variabilitatea genetica - curs

Upload: serban-cristina-georgiana

Post on 07-Jul-2018

244 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    1/156

    Variabilitatea genetica(curs pt studentii anului I Medicina UMF Carol Davila2014/2015/201!

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    2/156

    V" #$%& '" U I) *$'+"+I*, 'I+,-U#I *U.)IC,

    Acest curs este doar pentru uz personal.

    Dr. Dragotoiu

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    3/156

    Genetica – 2 laturi

    EREDITATEA VARIABILITATEA

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    4/156

    DEFINITIE

    Variabilitatea descrie potentialul sau

    capacitatea de a varia, de a fi diferit.

    La nivel molecular, variabilitatea genetica

    poate fi estimata prin determinarea ratei

    mutatiilor .

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    5/156

    DEFINITIE: aria!ilitateaeste "#$ tendinta caracteristicilor %enetice

    indiiduale de a & di'erite la niel

    populational

    "2$ potentialul unui %enotip de a se

    (odi&ca) atunci cand este supus actiunii

    unor 'actori de (ediu sau %enetici 

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    6/156

    *e(ni&catiaVG

    +u cat VG este (ai (are cresc sansele

    de adaptare la (odi&carile (ediului) deci

    rezistenta (ai (are la !oli) la (odi&cari

    ale cli(ei) la specii co(petitoare) etc.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    7/156

    Cat de diferiti sunt acesti oameni?

    Din cele

    ,.---.---.--- de

    !aze azotate ale

    %eno(ului u(an in

    (edie //./0 suntsi(ilare

    Adica apro1i(ati o!aza azotata din

    #--- este di'erita.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    8/156

    Deci intre 2

    persoane) intr

    o secenta "a

    unei catene$ de

    #--- p! e1ista

    o sin%ura

    di'erenta.

    Diferenta aici

    (mai putin

    evidenta) este

    inlocuirea C cu

    G.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    9/156

    Intre 2 persoane neinrudite& cate

    dierente vor in secventa de "D

    Ce trebuie sa luam in considerare?

    ?

    Raspuns: 6.000.000?

    •  1 diferenta la 1000 de baze•  3.000.000.000 baze/ set genomic•  2 seturi genomice/ persoana

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    10/156

    *urse de

    aria!ilitate Pentru ca selectia naturala sa poata actiona in

    cadrul unei populatii, este nevoie ca indivizii ce o

    alcatuiesc sa fie diferiti.

    Variabilitatea la eucariote are urmatoarele

    mecanisme posibile:

    !. "paritia mutatiilor

    #. $iploidia %. Reproducerea se&uata

    '. (ncrucisarile in afara speciei

    . Polimorfismele fenotipice ec)ilibrate in populatia

    studiata

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    11/156

    Natura doedeste cale%endele isi au

    radacinile in realitate.

    Mutatia = sursa devariabilitate

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    12/156

    3utatiile asi%ura aparitia unor noi

    ariante alelice "polialelis( sau

    poli(or&s( %enic$.

    Diploidia) adica prezenta celor doi

    cro(ozo(i o(olo%i in celule)contri!uie la pastrarea in

    %eno'ond "4 totalitatea %enelor

    unei populatii$ a alelelor recesie.In stare de 5eterozi%otie aceste

    alele nu sunt supuse selectiei

    naturale) ra(an 6ascunse7 si

    6depozitate7 pentru %eneratiile

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    13/156

    Reproducerea se1uata creeazaindiizi cu noi co(!inatii alelice.

    Aceste rearanjamente  "sau

    aceasta reco(!inare %enetica$ isiau ori%inea in , eeni(ente) care

    au loc in cazul or%anis(elor cu

    reproducere se1uata: #. crossin%oerul 2. asortarea independenta a

    o(olo%ilor

    ,. cuplarea inta(platoare a %a(etilor

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    14/156

    Recombinarea intracromozomica

    !. Crossing * overul sau sc)imbul de

    fragmente egale de "$+ intre

    cromatidele nesurori ale cromozomilor

    omologi din pa)itenul si diplotenulprofazei meiozei reductionale

    )eterotipice are drept urmare

    modificarea continutului informational al

    cromozomilor recombinanti. "cesti

    cromozomi nu vor mai aduce informatia

    de la un singur ascendentpredecesor.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    15/156

    Meiotic chromosome pairing culminates in the formation of the synaptonemal complex

     

    Pentru a avea loc recombinarea intracromozomica

    cromozomii omologi alcatuiesc bivalenti (tetrade)

    fiind uniti prin compleul sinaptonemal.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    16/156

    !iecare cromatida este alcatuita

    din "D# bicatenar(si proteine).

    (n anumite puncte "$+ul se rupe

    si o catena se desface de cea

    partenera -complementara.

    Monocatenele libere cauta impre$ur o

    alta catena cu care sa se uneasca prin

    complementaritatea bazelor azotate.

    +oua /partenera nu poate fi

    cromatida sora, ci trebuie

    sa fie din componenta

    cromozomului omolog.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    17/156

     #ou unitele fragmente mono%

    catenare sunt complementare.

    !ragmentul ce alcatuia inainte

    dubla catena (desenat in negru)

    este impins la distanta& solutia

    fiind unirea sa cu catena

    'singura de pe cromozomul

    omolog.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    18/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    19/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    20/156

    $ar de ce nu se despart

    aceste fragmente

    catenare -nou imbinate

    cand fibrele fusului de

    diviziune se depoli*

    merizeaza si trag cu forta

    de 2inetocor?

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    21/156

    Crossing over*ul leaga

    omologii, acolo unde

    era comple&ul

    sinaptonemal.

    $ar ce leaga

    cromatidele?

    i de ce in metafaza * sunt micro

    %tubuli atasati unilateral spre

    deosebire de metafaza **?

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    22/156

    Cromatidele surori sunt unite prin coezina, iar

    astfel ele nu se despart in meioza (.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    23/156

    Coezina mentine unite

    cromatidele surori din 3

    pana in metafaza.

    Proteinele MC

    (structural

    maintenance of

    c+romosomes)

    alcatuiesc

    C,-*#"

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    24/156

    *n "#"!""

    fosfataza cdc/0

    activeaza "PC

    (anap+ase 1

     promoting comple)&

    care la randul sau

    activeaza separaza&

    care desface inelele

    de coezina ce tin

    atasate cromatidele

    surori.

    -venimente care au loc in orice diviziune.

    s

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    25/156

    !ibre opuse ale fusului de diviziunetrag2imping 3inetocorii omologilor catre

    ecuatorul celulei& astfel incat ii aliniaza

    in 'placa metafazica.

    ,mologii sunt trasi

    spre polii celulei& *"R

    CR,M,,M** 4,R

    !* R-C,M5*#"#6*

    45(7" (

    3eparaza taie inelele de

    coezina eceptand

    centromerul.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    26/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    27/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    28/156

    e observa comparativ

     prinderea microtubulilor la

    nivelul 3inetocorului in

    metafaza * si **.

