europass curriculum vitae - biochim.ro · cv - farcasanu ileana cornelia – engleza . 2. cv ......

Opis

1. CV - Farcasanu Ileana Cornelia – engleza

2. CV - Farcasanu Ileana Cornelia – romana

3. Fisa de verificare a îndeplinirii standardelor minimale - Farcasanu IC - criterii noi

4. Lista de lucrari

5. Sumar - Teza de Abilitare (engleza) - Farcasanu IC

6. Sumar - Teza de Abilitare (romana) - Farcasanu IC

/4 - Curriculum vitae of Surname(s) First name(s)

For more information on Europass go to http://europass.cedefop.europa.eu © European Union, 2004-2010 24082010

Europass Curriculum Vitae

Personal information

First name(s) / Surname(s) Ileana Cornelia FARCASANU

Address(es) Polona 23A, Ap 4, 010553 Bucharest, Romania

Telephone(s) +40-21-2113348 Mobile: +40-721067169

Fax(es)

E-mail [email protected]; [email protected]

Nationality Romanian

Date of birth 25.07.1960

Gender F

Occupational field Academic, Research

Work experience

Dates 2006-onwards

Occupation or position held Associate professor

Main activities and responsibilities Teaching, research Molecular mechanisms involved in stress tolerance Natural compounds with anti-oxidant activity Bioremediation

Name and address of employer University of Bucharest, Faculty of Chemistry

Type of business or sector Academic

Dates 2001-2006

Occupation or position held Lecturer

Main activities and responsibilities Teaching, research Bioremediation Natural compounds with anti-microbial potential



Dates 2005

Occupation or position held Invited researcher

Main activities and responsibilities Research

Name and address of employer Hiroshima University, Graduate School of Advanced Sciences of Matter, Department of Molecular Biotechnology (Japan)


Dates 2002-2003

Occupation or position held Postdoctoral research assistant

mailto:[email protected]




Main activities and responsibilities Research Molecular studies of mechanisms involved in regulation of tolerance to sodium and heavy metals in Arabidopsis thaliana

Name and address of employer University of Glasgow, Institute of Biology and Life Science (IBLS), Department of Biochemistry and Molecular Biology (UK)


Dates 1999-2001

Occupation or position held Postdoctoral researcher

Main activities and responsibilities Research Molecular mechanisms involved in the unfolded protein response in yeast and mammalian cells

Name and address of employer Employed by the Japan Science and Technology Corporation (JST) at Nara Institute of Science and Technology (NAIST), Japan


Dates 1990-2001

Occupation or position held Professor’s assistant

Main activities and responsibilities Academic advising, research Asymmetric organic syntheses mediated by yeast



Dates 1985-1990

Occupation or position held Researcher

Main activities and responsibilities Research

Name and address of employer The National Institute of Oncology, Bucharest, Romania


Education and training

Dates 1996-1999

Title of qualification awarded Doctor of Engineering

Principal subjects/occupational skills covered

Molecular biology, Biotechnology, Biochemistry

Name and type of organisation providing education and training

Hiroshima University, Graduate School of Engineering, Department of Fermentation Technology, Japan, Funded by The Ministry of Culture and Education in Japan (Monbusho)

Dates 1994-1996

Title of qualification awarded Master of Engineering


Molecular biology, Biotechnology, Biochemistry


Hiroshima University, Graduate School of Engineering, Department of Fermentation Technology, Japan, Funded by The Ministry of Culture and Education in Japan (Monbusho)

Dates 1979-1984

Title of qualification awarded Master of Science


Biochemistry


Polytechnic University of Bucharest, Faculty of Technological Chemistry, Department of Biochemistry

Personal skills and competences

Mother tongue(s) Romanian



Other language(s)

Self-assessment Understanding Speaking Writing

European level (*) Listening Reading Spoken interaction Spoken production

English C2 Proficient user C2 Proficient user C2 Proficient user C2 Proficient user C2 Proficient user

French B2

Independent user

B2 Independent

user B1

Independent user

B1 Independent

user B1

Independent user

Japanese A1 Basic user A1 Basic user A1 Basic user A1 Basic user A2 Basic user

(*) Common European Framework of Reference for Languages

Organisational skills and competences

Principal Investigator in national research grants. 1. “Cellular and Molecular Biotechnologies for Medical Aplications“ (FSE POSDRU nr:

89/1.5/S/60746, approximate value: 200000 euros 2010-2013). PI in Partner group. 2. “Molecular mechanisms involved in Saccharomyces cerevisisae cellular response to

heavy metal and oxidative stress“ (PNII/IDEAS_985 nr: 176/2007, approximate value: 180000 euros, 2007-2010).

3. “Biochip with Multi-Alergens obtained through MicroArray Technology(MAMA)“ PI in Partner group (PNII/Partnership nr: 11-023/2007, approximate value: 80000 euros, 2007-2010) PI in Partner group.

4. “Manipulation of yeast tolerance to heavy metal stress as a primary tool for heavy metal bioremdiation through growing cells“, (CNCSIS 1643 nr: 13GR/28. 05. 2007, approximate value: 50000 euros, 2007-2009).

Technical skills and competences Laboratory experience includes: molecular cloning methods, standard yeast, bacteria, and plant genetic techniques, standard microbiological techniques, primers design, PCR gene analysis, gene fusion techniques, microbial and mammalian cell cultures, transfection, RT-PCR, drug selection, drug tests (on yeast and mammalian cell culture), kinetics of drug transport within cell, cation transport kinetics, yeast two-hybrid system, gene reporter assay, synthesis, extraction, purification and identification of natural compounds.

Computer skills and competences MS Office

Driving licence B

Additional information Hirsch Index 8, total number of citations: 290 (as of Google Scholar)

- Independent Evaluator FP7 for calls Marie Curie-People (IEF, IIIF, IOF) 2007-2012 - Evaluator independent FP7 for calls Marie Curie-People (Reintegration, IRG, ERG) 2009-2010 - Invited reviewer for: PlosOne, Current Microbiology, Applied Microbiology and Biotechnology, Applied Energy, Molecules, Pakistan Journal of Pharmaceutical Sciences, Revue Roumaine de Chimie, etc.

http://europass.cedefop.europa.eu/LanguageSelfAssessmentGrid/en



Annexes Selected publications 1. Mitrica R, Dumitru I, Ruta LL, Ofiteru AM, Farcasanu IC, The dual actionction of

epigallocatechin gallate (EGCG), the main constituent of green tea, against the deleterious effects of visible light and singlet oxygen-generating conditions as seen in yeast cells. Molecules, 17, 10355-10369 (2012).

2. Dumitru I, Ene CD, Ofiteru AM, Paraschivescu C, Madalan AM, Baciu I, Farcasanu IC, Identification of [CuCl(acac)(tmed)], a copper(II) complex with mixed ligands, as a modulator of Cu,Zn superoxide dismutase (Sod1p) activity in yeast. J Biol Inorg Chem, 17, 961-974 (2012).

3. Ofiteru AM, Ruta LL, Rotaru C, Dumitru I, Ene CD, Neagoe A, Farcasanu IC, Overexpression of the PHO84 gene causes heavy metal accumulation and induces Ire1p-dependent unfolded protein response in Saccharomyces cerevisiae cells. Appl Microbiol Biotechnol, 94, 425-455 (2012).

4. Farcasanu IC, Matache M, Neagoe A, Iordache V. Hyperaccumulation: a key to heavy metal bioremediation. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 251-278, (2012).

5. Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC. The Role of Organic Matter in the Mobility of Metals in Contaminated Catchments. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 297-325, (2012).

6. Farcasanu IC, Matache M. Sacchromyces cerevisiae’s three B-s: Bakery, Brewery, Bioremediation. In: Bioremediation: Biotechnology, Engineering and Environmental Management (Editor Alexander C. Mason), Nova Publishiers, ISBN: 978-1-61122-730-7, (2012).

7. Manolescu BN, Berteanu M, Dumitru L, Dinu H, Iliescu A, Farcasanu IC, Oprea E, Vlădoiu S, Popa O, Ianaș O, Dynamics of inflammatory markers in post-acute stroke patients undergoing rehabilitation. Inflammation, 34, 551-558 (2011).

8. Popa CV, Dumitru I, Ruta LL, Danet AF, Farcasanu IC, Exogenous oxidative stress induces Ca release in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEBS J, 277, 4027-4038 (2010).

9. Ruta L, Paraschivescu C, Matache M, Avramescu S, Farcasanu IC, Removing heavy metals from synthetic effluents using "kamikaze" Saccharomyces cerevisiae cells. Appl Microbiol Biotechnol, 85, 763-761 (2010).

10. Manolescu BN, Oprea E, Farcasanu IC, Berteanu M, Cercasov C, Homocysteine and vitamin therapy in stroke prevention and treatment: a review. Acta Biochim Pol, 57, 467-477 (2010).

11. Matache M, DobrotaC, Bogdan N, Dumitru I, Ruta L, Paraschivescu C, Farcasanu IC, Baciu I, Funeriu DP, Synthesis of fused dihydro-pyrimido[4,3-d]coumarins using Biginelli multicomponent reaction as key step. Tetrahedron, 65, 5949-5957 (2009).

