metabolism proteic
DESCRIPTION
BiochimieTRANSCRIPT
METABOLISM PROTEIC
Proteinele sunt componente fundamentale ale celulelor animale, ce îndeplinesc funcţii
biologice variate în funcţie de complexitatea proceselor ce se desfăşoară în fiecare ţesut.
În condiţii normale, ele nu au rol energetic dar, în inaniţie, aminoacizii sunt degradaţi
fie direct, fie după transformare în glucoză, pentru obţinerea energiei necesară supravieţuirii.
Proteinele sintetizate în organism conţin cei 22 aminoacizi proteinogeni, 8 dintre ei,
aminoacizii esenţiali, nefiind sintetizaţi în organism ci preluaţi din proteinele animale şi
vegetale exogene:valina, leucina, izoleucina, triptofan, metionina, lisina, fenilalanina,
treonina. Aminoacizi semiesenţiali sunt: histidina şi arginina.
Fondul metabolic comun al aminoacizilor reprezintă totalitatea aminoacizilor liberi
existenţi în fluidele organismului, proveniţi din:
hidroliza proteinelor alimentare;
hidroliza proteinelor tisulare;
sinteza de novo din compuşi neproteici.
Dinamica fondului comun al aminoacizilor constă în echilibrul care există între
procesele prin care se formează şi cele prin care se consumă astfel încât să nu existe
aminoacizi liberi intracelular.
Aminoacizii pot să treacă de mai multe ori prin fondul metabolic până la degradarea
ireversibilă şi eliminarea din circuitul metabolic.
Proteinele din organism se degradează continuu pentru a fi resintetizate într-o altă
secvenţă. Viteza de reînnoire a unei proteine este evaluată prin timpul de înjumătăţire (turn
over) care poate fi diferit pentru proteinele din celule. De exemplu, proteinele hepatice, cu
activitate metabolică intensă, au timp de înjumătăţire mai mic comparativ cu proteinele din
piele, os, muşchi care au timp de înjumătăţire mai mare.
131
Fond metabolic comun al aminoacizilor
Fond metabolic comun al aminoacizilor
Proteine alimentareProteine
structuraleProteine funcţionale
Compuşi neazotaţi
Compuşi azotaţi neproteici
Excreţie CatabolismCO2 + NH3 + H2O + Q
În funcţie de cantitatea de azot introdusă ca proteine şi cea eliminată sub formă de compuşi
azotaţi se evaluează bilanţul azotat.
Balanţa este echilibrată dacă N ingerat = N excretat, de ex. la un subiect matur, sănătos;
Balanţa este pozitivă când N ingerat > N excretat, de ex. pentru organisme în creştere,
convalescenţă, sarcină;
Balanţa este negativă dacă N ingerat < N excretat. Ex: stări febrile, inaniţie, boli
infecţioase.
Bilanţul azotat este important pentru a stabili necesarul de proteine al organismului.
Digestia proteinelor şi absorbţia aminoacizilor
Proteinele alimentare sunt hidrolizate până la α-aminoacizi, sub acţiunea enzimelor
hidrolitice din sucurile digestive.
Majoritatea enzimelor digestive, cu excepţia celor intestinale, sunt sintetizate sub formă
de proenzime (zimogeni) inactive. Activarea se face în prezenţa H+ sau sub acţiunea unor
peptidaze ce au rolul de a detaşa secvenţe oligopeptidice realizând expunerea centrilor activi.
Sucurile digestive conţin mai multe enzime ce acţionează diferit asupra proteinelor
alimentare şi a produşilor rezultaţi din acestea.
Pătrunderea alimentelor în stomac determină eliberarea gastrinei care stimulează
secreţia de HCl şi pepsină.
Pătrunderea conţinutului gastric în intestin determină eliberarea secretinei ce stimulează
eliberarea HCO3¯ din pancreas. Aminoacizii determină eliberarea colecistokininei ce
stimulează secreţia enzimelor pancreatice cu acţiune specifică asupra proteinelor (Tabel 8.1).
Proteinele sunt hidrolizate treptat la aminoacizii componenţi care sunt absorbiţi şi aduşi
prin vena portă la ficat care-i reţine pentru nevoile proprii dar îi şi distribuie altor ţesuturi.