    De asemenea 7imbratisarea8

    sau 7impletirea8 cromatidelor

    de la doi cromozomi omologi in

    vederea recombinarii

    intracromozomice

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    29/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    30/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    31/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    32/156

    8rin asortarea independenta a cro(ozo(ilor se pot

    'or(a 22, tipuri de %a(eti) adica peste 9) (ilioane

    de %a(eti di'eriti) la &ecare dintre cele doua se1e.

    Dupa 'ecundare pot rezulta teoretic 2; co(!inatii)

    aloare ce depaseste de opt (ii de ori populatia

    actuala a %lo!ului.

     Aceste cifre sunt insa calculate pentru situatia in

    care cromozomii se deosebesc prin alelele unei

    singure perechi de gene, ceea ce nu corepunde

    realitatii!

    In concluzie &ecare indiid are o structura %enica

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    33/156

    Reco(!inarea %eno(ica

    ,. +o(!inarea inta(platoare a %a(etilor in cursul 'ertilizarii contri!uie la

    diersi&carea co(!inatiilor %enice lanielul zi%otului.

    Desi se considera ca &indun eeni(ent in (are

    (asura supus inta(plarii)nu toti sper(atozoizii auaceeasi iteza dedeplasare "le%at se pare

    de 'or(a lor$.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    34/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    35/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    36/156

    Incrucisari in a'ara speciei

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    37/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    38/156

     8oli(or&s(ele 'enotipice

    ec5ili!rate in populatiastudiata

    Deseori un sin%ur 'enotip asi%uracea (ai !una adaptare) in ti(p cealtele sunt (ai putin aanta=oase

    In ast'el de cazuri) 'recenta alelelor

    pentru caracterul aanta=os acreste in populatie in detri(entul'recentei celorlalte alele">dezec5ili!ru?$

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    39/156

    8oli(or&s(ele 'enotipice Aanta=ul 5eterozi%otilor apare atunci cand

    starea de 5eterozi%ot acorda un aanta=

    selecti superior starii de 5o(ozi%ot) a.i

    toate cele , %enotipuri si i(plicit

    'enotipurile pe care le deter(ina) se or

    pastra in cadrul populatiei.

    In cursul eolutiei de o!icei la un (o(ent

    dat au predo(inat 5eterozi%otii) adaptati

    (ai !ine conditiilor de (ediu.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    40/156

    *n alcatuirea unei molecule de +emoglobina intra lanturi de globina

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    41/156

    Genele care codi&ca %lo!ina) in 'unctie de perioadaonto%enetica.

    >& altele pe cromozomul >

    @emoglobina " este

    alcatuita din doua

    lanturi alp+a si doua

    lanturi beta de

    globina& urmare a

    activarii genelor cu

    acelasi nume la

    adult

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    42/156

    Paloare(anemie)

    5ose frontaleA

    febra

    @epato% si

    splenomegalie

    (+emoliza)

    DureriDureri

    osoase

    -deme palmare si plantareA

    !rotiu sanguin: +ematii in

    secera

     #u toti copii

    au tabloul

    clinic complet

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    43/156

    *u!stitutiapuncti'or(a "A T$din codonul ; al B–%lo!inei deter(ina

    inlocuirea aciduluiglutamic cu valina.

    transersie: purina inlocuita cu

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    44/156

    -lectroforeza +emoglobinei unui +eterozigot& a unei persoane cu anemiefalciforma si a uneia normale. Petele de culoare arata pozitiile in care au

    migrat +emoglobinele in gelul de agaroza fata de punctul de origine

    Care este

    oare tipul de

    transmitere aacestei boli?

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    45/156

    M"

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    46/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    47/156

    deces

    selectati

    deces

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    48/156

    In i(a%inea anterioara sa putut o!sera

    cu( in ur(a cu sute de ani (utatiaproducatoare de !* sa pastrat in cadrulpopulatiei u(ane.

    In acel (o(ent) starea de 5eterozi%ot era

    aanta=oasa) deoarece nu e1ista untrata(ent pentru (alarie.

    Astazi) populatiile cu risc crescut suntconsiliate) sa e'ectueze analize prenuptiale inederea cunoasterii posi!ilei stari de5eterozi%ozitate.

    Daca sotii sunt 5eterozi%oti se reco(andadia%nosticul prenatal. Daca produsul deconceptie se doedeste a & 5o(ozi%ot

    pentru (utatia cauzatoare de ane(ie

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    49/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    50/156

    Varia!ilitatea  Trans'erul ADNului poate sa se 'aca

    si prin alte (ecanis(e) in a'ara de

    reproducere se1uata) reco(!inare sianu(e prin: con=u%area !acteriana

    transductia dintre !acterio'a%i si

    !acterii trans'or(area !acteriilor prin

    plas(ide

    trans'ectia in culturi de celule

    eucariote

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    51/156

    Reco(!inarea la

    !acterii In #/;) Leder!er% si Tatu( au

    aratat ca in'or(atia %enetica poate

    & sc5i(!ata trans(isa de la o!acterie la alta sau de la o tulpinade !acterii la alta.

    Aceasta ar corespunde unei asa

    nu(ite 6se1ualitati7 si ar conduce lareco(!inarea (aterialului %eneticla procariote

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    52/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    53/156

    *n >E/ Fos+ua si -st+er

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    54/156

    5&perimentul identifica bacteriile mutante

    Primul vas Petri contine colonia martor2normala*n al doilea este cultura cu mediu mai putin nutritiv (= minimal)& iar in

    urmatoarele doua este mediu minimal imbogatit diferentiat .

    5acteriile care lipsesc in al doilea vas sunt fie deficitare in 6+r& fie in "rg&

    fapt dovedit de prezenta unora in al treilea si a altora in al patrulea vas

    Petri& unde s%a adaugat cate unul din acesti aminoacizi.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    55/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    56/156

    6ulpina " necesita metionina si biotina& iar cea 5 treonina si leucina.

    "par insa colonii pe un mediu minimal& fara a.a.& cand se cultiva impreuna

    cele / tulpini.

    *nterpretare: a avut loc o recombinare intre tulpinile " si 5.

    Proprietatile genetice ale celulelor din tulpinile parentale s%au completat

    reciproc (7complementare genetica8)

    R !i

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    57/156

    Reco(!inarea la !acterii

    c+imbul de material genetic intre bacterii

    (C,#FG"R-") a fost evidentiat cu microscopul

    optic.

    6ransferul de "D# bacterian decurge numai intr%unsingur sens: materialul cromozomial 7masculin8 este

    introdus intr%o celula 7feminina8

    5acteriile -sc+eric+ia coli difera in functie de

     prezenta2absenta factorului de fertilitate ! Cand sunt miate celule !H si !%& se formeaza niste

     perec+i 'con$ugale: un pil(us) seual al bacteriei

    masculine (!H) se ataseaza la suprafata celulei !%.

    Reco(!inarea

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    58/156

    Reco(!inareala !acterii

    !actorul ! (de fertilitate)

     poate fi integrat (>) in cz.

     bacterian printr%un

    crossing%over specific.

    Cz. nou format se numeste

    @fr (7+ig+ freIuencJ of

    recombination8)& deoarece are

    o frecventa mare de

    recombinare cu genele

    altor bacterii in urma

     procesului de con$ugare.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    59/156

    Recombinarea

     bacteriana

    5acteriile pot contine factorul ! de fertilitate sub

    forma unui cz. mic aditional (/)& respectiv o molecula

    circulara de "D# de apro. 000pb& plasmidul !

