biochimie- enzime

23
ENZIME nzimele sunt catalizatorii lumii vii - biocatalizatori NOŢIUNI INTRODUCTIVE o catalizează reacţiile biochimice din organism o rol esenţial în biosinteza şi degradarea substanţelor din materia vie Există peste 2000 de enzime diferite Primele enzime izolate = fermenţi inteza enzimelor are loc în interiorul organismelor i pot exercita acţiunea şi atunci când sunt extrase anism, şi în afara acestuia 1

Upload: cernea-manuela

Post on 05-Jan-2016

213 views

Category:

Documents


14 download

DESCRIPTION

biochimie

TRANSCRIPT

Page 1: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME

Enzimele sunt catalizatorii lumii vii - biocatalizatori

NOŢIUNI INTRODUCTIVE

o catalizează reacţiile biochimice din organism o rol esenţial în biosinteza şi degradarea substanţelor din materia vie

Există peste 2000 de enzime diferite

Primele enzime izolate = fermenţi

Sinteza enzimelor are loc în interiorul organismelor

Îşi pot exercita acţiunea şi atunci când sunt extrase din organism, şi în afara acestuia

1

Page 2: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIMENOŢIUNI INTRODUCTIVE

d.p.d.v. chimic enzimele sunt PROTEINE cu rol funcţional îşi pierd puterea catalitică sub acţiunea:

- căldurii;- acizilor şi a bazelor tari;- solvenţilor organici

substanţa asupra căreia acţionează enzimele = SUBSTRAT

forma inactivă – proenzime – trec în stare activă când celula are nevoie endoenzime – îşi desfăşoară activitatea chiar în celulele în care sunt biosintetizate exoenzime – deşi biosintetizate în celule, sunt eliminate în lichidele din organism, exercitându-şi acţiunea la acest nivel

2

Page 3: biochimie- Enzime

De exemplu: o reacţie - în prezenţa unei enzime poate dura o secundă

- în absenţa enzimei durează 12 zile

ENZIMEENZIME

o permit ca reacţiile biochimice să fie considerabil accelerate

CARACTERISTICI

o acţionează în cantităţi extrem de mici o le regăsim intacte la sfârşitul reacţiei

o măresc viteza reacţiilor – prin scăderea Eactivare a substratului

o se disting printr-o caracteristică - specificitate

3

Page 4: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME

Substraturile (A şi B) în condiţii normale necesită o cantitate de energie considerabilă (E1) pentru a

atinge starea de tranziţie A...B, după care produsul de reacţie (AB) se poate forma.

Enzima (E) crează un microclimat propice în care A şi B pot să atingă starea de tranziţie (A...E...B) mai uşor, reducând astfel cantitatea de energie necesară (E2).

CARACTERISTICI

4

Page 5: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME

denumire constituită din 3 părţi:

NOMENCLATURA

o denumirea substratului

o tipul de reacţie

exemplu: lactat-dehidrogenaza

o sufixul -ază

C=O

COOH

CH3

C-OH

COOH

CH3

H-2H2

acid lactic acid piruvic

lactat-dehidrogenaza

5

Page 6: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIMESTRUCTURA

numeroase enzime au o structură binară

edificiu macromolecular complex determinat de nivelurile de organizare structurală ale proteinelor

o componenta proteică - APOENZIMA

o componenta neproteică - COFACTORIHOLOENZIMA

Activă d.p.d.v. catalitic

prin îndepărtarea cofactorului – rămâne componenta proteică – inactivă în formă liberă6

Page 7: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIMESTRUCTURA

componenta neproteică - COFACTORI

componenta proteică - APOENZIMA o manifestă proprietăţile generale ale proteinelor

o stabileşte legătura enzimei cu substratul

o manifestă diferite grade de afinitate pentru cofactor

o sunt indispensabili pentru manifestarea activităţii catalitice

o imprimă specificitate de substrat

o imprimă specificitate de acţiune7

Page 8: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIMESTRUCTURA

componenta neproteică - COFACTORI

1. COENZIME

2. GRUPĂRI PROSTETICE

3. IONI METALICI

- substanţe organice- fixate pe apoenzimă- greu disociabile de apoenzimă – leg. cov.- piridoxalfosfatul, hemul

- Mg2+, Mn2+, Cu2+, Zn2+, Fe2+(3+), Mo2+

- enzimele ce conţin ioni metalici = metal-enzime

- derivaţi de la vitamine- se ataşează temporar de apoenzimă- uşor disociabile de apoenzimă- NAD+, NADP+, FMN, FAD, ATP

8

Page 9: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

o diferă de catalizatorii neproteici

9

o proprietate caracteristică - specificitatea

DEFINIŢIE

Prin specificitatea unei enzime se înţelege proprietatea sa de a acţiona preferenţial numai asupra unui substrat sau grup de substraturi cu caractere chimice comune.o specificitatea de reacţieo specificitatea de substrat

- specificitate absolută- specificitate de grup- stereospecificitatea

Page 10: biochimie- Enzime

R CH2

NH2

decarboxilaza+ CO2

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

10

o specificitatea de reacţie (acţiune)- se manifestă asupra unui singur substrat de către mai multe enzime, fiecare catalizând o anumită reacţie- exemplu: un α-aminoacid poate constitui substratul pentru mai multe enzime