Absorbţia aminoacizilor este mediată de proteine specializate, numite translocaze.
132
N ingeratBilanţ azotat = N excretat
Enzime proteolitice
Endopeptidaze
Exopeptidaze
pepsinatripsinachimotripsinaelastaza
-carboxipeptidaze- aminopeptidaze
Tabel 8.1. Enzimele proteolitice şi acţiunea lor
Digestia Proenzima
(zimogen)
Enzima
Stomac
Suc gastric
pH=1,5-2,5
Gastrina
Intestin
Suc pancreatic
pH=7.8 – 8
Secretina,
colecistokinina
Suc intestinal
pH=6.2-7.3
Pepsinogen
Pepsinogen
Prolabferment
Tripsinogen
Chimotripsinogen
Proelastaza
Procarboxipeptidaza
Proaminopeptidaza
Pepsina - endopeptidază ce
scindează legături peptidice la care
participă aminoacizi aromatici.
Gastricsina – endopeptidază la
sugari.
Chimozina – în sucul gastric al
sugarului, realizează coagularea
laptelui.
Tripsina – endopeptidază ce
scindează legături peptidice la care
participă aminoacizi bazici
lisina/arginina.
Chimotripsina - endopeptidază
care scindează legături la care
participă aminoacizi aromatici.
Elastaza - endopeptidază care
scindează legături la care participă
aminoacizi cu caracter hidrofob.
Carboxipeptidaza – exopeptidază
care scindează legături peptidice
începând din capătul C-terminal
Aminopeptidaze - exopeptidaze
care scindează aminoacizii de la
capătul N-terminal
Dipeptidaze - peptidaze care rup
ultima legătură peptidică.
Există cinci sisteme de transport dependente de caracteristicile structurale ale
aminoacizilor:
1. transportor pentru aminoacizii neutri cu moleculă mică;
2. transportor pentru aminoacizii neutri cu moleculă mare;
3. transportor pentru aminoacizii bazici;
4. transportor pentru aminoacizii acizi;
133
5. transportor pentru prolină şi hidroxiprolină.
Absorbţia este selectivă, unii aminoacizi (leucină, izoleucină, metionină, triptofan) fiind
mai uşor absorbiţi, se face cu consum de energie (ATP). Aminoacizii absorbiţi constituie
fondul metabolic care-i dirijează spre biosinteza proteică sau spre degradare.
8.2. Metabolismul general al aminoacizilor
Include procesele prin care aminoacizii se degradează cu formare de intermediari ai
metabolismului glucidic şi lipidic, precum şi procesele de sinteză a aminoacizilor şi
proteinelor. Toţi aminoacizii participă la următoarele procese:
a) decarboxilarea;
b) transaminarea;
c) dezaminarea oxidativă;
d) biosinteza proteinelor.
Primele trei procese reprezintă modalităţi de catabolism al aminoacizilor.
Decarboxilarea
Reacţiile de decarboxilare sunt reacţii ireversibile prin care aminoacizii sunt
transformaţi în amine sub acţiunea unor decarboxilaze ce acţionează dependent de vitamina
B6 (sub formă de piridoxal fosfat, PALPO).
Aminele rezultate îndeplini anumite funcţii biologice sau pot fi toxice.
Amine biogene cu funcţii biologice
Histidina formează histamină, implicată în reacţiile de tip alergic, este vasodilatator.
Eliberarea histaminei din mastocite cauzează simptomele diferitelor alergii. Histamina se
leagă de receptori specifici (H1 sau H2) şi determină dilatarea vaselor de sânge, creşte
permeabilitatea capilarelor permiţând anticorpilor să treacă din capilar în ţesutul
înconjurător, determină constricţia bronhiolelor, stimulează secreţia acidă în stomac.
Medicamentele antihistaminice au proprietatea de a se lega de receptorii histaminici fără
să genereze acelaşi efect ca histamina. Se folosesc în tratamentul alergiilor, al hiperacidităţii
gastrice.
Acidul glutamic se transformă prin decarboxilare în acid γ-aminobutiric.