    "cesta reprezinta cam >20

    din totalul informatiei

    genetice continute in cz.

     bacterian.

    *ntr%o celula apare un singur

     plasmid si el poate fi

    transferat altei bacterii.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    60/156

    "pro. >2 din "D#ul

    factorului ! (plasmidului)

    consta din gene de transfer&

    inclusiv gene pentru

    formarea pililor seuali.

    6ransferul factorului ! incepe dupa ce

    se desc+ide dubla catena. ,

    monocatena este transferata celulei

    acceptoare& se replica si devine dubla.i monocatena ramasa in celula

    donoare se replica redevenind dubla.

    *n final ambele celule sunt de tip !H

    Reco(!inarea

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    61/156

    Reco(!inarea!acteriana

    @neori cro(ozo(ul se rupe in ti(pul

    trans'erului. Ast'el) !acteriile F receptoare (ostenesc o

    copie inco(pleta a ele(entului F.

    +elulele F ) care au pri(it doar o parte din cz.

    donor se nu(esc zi%oti partiali sau 5e(izi%otisi ra(an de tip F

    Daca trans'erul este co(plet) !acteria

    receptoare a (osteni un ele(ent F co(plet

    si proprietatea 'r descendentii sai or & tot

    celule 'r) respecti F

    +and cro(ozo(ii !acterieni contin di'eriti

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    62/156

    5acteriofag =

    4irus bacterianDesi initial (>>) s%a

    crezut ca s%a identifi%

    cat o modalitate de

    combatere a infectii%

    lor bacteriene& de faptacestia au fost utilizati

     pt a analiza bacteriile.

    Reproducerea bacteriofagilor nu

    are loc totdeauna imediat dupainfectarea celulei.

    ,cazional& "D#ul fagic este

    integrat in cz. bacterian si

    replicat odata cu acesta (ciclul

    lizogenic)

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    63/156

    *n acest caz bacteriofagul

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    64/156

    *n >E/ inder si

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    65/156

    - 8. eneralizata: fagul

    se insera oriunde in

    genomul gazdei

    - 8. 3pecializata: fagul seinsera numai la nivelul

    unui segment de "D#

    cz. particular 

    6ransductia poate

    fi de / feluri:

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    66/156

    Celulele modificate genetic prin incorporarea de "D# sunt considerate

    7transformate8. 6ermenul se refera de obicei la rezultat si nu la

    mecanism.8ransformarea prin plasmide

    Plasmidele = molecule mici& circulare de

    "D#& care se replica autonom si care nu

    intra in componenta cz. din celula

     bacteriana in care se gasesc

    Deseori contin gene de rezistenta la

    antibiotice (de e. la ampicilina)

    *ncorporarea plasmidului transformacelula bacteriana initial sensibila la

    ampicilina in una rezistenta.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    67/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    68/156

    8ransfectia = transferul de

    "D# intre celule eucariote incultura

    % Poate fi folosita in analizatransmiterii unor caracteristici

    genetice

    *n cele / cazuri alaturate

    fibroblastele normale pierd

    7contactul de in+ibitie8 si se

    transforma asemanator

    celulelor cu care vin in contact.

    "stfel de studii au fost initial

    utilizate pentru a identifica

    oncogene (gene cauzatoare de

    cancere)

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    69/156

    DEFINITIE

    Variatia %enetica a unei populatii este

    (asurata prin %radul de poli(or&s()

    respecti 5eterozi%ozitate

    Variatia se re'era la actualele di'erente

    prezente la indiizii unei populatii sau

    %rup studiat si poate & direct observata cao colectie de trasaturicaracteristice.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    70/156

    8oli(or&s(ele proteice au 'ost studiate pri(ele "AB)

    R5) etc$. +el (ai poli(or&c siste( %enetic

    u(an este considerat siste(ul LA

    %enetice sunt responsa!ile pentru cea

    (ai (are parte din diersitatea siindiidualitatea o!serate in cadrul speciei

    u(ane "de 'apt) sunt ori%inea

    poli(or&s(ului proteic$

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    71/156

    Diferente genomice la persoanele

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    72/156

    4ariatia

    genetica la

    africani

    !;;

    ;<

    =%4ariatia

    genetica la

    asiatici

    4ariatia

    genetica la

    europeni

    Concluzia: 

    ,amenii sunt genetic

    asemanatori. 4ariante

    genetice gasite intr%o

     populatie sunt de obicei prezente si in altele.

    Populatii 'neafricane au

    secvente de "D#

    intalnite la populatia

    moderna dar si

    ancestrala din "frica.

    din diferite parti ale lumii

     #umerele reprezinta diferite

    +aplotipuri pentru gene la

    L>00 persoane:

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    73/156

    8oli(or&s(e proteice

    +u cat 2 persoane sunt (ai indepartatedpd %enetic) adica apartin unor %rupurietnice di'erite) cu atat %radul de

    diersitate este (ai accentuat. Datorita nu(arului (are de siste(e

    poli(or&ce si de ariante in &ecaresiste() se poate realiza un nu(ar i(ensde co(!inatii

    Fiecare indiid poseda o co(!inatie

    speci&ca a acestor ariante) ceea ce il

    'ace unic din punct de edere !iolo%ic.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    74/156

    *oli3ors3ul"1"+

    A#AT produsa in &cat prote=eaza pla(anulde actiunea elastazei eli!erata deneutro&le "in inJa(atii$.

    A#AT este codi&cata de %ena *ER8INA #de la niel #K,2.#. %ena are peste 100alele 3utante "e1. * si $. Alela nor(alaeste 3

    Gt: 3*) 3) **) *) si "'or(a cea(ai %raa$ alelele sunt codo(inante

    A#AT 4 in5i!itor de proteaza "8I$

    8i este 'enotipul cel (ai %ra) alde&citului de A#AT) cand sunt (ani'estea'ectarea pul(onara si 5epatica.

    Actiitate enzi(atica redusa 4Melastaza poate actiona nestin%5erita"a'ectare pul(onara$

    A%re%area (oleculelor de A#AT lanielul RE al 5epatocitelor deter(inaa'ectarea &catului "5epatita) ciroza$

    Alte 'enotipuri nu prezinta a'ectare5epatica.

    *e esti(eaza) ca /0 din cazuri nu suntd%.

    *ecenta ADNuluinuclear este identica in

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    75/156

    nuclear este identica inproportie de //)/0 ladoua persoane alese lainta(plare.

    Geno(ul u(an &indco(pus din , (iliarde deperec5i de !aze)insea(na ca -)#0 reprezinta aproape ,(ilioane de !azeazotate) ceea cereprezinta di'erentadintre un %eno( si un

    altul totusi di'erentele'enotipice sunt uneoridra(atice intre douapersoane

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    76/156

    DIVER*ITATEA GENETI+A

    INDIVID@ALA *I 8O8@LATIONALA Din cele -)#0 secente de ADN unele nu au e'ecte

    sau au e'ecte 'enotipice minore) pe cand altele suntdirect responsa!ile de producerea unor !oli "(utatiipuncti'or(e$.

