statistica analitica - baicussumarizarea datelor varsta, vsh, autoevaluarea scaderii ponderale si...

41
STATISTICA ANALITICA C. Băicuş www.baicus.ro

Upload: others

Post on 06-Mar-2020

16 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

STATISTICA ANALITICA

C. Băicuş

www.baicus.ro

Page 2: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p şi intervalele de încredere

Dr. Cristian Băicuş

www.baicus.ro

Page 3: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

populaţie

eşantion

eşantionare p, CI

Page 4: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Incertitudinea statistica

• Incertitudinea (prezenta chiar intr-un

eşantion reprezentativ) care apare atunci

când folosim datele eşantionului pentru a

trage concluzii asupra populaţiei

Page 5: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• Incertitudinea statistica poate fi

cuantificata prin:

– testarea ipotezei (cu calculul valorii p)

– calculul intervalelor de incredere (CI)

Măsurarea incertitudinii statistice

Page 6: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• Placebo: supravieţuire: 10 ani

• Tratament: supravieţuire 10 ani + 1h

• p= 0,0001.

Page 7: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• Tratamentul îmbunătăţeşte semnificativ supravieţuirea (p= 0,0001)

1.Uitaţi-vă întotdeauna după mărimea efectului!

Page 8: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• Tratamentul îmbunătăţeşte semnificativsupravieţuirea (p= 0,0001)

– CI dau mai multe informaţii decât p, aşadar sunt de preferat

– p-urile amestecă mărimea efectului cu mărimea eşantionului

– p-urile nu au ce căuta în medicinăSchulz, Grimes. The Lancet Handbook of Clinical Research, 2006

– 1986: Ken Rothman a interzis p-urile în Epidemiology cat a fost editor sef

Page 9: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p

25%

20%20%

4,5%

1% 0,1%

12%12%

4,5%

1%0,1%

5C

6C

7C

8C

4C

3C

2C

9C 10C1C0C

37,5%

p=0,375

unidirectional, one tailed (one sided)

H0: C=P

H1: C>P

10x10.000

Page 10: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p

25%

20%20%

4,5%

1% 0,1%

12%12%

4,5%

1%0,1%

5C

6C

7C

8C

4C

3C

2C

9C 10C1C0C

~17,5%

H0: C=P

H1: C>P

p=0,175

unidirectional, one tailed (one sided)

Page 11: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p

25%

20%20%

4,5%

1% 0,1%

12%12%

4,5%

1%0,1%

5C

6C

7C

8C

4C

3C

2C

9C 10C1C0C

1%

H0: C=P

H1: C>P

p=0,01

unidirectional, one tailed (one sided)

Page 12: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p

25%

20%20%

4,5%

1% 0,1%

12%12%

4,5%

1%0,1%

5C

6C

7C

8C

4C

3C

2C

9C 10C1C0C

37,5% 37,5%

p=0,75

bidirectional, two tailed (two sided)

H0: C=P

H1: CP

Page 13: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p

25%

20%20%

4,5%

1% 0,1%

12%12%

4,5%

1%0,1%

5C

6C

7C

8C

4C

3C

2C

9C 10C1C0C

~17,5% ~17,5%

H0: C=P

H1: CP

p=0,35

bidirectional, two tailed (two sided)

Page 14: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

p

25%

20%20%

4,5%

1% 0,1%

12%12%

4,5%

1%0,1%

5C

6C

7C

8C

4C

3C

2C

9C 10C1C0C

1% 1%

H0: C=P

H1: CP

p=0,02

bidirectional, two tailed (two sided)

Page 15: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Studiu terapeutic

Placebo Tratament

500 pts 500 pts

23 ?

Page 16: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Studiu terapeutic

Placebo Tratament

500 pts 500 pts

23 23

Page 17: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Studiu terapeutic

Placebo Tratament

500 pts 500 pts

23 23

25 21

p=0,546

Page 18: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Studiu terapeutic

Placebo Tratament

500 pts 500 pts

23 23

25 21

29 17

p=0,07

Page 19: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Studiu terapeutic

Placebo Tratament

500 pts 500 pts

23 23

25 21

29 17

30 15

p=0.022

Page 20: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

CI

Johannis Procent CI

6/10 60%

[27 , 86]

Page 21: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

CI

Johannis Procent CI

6/10 60% [27%, 86%]

24/40 60%

[43%, 74%]

Page 22: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

CI

Johannis Procent CI

6/10 60% [27% 86%]

24/40 60% [43% 74%]

120/200 60%

[53%, 67%]

Page 23: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

CI

Johannis Procent CI

6/10 60% [27% 86%]

24/40 60% [43% 74%]

120/200 60% [53% 67%]

240/400 60% [55% 65%]

1200/2000 60% [58% 62%]

Page 24: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• p: probabilitatea ca diferenţa dintre tratamente observată în

studiul nostru să fie datorată întâmplării, iar în realitate

(la nivelul populaţiei) să nu existe nici o diferenţă între tratamente.

• interval de încredere: intervalul în care se află

parametrul respectiv în realitate (la nivelul populaţiei) (cu o

probabilitate de 95%).

