inhibiția enzimatică - biochimie · produsul unei succesiuni de reacții. km = 30 µm adenozin...

32
Inhibitorii ireversibili inactivatori reversibili K m sau v max modificare Competitivă Km Necompetitivă V max Inhibiție Anticompetitivă Km V max Mixtă Inhibiția enzimatică Tipuri de inhibiție enzimatică

Upload: others

Post on 24-Jan-2021

6 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibitorii

ireversibili inactivatori

reversibili

Km sau vmax

mo

dific

are

Competitivă Km

Necompetitivă Vmax

Inhibiție

Anticompetitivă Km Vmax

Mixtă

Inhibiția enzimatică

Tipuri de inhibiție enzimatică

Page 2: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

S

I

competitie → situsulcatalitic

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Inhibitorii competitivi structură aseamănătoare cu a substratului

interacționează cu situsul catalitic

nu conduc la produși de reacție

Page 3: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

CH2

C

CH2

OO

COO

C

C

C

O

O

C

O

O

H

H

Succinat Fumarat

Succinat dehidrogenaza

CH2

COO

C

OO

Malonat

Reactia nu are loc

www.medbiochemistry.com

Page 4: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Page 5: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Ks =[E][S]

[ES]KI =

[E][I]

[EI]

[E]t = [E] + [ES] + [EI] = [E] +[E][S]

Ks

[E][I]

KI

+

v = kcat [ES]

E + S ES E + Pkcat

Ks

+I

KI

EI + S nu are loc reactia

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Page 6: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

=vmax [S]

Km +[S]v = 1 +

KI

[I]

Kmap = Km

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

elte.prompt.hu Determinarea constantetor de inhibitieI = benzamidină; S = N-Cbz-L-lizinaAscenzi, P. Ascenzi, M. G., Amiconi G.

Biochemical Education, 15(3), 1987

tripsină

Factor Xa

Kalicreină B

Page 7: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

E + S ES EP E + P

Inhibitie reversibila

Produsul reactiei enzimatice - inhibitor reversibil

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

science.halleyhosting.com

https://biology.stackexchange.com/

Produsul unei succesiuni de reacții

Page 8: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Km = 30 µM

Adenozin deaminaza

KI = 300 µM

KI = 0,15 pM

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Compușii analogi - starea de tranziție

Page 9: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Adenozin deaminaza

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Compușii analogi - starea de tranziție

Gleeson, M. P., Buton, N. A., Hillier, I.H.,

Phys. Chem. Chem. Phys., 2003,5, 4272-4278

Bradford, Kathryn L. et al., Journal of

Clinical Immunology 37 (2017): 626-637.

Sindromul imunodeficienței severe combinate

Page 10: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Compușii analogi - starea de tranziție

Sindromul imunodeficienței severe combinate (ADA-SCID)

Organismul nu este capabil să scindeze deoxiadenozina (compus toxic)

Terapii de substituție cu PEG-ADA

Celule imature din măduva spinării (CD34+) cu gena ADA modificată

thasso.com

David Vetter Boala băiatului din balonul steril

http://www.newbornscreening.info/

Page 11: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibitia alcool dehidrogenazei

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

https://step1.medbullets.com/biochemistry/

Aspirina – inhibitor competitiv al ALDH1A1

KI = 12 mM

Page 12: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

slideshare.net

Hoyos, P. et al., Catalysts 2019, 9(3), 260

Lovastatinahttps://www.chemsrc.com/

Page 13: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Nucleotid pirofosfataza/fosfodiesteraza de tip 1

(NPP1)

Țintă pentru terapia cancerului din creier

Lee S.Y., et. al., 2017, Frontiers in Pharmacology, 8, 54

Inhibiția enzimaticăInhibiția reversibilă (competitivă)

Lee SY, Müller C., Medchemcomm. 2017, 8(5):823-840

Page 14: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Proteina lac represor

1,6-aloloactoza

IPTGInhibitor

competitiv

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Page 15: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Proteina lac represor

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

www.teknova.com

Page 16: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Agenti antivirali

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

https://www.slideshare.net

Page 17: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Tratarea SIDA

TranscriptazeProteaze

Transcriptaze

AZT (zidovudine)

Inhibitorcompetitiv

Agenti antivirali

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

transciptaza inversă a HIVchemistry.wustl.edu/

usmle.biochemistryformedics.com

Page 18: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Triclosanulinhibitor al reductazei

Agenti antituberculoși

Inhibiția enzimatică

Inhibiția reversibilă (competitivă)

Kim, S. Et al FEBS J., 2020https://doi.org/10.1111/febs.15267

Page 19: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Substratul si inhibitorul au situsuri de legare diferite

Inhibiția enzimatică

Inhibiția necompetitivă

Morfina este un inhibitor necompetitiv al NO sintazei

10.1016/j.biopha.2016.11.056

Page 20: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

E + S ESk1

k-1

E + Pk2

k-2

E + I EIk3

k-3

EI + S ESIk4

k-4

ES + I ESIk5

k-5

Inhibiția enzimatică

Inhibiția necompetitivă

10.1016/j.bcp.2018.04.016

Inhibitor al transcriptazei (HIV1)

Page 21: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

=vmax [S]

Km +[S]v 1

1+KI

[I] =v’max [S]

Km +[S]v

vmax

1 +KI

[I]v’max =

Inhibiția enzimatică

Inhibiția necompetitivă

Page 22: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

E + S+I

KI’

ESI

ESk1

k-1

E + Pk2

k-2

E + I + Pk3

k-3

Inhibiția enzimatică

Inhibiția anticompetitiva

Page 23: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

=v’max [S]

K’m +[S]v

vmax

1 +KI’

[I]v’max =

Km

1 +KI’

[I]K’m =

Inhibiția enzimatică

Inhibiția anticompetitiva

Biochemistry A short course -Stryer

Page 24: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

E + S+I

KI’

ESI

ESk1

k-1

E + Pk2

k-2+I

KI

EI

Inhibiția enzimatică

Inhibiția mixta

Page 25: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibiția enzimatică

Inhibiția mixta

Page 26: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

E + S+I

KI’

ESI

ESk1

k-1

E + Pk2

k-2+I

KI

EI

EI* P

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă

Page 27: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă

Analogi ai substratului Modificare covalentă reziduu situs catalitic

Biochemistry A short course -Stryer

Page 28: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Inhibitori sinucigasi

Se leaga covalent de o gruparecatalitica dincentrul activ

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă

Rocham R.O., Wilson, R.A., Fungal Biology ReviewsVolume 33 (1), 2019, 47-57

Page 29: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Parazitul Trypanosoma brucei inconjurat de celulele rosiidin sangele infectat

Courtesy: Jürgen Berger and Dr. Peter Overath,

Max Planck Institute for Developmental Biology, Tübingen)

Inhibitori sinucigasi

Se leaga covalent de o grupare catalitica dincentrul activ

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă

Inh. al ornitin decarboxilazeiDFMO (difluoro-metilornitina)

Satyavan Sharma, Nitya Anand, in Pharmacochemistry Library, 1997

Page 30: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Ciclul parazitului Trypanosoma brucei

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă

Page 31: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

Incidenta bolii somnului

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă

Page 32: Inhibiția enzimatică - Biochimie · Produsul unei succesiuni de reacții. Km = 30 µM Adenozin deaminaza KI = 300 µM KI = 0,15 pM Inhibiția enzimatică

https://www.atsdr.cdc.gov/

Inhibitori sinucigasi

ParationulInh acetil colinesterazei

Inhibiția enzimatică

Inhibiția ireversibilă