    Intre aceste doua e1tre(e se %asesc ariatiile%enetice care au drept ur(are aria!ilitatea'enotipica) precu(: caracterele anato(ice

    particularitatile &ziolo%ice

    intolerantele ali(entare raspunsul i(un si sau suscepti!ilitatea la in'ectii

    reactiile aderse sisau raspunsul la o anu(ita terapie

    predispozitia pentru dezoltarea anu(itor !oli "tu(ori$

    caracteristicile te(pera(entale si psi5olo%ice

    talentul artistic

    aptitudinile sportie) etc

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    77/156

    @n concept i(portant al %eneticiiu(ane si (edicale

    Boala %enetica este doar cea (ai eidentasi deseori cea (ai e1tre(a (ani'estare a

    di'erentelor %enetice) e1tre(itatea unuicontinuu( 'or(at din ariatii ce se intindde la variante rare ce produc !oala)trecand prin variantele mai obisnuite care

    pot spori suscepti!ilitatea pentru adezolta (aladia) pana la cea maicomuna (obisnuita) varianta din cadrulpopulatiei) care nu are nici o releantacunoscuta in patolo%ia u(ana.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    78/156

    Maoritatea *% suntsilentioase enotipic

    O arianta %enetica "alela$ o!isnuita) adica cu

    o 'recenta peste "sau e%ala cu$ #0 in

    populatia %enerala) este considerata un

    8OLI3ORFI*3 GENETI+ "8G$.

    "lelele cu o frecventa >K

    sunt numite ariante rare.

     #u eista o corelatie directaintre frecventa cu care apare

    o alela mutanta si efectul

    sau in patologia umana.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    79/156

    3otoo Pi(ura postula teoria neutralista a eolutiei la s'arsitul

    anilor #/;-: nielul de eolutie (oleculara e1plica eolutia

    speciei prin (utatiile succesie pastrate in %eno( si produse

    cu precadere printro deria aleatorie diersitatea speci&ca

    &ind in (are parte rezultatul acu(ularii su!stitutiilor >neutre?)

    care nu (odi&ca adapta!ilitatea or%anis(ului la (ediul sau de

    iata.

    Diersitatea %enetica este unul din (i=loacele prin care

    populatiile se adapteaza la (ediul (ereu sc5i(!ator.

    Diersitatea este cu atat (ai (are cu cat:

    nu(arul de alele ale unei %ene este (ai (are

    'recentele alelice sunt apropiate) adica nu e1ista una (ai 'recenta

    'recentele indiizilor 5eterozi%oti si 5o(ozi%oti sunt

    ec5ili!rate in o ulatia res ectia.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    80/156

    *e esti(eaza ca apro1. # din

    2-- perec5i de !aze azotate

    sunt 5eterozi%ote in re%iunile ce

    codi&ca proteine din %eno(.

    8oli(or&s(ele pot & localizate:

     intre %ene in introni

     in e1oni

     in re%iunile re%latoare

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    81/156

    Vario(ul 4 totalitatea (odi&carilor %enetice%asite in populatiile speciilor care au aut o

    sc5i(!are eolutia relati scurta

    De e1e(plu) la o() apro1. # din #2--

    nucleotide di'era.

    *pecia u(ana a aparut acu( doar #--.--- de

    ani) rata ariatiei &ind co(parati (ica.

    In practica) ario(ul poate & su(a *N8s "

    sin%le nucleotide pol(orp5is(s$ de la nielul

    http://en.wikipedia.org/wiki/Specieshttp://en.wikipedia.org/wiki/Single_nucleotide_polymorphismshttp://en.wikipedia.org/wiki/Single_nucleotide_polymorphismshttp://en.wikipedia.org/wiki/Species

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    82/156

    6Variatia cea (ai (are la nielul unui

    locus se eidentiaza in interiorul uneipopulatii si nu intrepopulatii7S..adearat'als<

    90 este ariatia %enetica in interiorul raselorcontinentale si nu(ai #0 intre ele.

    +oncret) pentru un locus dat in populatia # 'recentaalelei A poate & -0) iar in populatia 2 poate & 0.Adica (ica di'erenta nu este in'or(atia.

    Dar e1ista loci in'or(atii: o (are parte a ariatiei culoriite%u(entului la doua populatii poate & anticipata

    analizand %ena C2"A#, care codi&ca o proteina intracelulara(e(!ranara

    @n *N8) o su!stitutie) are un e'ect 'enotipic (a=or. Oarianta este aproape &1ata in populatia Europei si altaaproape &1ata in cea din A'rica.

    Alt'el spus ariatia %enetica in cazul acesta este de

    aproape #--0) "si nu #0$ INTRE 8O8@LATII

    8eoria /ut of "frica e&plica evolutia umana

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    83/156

    *mage source:

    Ni3imedia Commons

    @ominizii auaparut si s%au

    diversificat in

    "frica.

    n grup a

     plecat din"frica si

    divergenta a

    continuat.

    @ominizii s%au

    raspandit pe totglobul.

    6oate

     populatiile ne%

    africane sunt

    descendentiiacelui ru .

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    84/156

    Diersitatea este de 'apt 'oarte) 'oarte redusa la o(. In principal

    deoarece (i%rarea >out o' A'rica? a aut loc recent "apro1i(atiin ur(a cu #--.--- de ani catea zeci de (ii de ani) in

    'unctie de diersi specialisti$ si deoarece au e1istat eeni(ente

    ecolo%ice (a=ore) care au redus populatia u(ana la un nu(ar

    (ic de indiizi. De e1. eruptia ulcanului To!a in ur(a cu circa

    C-.--- de ani) care a racit cli(a si se presupune ca a deter(inat

    reducerea populatei u(ane.

    Diersitatea %enetica u(ana este de nu(ai #-.--- "%ra&cul

    ur(ator$ in ciuda unei populatii %lo!ale de aproape C (iliarde.

    Rasele nu sunt recunoscute ca entitati !iolo%ice.

    In #/C2 R.+. LeHontin arata) ca diersitatea %enetica este (ai

    (are la o( in interiorul unei populatii decat intre populatii cu

    ori%ine %eo%ra&ca di'erita totusi in 2--, A.U.F. EdHards

    contrazicea teoria lui LeHontin "pt in'or(atii (ai (ulte:

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    85/156

    Diversitatea

    nucleotidica

    autoo3al

    a ladiversespecii

    @omo sapiens

    Drosop+ila melanogaster

    are o diversitate geneticamai mare decat +omo

    sapiens& respectiv o variatie

    la fiecare cateva sute de

     baze azotate.

    4alorile sunt medii procentuale

    ale (pair;ise analizate)

    diferentelor per perec+e de

     baze si sunt reprezentate la

    scara log>0. !iecare estimarereprezinta media efectuata prin

    analiza 'pair;ise la nivel de

    minim loci din regiuni

    necodante sau situsuri

    sinonime.

     #ota9 -stimarile sunt valori

    medii % variatia genetica

    fiind raspandita neuniform

    in genom: unele portiuni ale

    genomului uman prezinta

    variabilitate inalta& pe cand

    altele sunt relativ uniforme.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    86/156

    Daca la o( # din #--- de !aze ariaza) la ci(panzei este # la

    &ecare C- de !aze) iar la %orile # la ;- de !aze.

