectul valorii
heterozigoției (He) și bogăției alelelor (A), populația de molid cu coroană normală (Picea
abies var. pyramidalis) a avut cele mai mici valori, indicând existența unui plus de
variabilitate genetică a populațiilor particularizate sub aspect ecotipic (molidul de turbărie)
și sub aspect biotipic (molidul cu coroana columnară).
23. Valorile mari ale variabilității genetice evidențiate la molidul cu coroană columnară sunt
confirmate și din studii anterioare privind caracterele calitative ale hibrizilor de molid
columnar.
24. Prin studiul comparativ al parametrilor genetici în populațiile aflate la diferite altitudini din
aceeași zonă geografică, nu s-a putut deduce un model gradiental general valabil, deși
nivelul polimorfismului înregistrează o anumită creștere la nivelul metapopulației, față de
populațiile luate individual.
25. Valorile mai ridicate ale heterozigoției în populațiile de joasă altitudine din metapopulațiile
MMS și PRG ar putea fi explicate și prin posibila introducere de material semincer din
populații cu un nivel scăzut de diversitate genetică, dar în același timp diferențierea
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
54
genetică mai scăzută în populațiile de mare altitudine se datorează probabil unor condiții
mai limitative cu acțiune selectivă.
26. Între populațiile diferite sub gradient altitudinal s-a indicat un flux ridicat de gene. Cu toate
acestea, nu poate fi acceptată existența și funcționarea unei bariere reproductive de mare
anvergură, deoarece datele din literatură au evidențiat existența unor decalaje fenologice
importante cauzate de diferențele climatice, așa cu sunt cele determinate pe clina nordică a
Postăvarului (Stănescu și Șofletea, 1992).
C. Concluzii rezultate din analiza distribuției microspațiale a structurilor genetice identificate
27. Prin calcularea indicelui autocorelației spațiale globale, indicator raportat la întreaga
populație studiată, nu s-a evidențiat prezența unei corelații semnificative din punct de
vedere statistic a distribuției genotipurilor în niciuna din populațiile studiate.
28. Prin efectuarea testului autocorelației spațiale locale (2D LSA), indicator ce se raportează
la structuri microspațiale, s-au identificat mici grupuri de arbori cu valori pozitive ale
indicelui autocorelației spațiale, semnificative din punct de vedere statistic.
29. Valorile semnificative din punct de vedere statistic ale autocorelației spațiale locale indică
la nivelul populațiilor Postăvarul culme și Nemira o influență a topografiei terenului în
distribuția spațială a genotipurilor.
30. Valorile semnificative ale autocorelației spațiale locale în populația Poiana Mică
(metapopulația Postăvarul) indică probabil efectul antropic asupra distribuției genotipurilor
în populația eșantionată.
31. Analiza autocorelației spațiale efectuate la nivelul fiecărui locus a indicat o prezență sporită
a grupării genotipurilor la locii Pgi-B, Got-C și Lap-B.
32. S-a realizat o analiză spațială cu ajutorul sistemelor geografice GIS, rezultatele confirmând
în cea mai mare parte distribuția genotipurilor conform testului 2D LSA realizat cu ajutorul
GenAlEx.
6.2 Contribuții personale
1. Cercetările efectuate aduc un important aport în studiul variabilității genetice izoenzimatice
a molidului din România, prin extinderea cercetării în cele mai reprezentative zone ale
arealului natural.
2. Prin realizarea unui amplu studiu la nivelul a 24 de loci izoenzimatici s-au identificat cei
mai eficienți loci care influențează diversitatea genetică a molidului carpatic.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
55
3. S-a realizat pentru prima dată o dendrogramă ierarhică a populațiilor de molid din Carpații
României, bazată pe markeri genetici izoenzimatici, pe baza căreia s-au identificat unele
specificități genetice pentru grupurile rezultate.
4. Pentru prima dată s-a realizat un studiu de markeri biochimici primari în populații
particularizate sub aspect ecotipic (molidul de turbărie) și sub aspect biotipic (molidul cu
coroană columnară - Picea abies var. columnaris versus molidul cu coroană piramidală -
Picea abies var. pyramidalis) .