12. Oprea E, Radulescu V, Balotescu C, Lazar V, Bucur M, Mladin P, Farcasanu IC, Chemical and biological studies of Ribes nigrum L. buds essential oil. Biofactors, 34, 3-12 (2008).

13. Gruia MI, Oprea E, Gruia I, Negoita V, and Farcasanu IC, The Antioxidant Response Induced by Lonicera caerulaea Berry Extracts in Animals Bearing Experimental Solid Tumors. Molecules, 13, 1195-1206 (2008).

14. Farcasanu IC, Paraschivescu C, Ruta L, Oprea E, Avramescu S, Manipulation of Ni2+ tolerance of Sacchromyces cerevisiae cells: a primary step to bioremediation by removal and recovery of Ni2+ from contaminated waters. Rev Roum Chim, 53, 647–651 (2008).

15. Farcasanu IC, Oprea E, Paraschivescu C, Ruta L, Avramescu A, Characterization of Sacchromyces cerevisiae mutants resistant to high concentrations of Co2+: a primary step to bioremediation by removal and recovery of Co2+ from contaminated waters. Rev Chim, 59, 1041-1045 (2008).

16. Farcasanu IC, Gruia MI, Paraschivescu C, Baciu I, and Oprea E, Ethanol extracts of Lonicera caerulea and Sambucus nigra berries exhibit antifungal properties upon heat-stressed Saccharomyces cerevisiae cells. Rev Chim, 57, 79-82 (2006).

17. Farcasanu IC, Mizunuma M, Nishiyama F, and Miyakawa T, Role of L-histidine in conferring tolerance to Ni2+ in Sacchromyces cerevisiae cells. Biosci Biotechnol Biochem, 69, 2343-2348 (2005).

PhD Thesis: “Studies on the regulatory mechanisms of cellular homeostasis of the essential trace element manganese in yeast”. Hiroshima University, Japan (1999).

Pagina 1 / 5 - Curriculum vitae al Fărcaşanu Ileana Cornelia

Pentru mai multe informaţii despre Europass accesaţi http://europass.cedefop.eu.int © Comunităţile Europene, 2003 20060628

Curriculum Vitae Europass

Informaţii personale

Nume / Prenume Fărcaşanu Ileana Cornelia

Adresa(e) Polonă 23A, Ap. 4, Sector 1 010553 Bucureşti (Romania)

Telefon(oane) +40 212113348 Mobil +40 721067169

E-mail(uri) [email protected]; [email protected]

Naţionalitate(-tăţi) română

Data naşterii 25/07/1960

Sex Femeiesc

Domeniu ocupaţional Academic, cercetare

Experienţa profesională

Perioada 01/10/2006 → prezent

Funcţia sau postul ocupat Conferenţiar

Activităţi si responsabilităţi principale - Activități didactice (predare, coordonare activitate de cercetare) - Cercetare (Tematică: Manipularea toleranţei celulelor faţă de condiţii de stres; Elucidarea unor mecanisme de răspuns faţă de condiţiile de stres; Bioremedierea sistemelor contaminate cu metale grele)

Numele şi adresa angajatorului Universitatea din Bucureşti, Facultatea de Chimie Şos. Panduri 90-92, 050663 Bucureşti (România)

Tipul activităţii sau sectorul de activitate Academic

Perioada 01/01/2001 - 30/09/2006

Funcţia sau postul ocupat Lector

Activităţi si responsabilităţi principale - Activități didactice (predare, coordonare activitate de cercetare) - Cercetare (Tematică: Screening de compuşi cu acţiune antioxidantă; Compuşi naturali cu potenţial terapeutic)

Numele şi adresa angajatorului Universiatea din Bucureşti, Facultatea de Chimie Şos. Panduri 90-92, 050663 Bucureşti (România)


Perioada 05/05/2005 - 07/07/2005

Funcţia sau postul ocupat Cercetător invitat

Activităţi si responsabilităţi principale Cercetare: - Studiul la nivel molecular al toleranţei fată de metale grele a celulelor de Saccharoyces cerevisiae. - Stabilirea unor metode de screening pentru investigarea activităţii antioxidante compuşilor naturali.





Numele şi adresa angajatorului Universitatea din Hiroshima, AdSM, Departamentul de Biotehnologie Moleculară 1-3-1 Kagamiyama, 739-8530 Higashi-Hiroshima (Japonia)

Tipul activităţii sau sectorul de activitate Cercetare

Perioada 01/12/2002 - 30/11/2003

Funcţia sau postul ocupat Cercetător asociat

Activităţi si responsabilităţi principale Studiul molecular al mecanismelor implicate în reglarea toleranţei faţă de sodiu si metale grele la plante.

Numele şi adresa angajatorului Universiitatea din Glasgow, IBLS, Departamentul de Biochimie si Biologie Moleculară Bower Building, G12 8QQ, Glasgow (Regatul Unit)


Perioada 01/04/1999 - 24/12/2000

Funcţia sau postul ocupat Cercetător postdoc

Activităţi si responsabilităţi principale Mecanisme implicate în recunoaşterea proteinelor incorect pliate în reticulul endoplasmatic

Numele şi adresa angajatorului NAIST (Institutul Naţional pentru Ştiinţă şi Tehnologie din Nara) 8916-5 Takayama, 630-0192 Ikoma, Nara (Japonia)

Tipul activităţii sau sectorul de activitate Cercetare, angajat de Corporaţia Japoneză pentru Ştiinţă şi Tehnologie (JST)

Perioada 01/04/1993 - 31/03/1999

Funcţia sau postul ocupat Bursier Monbusho

Activităţi si responsabilităţi principale Studiul unor mecanisme utilizate de drojdia Saccharomyces cerevisiae pentru reglarea homeostatică a microelementelor.

Numele şi adresa angajatorului Universitatea din Hiroshima, Facultaea de Inginerie Kagamiyama 1-4-1, 739-8527 Higashi-Hiroshima (Japonia)

Tipul activităţii sau sectorul de activitate Academic, cercetare

Perioada 01/02/1990 - 01/01/2001

Funcţia sau postul ocupat Asistent universitar

Activităţi si responsabilităţi principale -Studiul unor compuşi naturali cu potenţial terapeutic - Sinteze stereospecifice mediate de microorganisme

Numele şi adresa angajatorului Universitatea din Bucureşti, Facultatea de Chimie Şos. Panduri 90-92, 050663 Bucureşti (România)


Perioada 01/01/1985 - 31/01/1990

Funcţia sau postul ocupat Biochimist

Activităţi si responsabilităţi principale Imunologia cancerului: antigene asociate tumoral

Numele şi adresa angajatorului Institutul Oncologic Bucureşti (IOB) Şos. Fundeni 252, Bucureşti (România)


Educaţie şi formare

Perioada 01/04/1996 - 31/03/1999

Calificarea/diploma obţinută Doctor în Inginerie

Disciplinele principale studiate/competenţele profesionale

dobândite

Biologie moleculară, biotehnologie, biochimie

Numele şi tipul instituţiei de învăţământ/furnizorului de formare

Universitatea din Hiroshima (Facultatea de Inginerie) 1-4-1 Kagamiyama, 739-8527 Higashi-Hiroshima (Japonia)

Perioada 01/04/1994 - 31/03/1996



Calificarea/diploma obţinută Master în Inginerie


dobândite

Biologie moleculară, Tehnologia fermentaţiei, Biochimie


Universitatea din Hiroshima (Facultatea de Inginerie) 1-4-1 Kagamiyama, 739-8527 Higashi-Hiroshima (Japonia)

Perioada 15/09/1979 - 15/06/1984

Calificarea/diploma obţinută Master în Ştiinţe


dobândite

Biochimie


Institutul Politehnic Bucureşti (Facultatea de Tehnologie Chimică) Şos Polizu, Bucureşti (Romania)

Aptitudini şi competenţe personale

Limba maternă Română

Limbi străine cunoscute

Autoevaluare Înţelegere Vorbire Scriere

Nivel european (*) Ascultare Citire Participare la conversaţie

Discurs oral

Engleză C2

Utilizator experimentat

C2 Utilizator

experimentat C2


C2 Utilizator

experimentat C2


Franceză B2

Utilizator independent

B2 Utilizator

independent B1


B1 Utilizator

independent B1


Japoneză B1


B1 Utilizator

independent B2


B1 Utilizator

independent A2

Utilizator elementar

(*) Cadrului european comun de referinţă pentru limbi

Competenţe şi aptitudini organizatorice Director de proiect:

1) Contract CNCSIS 1643 “Manipularea toleranţei celulelor de Saccharomyces cerevisiae faţă de concentraţii crescute de metale grele ca instrument primar pentru bioremediere prin îndepărtatrea şi reciclarea metalelor grele”, 2007-2008, director proiect 2) Contract de cercetare exploratorie IDEI (PN II, IDEI, ID_965) „Mecanisme moleculare implicate in raspunsul celulelor de Saccharomyces cerevisisae la conditii de stres metalic si stres oxidativ”, 2007-2010, director proiect 3) Contract de cercetare exploratorie PARTENERIATE (PNII nr: 11-023/2007) “Biochip with Multi-Alergens obtained through MicroArray Technology(MAMA)“, director partener 2009-2010 4) Contract FSE POSDRU nr: 89/1.5/S/60746 “Cellular and Molecular Biotechnologies for Medical Aplications“, director partener

Competenţe şi aptitudini tehnice Experienţa de laborator include: tehnici de biologie moleculară, tehnologia ADN recombinant, metode standard de clonare moleculară, tehnici standard de genetica drojdiilor, bacteriilor si plantelor, izolare, purificare şi cuantificare de acizi nucleici, Southern, Northern, Western blotting, primer design, analiză PCR, RT-PCR, tehnici de fuzionare a genelor, obţinere pe scară largă a proteinelor recombinante, selecţie de substanţe fungicide, cinetica transportului de cationi la microorganisme, determinare a interacţiilor între proteine "in vivo" prin metoda "yeast two-hybrid", expresia proteinelor recombinante în drojdii şi bacterii, culturi celulare, sinteze oragnice, etc.