    Deci) cu( a( azut anterior) $. melanogaster   are o ariatie

    %enetica (ult (ai (are.

    +oncluzia este) ca desi noua ne par specii cu aria!ilitate 'oarte

    redusa) atat (usculitele de otet ) cat si %orilele ne suntsuperioare in ceea ce prieste diersitatea %enetica.

     7Variatia intre >rase? de caini este cu (ult (ai (are decat

    ariatia identi&cata intre anu(ite populatii u(ane: 2C.0

    ersus .0. *i iners) %radul de o(o%enitate %enetica este

    (ai (are in cadrul unei >rase? canine indiiduale decat in

    interiorul unei populatii u(ane distincte "/.;0 ersus

    C2.0$78arer et al.

    Professor 3vante Paabo -de la(nstitutul 4a& Planc2 de"lte intrebari9

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    87/156

    Did humans

    really mate withNeanderthals?

    P+oto from

     Ni3imedia Commons

    "ntropologie 5volutionista

     Yes!

    te t eba 9

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    88/156

    "u eistat doua imperec+eri (punctele galbene pe

    desen)intre +ominizii 'cu anatomie moderna (liniile

    albastre) si neandert+alieni (liniile rosii)

    Procentul secventelor similare dovedeste aceste imperec+eri.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    89/156

    Cum s%au aflat aceste lucruri?

    Mai intai s%au pus bazele te+nicii de secventiere a

    "D#ului din sc+eletele gasite de antropologi si

    ar+eologi (ec+ipa profesorului Paabo).

    *n prezent dispun de secvente de "D# de la oameni

    de #eandertal& din care unul dintr%o pestera din iberia(Denisova).

    Genomul 'ne%"frican contine /%K alele de la

    neandertalieni.

    Genomul populatiei din Papua%#oua Guinea si din"ustralia contine circa K modele comune cu secventa

    de "D# izolat din oasele gasite la Denisova dovedind o

    a doua incrucisare.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    90/156

    8oli(or&s(ele ADN

    #. 8oli(or&s(ele unui sin%ur nucleotid

    "*N8s$RFL8

    2. 8oli(or&s(ele 'ra%(entelor (ai (ici de #---

    perec5i de !aze "(inisateliti) (icrosateliti)VNTR)

    indel$ ,. 8oli(or&s(ele su!(icroscopice

    . 8oli(or&s(ele (icroscopice "5etero(or&s(ele

    5eterocro(atinei si ale eucro(atinei) situsurile

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    91/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    92/156

    #Ps neutre sunt folosite ca mar3eri genetici

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    93/156

    #P inlantuit cu gena

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    94/156

    In prezent *N8s utilizate pentru:

    Localizarea %enelor desuscepti!ilitate in cazul !olilor

    (ulti'actoriale "dia!et$ 'olosindusestudii de dezec5ili!ru al inlantuirii side asociere a 5aplotipurilor

    *tudii de 'ar(aco%enetica

    Intele%erea ori%inii si eolutiei

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    95/156

    #Ps au fost identificate prin digestia "D#%ului cu endonucleaze de

    restrictieA aceste enzime bacteriene recunosc si sectioneaza "D#%ul

    la nivelul unei secvente specifice. *n acest caz CC6G"GG. rmare amutatiei punctiforme (#P) dispare un situs de restrictie& iar

    fragmentele de "D# vor fi diferite in cazul lantului normal si

    respectiv anormal de globina. R!

    .+tm

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    96/156

    Variatiile identi&cate in %eno(ul

    u(an Variatii de secenta prin (odi&carea unuisin%ur nucleotid: prin su!stitutie

    *NV "sin%le nucleotid variation$ #0 in pop.

    *N8 M#0

    prin insertiedeletie 4 DI8 "deletioninsertionpol(orp5is( o' one !ase pair$

    Variante structurale – 'ra%(ente de ADN

    (odi&cate: Variatiile 'ra%(entelor aand intre 2 – #.---

    nucleotide Variatiile su!(icroscopice " #! – catea 3!$

    Variatiile (icroscopice cro(ozo(iale sau %eno(ice

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    97/156

    Variatiile 'ra%(entelor ADN cu lun%i(e intre 2 – #.---p!:

    #. VNTR "aria!le nu(!er tande( repeats$ sunt de 2'eluri:

    Microsateliti (sau STR=short tandem repeats sau SSR = simple

    sequence repeats): repetitii foarte scurte (1-15pb), frecvent

    dinucleotidice (CA/TA) sau trinucleotidice, ce formeaza

    fragmente de100pb foarte numeroase, polimorfe (cu circa 10

    alele/locus)si cu o distributie uniforma: un microsatelit la

    1.000pb

    Minisateliti: repetitii de secvente scurte (15-500pb), ce formeaza

    fragmente de1-20 kb, dispersate in structura autozomilor si

    ocupand situsuri specifice (peste 1.000 de localizari)

     Ambele tipuri utile in medicina legala pentru realizarea profi-lului

    genetic individual,specific (identificare sau paternitate)

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    98/156

    )ocusul " este o repetitie in tande( %C: alele posibile) cucate 2),) sau repetitii ""2) "6) "4 si "5$.)ocusul . cu (otiul "%C+ : 2 alele) cu 2 sau , repetitii

    ".2 si .6$.  A38RENTA GENETI+A include si(ultan a(!ii loci.

      *  n   d  i  v  i   d  > :   @  e  t  e  r  o  z  i  g  o  t   "  s  i  +  o    m  o  z  i  g  o  t   5  *  n   d  i  v  i   d  / :  +  e  t  e  r  o  z  i  g  o  t   "  s  i   5

    Cele / persoane

    se diferentiaza

     prin ambii loci.

    "MPR-#6-0 loci

     polimorfi+ttp:22;;;.mun.ca2biologJ2scarr24#6RQfin

    gerprinting.+tml  vezi +ome;or3 

    Genotipuri hTERT MNS16 A

    http://www.mun.ca/biology/scarr/VNTR_fingerprinting.htmlhttp://www.mun.ca/biology/scarr/VNTR_fingerprinting.htmlhttp://www.mun.ca/biology/scarr/VNTR_fingerprinting.htmlhttp://www.mun.ca/biology/scarr/VNTR_fingerprinting.html

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    99/156

    Hofer P et al. Carcinogenesis 211!"2#$66%$&1

    © The Author 2011. Published by Oxford University Press. All rights reserved. For Permissions

    !le"se em"il# $ourn"ls.!ermissions%ou!.&om

    4+3!6" minisateliti ai genei umane pentru telomeraza :

    un factor de risc pentru cancerul colorectal

    %au identificat E 4#6R (/ curte si 0

    combinatii alelice

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    100/156

    Variatiile 'ra%(entelor ADN cu lun%i(e

    intre 2 – #.--- p!: #. VNTR

    2. INDEL* 4 insertion deletion

    secentele nucleotidice sunt scurte #, din ele sunt intre 2-- – -- p! si

    reJecta poli(or&s(ul secentelor Aludin %eno(ul u(an

    utilizate in studiul eolutiei %eno(uluiu(an si pentru intele%erea structuriisale dina(ice