134
HOOC CH2 CH2 CH COOH
NH2
HOOC CH2 CH2 CH2 NH2
CO2
Glutamic decarboxilaza
PALPO
Acid glutamicAcid γ aminobutiric (GABA)
GABA este un neurotransmiţător inhibitor, fiind agent de blocare a transmiterii
impulsului nervos de la neuronul postsinaptic. Receptorii pentru GABA funcţionează ca şi
canale ionice (pentru Cl¯ sau HCO3¯ ). O producţie scăzută de GABA este asociată crizei
epileptice. Acţionează numai în creier.
Efectul etanolului asupra creierului presupune şi deschiderea canalelor pentru Cl -
dependente de GABA, ceea ce duce la o hiperpolarizare a membranei postsinaptice, făcând
neuronul rezistent la neurotransmiţătorii excitatori.
Analogi ai GABA se utilizează pentru tratamentul epilepsiei.
Aminele toxice se obţin sub acţiunea microorganismelor din flora intestinală:
Aminele toxice se formează normal în cantitate redusă şi au următoarele roluri:
intervin în procesele de putrefacţie;
în cantităţi mici sunt neurotransmiţători;
spermina participă la împachetarea ADN.
Procese de decarboxilare se desfăşoară şi în biosinteza catecolaminelor:
În creier, catecolaminele se sintetizează în neuronii simpatici şi funcţionează ca
neurotransmiţători. Rezervorul de catecolamine din creier e independent de cel din
medulosuprarenală, datorită barierei hematoencefalice, ce permite numai speciilor foarte
hidrofobe să o treacă. Noradrenalina este neurotransmiţător în joncţiunile dintre nervii
simpatici şi muşchiul neted.
Sinteza dopaminei este modificată în anumite boli neurologice:
135
producerea excesivă sau hipersensibilitatea receptorilor dopaminici sunt responsabile
pentru simptomele psihotice şi schizofrenie;
scăderea sintezei de dopamină sau a numărului de receptori pentru aceasta determină
boala Parkinson.
Şi în biosinteza serotoninei şi melatoninei apar reacţii de decarboxilare:
Serotonina (5-hidroxitriptamina) se găseşte în SNC, splină. La nivel periferic acţionează
asupra musculaturii din vasele sanguine, aparat respirator, tract digestiv, la nivelul SNC este
neuromodulator cu rol în reglarea ritmului somn/stare de veghe.
Excesul de serotonină determină intensificarea activităţii cerebrale, iar deficitul duce la
depresie.
Aminele biogene sunt şi componente structurale ale unor compuşi activi biologic.
Aminoalcoolii din glicerofosfolipide şi sfingolipide (colamina, colina) rezultă prin
decarboxilarea serinei.
Acetilcolina formată prin esterificarea colinei este un important neurotransmiţător.
Este conţinută în cantitate mare în veziculele sinaptice din sinapsele colinergice. Ca rezultat al
unui potenţial de acţiune primit de membrane, se deschid canalele de calciu şi ionii de Ca 2+
intră în umflăturile sinaptice determinând ataşarea şi fuzionarea veziculelor cu membrana.
Acetilcolina se eliberează în despicăturile sinaptice, se leagă la receptorii pentru acetilcolină
din membrana postsinaptică şi determină apariţia unui nou potenţial.
Sunt două tipuri de receptori:
muscarinici – răspund la muscarină (substanţă toxică din Amanita muscaria);
nicotinici – răspund la nicotină.
După fiecare transmisie sinaptică, acetilcolina se degradează rapid sub acţiunea
acetilcolinesterazei pentru a elibera receptorii pentru un nou potenţial.
Acetilcolinesteraza este inhibată de anumite insecticide (paration) sau gaze toxice de
luptă (sarin, tabun) care blochează impulsul nervos, opresc respiraţia şi cauzează moartea prin
sufocare.
Unii inhibitori moderaţi ai acetilcolinestrazei sunt utili terapeutic. Fizostigmina din
136
fasole şi neostigmina (sintetică) au fost folosite pentru tratarea miasteniei gravis (boală
autoimună în care organismul produce anticorpi împotriva receptorilor pentru acetilcolină şi
blochează răspunsul la aceasta).
Reacţii de decarboxilare intervin şi în sinteza taurinei, β-alaninei.