Competenţe şi aptitudini de utilizare a calculatorului

Utilizator MS Office, programe bioinformatice

http://europass.cedefop.europa.eu/LanguageSelfAssessmentGrid/ro



Permis de conducere B

Alte informații Hirsch Index 8, număr total de citări: 290 (cf. Google Scholar)

Hirsch Index 8, număr total de citări: 290 (cf. Google Scholar) - Evaluator independent FP7 la programele People-Marie Curie (Mobilități, IEF, IIIF, IOF) 2007-2012 - Evaluator independent FP7 la programele People-Marie Curie (Reintegrare, IRG, ERG) 2009-2010 - Referent pentru reviste de specialitate: PlosOne, Current Microbiology, Applied Microbiology and Biotechnology, Applied Energy, Molecules, Pakistan Journal of Pharmaceutical Sciences, Revue Roumaine de Chimie, etc.



Anexe Publicații relevante 1. Mitrica R, Dumitru I, Ruta LL, Ofiteru AM, Farcasanu IC, The dual actionction of

epigallocatechin gallate (EGCG), the main constituent of green tea, against the deleterious effects of visible light and singlet oxygen-generating conditions as seen in yeast cells. Molecules, 17, 10355-10369 (2012).

2. Dumitru I, Ene CD, Ofiteru AM, Paraschivescu C, Madalan AM, Baciu I, Farcasanu IC, Identification of [CuCl(acac)(tmed)], a copper(II) complex with mixed ligands, as a modulator of Cu,Zn superoxide dismutase (Sod1p) activity in yeast. J Biol Inorg Chem, 17, 961-974 (2012).

3. Ofiteru AM, Ruta LL, Rotaru C, Dumitru I, Ene CD, Neagoe A, Farcasanu IC, Overexpression of the PHO84 gene causes heavy metal accumulation and induces Ire1p-dependent unfolded protein response in Saccharomyces cerevisiae cells. Appl Microbiol Biotechnol, 94, 425-455 (2012).

4. Farcasanu IC, Matache M, Neagoe A, Iordache V. Hyperaccumulation: a key to heavy metal bioremediation. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 251-278, (2012).

5. Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC. The Role of Organic Matter in the Mobility of Metals in Contaminated Catchments. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 297-325, (2012).

6. Farcasanu IC, Matache M. Sacchromyces cerevisiae’s three B-s: Bakery, Brewery, Bioremediation. In: Bioremediation: Biotechnology, Engineering and Environmental Management (Editor Alexander C. Mason), Nova Publishiers, ISBN: 978-1-61122-730-7, (2012).

7. Manolescu BN, Berteanu M, Dumitru L, Dinu H, Iliescu A, Farcasanu IC, Oprea E, Vlădoiu S, Popa O, Ianaș O, Dynamics of inflammatory markers in post-acute stroke patients undergoing rehabilitation. Inflammation, 34, 551-558 (2011).

8. Popa CV, Dumitru I, Ruta LL, Danet AF, Farcasanu IC, Exogenous oxidative stress induces Ca release in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEBS J, 277, 4027-4038 (2010).

9. Ruta L, Paraschivescu C, Matache M, Avramescu S, Farcasanu IC, Removing heavy metals from synthetic effluents using "kamikaze" Saccharomyces cerevisiae cells. Appl Microbiol Biotechnol, 85, 763-761 (2010).

10. Manolescu BN, Oprea E, Farcasanu IC, Berteanu M, Cercasov C, Homocysteine and vitamin therapy in stroke prevention and treatment: a review. Acta Biochim Pol, 57, 467-477 (2010).

11. Matache M, DobrotaC, Bogdan N, Dumitru I, Ruta L, Paraschivescu C, Farcasanu IC, Baciu I, Funeriu DP, Synthesis of fused dihydro-pyrimido[4,3-d]coumarins using Biginelli multicomponent reaction as key step. Tetrahedron, 65, 5949-5957 (2009).

12. Oprea E, Radulescu V, Balotescu C, Lazar V, Bucur M, Mladin P, Farcasanu IC, Chemical and biological studies of Ribes nigrum L. buds essential oil. Biofactors, 34, 3-12 (2008).

13. Gruia MI, Oprea E, Gruia I, Negoita V, and Farcasanu IC, The Antioxidant Response Induced by Lonicera caerulaea Berry Extracts in Animals Bearing Experimental Solid Tumors. Molecules, 13, 1195-1206 (2008).

14. Farcasanu IC, Paraschivescu C, Ruta L, Oprea E, Avramescu S, Manipulation of Ni2+ tolerance of Sacchromyces cerevisiae cells: a primary step to bioremediation by removal and recovery of Ni2+ from contaminated waters. Rev Roum Chim, 53, 647–651 (2008).

15. Farcasanu IC, Oprea E, Paraschivescu C, Ruta L, Avramescu A, Characterization of Sacchromyces cerevisiae mutants resistant to high concentrations of Co2+: a primary step to bioremediation by removal and recovery of Co2+ from contaminated waters. Rev Chim, 59, 1041-1045 (2008).

16. Farcasanu IC, Gruia MI, Paraschivescu C, Baciu I, and Oprea E, Ethanol extracts of Lonicera caerulea and Sambucus nigra berries exhibit antifungal properties upon heat-stressed Saccharomyces cerevisiae cells. Rev Chim, 57, 79-82 (2006).

17. Farcasanu IC, Mizunuma M, Nishiyama F, and Miyakawa T, Role of L-histidine in conferring tolerance to Ni2+ in Sacchromyces cerevisiae cells. Biosci Biotechnol Biochem, 69, 2343-2348 (2005).

Teză doctorat: “Studies on the regulatory mechanisms of cellular homeostasis of the essential trace element manganese in yeast”. Hiroshima University, Japan (1999).

Dosar Abilitare Candidat: Fărcășanu Ileana Cornelia COMISIA BIOLOGIE ȘI BIOCHIMIE

1

Fișa de verificare a îndeplinirii standardelor minimale

(Conform Ordinului 6.560/2012, Anexa 19)

A. Condiții preliminarii obligatorii

1. Calificare profesională

- Master în Științe (Master of Science), Institutul Politehnic București, iunie

1984 (specializarea Biochimie)

- Master în Inginerie (Master of Engineering), Universitatea din Hiroshima

(Japonia), 1996

- Postdoc, Nara Institute of Science and Technology (NAIST; Japonia) 1999-

2000

- Postdoc, University of Glasgow, IBLS (UK), 2002-2003

2. Calificare științifică

- Doctor în Inginerie (Doctor of Engineering), Universitatea din Hiroshima

(Japonia), 1999

Teza de doctorat cu titlul „Studies on the regulatory mechanisms of cellular homeostasis of

the essential trace element manganese in yeast”. Hiroshima, Japonia (1999),

Coordonator: Profesor Dr. Tokichi Miyakawa

3. Coordonator de proiecte de cercetare

1) “Manipularea toleranței celulelor de Saccharomyces cerevisiae fața de

concentrații crescute de metale grele ca instrument primar pentru

bioremedierea prin îndepartarea și reciclarea metalelor grele”, CNCSIS

1643, Contract nr. 13GR /28.05.2007, 200 000 lei, 2007-2009. Director

proiect

2) “Mecanisme moleculare implicate în răspunsul celulelor de Saccharomyces

cerevisiae la condiţii de stres metalic şi stres oxidativ” Program PNII-IDEI,

Contract nr: 176/2007, 2007-2010, valoare contract 721.965,17 RON.

Director proiect

3) ”Biochip-uri cu Multi-Alergeni obținute prin Tehnologia MicroArray

(MAMA). Program PNII-Parteneriate, Contract nr. 11-023/2007,

280.000RON. Director partener 2009-2010

4) ”Biotehnologii celulare şi moleculare cu aplicaţii în medicină”, FSE

POSDRU /89/1.5/S/60746, 1.057.542 RON, 2010-2013. Director

partener


2

B. Criterii și standarde

C1. Evaluarea acivității de cercetare

Tabel 1. Parametrii luați în calcul și modul de cuantificare

Nr.

crt.

Parametru Mod de calcul Nr

puncte

1. Articole în reviste ISI, ca autor principal Formula (1)

1) Farcasanu IC, Hirata D, Tsuchiya E, Nishiyama F, Miyakawa T. Protein phosphatase 2B of Saccharomyces cerevisiae is required for tolerance to manganese,

in blocking the entry of ions into the cells. Eur J Biochem. 1995, 232:712-7. Actual FEBS J

2) Farcasanu IC, Ohta N, Miyakawa T. The fate of Mn2+ ions inside Saccharomyces

cerevisiae cells seen by electron paramagnetic resonance. Biosci Biotechnol Biochem. 1996 60:468-71.

3) Farcasanu IC, Mizunuma M, Hirata D, Miyakawa T.Involvement of histidine

permease (Hip1p) in manganese transport in Saccharomyces cerevisiae. Mol Gen Genet. 1998, 259:541-8. Actual MOL GENET GENOMICS

4) Farcasanu IC, Hirata D, Tsuchiya E, Mizuta K, Miyakawa T. Involvement of

thioredoxin peroxidase type II (Ahp1p) of Saccharomyces cerevisiae in Mn2+ homeostasis. Biosci Biotechnol Biochem. 1999, 63:1871-1881.

5) Farcasanu IC, Mizunuma M, Nishiyama F, Miyakawa T.Role of L-histidine in conferring tolerance to Ni2+ in Sacchromyces cerevisiae cells.Biosci Biotechnol

Biochem. 2005, 69:2343-2348.

6) Farcasanu IC, Gruia MI, Paraschivescu C, Baciu I, and Oprea E: Ethanol Extracts

of Lonicera caerulea and Sambucus nigra Berries Exhibit Antifungal Properties

upon Heat-Stressed Saccharomyces cerevisiae Cells. Revista de Chimie, 2006;

57:79-82. 7) Stan D, Mihailescu C, Paraschivescu C, Oprea E, Farcasanu IC: Electroforeza

proteinelor, o importantă metodă în diagnosticul de laborator clinic. Rev Chim 2006;

57:308-311. 8) Farcasanu IC, Paraschivescu C, Ruta L, Oprea E, Avramescu S: Characterization of

Sacchromyces cerevisiae Mutants Resistant to High Concentrations of Co2+: A

Primary Step to Bioremediation by Removal and Recovery of Co2+ from Contaminated Waters, Rev Chim 2008; 59: 1041-1044.

9) Farcasanu IC, Paraschivescu C, Ruta L, Oprea E, Avramescu S: Manipulation of

Ni2+ tolerance of Saccharomyces cerevisiae cells: a primary step to bioremediation by removal and recovery of Ni2+ from contaminated waters, Rev Roum Chim 2008;

53: 647-651. 10) Oprea E, Radulescu V, Balotescu C, Lazar V, Bucur M, Mladin P, Farcasanu IC.

Chemical and biological studies of Ribes nigrum L. buds essential oil. Biofactors.

2008, 34:3-12.

11) Gruia MI, Oprea E, Gruia I, Negoita V, Farcasanu IC. The antioxidant response

induced by Lonicera caerulaea berry extracts in animals bearing experimental solid

tumors. Molecules. 2008;13:1195-1206. 12) Ruta L, Paraschivescu C, Matache M, Avramescu S, Farcasanu IC. Removing

heavy metals from synthetic effluents using "kamikaze" Saccharomyces cerevisiae

cells. Appl Microbiol Biotechnol. 2010; 85:763-771. 13) Popa CV, Dumitru I, Ruta LL, Danet AF, Farcasanu IC. Exogenous oxidative

stress induces Ca2+ release in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEBS J. 2010;

277:4027-4038. 14) Ofiteru AM, Ruta LL, Rotaru C, Dumitru I, Ene CD, Neagoe A, Farcasanu IC.

Overexpression of the PHO84 gene causes heavy metal accumulation and induces

Ire1p-dependent unfolded protein response in Saccharomyces cerevisiae cells. Appl Microbiol Biotechnol. 2012; 94:425-435.

15) Dumitru I, Ene CD, Ofiteru AM, Paraschivescu C, Madalan AM, Baciu I, Farcasanu

IC. Identification of [CuCl(acac)(tmed)], a copper(II) complex with mixed ligands, as a modulator of Cu,Zn superoxide dismutase (Sod1p) activity in yeast. J Biol Inorg

Chem. 2012;17:961-974.

16) Mitrica R, Dumitru I, Ruta LL, Ofiteru AM, Farcasanu IC. The dual action of

epigallocatechin gallate (EGCG), the main constituent of green tea, against the

deleterious effects of visible light and singlet oxygen-generating conditions as seen

in yeast cells. Molecules. 2012;17:10355-10369.

10+5x1,1829+60

10+5x0.3827+6

10+5x0,9224 +12

10+5x0.3827 +12

10+5x0.3827 +6

10+5x0,0347+3

10+5x0,0347

10+5x0,0347+1

10+5x0,0649

10+5x0,8025+4

10+5x0,5183+13

10+5x0,9108+14

10+5x1,1829+7

10+5x0,9108

10+5x1,0286

10+5x0,5183+2

75,9145

17.9135

26,612

23,9135

17,9135

13,1735

10,1735

11,1735

10,3245

18,0125

25,5915

28,554

22,9145

14,554

15,143

14,5915


3

Total: 346,473

2. Articole în reviste ISI, ca și contributor Formula (2)

1) Kimata Y, Kimata YI, Shimizu Y, Abe H, Farcasanu IC, Takeuchi M, Rose MD,

Kohno K. Genetic evidence for a role of BiP/Kar2 that regulates Ire1 in response to

accumulation of unfolded proteins. Mol Biol Cell. 2003;14:2559-2269 2) Matache M, DobrotaC, Bogdan N, Dumitru I, Ruta L, Paraschivescu C, Farcasanu

IC, Baciu I, Funeriu DP Synthesis of fused dihydro-pyrimido[4,3-d]coumarins

using Biginelli multicomponent reaction as key step. Tetrahedron 2009; 65: 5949-5957.

3) Manolescu BN, Oprea E, Farcasanu IC, Berteanu M, Cercasov C. Homocysteine

and vitamin therapy in stroke prevention and treatment: a review. Acta Biochim Pol. 2010;57:467-477.

4) Manolescu BN, Berteanu M, Dumitru L, Dinu H, Iliescu A, Fărcășanu IC, Oprea E,

Vlădoiu S, Popa O, Ianăș O.Dynamics of inflammatory markers in post-acute stroke patients undergoing rehabilitation. Inflammation. 2011; 34:551-558.

5) Almajan GL, Barbuceanu SF, Farcasanu I, Draghici C. Synthesis and

Characterization of New 2, 5-disubstituted-1, 3, 4-oxadiazoles as Possible Biological Active Compounds. Rev Chim 2011; 62:386-390

6) Popa CV, Farcasanu IC, Jipa S, Zaharescu T, Danet AF, Chemiluminescence

Determination of the Total Antioxidant Capacity of Rosemary Extract . Rev Chim 2012; 62:715-719.

7) Paraschivescu CC, Matache M, Dobrota C, Nicolescu A, Maxim C, Deleanu C,

Farcasanu IC, Hadade ND. Unexpected Formation of N-(1-(2-Aryl-hydrazono)isoindolin-2-yl)benzamides and Their Conversion into 1,2-(Bis-1,3,4-

oxadiazol-2-yl)benzenes. J Org Chem. 2013 Feb 21. [Epub ahead of print]

0,7x(10+5x2,7215

+108)

0,7x(10+5x0,7273 +4)

0,7x(10+5x0,4208+22)

0,7x(10+5x0,5598+3)

0,7x(10+5x0,0347)

0,7x(10+5x0,0347+1)

0,7x(10+5x1,0569)

92,12525

12,34555

23,8728

11,0593

7,12145

7,82145

10,69915

Total: 165.045

3. Articole în reviste BDI ca autor principal

1) Farcasanu IC, Nishiyama F, and Miyakawa T: Particle-induced X-ray emission

(PIXE): a tool for multielement analysis in the yeast cells. Analele Universităţii din

Bucureşti, Seria de Chimie, XIII, 39-43 (2004).

2) Farcasanu IC, Nishiyama F, and Miyakawa T: Particle-induced X-ray emission

(PIXE): a practical approach to determine the manganese accumulation by yeast mitochondria. Analele Universităţii din Bucureşti, Seria de Chimie, XIV, 39-43

(2005).

3) Farcasanu IC, Oprea E: Ethanol Extracts of Salvia officinalis exhibit antifungal properties against Saccharomyces cerevisiae cells. Analele Universităţii din

Bucureşti, Seria de Chimie, XV (2006)

1x5

1x5

1x5

Total: 15

4. Articole în alte reviste ca autor principal 1) Farcasanu R, Vasile I, Farcasanu IC, Removal of petroleum hydrocarbons and

derivatives from soil. Rev. Danube Env. Ed. Centre, III, 7-9 (2005). 2) Gruia MI, Farcasanu IC, Producerea speciilor reactive ale oxigenului şi rolul

antioxidanţilor în bolile degenerative. Revista Română de Oncologie, Vol. 42 (3)

(2005).

1

1

Total: 2

5. Cărți în editurile universităților din Consorțiu 1) Farcasanu IC, Cretu I, Organic Chemistry. Chemistry of compounds with mixed

functional groups. Editura Universităţii din Bucureşti (2004), ISBN 973-575-966-7

2) Cretu I, Farcasanu IC, Compounds with mixed functional groups: problems and exercises. Editura Universităţii din Bucureşti (2005), ISBN 973-575-986-1.

3) Farcasanu IC, Gruia MI, Biochimie medicală, Editura Universităţii din Bucureşti

(2005), ISBN 973-737-023-6. 4) Farcasanu IC, Gruia MI, Brasoveanu LI, Biochimie medicală, Lucrări de laborator,

Editura Universităţii din Bucureşti (2005), ISBN 973-737-034-1

5) Manolescu BN, Farcasanu IC, Teste comentate de biochimie, Editura Universităţii din Bucureşti (2011), ISBN 978-973-737-915-3

6) Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC, Remedierea zonelor poluate, , Editura

Universităţii din Bucureşti (2011), ISBN 978-973-737-907-8

50:2

50:2

50:2

50:3

50:2

50:3

25

25

25

16,33

25

16.33

Total: 132,66

6. Capitole în cărți/volume în edituri internaționale 1) Farcasanu IC, Matache M, Neagoe A, Iordache V. Hyperaccumulation: a key to

heavy metal bioremediation. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 251-

20:3

6,67


4

278, (2012). DOI: 10.1007/978-3-642-23327-2_13.

2) Farcasanu IC, Matache M. Sacchromyces cerevisiae’s three B-s: Bakery,

Brewery, Bioremediation. In: Bioremediation: Biotechnology, Engineering and

Environmental Management (Editor Alexander C. Mason), Nova Publishiers,

ISBN: 978-1-61122-730-7, (2012).

3) Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC. The Role of Organic Matter in the Mobility

of Metals in Contaminated Catchments. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated

Soils (Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31,

297-325, (2012). DOI: 10.1007/978-3-642-23327-2_15.

20:3

20:3

6,66

6,66

Total: 20

Total: 681,178

Tabel 2.

Parametru Punctaj minim abilitare Punctaj candidat

1-2 (Recunoaștere internațională) 150 511,518

1-6 (Performanță totală) 320 681,178

C2. Contribuția la dezvoltarea cunoașterii în domeniu

Articole reprezentative pentru activitatea de cercetător independent (articolele

reprezentative sunt atașate in extenso)

Articole

1. Mitrica R, Dumitru I, Ruta LL, Ofiteru AM, Farcasanu IC, The dual actionction of


deleterious effects of visible light and singlet oxygen-generating conditions as seen in

yeast cells. Molecules, 17, 10355-10369 (2012).

2. Dumitru I, Ene CD, Ofiteru AM, Paraschivescu C, Madalan AM, Baciu I, Farcasanu

IC, Identification of [CuCl(acac)(tmed)], a copper(II) complex with mixed ligands, as

a modulator of Cu,Zn superoxide dismutase (Sod1p) activity in yeast. J Biol Inorg

Chem, 17, 961-974 (2012).

3. Ofiteru AM, Ruta LL, Rotaru C, Dumitru I, Ene CD, Neagoe A, Farcasanu IC,


Ire1p-dependent unfolded protein response in Saccharomyces cerevisiae cells. Appl

Microbiol Biotechnol, 94, 425-455 (2011).

4. Manolescu BN, Berteanu M, Dumitru L, Dinu H, Iliescu A, Farcasanu IC, Oprea E,

Vlădoiu S, Popa O, Ianaș O, Dynamics of inflammatory markers in post-acute stroke

patients undergoing rehabilitation. Inflammation, 34, 551-558 (2011).

5. Popa CV, Dumitru I, Ruta LL, Danet AF, Farcasanu IC, Exogenous oxidative stress

induces Ca release in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEBS J, 277, 4027-4038

(2010).

6. Ruta L, Paraschivescu C, Matache M, Avramescu S, Farcasanu IC, Removing heavy

metals from synthetic effluents using "kamikaze" Saccharomyces cerevisiae cells.

Appl Microbiol Biotechnol, 85, 763-761 (2010).


5

7. Manolescu BN, Oprea E, Farcasanu IC, Berteanu M, Cercasov C, Homocysteine and

vitamin therapy in stroke prevention and treatment: a review. Acta Biochim Pol, 57,

467-477 (2010).

8. Matache M, DobrotaC, Bogdan N, Dumitru I, Ruta L, Paraschivescu C, Farcasanu

IC, Baciu I, Funeriu DP, Synthesis of fused dihydro-pyrimido[4,3-d]coumarins using

Biginelli multicomponent reaction as key step. Tetrahedron, 65, 5949-5957 (2009).

9. Oprea E, Radulescu V, Balotescu C, Lazar V, Bucur M, Mladin P, Farcasanu IC,

Chemical and biological studies of Ribes nigrum L. buds essential oil. Biofactors, 34,

3-12 (2008).

10. Gruia MI, Oprea E, Gruia I, Negoita V, and Farcasanu IC, The Antioxidant Response

Induced by Lonicera caerulaea Berry Extracts in Animals Bearing Experimental Solid

Tumors. Molecules, 13, 1195-1206 (2008).

11. Farcasanu IC, Paraschivescu C, Ruta L, Oprea E, Avramescu S, Manipulation of Ni2+

tolerance of Sacchromyces cerevisiae cells: a primary step to bioremediation by

removal and recovery of Ni2+

from contaminated waters. Rev Roum Chim, 53, 647–

651 (2008).

12. Farcasanu IC, Oprea E, Paraschivescu C, Ruta L, Avramescu A, Characterization of

Sacchromyces cerevisiae mutants resistant to high concentrations of Co2+

: a primary

step to bioremediation by removal and recovery of Co2+

from contaminated waters.

Rev Chim, 59, 1041-1045 (2008).

13. Farcasanu IC, Gruia MI, Paraschivescu C, Baciu I, and Oprea E, Ethanol extracts of

Lonicera caerulea and Sambucus nigra berries exhibit antifungal properties upon

heat-stressed Saccharomyces cerevisiae cells. Rev Chim, 57, 79-82 (2006).

14. Farcasanu IC, Mizunuma M, Nishiyama F, and Miyakawa T, Role of L-histidine in

conferring tolerance to Ni2+

in Sacchromyces cerevisiae cells. Biosci Biotechnol

Biochem, 69, 2343-2348 (2005).

Invited Reviews

1. Farcasanu IC, Matache M, Neagoe A, Iordache V. Hyperaccumulation: a key to heavy

metal bioremediation. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors: Erika

Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 251-278, (2012). DOI:

10.1007/978-3-642-23327-2_13.

2. Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC. The Role of Organic Matter in the Mobility of

Metals in Contaminated Catchments. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils

(Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 297-325,

(2012). DOI: 10.1007/978-3-642-23327-2_15.

3. Farcasanu IC, Matache M. Sacchromyces cerevisiae’s three B-s: Bakery, Brewery,

Bioremediation. In: Bioremediation: Biotechnology, Engineering and Environmental Management (Editor Alexander C. Mason), Nova Publishiers, ISBN: 978-1-61122-730-

7, (2012).

C3. Evaluarea acivității didactice

Fiind angajată la Universitatea din București, Facultatea de Chimie din 1991, de-a lungul

timpului am avut o activitate didactică susținută, alcătuită în pribncupal din activitate de

predare (11 cursuri diferite din 2005), lucrări de laborator didactic, îndrumarea activității de

cercetare a studenților


6

C3.1. Activitatea de predare. Lista cursurilor predate în perioada 2005-20013 este

prezentată mai jos.

1) „Chimia compuşilor organici cu funcţiuni mixte”, Curs Licenţă seriile pre-Bologna, secţia

Chimie – Engleză: 2005-2006, 2006-2007

2) „Compuşi bioorganici şi coloranţi”, Curs Licenţă seriile Bologna, secţia Chimie: 2009-2010

3) „Biochimie generală”, Curs Licenţă seriile pre-Bologna şi Bologna, Secţia Biochimie

Tehnologică: 2005-2006; 2006-2007; 2007-2008; 2008-2009; 2009-2010, 2010-2011, 2011-

2012, 2012-2013.

4) „Biochimie şi biologie moleculară”, Curs Licenţă seriile Bologna, Secţia Biochimie

Tehnologică: 2008-2009; 2009-2010, 2010-2011.

5) „Biologie celulară”, Curs Licenţă seriile Bologna, Secţia Biochimie Tehnologică: 2011-2012;

2012-2013.

6) „Proteine și acizi nucleici”, Curs opțional Licenţă seriile Bologna, Secţia Biochimie

Tehnologică: 2011-2012; 2012-2013.

7) „Introducere în Biochimie”, Curs facultativ Licenţă, secţiile Chimie şi Chimia mediului: 2007-

2008; 2008-2009, 2009-2010.

8) „Biochimie medicală”, Curs Master I seriile pre-Bologna, specializarea Chimie terapeutică:

2005-2006, 2006-2007; 2007-2008.

9) „Biocatalizatori în sinteza unor substanţe bioactive”, Curs Master I, seriile pre-Bologna,

specializarea Enzimologie aplicată: 2007-2008.

10) „Enzime imobilizate” Curs Master I, seriile pre-Bologna, specializarea Enzimologie aplicată:

2007-2008.

11) „Noţiuni aprofundate în Biochimie”, Curs Master I, seriile Bologna, specializarea

Biomolecule: 2008-2009.

C.3.2. Coordonare lucrări practice de laborator (cu scop didactic)

1) „Biologie celulară”, Lucrări practice Licenţă seriile Bologna, Secţia Biochimie Tehnologică:

2011-2012; 2012-2013.

2) „Proteine și acizi nucleici”, Lucrări practice Licenţă seriile Bologna, Secţia Biochimie

Tehnologică: 2011-2012; 2012-2013.

3) „Biochimie medicală”, Lucrări practice Master I seriile pre-Bologna, specializarea Chimie

terapeutică: 2005-2006, 2006-2007.

4) „Enzime imobilizate” Lucrări practice I, seriile pre-Bologna, specializarea Enzimologie

aplicată: 2007-2008.

C.3.3. Coordonare de lucrări de licență și masterat

În perioada 2007-2012 am coordonat actrivitatea a 49 studenți în activitatea de elaborare a

tezelor de licență (24) și master (25). Toți studenții din lista de mai jos au promovat.

Tabel 1. Lista studenţilor îndrumaţi de conf. dr. IC Fărcăşanu în activitatea de efectuare şi elaborare a lucrărilor

de licenţă şi de dizertaţie în perioada 2005-2012, în cadrul Faculății de Chimie, Universitatea din București

Nr. crt. Nume şi Prenume Nivel de studii Secţie Promoţie

1. Soare Cornelia Licenţă Chimie 2007

2. Stoica Petruţa Licenţă BTH 2007

3. Roşca Oana Licenţă BTH 2007

4. Cachiţ Angelica Licenţă BTH 2007

5. Flăutaru Ramona Master Chimie Terapeutică 2007

6. Soare Gica Master Chimie Terapeutică 2007

7. Orăşteanu Alina Master Chimie Terapeutică 2007

8. Comănescu Constantina Licenţă BTH 2008

9. Ochea Ana Licenţă BTH 2008

10. Rădulescu Cristina Licenţă BTH 2008

11. Calu Larisa Licenţă BTH 2008


7

12. Zamfir Lucian Licenţă BTH 2008

13. Popa Cristina Licenţă BTH 2008

14. Zabara Alexandru Licenţă BTH 2008

15. Popa Cristina Licenţă BTH 2008

16. Chiriţoiu Marioara Licenţă BTH 2008

17. Chiriţoiu Gabriela Licenţă BTH 2008

18. Enciu Simona Master Chimie Terapeutică 2008

19. Gheorghe Roxana Master Chimie Terapeutică 2008

20. Isac Simona Master Chimie Terapeutică 2008

21. Morcov Silvia Master Chimie Terapeutică 2008

22. Panait Elena Master Chimie Terapeutică 2008

23. Crasanda AnaMaria Licenţă BTH 2009

24. Neaţă Dana Licenţă BTH 2009

25. Rotaru Codruţa Licenţă BTH 2009

26. Stănescu Andrada Licenţă BTH 2009

27. Strîmbeanu Andreea Licenţă BTH 2009

28. Tudor Andreea Licenţă BTH 2009

29. Ureche Cristina Licenţă BTH 2009

30. Stoica Petruţa Master Chimie Terapeutică 2009

31. Bărbulescu Camelia Master Enzimologie Aplicată 2009

32. Cachiţ Angelica Master Enzimologie Aplicată 2009

33. Logofătu Liliana Master Enzimologie Aplicată 2009

34. Roşca Oana Master Enzimologie Aplicată 2009

35 Vasile Alina Licenţă BTH 2010

36 Remeș Anca Licenţă BTH 2010

37 Lupșeneanu Alexandra Master Biomolecule 2010

38 Vasile Otilia Master Biomolecule 2010

39 Torcatoru Andrei Master Biomolecule 2010

40 Grigore Claudia Master Chimie Terapeutică 2010

41 Stoica Cătălina Master Chimie Terapeutică 2010

42 Craiu Camelia Master Chimie Terapeutică 2011

43 Ionițescu Aurora Master Chimie Terapeutică 2011

44 Ochea Ana Master Chimie Terapeutică 2011

45 Tudor Andreea Master Chimia Medicamentelor și

Produselor cosmetice

2011

46 Rotaru Codruța Master Chimia Mediului 2011

47 Marin Valentina Licenţă BTH 2012

48 Savin Simona Master Chimia Medicamentelor și Produselor cosmetice

2012

49 Tatia Rodica Master Chimia Medicamentelor și

Produselor cosmetice

2012

C.3.4. Elaborare de suporrturi de curs

1) Farcasanu IC, Cretu I, Organic Chemistry. Chemistry of compounds with mixed functional

groups. Editura Universităţii din Bucureşti (2004), ISBN 973-575-966-7

2) Cretu I, Farcasanu IC, Compounds with mixed functional groups: problems and exercises.

Editura Universităţii din Bucureşti (2005), ISBN 973-575-986-1.

3) Farcasanu IC, Gruia MI, Biochimie medicală, Editura Universităţii din Bucureşti (2005),

ISBN 973-737-023-6.

4) Farcasanu IC, Gruia MI, Brasoveanu LI, Biochimie medicală, Lucrări de laborator, Editura

Universităţii din Bucureşti (2005), ISBN 973-737-034-1

C.3.5. Membru în comisii de doctorat

- 7 comisii la Universitatea din București

- 1 comisie la Universitatea Politehnică din București

- 2 comisii la Universitatea A.I. Cuza din Iași

- 2 comisii la Universitatea Babeș-Bolyai din Cluj

- 2 comisii internaționale (India și Pakistan)


8

C.3.6. Varia

- Evaluator FP7 la programele People-Marie Curie (Mobilități, IEF, IIIF, IOF) 2007-2012

- Evaluator FP7 la programele People-Marie Curie (Reintegrare, IRG, ERG) 2009-2010

- Referent pentru reviste de specialitate: PlosOne, Current Microbiology, Applied

Microbiology and Biotechnology, Applied Energy, Molecules, Pakistan Journal of

Pharmaceutical Sciences, Revue Roumaine de Chimie, etc.

Ileana Cornelia Fărcășanu Dosar Abilitare Comisia BIOCHIMIE ȘI BIOLOGIE

1

Lista de lucrări

a) Lista lucrărilor relevante pentru realizările profesionale ulterioare

obținerii titlului de doctor

1. Mitrica R, Dumitru I, Ruta LL, Ofiteru AM, Farcasanu IC. The dual actionction of


deleterious effects of visible light and singlet oxygen-generating conditions as seen in

yeast cells. Molecules, 17, 10355-10369 (2012).

2. Dumitru I, Ene CD, Ofiteru AM, Paraschivescu C, Madalan AM, Baciu I, Farcasanu

IC. Identification of [CuCl(acac)(tmed)], a copper(II) complex with mixed ligands, as

a modulator of Cu,Zn superoxide dismutase (Sod1p) activity in yeast. J Biol Inorg

Chem, 17, 961-974 (2012).

3. Ofiteru AM, Ruta LL, Rotaru C, Dumitru I, Ene CD, Neagoe A, Farcasanu IC.


Ire1p-dependent unfolded protein response in Saccharomyces cerevisiae cells. Appl

Microbiol Biotechnol, 94, 425-455 (2012).

4. Popa CV, Dumitru I, Ruta LL, Danet AF, Farcasanu IC. Exogenous oxidative stress

induces Ca2+

release in the yeast Saccharomyces cerevisiae. FEBS J, 277, 4027-4038

(2010).

5. Ruta L, Paraschivescu C, Matache M, Avramescu S, Farcasanu IC. Removing heavy

metals from synthetic effluents using "kamikaze" Saccharomyces cerevisiae cells.

Appl Microbiol Biotechnol, 85, 763-761 (2010).

6. Oprea E, Radulescu V, Balotescu C, Lazar V, Bucur M, Mladin P, Farcasanu IC.

Chemical and biological studies of Ribes nigrum L. buds essential oil. Biofactors, 34,

3-12 (2008).

7. Gruia MI, Oprea E, Gruia I, Negoita V, Farcasanu IC. The Antioxidant Response

Induced by Lonicera caerulaea Berry Extracts in Animals Bearing Experimental Solid

Tumors. Molecules, 13, 1195-1206 (2008).

8. Farcasanu IC, Paraschivescu C, Ruta L, Oprea E, Avramescu S. Manipulation of Ni2+

tolerance of Sacchromyces cerevisiae cells: a primary step to bioremediation by

removal and recovery of Ni2+

from contaminated waters. Rev Roum Chim, 53, 647–

651 (2008).

9. Farcasanu IC, Oprea E, Paraschivescu C, Ruta L, Avramescu S. Characterization of

Sacchromyces cerevisiae mutants resistant to high concentrations of Co2+

: a primary

step to bioremediation by removal and recovery of Co2+

from contaminated waters.

Rev Chim, 59, 1041-1045 (2008).


2

10. Farcasanu IC, Gruia MI, Paraschivescu C, Baciu I, and Oprea E. Ethanol extracts of

Lonicera caerulea and Sambucus nigra berries exhibit antifungal properties upon

heat-stressed Saccharomyces cerevisiae cells. Rev Chim, 57, 79-82 (2006).

11. Farcasanu IC, Mizunuma M, Nishiyama F, and Miyakawa T. Role of L-histidine in

conferring tolerance to Ni2+

in Sacchromyces cerevisiae cells. Biosci Biotechnol

Biochem, 69, 2343-2348 (2005).

b) Teza de doctorat

“Studies on the regulatory mechanisms of cellular homeostasis of the essential trace element

manganese in yeast”. Hiroshima University, Japan (1999).

c) Cărți

1. Farcasanu IC, Cretu I. Organic Chemistry. Chemistry of compounds with mixed

functional groups. Editura Universităţii din Bucureşti (2004), ISBN 973-575-966-7

2. Cretu I, Farcasanu IC. Compounds with mixed functional groups: problems and

exercises. Editura Universităţii din Bucureşti (2005), ISBN 973-575-986-1.

3. Farcasanu IC, Gruia MI. Biochimie medicală, Editura Universităţii din Bucureşti

(2005), ISBN 973-737-023-6.

4. Farcasanu IC, Gruia MI, Brasoveanu LI. Biochimie medicală, Lucrări de laborator,

Editura Universităţii din Bucureşti (2005), ISBN 973-737-034-1

5. Manolescu BN, Farcasanu IC. Teste comentate de biochimie, Editura Universităţii

din Bucureşti (2011), ISBN 978-973-737-915-3

6. Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC. Remedierea zonelor poluate, , Editura

Universităţii din Bucureşti (2011), ISBN 978-973-737-907-8

d) Articole de tip review

1. Farcasanu IC, Matache M, Neagoe A, Iordache V. Hyperaccumulation: a key to

heavy metal bioremediation. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils (Editors:

Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 251-278, (2012).

2. Neagoe A, Iordache V, Farcasanu IC. The Role of Organic Matter in the Mobility of

Metals in Contaminated Catchments. In: Bio-Geo-Interactions in Contaminated Soils

(Editors: Erika Kothe, Ajit Varma), Springer Publishing, Berlin, Soil Biol 31, 297-

325, (2012).


3

3. Farcasanu IC, Matache M. Sacchromyces cerevisiae’s three B-s: Bakery, Brewery,

Bioremediation. In: Bioremediation: Biotechnology, Engineering and Environmental

Management (Editor Alexander C. Mason), Nova Publishiers, ISBN: 978-1-61122-

730-7, (2012).

e) Alte lucrări

1. Farcasanu IC, Hirata D, Tsuchiya E, Nishiyama F, Miyakawa T. Protein phosphatase

2B of Saccharomyces cerevisiae is required for tolerance to manganese, in blocking

the entry of ions into the cells. Eur J Biochem, 232, 712-717 (1995). Actual FEBS J

2. Farcasanu IC, Ohta N, Miyakawa T. The fate of Mn2+

ions inside Saccharomyces

cerevisiae cells seen by electron paramagnetic resonance. Biosci Biotechnol Biochem,

60, 468-471 (1996).

3. Farcasanu IC, Mizunuma M, Hirata D, Miyakawa T. Involvement of histidine

permease (Hip1p) in manganese transport in Saccharomyces cerevisiae. Mol Gen

Genet. 259, 541-548 (1998). Actual MOL GENET GENOMICS

4. Farcasanu IC, Hirata D, Tsuchiya E, Mizuta K, Miyakawa T. Involvement of

thioredoxin peroxidase type II (Ahp1p) of Saccharomyces cerevisiae in Mn2+

homeostasis. Biosci Biotechnol Biochem, 63, 1871-1881 (1999).

5. Kimata Y, Kimata YI, Shimizu Y, Abe H, Farcasanu IC, Takeuchi M, Rose MD,

Kohno K. Genetic evidence for a role of BiP/Kar2 that regulates Ire1 in response to

accumulation of unfolded proteins. Mol Biol Cell, 14, 2559-2269 (2003).

6. Farcasanu IC, Nishiyama F, and Miyakawa T: Particle-induced X-ray emission

(PIXE): a tool for multielement analysis in the yeast cells. Analele Universităţii din

Bucureşti, Seria de Chimie, XIII, 39-43 (2004).

7. Farcasanu IC, Nishiyama F, and Miyakawa T: Particle-induced X-ray emission

(PIXE): a practical approach to determine the manganese accumulation by yeast

mitochondria. Analele Universităţii din Bucureşti, Seria de Chimie, XIV, 39-43

(2005).

8. Farcasanu IC, Oprea E: Ethanol Extracts of Salvia officinalis exhibit antifungal

properties against Saccharomyces cerevisiae cells. Analele Universităţii din Bucureşti,

Seria de Chimie, XV (2006).

9. Matache M, DobrotaC, Bogdan N, Dumitru I, Ruta L, Paraschivescu C, Farcasanu

IC, Baciu I, Funeriu DP Synthesis of fused dihydro-pyrimido[4,3-d]coumarins using

Biginelli multicomponent reaction as key step. Tetrahedron, 65, 5949-5957 (2009)..

10. Manolescu BN, Oprea E, Farcasanu IC, Berteanu M, Cercasov C. Homocysteine and

vitamin therapy in stroke prevention and treatment: a review. Acta Biochim Pol, 57,

467-477 (2010).

11. Manolescu BN, Berteanu M, Dumitru L, Dinu H, Iliescu A, Fărcășanu IC, Oprea E,

Vlădoiu S, Popa O, Ianăș O.Dynamics of inflammatory markers in post-acute stroke

patients undergoing rehabilitation. Inflammation. 34, 551-558 (2011).


4

12. Almajan GL, Barbuceanu SF, Farcasanu I, Draghici C. Synthesis and

Characterization of New 2, 5-disubstituted-1, 3, 4-oxadiazoles as Possible Biological

Active Compounds. Rev Chim, 62, 386-390 (2011).

13. Popa CV, Farcasanu IC, Jipa S, Zaharescu T, Danet AF, Chemiluminescence

Determination of the Total Antioxidant Capacity of Rosemary Extract . Rev Chim, 62,

715-719 (2012).

14. Paraschivescu CC, Matache M, Dobrota C, Nicolescu A, Maxim C, Deleanu C,

Farcasanu IC, Hadade ND. Unexpected Formation of N-(1-(2-Aryl-

hydrazono)isoindolin-2-yl)benzamides and Their Conversion into 1,2-(Bis-1,3,4-

oxadiazol-2-yl)benzenes. J Org Chem, 2013 Feb 21. [Epub ahead of print].

Ileana Cornelia Fărcășanu – Habilitation Thesis - Abstract

1

Engineering Yeast Cells:

From Bioremediation to Chemogenomics

ABSTRACT

Saccharomyces cerevisiae is a spectacular microorganism. It is one of the nature’s

wonders which undoubtedly reached perfection. It is so friendly and easily adaptable, it has

such elegant genetic manipulability and it shares so many fundamental characteristics with the

higher organisms that is has been adopted with enthusiasm by researchers from all over the

scientific world. It has so many qualities that it is no wonder that this humble but cheerful

organism was chosen to have the first genome to be ever sequenced. With more than 6,000

genes divided between 16 chromosomes, yeast has been one of the favorite model organisms

used to elucidate numerous fundamental biologic processes at molecular level. Since genome

sequencing completion in 1996, things went so fast that the scientific community now

benefits from the existence of exhaustive databases such as SGD (Saccharomyces cerevisiae

Genome Database) and from a wide variety of physical collections of strains and plasmids.

Due to various joined projects researchers have full access to whole sets of deletion mutants

(both haploid and diploid, both homozygous and heterozygous), GFP-fused gene collections

for protein visualization, TAP-fused gene collections for targeted protein purification, to say

nothing of the yeast-related systems used to identify virtually any protein-protein interactions

in the yeast two-hybrid system, or of the possibility to screen entire libraries of small

molecules against heterologous proteins conveniently expressed at the surface of yeast cell.

And the list goes on…

Being a PhD student in a top yeast laboratory (Professor Tokichi Miyakawa’s group at

Hiroshima University in Japan) I had the opportunity to witness the progression of research

right in the middle of the genomic period, time when the discovery of each individual gene

sequence and function was acquainted with great enthusiasm. During that “romantic” period

(1994-1999) I was specialized in yeast molecular biology and biotechnology, with a special

focus on elucidating the molecular mechanisms involved in heavy metal homeostasis using

yeast as a model organism.

Following my PhD studies, I had two post-doctoral positions (1999-2001, Nara

Institute of Science and Technology, NAIST, Japan, and 2002-2003, University of Glasgow,

IBLS, UK) each with a significant contribution to acquiring new expertise and complementary

experimental skills.

After a period dedicated solely to teaching (2003-2007), I finally had the opportunity

to start independent research. This was in full post genomic era, when many genomes

(including human) had already been sequenced. Working in a scientific environment

dedicated entirely to chemistry (University of Bucharest, Faculty of Chemistry), but being

constantly fascinated by the versatility of yeast, I have been constantly attempting to

introduce the Saccharomyces cerevisiae as an invaluable tool in chemistry research. Owing to

my first research grant gained as a principal investigator in 2007, I managed to equip


2

laboratories and therefore I could initiate a research group dedicated to yeast-related studies.

A small independent interdisciplinary group could be henceforth initiated, consisting of young

scientists (mainly PhD and master students in chemistry) whom I constantly trained to gain

complementary skills in biochemistry and molecular biology techniques. Since May 2010, I

joined a consortium involved in the European Structural Funding Postdoctoral Program FSE

POSDRU/89/1.5/S/60746 entitled “Cellular and Molecular Biotechnologies for Medical

Applications”. In this program, I directly coordinated two sub-projects entitled “The cellular

response to abiotic-like stress in S. cerevisiae“ and “Directional synthesis and screening of

stresso-protective compounds“ supervising the activity of two post-doctoral fellows (one

chemist and one biochemist) who joined the group in July 2010. Although my group is only

recently established, it is very dynamic and multidisciplinary, and eager to fully cooperate in

future projects. Under such circumstances, obtaining the Habilitation seems like the next

natural step in my scientific career.

My early and current independent works, as well as the future projects, are

summarized below.

Current research

1. Engineering yeast cells for heavy metal bioremediation

For bioremediation purposes, one of the key factors is obtaining organisms which can

accumulate the pollutant, thus separating it from the environment. Heavy metal

hyperaccumulation by yeast cells, a phenotype rather restricted to plants, was the ultimate

goal of our research, pursued through the following approaches:

1.1. Manipulation of heavy metal tolerance of yeast cells as a primary step in

bioremediation through growing cells. In this direction, the main focus was to obtain

metal hyperaccumulating cells by genetic manipulation of Saccharomyces cerevisiae,

a potentially eco-friendly microorganism, but with low accumulation abilities. We

ended up by using kamikaze cells (hyperaccumulating cells which die in the

accumulation process); a concept which was primarily used by our group (Ruta et al.,

2010).

1.2. Overexpression of genes encoding transmembrane proteins involved in the co-

transport of ligands and heavy metals. By overexpressing PHO84 (the gene which

encodes the protein which transports inorganic phosphate across the plasma

membrane) under certain genetic background we obtained truly hyperaccumulating

cells that took up metals at concentrations at least 1000 times higher than the

concentration in the environment. (Ofiteru et al. 2012).


3

2. Getting new insights into the molecular mechanisms involved in cell

response to oxidative stress

As the deleterious effects of heavy metals upon the living cell often relate to oxidative

stress, we attempt to highlight new aspects involved in oxidative stress response and to

identify new compounds with chemoprotective action against the oxidative stress.

2.1. Molecular mechanisms involved in cellular response to heavy metal and oxidative

stress. In this direction, research focused on calcium-mediated response and UPR-

pathway mediated response of yeast cells. Research is still on-going, and the most

notable result was to demonstrate the calcium-dependent response of yeast cells to

exogenous oxidative stress (Popa et al. 2010). Another interesting result was the

identification of certain notorious anti-oxidants (e. g., antocyanidins) as alleviators of

Cd-related oxidative stress (Oprea et al., in preparation).

2.2. Screening of chemicals for their anti-oxidant or pro-oxidant activity using yeast cells

with various defects in the response to oxidative stress. As there is mounting evidence

that anti-oxidants have dual antagonistic effects, we are attempting to identify the

conditions under which certain antioxidants become toxic, using a collection of yeast

knock-out mutants with defects in the oxidative stress defense (Mitrica et al., 2012).

2.3. Screening of metal coordination compounds with potential SOD-mimetic activity. We

recently established a color test for the rapid screening of coordination compounds

with superoxide dismutase (SOD)-like activity and found that certain Cu(II) complex

compounds with mixed ligands exhibited superoxide dismutase-mimetic activity in

cells devoid of native SOD, otherwise modulating the activity of Cu,Zn-SOD within

the yeast cells (Dumitru et al., 2012).

3. Future projects

The plans for future independent research summarized below are based on preliminary

results and will involve collaborations with research groups from our faculty (the organic

chemistry group) and from the Institute of Biochemistry of the Romanian Academy. The

research will be carried out mainly in the laboratories existent within the Faculty of Chemistry

(University of Bucharest) and will focus on attracting new funding (national and international

grants) as well as new young researchers, predominantly undergraduate, master and doctoral

students.

3.1. Getting new insights into calcium-related processes starting from an

abnormal phenotype observed by our group

By overexpressing the gene which encodes a stretch-activated calcium channel we

obtained yeast cells with abnormal morphology, a starting point in identifying new

components involved in calcium homeostasis and calcium-related processes. Two types of

screening (genomic and chemogenomic) are envisaged.


4

3.2. Screening chemicals using yeast genomic techniques

(chemogenomics)

Groups of chemicals will be screened against collection of genomic knock-out mutants

using HIP-HOP assays and microarray technologies.

3.3. Screening for interactions between small molecules and specific

proteins using yeast techniques (yeast two hybrid system and yeast

cell surface display)

Theoretically, the physical interaction between the subunits of any oligomeric protein

can be highlighted by cloning the genes which encode the subunits into the appropriate

vectors used in the yeast two-hybrid system. We plan to use this system to screen collections

of chemicals which potentially interfere with the protein-protein interaction of targeted

protomers. In an alternative approach we plan to screen collection of chemicals on proteins of

interest (mainly enzymes) displayed on the surface of yeast cells by arming technology.

3.4. Obtaining new heavy metal hyperaccumulating strains by targeting

metal-binding peptides or proteins to the inner face of yeast cell

membrane

Starting from a plasmid which targets GFP to the inner face of the membrane when

transformed into yeast cells, we plan to fuse various oligo-nucleotides or genes to this

construct to allow attachment of heavy-metal binding peptides or proteins to the inner face of

the cell membrane.

Ileana Cornelia Fărcășanu – Teză de Abilitare_Sumar

1

Manipularea celulelor de Saccharomyces cerevisiae:

de la bioremediere la chemogenomică

SUMAR

Saccharomyces cerevisiae este unul dintre cele mai interesante microorganisme. Fără riscul

de a exagera, această specie este una din minunile naturii. Fiind un microorganism prietenos,

complet nepatogen și ușor adaptabil, s-a impus ca un instrument biotehnologic de neprețuit.

Datorită faptului că este foarte ușor de manipulat genetic și pentru că are în comun cu

organismele superioare o serie de procese biochimice fundamentale, acest organism unicelular

eucariot a fost adoptat cu entuziasm de cercetătorii din întreaga arie a științelor vieții. Acest

microorganism prezintă atât de multe avantaje pentru cercetători încât nu e de mirare că a avut

privilegiul de a fi prima specie căreia i s-a secvențializat complet genomul.

Cu mai mult de 6000 de gene repartizate în 16 cromozomi, celulele de S. cerevisiae au

reprezentat unul din dintre modelele preferate de cercetători, utilizate în studiile menite să

elucideze la nivel molecular numeroase procese biologice fundamentale.

De la finalizarea proiectului de secvențializare a genomului S. cerevisiae (1996)

lucrurile au cunoscut o dezvoltare galopantă, astfel încât în momentul de față comunitatea

științifică beneficiază de baze de date exhaustive de tipul SGD (Saccharomyces cerevisiae

Genome Database) precum și de existența unor colecții impresionante de linii mutante și

plasmide. Astfel, ca urmare a lansării unor proiecte trans-naționale, cercetătorii pot beneficia

de seturi complete de nul-mutanți (în formă haploidă sau diploidă, hetero- sau homozigotă),

colecții de plasmide care conțin gene fuzionate cu gena GFP (proteina verde fluorescentă)

construite în scopul determinării localizării intracelulare a tuturor proteinelor, colecții de

plasmide care conțin gene fuzionate cu TAP (tandem affinity purification) pentru purificarea

oricărei proteine de interes, etc. Celulele de S. cerevisiae sunt atât de bine și intens studiate

încât au devenit baza unor tehnici de interes general care permit identificarea interacțiilor

proteină-proteină (yeast two hybrid system) sau interacțiilor ligand-proteine prin screening-uri

chemo-genomice în diferite forme. Și lista poate continua.

Ca doctorand într-unul din laboratoarele emblematice de S. cerevisiae (grupul

profesorului Tokichi Miyakawa, Universitatea din Hiroshima, Japonia) am avut șansa să fiu

martoră la progresele uriașe care s-au făcut în plină eră genomică, perioadă în care

descoperirea fiecărei noi gene era primită cu mult entuziasm. În acea perioadă “romantică”

(1994-1999) m-am specializat în biologia moleculară și biotehnologia drojdiilor, cu accent pe

studii privind elucidarea mecanismelor moleculare implicate în homeostazia metalelor grele,

utilizând celule de S. cerevisiae ca organism model.

După absolvirea doctoratului, am urmat două stagii post-doctorale (1999-2001,

Institutul pentru Știință și Tehnologie din Nara, NAIST, Japonia și 2002-2003, Universitatea

din Glasgow, IBLS, Regatul Unit) urmate de o perioadă dedicată exclusiv activității didactice

(2001-2007, