INCD Victor Babe Laboratorul de Genetic Medical

DIRECII ACTUALE DE CERCETARE

n prezent, Laboratorul de Genetic Medical este dedicat studiilor genetice n dou domenii importante ale patologiei umane:

hemato-oncologie: studiul neoplaziilor hematologice vizeaz mecanismele genetice ale leucemogenezei, progresiei tumorale i rezistenei la terapie (modificri la nivel genomic, cromozomial, genic i de expresie genic);

neuropsihiatrie: studiul afectiunilor neuropsihiatrice este orientat ctre tulburrile cognitive i comportamentale izolate sau sindromice, fiind urmrite modificrile la nivel genomic i cromozomial. O atenie deosebit este acordat bolilor rare, cu accent pe sindroamele ce asociaz dizabiliti intelectuale i bolile din spectrul autist.

Investigarea aspectelor genetice ale patologiilor abordate se bazeaz pe utilizarea tehnologiilor genomice, metodologiilor de genetic molecular (tehnologii PCR, secveniere), citogeneticii moleculare i clasice.

Laboratorul nostru colaboreaz n mod curent cu clinici i departamente universitare din Bucureti. In acest context, strategia de cercetare include exploatarea materialului biologic unic provenit de la pacieni pentru detectarea i caracterizarea modificrilor genetice de importan clinic. Datele obinute contribuie la mbogirea cunotinelor referitoare la patologiile abordate, avnd ca scop final optimizarea managementului clinic al pacienilor. Dezvoltarea infrastructurii de cercetare, realizat n perioada 2007-2009 din fondurile Proiectului Capaciti 29/2007 - Infrastructur avansat pentru cercetri de citogenetic molecular medical, a creat baza material necesar unei cercetri performante, n bune condiii de management al calitii. Utilizarea echipamentelor i programelor specializate de nalt performan, implicit a tehnicilor de investigaie moderne contribuie decisiv la creterea calitii activitii de cercetare i diagnostic, la extinderea i eficientizarea activitilor curente, precum i la armonizarea capacitilor noastre cu performanele europene n domeniul complex al geneticii moleculare i citogeneticii umane.

TEHNOLOGII GENOMICE

MICROARRAY: Hibridizare comparativ genomic bazat pe microarray (aCGH) Investigarea anomaliilor structurale genomice i implicit identificarea unor gene amplificate sau deletate, cu aplicaii n:

Patologia neuropsihiatric ce asociaz tulburri cognitive i de comportament: o Autism. o Sindroame de microdeleie/microduplicaie. o Dizabiliti intelectuale nencadrabile n sindroame genetice bine definite.

Neoplazii hematologice.

INCD Victor Babe Laboratorul de Genetic Medical

Platform utilizat: Agilent - un ansamblu de echipamente (Agilent Bioanalyzer i vortex destinat pregtirii cipurilor, microcentrifugi, cuptor de hibridizare, Agilent Microarray C Scanner with Surescan, computere i programe specializate destinate desfurarii experimentelor, extraciei i analizei datelor) pentru aplicaii de tipul: hibridizarea genomic comparativ bazata pe microarray (aCGH), analiz de expresie genic i studiul modificarilor epigenetice la nivel genomic.

Metode de validare a rezultatelor: FISH i real-time PCR cantitativ

GENETIC MOLECULAR PCR cantitativ (tehnologie TaqMan, SYBRGreen, etc): pentru analiza de dozaj, n vederea

validrii rezultatelor de microarray. PCR cantitativ de revers-transcriere: pentru evaluarea cantitativ a tipurilor de transcripi de

fuziune observai n neoplazii hematologice. Analiza modelului de metilare prin PCR specific de metilare. PCR clasic PCR de revers-transcriere: pentru evaluarea calitativ a tipurilor de transcripi de fuziune n

neoplazii hematologice. Echipamente PCR i real-time PCR (Corbett), cu aplicaii multiple n genetica molecular;

Secveniere (n colaborare cu Departamentul de Biochimie i Biologie celular, Facultatea de Biologie, Universitatea Bucureti): prin metoda clasic de secveniere Sanger.

CITOGENETIC Citogenetic clasic: analiza cromozomilor metafazici prin bandare GTG. Alte metode de

bandare pot fi utilizate n funcie de regiunea cromozomial de interes: CBG, NOR. FISH - hibridizare fluorescent in situ: laboratorul nostru are o experien de 7 ani n studii

FISH pe cromozomi sau celule interfazice, utiliznd o mare varietate de sonde: painting, centromerice, telomerice i locus specifice. De asemenea, n laboratorul nostru a fost iniiat o colecie de sonde FISH obinute n laborator pe baza clonelor BAC (cromozomi artificiali bacterieni).

Echipament: microscop motorizat Axio lmager Z1, dotat cu camer CCD de nalt sensibilitate i programe specializate, destinat studiilor de microscopie optic n lumina transmis i epifluorescen. Automatizarea analizei preparatelor citogenetice este realizat prin identificarea i captarea metafazelor cu programul Metafer4, prelucrarea imaginilor, cariotiparea i nregistrarea datelor n baze de date specializate cu programul Ikaros Metasystem, captarea i prelucrarea imaginilor fluorescente cu programul Isis Metasystem.

INCD Victor Babe Laboratorul de Genetic Medical

PERSPECTIVE DE DEZVOLTARE

Perspective pe termen scurt i mediu: investigarea modificrilor genomice, inclusiv a variaiilor numrului de copii (CNV) asociate

unor tipuri tumorale specifice, n vederea inelegerii rolului potenial patogen jucat de acestea i a valorii lor de prognostic;

investigarea alterrilor genomice n patologia neuropsihiatric, cu scopul stabilirii de corelaii genotip-fenotip i nelegerii rolului diverselor entitti n patogenez i, n ultima instan, n ontogenez;

studiul profilelor de expresie genic, la nivelul ntregului genom, n patologia hemato-oncologic i neuropsihiatric.

Perspective pe termen lung: studiul variaiilor structurale genomice i a modificrilor transcriptomice n organisme model i

implicarea acestora n patologia tumoral i/sau generarea defectelor cognitive.