Taurina funcţionează ca slab neurotransmiţător, dar intră şi în acizii biliari conjugaţi.
Alţi compuşi rezultaţi prin decarboxilare sunt componente structurale ale unor
dipeptide, vitamine, coenzime.
Dezaminarea oxidativă
Reacţii de dezaminare pot cataliza diferite enzime care transformă aminoacizii după
reacţia generală:
L-aminoacid oxidaza din reticulul endoplasmatic nu acţionează asupra aminoacizilor
monoaminodicarboxilici şi diaminomonocarboxilici.
Cea mai importantă dezamină este L- glutamatdehidrogenaza/NADP+. Este localizată
în ficat, rinichi, creier, intestin.
137
HOOC CH2 CH COOH
NH2
CO2
CH3 CH COOH
NH2
CO2
HOOC CH2 CH2 NH2
asparticdecarboxilaza
I.Proteine
CarnozinaAnserinaCoA~SHPTA
II.Acid aspartic
α-alanina
β-alanina
Acidul α-cetoglutaric este intermediar al ciclului Krebs. Este singura reacţie prin care
organismul sintetizează α-aminoacizi prin încorporarea azotului anorganic din amoniac.
Transaminarea
Este procesul de transfer al grupării amino de la un aminoacid pe un cetoacid.La
această reacţie participă toţi aminoacizii, excepţie treonina şi lisina.
α-cetoacizii care participă la reacţia de transaminare sunt: acidul piruvic, acidul
oxalilacetic, acidul α-cetoglutaric. Acidul oxalilacetic şi acidul α-cetoglutaric sunt
intermediari ai ciclului Krebs.
Reacţiile catalizate de transaminazele ALT şi AST au fost prezentate anterior.
Determinarea activităţii celor două enzime prezintă valoare diagnostică în afecţiuni
hepatice, infarct miocardic, afecţiuni musculare, informaţiile referitoare la gravitatea bolii
fiind diferite datorită localizării diferenţiate a acestora (ALT – numai în citoplasmă, AST –
localizare mixtă şi, deci, modificare semnificativă în condiţiile unor afecţiuni ce se
cronicizează.
8.3. Metabolismul amoniacului
Amoniacul rezultă în organism din:
dezaminarea aminoacizilor;
dezaminarea bazelor purinice şi pirimidinice;
hidroliza ureei în intestin.
Degradarea amoniacului începe prin trei reacţii majore care se desfăşoară în toate
celulele:
reacţia de formare a carbamoilfosfatului, catalizată de carbamoilfosfat sintetază;
reacţia de gormare a glutamatului, sub acţiunea glutamat dehidrogenazei;
formarea glutaminei sub acţiunea glutamin sintetazei
Reacţia catalizată de carbamoilfosfat sintetază este prima reacţie din ciclul
ureogenetic, degradarea amoniacului în acest continuând cu formarea ureei.
Glutamina este preluată de fluxul sanguin şi dusă la rinichi şi ficat unde este scindată
în componentele iniţiale sub acţiunea glutaminazei.
138
În rinichi, amoniacul difuzează prin membrana celulelor tubulare şi se transformă în
NH4+ care se elimină în urină. În ficat, glutamina contribuie la procese de biosinteză
(biosinteza purinelor, pirimidinelor, a unor aminoacizi) sau eliberează amoniac pentru ciclul
ureogenetic
8.4. Ciclul ureogenetic (ciclul Krebs - Henseleit)
Enzimele ce catalizează reacţiile din ciclul Krebs sunt localizate atât în citosol cât şi în
mitocondriile hepatocitelor. Ureogeneza decurge în mai multe etape:
1. Sinteza carbamoil fosfatului sub acţiunea carbamoil fosfat sintetazei. Reacţia se
desfăşoară în mitocondrie. Enzima este activată de ionii Mg2+
2. Sinteza citrulinei în prezenţa ornitintranscarbamoilaza sau ornitin carbamoil
transferazei (OCT), tot enzimă mitocondrială.
3. Sinteza acidului argininsuccinic. Reacţia se desfăşoară în citosol, sub acţiunea :
argininsuccinat sintetazei.