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    101/156

    8oli(or&s(ele su!(iscroscopice

    "#! – catea 3!$ #. Variatiile nu(arului de copii "+NV$

    reprezinta principala sursa de ariatie

    %enetica intre indiizi

    +N8 4 poli(or&s(ul nu(arului de copii)

    cand +NV au o 'recenta peste #0 in

    populatie

    ,,0 din %eno(ul u(an

    2. 8oli(or&s(ul inersiilor sau

    translocatiilor

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    102/156

    ,rice clasificare este

    relativa& prin ea

    incercam doar sa

    intelegem putin mai mult

    lumea

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    103/156

    *ncercam sa intuim viitorul presupunand ca intelegem trecutul

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    104/156

    Mutatiile ca sursa de

    variabilitate

    +lasi&care

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    105/156

    a

    (utatiilor

    #. so(atice sau %er(inale

    2. %eno(ice) cro(ozo(iale sau %enice

    ,. AD) AR) lincat D) lincat R) Wlincate

    . nucleare sau (itocondriale

    . sta!ile sau insta!ile " 4 (utatii dina(ice$

    ;. de tip su!stitutii) deletii) insertii "de nucleotide$

    C. 6(issense7) 6nonsense7 sau 6'ra(es5i't7

    9. spontane sau induse "&zic) c5i(ic$ /. silentioase sau izi!ile in 'enotip

    #-. puncti'or(e sau lar%i "4 e1pansiuni$

    ##. aanta=oase) neutre sau

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    106/156

    *pre deose!ire

    de cele

    so(atice)

    (utatiile

    %er(inale

    a'ecteaza

    intre%ul

    or%anis( si

    sunt ereditare

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    107/156

    Mutatiile genomice: poliploidii si

    aneuploidii

    Mutatiile cromozomiale = aberatiile cromozomiale

    de structura

    Mutatiile genice

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    108/156

    Mutatia autoo3al do3inanta

    De e1. la nielul %enei care codi&ca receptorul , al'actorului de crestere a &!ro!lastelor F%F#6 (broblast

    gro7t8 actor receptor 6!

    FGFR, 6re%leaza ne%ati7 cresterea oaselor.

    @r(are a splicin%ului alternati al %enei FGFR, e1ista (ai

    multe izoforme ale proteinei ce interin in procese

    precu(:

    o re%larea cresterii si diiziunii celulare

    o deter(inarea tipului de celula

    o 'or(area aselor san%uine

    o indecarea ranilor

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    109/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    110/156

    Reactii in cascada in

    interiorul celulei

    dupa legarea !G! cu

    !G!R

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    111/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    112/156

    *oarecele nocout FGFR, are oase

    e1cesi de lun%i si erte!re elon%ate)

    respecti o coada lun%a.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    113/156

    a

     b

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    114/156

    Mutatia este complet

    penetranta (si nu incomplet penetranta 1 alta clasificare)A

    in E%O0K din cazuri este

    o mutatie de novo p >.

    Cele / substitutii punctiforme produc aceeasi modificare:

    aminoacidul glicina este inlocuit cu aminoacidul arginina in pozitia

    O0 (GlJO0"rg sau GO0R) din structura receptorului. "stazi se

    considera ca aceasta modificare suprastimuleaza receptorul& astfel

    determinand modificari osoase caracteristice acondroplaziei.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    115/156

    *nvatand intelegeti tot mai mult& da?

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    116/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    117/156

    3utatia %enei 8A deter(ina incapacitatea enzi(ei

    5epatice 'enilalanin5idro1ilaza "8A$ de a (eta!oliza

    a(inoacidul fenilalanina si deci de al trans'or(a ina(inoacidul tirozina.

    +and actiitatea 8A este redusa) 'enilalanina se

    acu(uleaza si este conertita in acidul 'enilpiruic)

    acidul 'enillactic si 'eniletila(ina "'enilcetone$) ce pot &

    detectate in urina

    "test d%.$ "8E este (eta!olizata pe calea (inora a transa(inazelor pana la'enilcetone$

    !enilcetonuria

    http://en.wikipedia.org/wiki/Phenylalanine_hydroxylase

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    118/156

    De&citul de GL@+OO;FO*FATDEIDROGENAA "FAVI*3$ – e1 de(utatie lincata recesia

    ' D,FICI+U) de %*D deter3ina o ",MI, 9,M$)I+IC" cronica

    '

    Dupa identi&carea !olii si a ori%inii (odi&carilor pecro(ozo(ul in anii #/- si de(onstrarea e1istentei

    ariantelor electro'oretice ale enzi(ei in anii #/;-) sa

    inteles i(portanta se(ni&catie %enetica) clinica si

    !ioc5i(ica a acestui poli(or&s(.

    '  Toate (utatiile care deter(ina !oala se %asesc la K2;.

    ' Gena nor3ala a enzi(ei G;8D are #9. ! &ind nu(ita

    GdB. E1ista / !inecunoscute ariante si (utatii ale

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    119/156

    GL@+OO;FO*FAT DEIDROGENAA

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    120/156

    ' Variante di'erite ale enzi(ei sunt %asite in A'rica) Asia si

    zona (editeraniana

    ' Dar) de ce ar & (utatia anor(ala GdB sau Gd( (ai

    'recenta in aceste populatii<

    ' eterozi%otii au aut aanta= selecti isais de (alarie

    in populatiile din aceste re%iuni

    '  Alela mediteraniana acorda rezistenta la (alarie) caci

    parazitul nu se poate (ultiplica in celule cu de&cit de

    %lucozo;'os'at de5idro%enaza.

    ' Ast'el) alela  !olii con'era un aanta= adapti " sau

    intrinsec %enetic$ prote=and i(potria (alariei.

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    121/156

    3utatii dina(ice"insta!ile$

    Are loc o a(pli&care a nu(arului

    de nucleotide in %a(eto%eneza "spre

    deose!ire de (utatiile sta!ile$

    E1: +oreea untin%ton si sindro(ul

    'ra%il

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    122/156

    Gena untingtin ( "## )& numita si gena $ 

    (untington disease este localizata pe bratul scurt 

    al cromozomului  (p>.).

    http://en.wikipedia.org/wiki/Locus_(genetics)http://en.wikipedia.org/wiki/Locus_(genetics)http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_4_(human)http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_4_(human)http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_4_(human)http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_4_(human)http://en.wikipedia.org/wiki/Chromosome_4_(human)http://en.wikipedia.org/wiki/Locus_(genetics)http://en.wikipedia.org/wiki/Locus_(genetics)http://en.wikipedia.org/wiki/Locus_(genetics)http://en.wikipedia.org/wiki/Locus_(genetics)

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    123/156

    Boala untin%ton "D$  Este cauzata de repetitia unei expansiuni anormale

    trinucleotidice (CAG)

     In modnormal repetitiaCAG trebuie sa fie intre7

    si 35 de repetitii

    Gena HTT codifica proteinahuntingtina si daca este

    anormala ea contine o expansiune poliglutaminica

    Huntingtina este prezenta in numeroase tesuturi;

    nivelurile cele mai ridicate se gasesc intracerebral;

    Gravitatea bolii corelata cu numarul de repetitii

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    124/156

    +umar derepetitii

    Clasificare 3tatusul bolii

    / #ormal #eafectat

    /1E *ntermediar #eafectat

    1 PenetrantaRedusa

    H2% "fectat

    S Penetrantatotala2completa

    "fectat

    p

    trinucleotidice

     #u eista un algoritm precis cu privire la momentul instalarii bolii

    si gravitatea sa.