RR, OR, RRR, RRA, NNT

p şi CI

Page 25: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Nesemnificativ statistic:

atunci când CI include

• 1 (pt. RR, OR)

• 0 (pt. RRR sau RRA)

• (pt. NNT)

Page 26: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• nesemnificativ statistic = H0 nu a putut fi

înlăturată, nu că aceasta este adevărată

• nu există diferenţă, sau studiul nu a avut

puterea necesară pentru a evidenţia această

diferenţă

atenţie la CI

Page 27: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

CI

semnificaţie statistică

semnificaţie clinică

Page 28: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa
Page 29: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• Clasa NYHA: I medic

4, 4, 2, 3, 1, 3, 4, 4, 3, 2

• Clasa NYHA: II medic

3, 2, 2, 4, 2, 4, 2, 3, 3, 2, 1, 4, 2, 2, 3

Page 30: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

• Clasa NYHA: I medic

1, 2, 2, 3, 3, 3, 4, 4, 4, 4

• Clasa NYHA: II medic

1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3, 4, 4, 4

I: 1: -14 -14

2: (+ 1 - 7) x 2 = -12

3: (+ 8 - 3) x 3 = +15

4: (+12 ) x 4 = +48

+37

Page 31: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

DECES

+ -

TRAT 10

/15

90/85

100

PLACEBO 20/15

80/85

100

30 (0,15) 170 (0,85) 200

Page 32: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

DECES

+ -

TRAT 20

/28,57

180/171,42

200

PLACEBO 30/21,42

120/128,57

150

50 (0,14) 300 (0,86) 350

Page 33: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Sumarizarea datelorVarsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii

cu cancer si fara

Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p

Cantitativa (distributieGaussiana) Varsta

Media (SD)<0.001

65 (11) 55 (9)

Cantitativa (distributieneGaussiana) VSH

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.02776 (12, 157)

76 (23, 119)

45 (12, 122)

45 (19, 87)

Ordinala

Eval scaderii

ponderale scala

Lickert

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.09

3 (0, 4) 4 (0, 5)

Nominala dihotomicaSexul

masculin

Nr (%)

0.03228 (65%) 115 (43%)

Page 34: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Sumarizarea datelorVarsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii

cu cancer si fara

Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p

Cantitativa (distributieGaussiana) Varsta

Media (SD)<0.001

65 (11) 55 (9)

Cantitativa (distributieneGaussiana) VSH

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.02776 (12, 157)

76 (23, 119)

45 (12, 122)

45 (19, 87)

Ordinala

Eval scaderii

ponderale scala

Lickert

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.09

3 (0, 4) 4 (0, 5)

Nominala dihotomicaSexul

masculin

Nr (%)

0.03228 (65%) 115 (43%)

Test t (Student)

Page 35: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Sumarizarea datelorVarsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii

cu cancer si fara

Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p

Cantitativa (distributieGaussiana) Varsta

Media (SD)<0.001

65 (11) 55 (9)

Cantitativa (distributieneGaussiana) VSH

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.02776 (12, 157)

76 (23, 119)

45 (12, 122)

45 (19, 87)

Ordinala

Eval scaderii

ponderale scala

Lickert

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.09

3 (0, 4) 4 (0, 5)

Nominala dihotomicaSexul

masculin

Nr (%)

0.03228 (65%) 115 (43%)

Variabile numerice cu distributie neGaussianaVariabile ordinale:

Test Mann-Whitney U

Page 36: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Sumarizarea datelorVarsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii

cu cancer si fara

Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p

Cantitativa (distributieGaussiana) Varsta

Media (SD)<0.001

65 (11) 55 (9)

Cantitativa (distributieneGaussiana) VSH

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.02776 (12, 157)

76 (23, 119)

45 (12, 122)

45 (19, 87)

Ordinala

Eval scaderii

ponderale scala

Lickert

Mediana (min, max)Mediana (Q25%, Q75%)

0.09

3 (0, 4) 4 (0, 5)

Nominala dihotomicaSexul

masculin

Nr (%)

0.03228 (65%) 115 (43%)

Variabile nominale:

Testul X2Testul exact al lui Fisher

Page 37: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

r=0,332p<0,000

Page 38: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

r=-0,623p<0,001

Page 39: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Figura 8: Grafice ilustrând diferite grade de corelaţie lineară

Page 40: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Variabilă

cantitativă

Variabilă

ordinală

Variabilă

dihotomică

distribuţie

normală

distribuţie

nonnormală

teste

parametrice

teste

non-

parametrice

Mann-Whitney U,

Wilcoxon

Interval de

timp

Regresie

lineară

multiplă

Log rank

Regresie

logistică

Modelul

lui Cox

X2

Fisher exact

Corelaţie

(coeficient Pearson)/

regresie

Corelaţie

(coef.

Kendall/Spearman)

Comparaţia a

2 grupuri

Comparaţia a

3 grupuriTest F (ANOVA)

Corelaţia a 2

variabile în

acelaşi grup

Corelaţia a 2

variabile în

acelaşi grup

Comparaţia a

2 grupuri

Comparaţia a

3 grupuriKruskall-Wallis

Student (t)

Page 41: statistica analitica - BaicusSumarizarea datelor Varsta, VSH, autoevaluarea scaderii ponderale si sexul la pacientii cu cancer si fara Tipul variabilei Exemplu Cancer+ Cancer- p Cantitativa

Alegerea între un test

parametric/nonparametric - cazurile simple

Alegem un test neparametric în 2 situaţii:

• efectul este o variabilă ordinală şi populaţia este clar

non-Gaussiană (de ex. notele studenţilor, scorul

Apgar, scala vizuală analogică pt. Durere etc.)

• efectul este o variabilă cantitativă şi suntem siguri

că nu are o distribuţie gaussiană în populaţie

(transformare: log, reciproca, radical)

• efectul este o variabilă cantitativă cu distribuţie

gaussiană, dar dispersia este mult diferită