139
4. Sinteza argininei, în citosol, sub acţiunea argininsuccinat liazei.
5. Hidroliza argininei în prezenţa arginazei, reacţie ce conduce la formarea ureei şi
reface ornitina care intră în mitocondrie şi poate relua ciclul ureogenetic.
8.5. Metabolismul creatinei
Creatina se sintetizează prin transferul grupei guanido a argininei pe glicină urmată de
metilarea compusului rezultat. Creatina este compusul care poate depozita energia necesară
140
contracţiei musculare sub forma fosfocreatinei (creatinfosfat). Enzimele ce catalizează
reacţiile sunt localizate predominant în rinichi, ficat, muşchi.
Procesul se desfăşoară în mai multe etape.
1. Sinteza acidului guanidoacetic catalizată de argininglicintransamidinaza
2. Metilarea acidului guanidoacetic catalizată de guanidin acetat N-metil transferaza,
reacţie ce se desfăşoară în ficat şi în care se formează creatina (acidul N-metil guanidoacetic)
3. Fosforilarea creatinei în prezenţa creatinkinazei (creatinfosfokinaza), enzimă ce
acţionează mai ales în muşchi
Fosfocreatina poate regenera ATP-ul necesar contracţiei musculare prin parcurgerea
reacţiei de mai sus în sens invers.
O mică fracţiune din fosfocreatină, constantă pentru aceeaşi masă musculară, pierde
grupa fosfat şi formează creatina liberă. Creatina, fiind deosebit de instabilă la pH bazic sau
acid, se transformă în anhidrida sa, creatinina, care trece în sânge şi apoi este eliminată pe cale
renală. Eliminarea creatininei se face prin filtrare glomerulară şi, din acest motiv, este folosită
pentru măsurarea vitezei de filtrare glomerulară prin determinarea clearance-ului de
creatinină.
8.6. Biosinteza proteinelor
141
Biosinteza proteinelor este realizată prin traducere (translaţie) care converteşte limbajul
informaţiei genetice înmagazinate în secvenţa de baze dintr-un ARNm într-o secvenţă de
aminoacizi a unui lanţ polipeptidic. Fiecărui aminoacid îi corespunde un cuvânt cod format
dintr-o anumită succesiune de nucleotide. Totalitatea cuvintelor cod formează codul genetic.
Codul genetic reprezintă relaţia dintre secvenţa de nucleotide din acizii nucleici şi
secvenţa de aminoacizi din lanţul polipeptidic.
Caracteristicile codului genetic:
a) codul genetic este universal pentru toate organismele fiind alcătuit din n3 = 64 codoni,
formaţi din câte trei nucleotide;
b) codul genetic este fără semne de punctuaţie, citirea se face neîntrerupt de la codonul
de iniţiere (AUG ce codifică metionina) până la unul din cei trei codoni stop (UAA,UAG,
UGA) care nu codifică nici un aminoacid;
c) codul genetic este degenerat – un anumit aminoacid este codificat de mai mulţi
codoni. Există trei codoni non-sens – care nu codifică nici un aminoacid;
Codonii care codifică acelaşi aminoacid diferă între ei prin baza celui de-al III-lea
nucleotid. Exemplu: UCU = serina; UCG = serina, UCA = serina.
Locul biosintezei proteinelor sunt ribozomii.
Ribozomii sunt particule ribonucleoproteice ce se găsesc în citoplasma tuturor
celulelor, precum şi în matricea mitocondrială şi stroma cloroplastelor.
Sunt sisteme care se deplasează de-a lungul ARNm matriţă coordonând interacţia între
codonii succesivi şi anticodonii corespunzători din aa-ARNt.
Ribozomii eucariotelor au două situsuri principale: situsul aminoacil (A) pe care se
leagă aminoacil-ARNt şi situsul peptidil (P) pe care se leagă peptidul (Figura 8.1).
Figura 8.1. Ribozomul funcţional
142
La procariote mai există şi situsul de ieşire (I) pe care se leagă ARNt înainte de a ieşi
din ribozom.
Ribozomii conţin enzimele care catalizează formarea legăturilor peptidice între
aminoacizii aliniaţi pe baza recunoaşterii codon-anticodon.