R CH

NH2

COOH

R CH

COOH

OH

oxidaza+ NH3

R CO COOHtransaminaza

Page 11: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

11

o specificitatea de substrat - se referă la activitatea care o manifestă enzimele faţă de anumite substraturi

- exemplu: ureaza hidrolizează numai ureea

SPECIFICITATE ABSOLUTĂ- unele enzime nu acţionează decât asupra unui singur substrat fiind inactive faţă de altele cu structură asemănătoare

O=CNH2

NH2 ureazaCO2 + 2NH3

H2O

Page 12: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

12

o specificitatea de substrat

- exemplu: arginaza hidrolizează numai arginina

SPECIFICITATE ABSOLUTĂ

NH2

C=NH

NH

CH2)3

CH NH2

COOH

NH2

CH2)3

CH NH2

COOH

C=O

NH2

NH2

arginaza

H2O(

(

arginina

ornitina uree

+

Page 13: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

13

o specificitatea de substrat

STEREOSPECIFICITATEA

- unele enzime au stereospecificitate faţă de izomeria cis-trans

- exemplu: fumaraza acţionează numai asupra acidului fumaric şi este inactivă asupra izomerului său cis – acidul maleic

H

H COOH

HOOC H

H H OHCOOH

HOOCfumaraza

H2O

acid fumaric acid malic

Page 14: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

14

o specificitatea de substrat

STEREOSPECIFICITATEA

- unele enzime manifestă o acţiune specifică faţă de o anumită formă stereoizomeră a substratului

exemplu: L-aminoacid-oxidazele nu recunsoc decât L-aminoacizii

- unele enzime fac distincţie între conformaţiile α şi β din legăturile glicozidice

exemplu: maltaza hidrolizează numai legătura (1-4) α glicozidică din molecula de maltoză şi nu atacă legătura (1-4) β glicozidică din celobioză

Page 15: biochimie- Enzime

ENZIME

ENZIME

SPECIFICITATEA ENZIMELOR

15

o specificitatea de substrat

- exemplu: amilaza hidrolizează amidonul, dextrinele, glicogenul

hexokinaza catalizează fosforilarea unei serii de hexoze în prezenţa de ATP

SPECIFICITATE de GRUP

- unele enzime acţionează asupra unei serii de substraturi apropiate ca structură

Page 16: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIMEMECANISM DE ACŢIUNE

17

o scăderea energiei de activare se datorează formării unui complex activat între enzimă (E) şi substrat (S)

K1

K2

K3

o ipoteza formării complexului intermediar activat ES a fost emisă de Michaelis şi Menten

Page 17: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIMEMECANISM DE ACŢIUNE

18

o la formarea complexului activat, substratul se fixează pe centrul activ al enzimei

o enzima participă cu o porţiune limitată din structura sao pe această porţiune există grupări capabile să atragă şi să fixeze molecula substratului

o ansamblul acestor grupări chimice = centru activ = centru catalitic

Page 18: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIMEMECANISM DE ACŢIUNE

19

o între centrul activ şi molecula substratului există complementarităţi conformaţionale şi chimice care permit asamblarea lor

o ipoteza “LACĂT-CHEIE”

Page 19: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME Factorii care influenţează cinetica reacţiilor enzimatice

concentraţia enzimei

concentraţia substratului

temperatura

pH-ul

activatorii şi inhibitorii

Page 20: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME concentraţia enzimei

viteza de reacţie este direct proporţională cu concentraţii crescânde ale enzimei până la o limită

la concentraţii mari de substrat, toate situsurile catalitice ale moleculelor de enzimă sunt complet saturate cu substrat şi nu mai există enzimă disponibilă

concentraţia substratului

Page 21: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME

diminuarea activităţii enzimei până la anularea ei se explică prin denaturarea termică a enzimei

enzimele încălzite dincolo de o anumită temperatură îşi pierd ireversibil activitatea

temperatura optimă pentru cele mai multe enzime – 30-40ºC

majoritatea enzimelor sunt inactivate printr-o încălzire peste 55ºC

există enzime care rezistă la temperatura de 100ºC

la temperaturi scăzute, enzimele au o activitate foarte lentă chiar nulă, dar prin ridicarea temperaturii ele devin din nou active

temperatura

Page 22: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME valoarea pH-ului optim al diverselor enzime coincide în general cu pH-ul lichidelor din organism unde ele îşi exercită acţiunea

exemplu: pH-ul optim al pepsinei este de 1,5-2,5 realizat în sucul gastric de HCl

exemplu: pH-ul optim al tripsinei este de 8-11 identic cu pH-ul sucului pancreatic

majoritatea enzimelor vegetale activează bine la un pH în jur de 6-7

pH-ul

activatorii şi inhibitorii sunt compuşi de natură organică sau anorganică

capabili să mărească sau să diminueze (în concentraţie mică) activitatea enzimatică şi implicit viteza reacţiei enzimatice

Page 23: biochimie- Enzime

ENZIMEENZIME în funcţie de tipul reacţiei pe care o catalizează – 6 clase

CLASIFICARE

oxidoreductaze transferaze

hidrolaze

liaze

izomeraze

ligaze

- catalizează reacţii de tip redox

- catalizează reacţii de transfer

- catalizează reacţii de scindare cu participarea apei

- catalizează reacţii de desfacere în care nu apar fenomene de tip redox sau hidroliză

- catalizează reacţii de izomerizare a substanţelor

- catalizează reacţii în care se formează legături chimice noi