5. Prin analiza comparativă a populațiilor aflate la diferite altitudini din aceeași zonă
geografică s-a studiat efectul altitudinii asupra variabilității genetice izoenzimatice.
6. S-au extins studiile structurii genetice la nivel microspațial, prin efectuarea unor noi tipuri
de analize spațiale, care au evidențiat grupări ale genotipurilor identificabile la nivel de
exemplar.
7. S-au realizat hărți ale distribuției spațiale a genotipurilor cu ajutorul Sistemelor Informatice
Geografice GIS.
Diseminarea rezultatelor
Lucrari ISI:
Curtu A. L., Șofletea N. Radu G. R., Bacea A. Abrudan I. V., Keul B. A., Farcaș S.,
2009 – Allozyme variation of coniferous tree species from Maramureș Mountains,
România. În: Not. Bot. Hotr. Abrobot. Cluj 37 (2), p.245-251.
Lucrari BDI
Radu G. R., Șofletea N., Curtu A. L., 2011 – Allozyme genetic variation in high
elevated population of Norway Spruce ( Picea abies L. (Karst)) from Nemira
Mountains. În: Proceedings of Biennal International Symposium Forest and Sustainable
Development, Editura Universității Transilvania din Brașov, p. 93-98.
Șofletea N., Curtu A. L., Toader V. A., Pricopie I., Radu G. R., 2009 – Utilizarea
analizelor de izoenzime în genetica forestieră: un studiu de caz pentru molidul din
Munții Poiana Ruscă. În: Revista Pădurilor nr. 5, 17-21.
Radu G. R., Șofletea N., Curtu A. L., 2012 – Allozyme genetic variation and spatial
genetic structure in two populations of Norway spruce (Picea abies L. (Karst)) from
different levels of altitude from Postăvarul Mountain. În : Revista Pădurilor nr. 5, 3-8.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
56
Bibliografie
Acheré V., Favre M., Besnard G., Jeandroz S., 2005. Genomic organization of molecular
differentiation in Norway spruce (Picea abies). Molecular Ecology 14: p. (3191-3201).
Anselin L., 1995. Local indicators of Spatial Association-LISA.geographical Analysis 27 (2):p.
(93-115).
Ballian D., Bogunić F., Božič G.,2007. Genetic Variability of Norway Spruce (Picea abies /L./
H. Karst.) in the Bosnian Part of the Dinaric Mountain Range. Journal of Forestry Society of
Croatia 5-6: p. (237-247).
Burczyk J, DiFazio SP, Adams WT (2004) Gene flow in forest trees:How far do genes really
travel? Forest Genetics, 11, 179–192
Crawford Dj., 1989. Enzyme electrophoresis and plant systematic. Allozymes and plant
biology,Oregon:p. (146-164).
Curtu A. L., 2003. Cercetări privind variabilitatea genetică a molidului (Picea abies (L.)
Karst.) realizate cu ajutorul markerilor ADN. Revista Pădurilor 118(3): p. (10-15).
Curtu L. A., Sofletea N., Radu R., Bacea A., Abrudan I. V., Butiuk-Keul A., Farcas S.,2009.
Allozyme Variation of Coniferous Tree Species from Maramures Mountains, România.
Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca 37(2): p. (245-251).
Dutcă , Abudan I., Stăncioiu P.T. 2010. Biomass Conversion and Expansion Factors for Young
Norway Spruce (Picea abies (L.) Karst.) Trees Planted on Non-Forest Lands in România.
Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca 38 (2): p. (286-292).
Enescu, V., Cherecheș, D., Bânciu, C., 1997. Conservarea biodiversității și a resurselor
genetice forestiere. S.C. Agris-Redacția Revistelor Agricole, București p. 439
Escudero, A., Iriondo, J.,M., Torres, M.E., 2003. Spatial analysis of genetic diversity as a tool
for plant conservation. Biological Conservation 113: p.(351-365).
Excoffier L, Laval G, Schneider S., 2005. Arlequin version 3.0. An integrated software package
for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics Online 1: p. (47-50).
Falk D. A., Holsinger K., 1991. Genetics and conservation of rare plants.Oxford University
Press, New York.
Farjon A. 2001. World checklist and bibliography of conifers. Kew: Royal Botanic Gardens.
Feurdean, A.,Wohlfarth, B., Björkman, L., I., Bennike, O., Willis, K.J., Farcas, S.,Robertsson,
A.M., 2007a. The influence of refugial population on Lateglacial and early Holocene
vegetational changes in Romania. Review of Palaeobotany and Palynology 145, p. (305-
320).
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
57
Feurdean A., Tanțău I., Fărcaș S., 2011. Holocene variability in the range distribution and
abundance of Pinus, Picea abies, and Quercus in România; implications for their current
status. Quaternary Science Reviews Volume 30 (21-22): p. (3060-3075).
Geburek, Th., 1997: Isozymes and ADN markers in gene conservation on forest trees.
Biodiversity and Consevation 6: p. (1639-1654).
Geburek, Th., Mottinger-Kroupa S.,Morgante, M., burg, M., 1998: Genetic variation of
Norway spruce (Picea abies (L.) Karst) populations in Austria. II-Microspatial patterns
derived from nuclear derived from nuclear sequence tagged microsatellite sires. Forest
Genetics 5Ș p. (231-237).
Giannini R., Morgante M., Vendramin G.G., 1991. Allozyme Variation in Italian Populations of
Picea abies (L.) Karst. Silvae genetica 40,3/4: p. (160-166).
Goncharenko G., Kurm M., Birgelis J., Maaten T., Tamm Ü., Shevchenko L., 2005. Isoenzymes
structure of Norway spruce (Picea abies (L.) Karst.) in natural populations in Estonia,
Latvia and Byelorussia. Baltic Forestry, 11 (2): p. (9–19).
Goncharenko G.G., Zadeika I.V., Birgelis J.J., 1995. Genetic structure, diversity and
differentiation of Norway spruce (Picea abies (L.) Karst.) in natural populatins of
Latvia.Forest Ecology and Management 72 (1): p. (31-38).
Goudet J., 1995. FSTAT Version 1.2. A Computer Program to Calculate F-Statistics. Journal of
Heredity 86(6): p. (485-486).
Hamrick J.L, Godt M.J.V., Sherman-Broyles S.L., 1992. Factors influencing levels of genetic
diversity in woody plant species . New forest 6 (1-4): p. (95-124).
Hamrick J.L., Nason, J.D., 1996. Consequences of dispersal in plants. Population Dynamics in
Space and Time (ed. Rhones, O. E., Chesser, R.K., Smith, M.H.,)p. 203-236. University of
Chicago Press, Chicago.
Hamrick J.L., 2004. Responsev of forest trees to global envoromental changes. Forest Ecology
and Management 197 (1-3): p. (323-335).
Hattemer, H.H., 1995. Concepts and requirements in the conservation of forest genetic
resources.Forest Genetics 2 (3):p. (125-134).
Hewitt GM (1996) Some genetic consequences of ice ages, and their role in divergence and
speciation. Biological Journal of theLinnean Society, 58, 247–276
Heywood, J.S., 1991. Spatial analysis of genetic variation in plant populations. Annual
Review of Ecology and Systematics 22, 335–355.
Hosius, B. (1993). Wird die genetische Struktur eines Fichtenbestandes von
Durchforstungseingriffen beeinflußt? Forst und Holz. 48(11):306-308.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
58
Hoffman JI, Boyd ILB, Amos W (2003) Male reproductive strategy and the importance of
maternal status in the ntarctic fur seal Arctocephalus gazella.Evolution, 57, p. (1917–1930).
Hussendörfer, E. (1996). Wird “Biodiversität” durch eine künstliche Bestandesbegründung
beeinflußt? p. 160-176. In: Biodiversität und nachhaltige Forstwirtschaft (Eds.). Müller-
Starck G, Ecomed, Landsberg.
Hughes A. R., Inouye B. D., Johnson M. T. J., Underwood N., Vellend M., 2008. Ecological
consequences of genetic diversity. Ecology Letters 11:p. (609–623).
Kannenberg N., Gross K., 1999. Allozymic Variation in Some Norway Spruce Populations of
the International IUFRO Provenance-testing Programe of 1964/1968. Silvae Genetica 48,5:
p. (209-217).
Knowles, P., Perry, D.J., Foster, H.A., 1992. Spatial genetic structure in two tamarack (Larix
laricina Du Roi K.Koch) populations with different establishment histories. Evolution 46,
p.(572–576).
Konnert M.,Werner M., 2004. Isoenzymuntersuchungen bei Fichte (Picea abies). Anleitungen
zur Trennmethodik und Auswertung der Zymogramme. [Instructions for separation
methodology and analysis of the zimograms for Picea abies] Bayerrisches Amt fur forstiche
Saat- und Pflanzenzucht: p. (1-22).
Korshikov I.I., Privalikhin S.N., 2007. Genetic Structure of Populations of Norway Spruce
(Picea abies (L.) Karst. from Ukrainian Carpathians. Russian Journal of Generics vol. 43 no.
12.: p. (1364-1372).
Kozak, K. H., Graham C. H., Wiens J. J.. 2008. Integrating GIS data into evolutionary studies.
Trends in Ecology and Evolution 23:p. (141–148).
Krajmerová D.; Longauer R., 2000. Genetická diverzita smreka obyčajného na
Slovensku[Genetic diversity of Norway spruce in Slovakia]. Lesnícky Časopis 2000 46 (3):
page (273-286).
Kravchenko A.N., Larionova A.Ya., Milyutin L.I., 2008. Genetic Polymorphism of Siberian
Spruce (Picea obovata Ledeb.) in middle Siberia. Russian Journal of Genetics 44,1: p. (35-
43).
Krutovskii K.V., Bergmann F., 1995. Introgressive hybridization and phylogenetic relationship
between Norway, Picea abies (L.) Karst., and Siberian, P.obovata Ledeb., spruce species
studied by isozyme loci. The Genetical Society of Great Britain, Heredity, 74: p. (464-480).
Lalu, I., 1996. Catalogul național al resurselor genetice forestiere. Manusris Icas Bucuresti.
Lagercrantz U., Ryman N., 1990. Genetic structure of Norway spruce (Picea abies):
Concordance of Morphological and Allozymic Variation. Evolition 44,1: p. (38-53).
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
59
Langella O., 1999. Population Genetic Software 1.2.31. Free Software Foundation, Boston.
Avaible on http//bioinformatics.org
Latalowa, M., van der Knaap, W.O., 2006. Late Quaternary expansion of Norway spruce (L.)
Karst. in Europe according to pollen data. Quaternary Science Reviews 25,p. (2780-2805).
Leberg P.L., 2002. Estimating allelic richness: Effects of sample size and bottlenecks.
Molecular Ecology 11:p. (2445–2449).
Lewandowski A., Burczyk J., 2002. Allozyme Variation of Picea abies in Poland. Scandinavian
Journal of Forest Research 17 (6): p. (487-494).
Leonardi S., Raddi, S., Borghetti, M., 1996: Spatial autocorrelation of of allozyme traits in a
Norway spruce(Picea abies) population. Can J For Res 26:p.(63–71).
Luo J., Wang Y., Karpelainen H., Li C., 2005. Allozyme Variation in Natural Populations of
Picea asperata. Silva Fennica 39(2): p. (167-176).
Mánek J., 1999. Genetic structure of three natural Norway spruce populations in the Sumava
mountains determined by isoenzyme analysis. Silva Gabreta vol.3: p. (173-182).
Manel. S., Schwartz K. M., Luikart, G., Taberlet, B., 2003. Landscape genetics: Combining
landscape ecology and population genetics.Trends in Ecology and Evolution 18 (4): p. (189-
197).
Mihai G., 2009. Surse de seminţe testate pentru principalele specii de arbori forestieri din
România. [Seed sources tested for mains species of forest trees in România]. Editura Silvică:
p. (281).
Milovanovic J., Sijaric-Nikolic M., 2010. Characterization of Serbian spruce Variability
applying Isoenzyme Markers. Biotehnol & Biotechnol Eq. (1): p. (1600-1605).
Mitchell, A., 2005: The ESRI Guide to GIS Analysis, Volume 2: Spatial Mesurements and
Statistics, ESRI Press.
Muller-Starck G., 1995. Genetic variation in Hight Elevated Populations of Norway Spruce
(Picea abies (L.) Karst.) in Switzerland. Silvae genetica 44, 5-6: p. (356-362).
Ord, J.K., Getis A., 1995. Local Spatial Autocorrelation Statistics: Distributional issues an
Aplication. Geographical analysis 27 (4): p. (286-306).
Oršanić, M., D. Drvodelić, I. Kovačević, 2007. Genetic Variability of Norway Spruce (Picea
abies /L./ H. Karst.) in the Bosnian Part of the Dinaric Mountain Range. Journal of Forestry
Society of Croația.p. (237-247).
Ondrej, I., și Karel, M., 2009. Genetic diversity and spatial structure of the selected young
Norway spruce (Picea abies)population in the Giant Mts. Management biodiversity. Ed. K.
Metejka, Praha.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
60
Pârnuţă GH., 2008. Variabilitatea genetică şi ameliorarea arborilor de molid cu coroană
îngustă în România [Genetic variability and tree impruvment of Norway spruce narrow tree
in România]. Editura Silvică, Bucureşti: p. 181.
Pârnuţă, Ghe., Stuparu, E., Budeanu, M., Scărlătescu, V., Marica, Fl.M., Lalu,I., Filat, M.,
Tudoroiu, M., Lorent, A., Nica, M., Teodosiu, M., Chesnoiu, E.N., Pârnuţă,P., Mirancea, I.,
Marcu, C., 2011: Catalogul Naţional al Resurselor Genetice Forestiere . Editura
Silvică.526p
Peakall R., Smouse P.E.,2006. GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic
software for teaching and research. Molecular Ecology Notes 6(1): p. (288-295).
Perry, D.J., Bousquet, M., Bousquet, J., 1999. Sequence-tagged-site (STS) markers of
arbitrary genes: the amount and nature of variation revealed in Norway spruce. Heredity
83: p. (239-248).
Peakall, R., and Beattie, A.J. (1995) Does ant dispersal of seeds in Sclerolaena diacantha
(Chenopodiaceae)generate local spatial genetic structure? Heredity 75, 351-361.
Pulkkinen, P., 1991. Crown form and harvest in pendulos Noeway spruce. Silvae Fennica 25: p.
(207-214).
Reed D. H., Frankham R., 2003. Correlation between Fitness and Genetic Diversity.
Conservation Biology 17:p. (230–237).
Scheldeman, X., and Zonneveld, M., 2010: Training manual on analysis of plant diversity and
distribution. Biodiversity International Rome Italy
Slatkin, M., și Arter, H., 1991, Spatial autocorelation methods in population genetics Am Nat.,
1998, 499-517.
Sofletea N., Curtu L., 2007.Dendrologie[Dendrology]. Ed. Universitatii Transilvania Brasov: p.
304.
Sokal, R. și Oden, N.,(1978) Spatial autocorrelation in biology, 2.Some implications and four
applications of volutionary interest. Biol.J. Linn. Soc. 10, 229–249
Sokal, R., Oden, N.., Thomson, Ba., 1998: Local spatial autocorrelation in biological
variables. Biological Journal of the Linnean Society, 65, p. (41-62).
Stănescu, V., Şofletea, N., 1992: Cercetări de genetică ecologică în molidişuri montane.
Revista Pădurilor 107 (1): 2-5, 51.
Stănescu, V., Șofletea, N.,Popescu, O., 1997. Circumstanțe fenotipice interesând genomul
molidului. Revista de silvicultură. Nr. 2:3-5.
Stănescu V., Şofletea N., 1992. Cercetări de genetică ecologică în molidişuri montane (II).
[Ecological genetics research in mountains spruce stands] Revista Pădurilor 1: p. (2-5).
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
61
Teodosiu M., 2011. Cercetari Privind Variabilitatea Genetica in Arboretele de Molid din
Obcinele Bucovinei [Resarch regarding genetic variability in Norway spruce stands from
Obcinele Bucovinei]. Ph. D. Thesis, Department of Forest Sciences, Transylvania University
Brasov: p. (164)
Tjoelker M.G., Boratynski A., Bugala W., 2007. Biology and Ecology of Norway Spruce.
Forestry Sciences 78: p. (469)
Tollefsrud M. M., Kissling R.,Gugerli F., Johnsen Ø., Skroppa T., Cheddadi., Van Der Knaap
W. O., Lataaowa M., Terhurne-Berson R., Litt T., Geburek T., Brochmann C., Sperisen C.,
2008. Genetic consequences of glacial survival and postglacial colonization in Norway
spruce: combined analysis of mitochondrial DNA and fossil polllen. Molecular Ecology 17:
p. (4134-4150).
Vicario F., Vendramin GG., Rossi P., Liò P., Giannini R., 1995. Allozyme, chloroplast DNA and
RAPD markers for determining genetic relationships between Abies alba and the relic
populationof Abies nebrodensis. Theor Appl Genet 90:p. (1012–1018).
Weir, B. S. și Cockerham, C. C., 1984. Estimating F-statistics for the analysis of population
structure. Evolution 38: 1358{1370.
Wright, S., 1965. The interpretation of population structure by F-statistics with special regard
to system of mating. Evolution 19: p. (395-420).
Yeh F.C., Yang R., 1999. Popgene Version 1.31. Department of Renewable
ResourcesUniversity of Alberta: p. (29).
Zubizarreta G. A., Peltola H., Pulkkinen P., 2009. Growth and wood property traits in narrow
crowned Norway spruce (Picea abies f. pendula) clones grown in southern Finland. Silva
Fennica 43 (3): p.(369-382).
Xie, C.Y., Knowles, P., 1994: Mating System and Effective Pollen Immigration in a Norway
Spruce (Picea abies (L.) Karst) Plantation. Silvae Genetica: 43(1): 48-52.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
62
Rezumat
Prin analizele și cercetările efectuate s-a urmărit evaluarea diversității genetice a celei mai
importante specii de conifere [Picea abies L. (Karst)] în populații reprezentative pentru arealul său
natural din România. Distribuția geografică a populațiilor în siturile NATURA 2000 permite
certificarea valorii genetice a acestora și a furnizării de date genetice care să fie folosite în
stabilirea și derularea măsurilor de management forestiere sustenabil.
Diversitatea genetică s-a studiat cu ajutorul markerilor genetici izoenzimatici. Un total de 11
populații din șase regiuni, reprezentative pentru arealul natural al molidului din România au fost
studiate. Pentru toate populațiile analizate s-au studiat 695 de arbori cu ajutorul a 12 loci
izoenzimatici, pentru care s-au identificat 38 de variante alelice. Media proporției locilor polimorfi
a fost de 86.11%, cu valori cuprinse între 75% și 91.67%. Valoarea medie a heterozigoției a fost de
0.115. Cea mai mare valoare a diversității genetice (He=0.125) și bogăției alelelor (A=1.995) au
fost identificate în metapopulația din Munții Apuseni. Din analiza comparativă a populațiilor cele
mai ridicate valori ale indicilor genetici (în special He și A) s-au calculat pentru populația de molid
columnar (APS-2) din Munții Apuseni. Nivelul diferențierii genetice între populații a fost unul
foarte scăzut (Fst=0,009), indicând o diferențiere din punct de vedere genetic de doar 0.9% între
populații. Testul AMOVA a confirmat valoarea mare a prezenței diversității genetice în interiorul
populațiilor de 99%. Testul Mantel nu a indicat o tendință de grupare geografică bazată pe
frecvența alelelor. Totuși dendrograma UPGMA, de grupare ierarhică a populațiilor analizate în
funcție de distanțele genetice Cavalli-Sforza a indicat prezența a trei grupuri la nivelul populațiilor
studiate.
În trei situri (Parâng, Nemira și Postăvarul) prin studiul diversității genetice a populațiilor
gradientale nu s-a indicat o influnță a altitudinii. În metapopulația Apuseni studiul populațiilor
particularizate sub aspect ecotipic și biotipic a indicat o diversitate genetică mai ridicată pentru
populația de molid columnar (Picea abies var. columnaris) și populația molidului de turbărie față
de molidul cu coroană normală (Picea abies var pyramidalis).
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
63
Abstract
The aim of the extensive researches and investigations of allozyme variations was to determine
the genetic diversity of the most important coniferous tree species from România [Picea abies L.
(Karst.)], in representatives populations of its natural range. The studies of populations located in
NATURA 2000 sites are allowing a certification of genetic values of these sites and provides
genetic data usable in sustainable genetic forestry plans.
Genetic diversity was studied by means of allozyme markers. Eleven populations grouped in six
representative sites across Carpathian Mountains were analyzed. Across all eleven populations,
695 adult trees were studied at 12 enzyme coding loci, and for them 38 alleles variants were
revealed. The mean of polymorphic loci was 86.11%, ranging between 75.00% and 91.67%. The
mean expected heterozygosity was 0.115. The highest values for genetic diversity (He=0.125) and
allelic richness (A=1.995) have been scored in the Apuseni Mountains metapopulation. By
comparative analyses of populations, the highest genetic diversity has been found in the narrow
crown spruce population from Apuseni Mountains. The genetic diversity among populations
estimated by Fst value, was 0.9%. As consequence, AMOVA test revealed a very high value of
genetic diversity at intrapopulational level (99%) and the Mantel test did not indicate a
geographical pattern of allele frequencies. Nevertheless, the UPGMA cluster analysis based on the
Cavalli-Sforza genetic distances indicates a small clustering tendency in three groups.
In three sites (Parâng, Nemira and Postăvar) the study of genetic differences between low and
high altitude populations did not showed the influence of altitude gradient in the alleles diversity.
Higher genetic diversity values were found in narrow-crown biotype (Picea abies var columnaris)
and in the peat bog ecotype then in the typical crown spruce (Picea abies var pyramidalis), in three
populations from Apuseni Mountains.
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
64
Curriculum vitae
Informaţii personale
Nume / Prenume RADU GHEORGHE RAUL
Naţionalitate Română
Data naşterii și locul nasterii 04.04.1984; Brașov
Starea civilă Căsătorit
Experienţa profesională
Perioada 2008 – prezent
Funcţia sau postul ocupa Expert cartografiere, fotointerpretare, digitizare, studii statistice
Activităţi şi responsabilităţi principale
Realizarea proiectelor de cartografiere, GIS, fotointerpretare, digitizare,
teledetecţie, analiză, procesare si transformare date
Numele şi adresa angajatorului
S.C. Geodis România S.R.L., Braşov
Perioada 2008
Funcţia sau postul ocupat Inginer amenajist
Activităţi şi responsabilităţi principale
Proiecte de amenajament silvic
Numele şi adresa angajatorului
I.C.A.S. Braşov
Educaţie şi formare
Perioada 2003 – 2008
Calificarea / diploma obţinută
Diplomă de Inginer silvic
Disciplinele principale studiate
Silvicultură, cadastru
Numele şi tipul instituţiei de învăţământ
Universitatea „Transilvania” Braşov, Facultatea de Silvicultură şi Exploatări Forestiere
Perioada 1999-2003
Calificarea / diploma obţinută
Tehnician silvic
Disciplinele principale studiate
Silvicultură
Numele şi tipul instituţiei de învăţământ
Liceul silvic Nicolae Rucăreanu Brașov
Limbi străine cunoscute Engleză; Franceză
Activitatea ștințifică Lucrări publicate: 4; Comunicări ștințifice: 1
Evaluarea diversității genetice în populații naturale de molid [Picea abies (L.) Karst.]
65
Curriculum vitae
Personal information
First name / Surname RADU GHEORGHE RAUL
Nationality Romanian
Date of birti 04.04.1984; Brașov
Marital status Married
Work experiance
Dates 2008 – present
Occupation or position held Cartography expert, photointerpretation, digitization, statistic studies
Main activities and responsabilities
Buiding of GIS and carthographic maps based on surveys,
photointerpretation; analize and data precessing and transformation
Name and adress of employer
S.C. Geodis România S.R.L., Braşov
Dates 2008
Occupation or position held Forestry engineer
Main activities and responsabilities
Forestry planning projects
Name and adress of employer
I.C.A.S. Braşov
Education and training
Dates 2003 – 2008
Title of qualification awarded Forestry engineer diploma
Main study Silviculture and forestry
Name and type of organisation providing education and training
Transilvania University Braşov, Faculty of Forestry Brașov
Dates 1999-2003
Title of qualification awarded Forestry tehnician
Main study Silviculture
Name and type of organisation providing education and training
Nicolae Rucăreanu High School Brașov
Foreign languages English and French
Scientific activity Published articles: 4; Scientific conferences: 1