Biosinteza proteinelor din toate celulele se desfăşoară în trei etape :
a) iniţiere
b) propagare (elongare);
c) terminarea sintezei
Donorul de energie pentru fiecare etapă este GTP. La fiecare etapă participă factori
proteici specifici.
Iniţierea presupune legarea ARNm la subunitatea mică a ribozomului urmată de
ataşarea unui aa-ARNt iniţiator particular care recunoaşte primul codon. La situsul P
recunoaşterea se face pe baza complementarităţii codon (din ARNm)-anticodon din ARNt.
Aminoacidul iniţiator este N-formil metionina la procariote şi metionina la eucariote.
După legarea aa-ARNt, se leagă şi subunitatea mare pregătind complexul pentru
elongare. Complexul format se numeşte ribozom funcţional (Figura 8.1).
Elongarea include sinteza tuturor legăturilor peptidice de la prima până la ultima.
Ribozomul se deplasează de-a lungul ARNm şi transformă mesajul în secvenţa de aminoacizi.
La cele două situsuri sunt legate tot timpul doar două molecule de ARNt. După ce se
formează legătura peptidică între aminoacidul de pe situsul P şi cel de pe situsul A, peptida
formată rămâne pe situsul A. Când ribozomul se deplasează spre capătul 3` al ARNm, peptida
trece pe situsul P odată cu eliberarea situsului A şi îndepărtarea ARNt. La situsul A se va lega
un nou aa~ARNt şi se va relua reacţia.
Întreruperea se realizează atunci când ribozomul ajunge la un codon „stop” din
ARNm. Se eliberează lanţul polipeptidic şi ribozomul funcţional disociază.
Reglarea biosintezei proteinelor. Procesul de biosinteză a proteinelor este reglat prin
controlul procesului de translaţie. Reglarea implică procese de fosforilare şi defosforilare a
componentelor ce intervin în translaţie şi deci de activare sau inactivare a acestora.
Reglarea se face mai ales în faza de iniţiere.
Inhibarea biosintezei proteice. Inhibitorii sintezei proteinelor s-au folosit în două
direcţii principale: i) pentru elucidarea mecanismului biosintezei şi ii) utilizarea ca
antibiotice, deoarece unii dintre ei afectează numai sinteza proteinelor la procariote şi nu la
eucariote. În tabelul 8.1. sunt prezentate câteva dintre efectele unor inhibitori ai biosintezei.
Pe măsură ce se sintetizează, proteinele se pliază pentru a adopta structura
tridimensională specifică (protein folding).
143
Pentru pliere, proteinele sunt asistate de nişte proteine ajutătoare cunoscute sub
denumirea de chaperoni moleculari. Proteinele pliate necorespunzător sunt catabolizate
intracelular cu participarea componentelor sistemului ubiquitină – proteasom.
În afară de pliere, proteinele pot suferi şi alte modificări covalente ulterior sintezei
cunoscute sub denumirea de prelucrări posttraducere.
Exemple de prelucrări posttraducere:
prelucrarea proteinelor sintetizate ca proenzime (zimogeni) inactive şi care se
activează ulterior prin proteoliză;
iodurarea resturilor de tirozină din tireoglobulină;
hidroxilarea prolinei şi lisinei pentru sinteza colagenului;
fosforilarea unor proteine;
glicozilarea glicoproteinelor.
Tabel 8.1 Efectele unor inhibitori ai biosintezei proteinelor
Inhibitor Sistem inhibat Mod de acţiune
Iniţiere:
Streptomicina
Elongarea:
Streptomicina
Tetraciclina
Cloramfenicol
Eritromicină
Cicloheximida
Acid fusidic
Toxina difterică
Terminare prematură
Puromicina
Procariote
Procariote
Procariote
Procariote
Eucariote
Procariote
Eucariote
Eucariote
Eucariote
Inhibă legarea formil
metionin~ ARNt
Citire incorectă a codonilor
Inhibă legarea aa~ARNt la
situsul A
Inhibă activitatea peptidil
transferazei.
Inhibă transferul
peptidil~ARNt
Inhibă diferiţi factori
implicaţi în translocare.
Este un analog de structură
al aa~ARNt şi acţionează ca
144
Procariote acceptor al restului peptidil
ceea ce induce terminarea
prematură a elongării
145