    +estare 3oleculara pentru 9D

    8ersoanele care au pe cinea !olna in 'a(ilie si doresci d i ! lii

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    125/156

    sa stie) daca au (ostenit %ena !olii) pot cererealizarea unui dia%nostic (olecular. Bineinteles ca)daca sunt purtatoare ale %enei (utante TT nu se aputea preciza (o(entul in care or de!utasi(pto(ele. Desi nu e1ista inca un trata(ent curati)testarea %enetica poate & de a=utor persoanelor la riscin ederea luarii unor decizii priind iitorul lor. %otusimajoritatea decid sa nu faca acest test!

    Analiza ADN a !oliiuntin%ton.

    Fiecare coloana arata ADN ulaltei persoane:

    2 !enzi in zona nor(ala "N$

    apartin celor nea'ectati.

    O !anda in zona arata opersoana care a puteadeeni !olnaa de D"5eterozi%ot$.$epartment of &eurogenetics, 'nstitute of

    &eurolog, ondon > / E

    *indro(ul 'ra%il

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    126/156

    % *e datoreazX unei (utaYii dina(ice

    In gametogeneza materna "cu precadere$ are loc

    a(pli&carea.

    Denu(irea este data de 'aptul ca initial) prin analiza

    cito%enetica cro(ozo(ul parea sa prezinte o ruptura la

    nielul telo(erului !ratului K) adica sa presupus

    e1istenta la acest niel a unui 6situs 'ra%il7 "zona cz. cu

    rupturi 'recente$

    Astazi) se stie ca) aspectul cito%enetic este datorat(ultiplicarii e1cesie a codonului +GG la nielul

    pro(otorului %enei F3R# "Fra%ile 3ental Retardation$

    La !aieYii cu o ast'el de a(pli&care) unde codonul +GG

    In analiza *out5ern !lot alaturata

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    127/156

    In analiza *out5ern !lot alaturata

    ADNul (i%reaza de la (inus la

    cu cat 'ra%(entul de ADN este

    (ai (are) cu atat (ai %reu se a

    deplasa in %elul de a%aroza.

     I  n  t  e  r  p  r  e  t  a  r  e : I  #  p  r  e  z i  n  t  a  p  r  e   (  u  t  a  t i  a "  p  e  s i  n  %  u  r  u l  s  a  u  c  z .   G $ )

      p  e  c  a  r  e  & i  c  a  s  a ) I I  2 )  o   (  o  s  t  e  n  e  s  t  e  d  e  a  c  e  e  a  s i   (  a  r i   (  e  I I  2

      a  r  e  2  c  z .   G  d  e  c i  u  n  u l  c  u  p  r  e   (  u  t  a  t i  a  d  e l  a  t  a  t  a  s i  u  n  u l  c  u

      %  e  n  a  F   3   R  #  n  o  r   (  a l  a )   (  o  s  t  e  n i  t  d  e l  a   (  a   (  a )  c  a  r  e  n  u   (  a i

      e  s  t  e  r  e  p  r  e  z  e  n  t  a  t  a i  n  a  r  !  o  r  e l  e  %  e  n  e  a l  o  % i  c  I I I  #  a  r  e   (  u  t  a  t i  a

      c  o   (  p l  e  t  a )  a  d i  c  a  s  d .   G   '  r  a  % i l )  a   (  p  r  e  n  t  a   A   D   N  u l  u i  s  a  u

      a  p  r  o  a  p  e  c  a  n  u  s   a  d  e  p l  a  s  a  t  d  e l  a  p  u  n  c  t  u l  d  e  s  t  a  r  t . I I  #  a  r  e

      u  n  c  z .   G  c  u  %  e  n  a  n  o  r   (  a l  a

    Numarul de repetitii ale Situs fragil

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    128/156

    codonului

    (CGG)

    detectabil

    (citogenetic)

    Inteligenta Descendenti

    Barbati cu 50-200 repetitii

    (premutatie =“PM”)

    Nu Normala

    ( barbat purtator)

    Fete purtatoare (PM)

    Baieti normali (fara PM)

    Barbati cu 200-2000 repetitii(mutatie completa=“M”)

    Da Retard moderatpana la sever

    Fete purtatoare (M)Baieti normali (fara PM)

    Femei cu 50-200 repetiţii

    (premutatie)

    Nu Normala Baieti bolnavi (M)

    Fete normale (fara PM)

    sau purtatoare (PM)

    Femei cu 200-2000 repetiţii

    (mutatie completa)

    Da De la normal 

    retard moderat

    Baieti bolnavi (M)

    Fete normale (fara PM)

    sau cu M

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    129/156

    Dupa mecanismul deformare eista trei tipuri de

    mutatii.

    Gasiti diferenta

    intre tranzitii sitransversii?

    Dupa efectul pe

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    130/156

    Mutatie silentioasa

    H2% silentioasa

    Mutatie cu eprimare

    in fenotip (7zgomotoasa)

    Dupa efectul pe

    care il are o

    mutatie poate fi:

    Dupa e'ectul pe care il au (utatiile se

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    131/156

    Dupa e'ectul pe care il au (utatiile se

    (ai pot clasi&ca in:

    3utatii 6(isens7: o su!stitutie puncti'or(a

    deter(ina inlocuirea a(inoacidului cu altul)

    pastrandusenu 'unctia proteineienzi(ei

    3utatii nonsens) cauzate de aparitia unui codon

    stop pre(atur) nu sunt silentioase

    3utatii 'ra(es5i't) cauzate de insertia sau

    deletia:

    unei !aze azotate sau

    (ai (ultor !aze azotate) dar o!li%atoriu un

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    132/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    133/156

    3@+OVI*+IDOA

    Este cauzata de:

     (utatii nonsens si

    (utatii cu sens %resit "en%l.

    missense$)

    deletii si (utatii ce (odi&ca (atisarea

    "splicin%ul$ ARNului

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    134/156

    @eterogenitatea alelica in mucoviscidoza (fibroza c+istica)

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    135/156

    Gena ABCC7determina sinteza unei forme

    anormale de proteina C!6R ( = cJstic fibrosis

    transmembrane conductance regulator)& care

    actioneaza ca un canal de clor la nivelul

     polului apical al celulelor epiteliale

     Proteina C!6R a fost identificata in celulele din :

    -  plamani& % glandele sudoripare &

    -  ficat& % si tractul genitourinar 

    - pancreas.

    Proteina C!6R (;i3ipedia)

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    136/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    137/156

    +ttp:22nature.ca2genome202d2>020dQ>>Qe.cfm

    Gena

    este

    numita

    totC!6R 

    vs

    3ucoiscidoza

    +and proteina +FTR este anor(al

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    138/156

      +and proteina +FTR este anor(al

    sintetizata datorita unei (utatii) celulele epiteliale

    nu (ai pot re%la (odul in care clorul stra!ate

    (e(!ranele celulare

    etero%enitate alelica

    Gena nor(ala AB++C de peste 2Z #-  p! are 2C

    e1oni

    3 i id

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    139/156

    3ucoiscidoza

    E1onii sunt supusi unei 3atisari alternative

    in cazul prezentei unei (utatii ", izo'or(e

    sunt (ai 'recente$ ast'el pot lipsi: e1onul ,

    sau e1onii 2 si , "5ttp:5(%.o1'ord=ournals.or%content,C###$

    8entru %ena nor(ala ARN( 4 ;#2/ p!) din

    care , p! codi&ca #9- a(inoacizi aiproteinei  trans(e(!ranare ce re%leaza

    actiitatea canalelor de clor "5ttp:HHH.uniprot.or%uniprot8#,;/$

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    140/156

    Peste K dintre bolnavi au mutatia T !E0O& adica o

    deletie de pb& ce are drept urmare disparitia a.a.

    fenilalanina din pozitia E0O a C!6R 

    " ti l l i d l t l 9

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    141/156

    "ctivarea canalului de clor este un proces comple9

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    142/156

    @-6-R,G-#*6"6- "

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    143/156

    +ttp:22;;;.glo;m.com2?p=glo;m.cml2sectionQvie;Uarticleid=

    ". Relatia dintre gena si unR! 

     prezenta & iar 1 alela absenta

    la nivelul situsului de

    restrictie

    5. Diagnosticul bolii

    utilizand R!

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    144/156

    unei alele -"3

    pacienti cu mucoviscidozaA

    "D#%ul genomic nefractionat imobilizat pe o membrana de

    nitroceluloza va +ibrida cu sondaA

    +eterodupleul tinta 1 sonda este evidentiat in cele cazuri

     prin autoradiografie

    onde monocatenare

    specifice:

    >. "D# normal&

    fara mutatia-   T !E0O

    /. "D# cu mutatiaT !E0O

    - +tz: >&&

    - +z:/&&&E&O

    Ce se intampla? #u uitati: b. autoz.rec == se manifesta doar la +omozigotii recesivi

    Deci la @tz trebuie sa mai fie alta mutatie prezenta pt a fi bolnavi9

     *ar pacientul are / mutatii diferite de T !E0O (+ttp:22;;;.glo;m.com2?p=glo;m.cml2sectionQvie;Uarticleid= )

    http://www.glowm.com/?p=glowm.cml/section_view&articleid=344http://www.glowm.com/?p=glowm.cml/section_view&articleid=344http://www.glowm.com/?p=glowm.cml/section_view&articleid=344

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    145/156

    Conor3 baei de date canadiene (+stic Fi!rosis 3utation Data!ase$ peste 1:003utatii ale genei CF+# au ost descrise din 1;:;&cand a ost descoperita

     Traditional) (utatiile +FTR sunt i(partite in ; clase pe!aza e'ectului pro!a!il:

    +lasa I produc o proteina neunctionala

    +lasa II deter(ina o procesare de'ectuoasa a proteinei"e1. Deletia F-9$

    +lasa III produc o reglare de'ectuoasa a canalului

    +lasa IV deter(ina o conductanta decitara lanivelul canalului

    +lasa V se caracterizeza prin splicing anor3al.

    +lasa VI sunt (utatii cu e'ecte necunoscute

    Clasificarea mutatiilor ce produc mucoviscidoza

    +ttp:22;;;.cftr.info2about%cf2role%of%ctfr%in%cf2cftr%mutations2t+e%si%classes%of%cftr%defects2

    http://www.genet.sickkids.on.ca/Home.htmlhttp://www.genet.sickkids.on.ca/Home.html

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    146/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    147/156

    Dupa localizare (utatiile pot&:

    Nucleare – toate tipurile discutate

    anterior si care actioneaza la nielul

    ADNului din nucleu

    3itocondriale – ce a'ecteaza ADNul

    (itocondrial

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    148/156

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    149/156

    Dupa diviziunea celulara mitocondriile sunt distribuite la intamplare in celulele

    fiice& astfel incat doar si numai pe baza de sansa celulele pot primi2mosteni mai

    multe sau mai putine (c+iar 0) mitocondrii cu "D# mutant.

     

    S

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    150/156

     #oua mutatie poate fi prezenta in cateva celule& dar daca se gaseste si intr%un ovocit *&

    va putea fi transmisa la descendenti. "stfel& o mama (aparent) sanatoasa poate

    transmite mitocondrii cu "D# mutant in numar mai mare decat in celulele sale&

    datorita efectului 7bottle%nec37& respectiv mitocondriile cu mutatii pot fi

    disproportional incluse in ovul comparativ cu alte celule.

    "poi& aceste mitocondrii cu "D# mutant se pot multiplica si ca urmare pot avea o

    frecventa mai mare printre cele zeci de mii de mitocondrii intalnite intr%un caz

    sporadic (rar& intamplator).

    Cazurile sporadice de

     boli mitoocondriale audrept cauza o noua

    mutatie mitocondriala

    @eteroplasmia descrie situatia in

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    151/156

    @eteroplasmie

    @omeoplasmie

    p

    care o celula contine atat "D#mt

    normal cat si cu mutatii.

    @omeoplasmia descrie uniformitatea

    "D#mt (normal sau cu mutatii) in

    celule.

    6esuturile bogate in mitocondrii cu mutatii produc mai putin "6P

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    152/156

    Pedigree%ul ilustreaza atat baieti cat si fete bolnave& iar boala se

    mosteneste doar de la mama (6R"#M*6-R- M"6R,C

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    153/156

     Trans(iterea (utatiilor (itocondriale este

    e1clusi (aterna.

    *per(atozoidul contri!uie nu(ai cu nucleul sau

    "pronucleu$.

    E1ista (ai (ulte e1plicatii posi!ile ale acestui'eno(en:

    diluarea (itocondriilor paterne printre

    nu(eroasele (itocondrii ale oulului

    prezenta (itocondriilor paterne doar in piesa

    inter(ediara si deci pierdera lor in ur(a fertilizarii

    descompunerea activa a (itocondriilor paterne

    -reditatea matroclina

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    154/156

    Deci& mitocondriile

    spermatozoidului (in

    galben pe desen) suntde obicei distruse in

    ovul imediat dupa

    fertilizare.

    -reditatea matroclina

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    155/156

    +ttp:22;;;.nature.com2pr2$ournal2v2nE2full2pr>/Ea.+tml

    Cele eemple arata procentul mutatiilor mitocondriale de tip 6OC (o substitutie puncti%

    forma). Manifestarea fenotipica anormala (boala) apare atunci cand mutatiile depasesc un

    anumit prag (peste 0K). Multe persoane sunt purtatoare ale mutatiei analizate& dar sunt

     sanatoase.

    "nalizele au fost facute pe

    mitocondrii din

    5 = sange

    M = musc+i! = fibroblaste din piele

  • 8/19/2019 Variabilitatea Genetica - Curs

    156/156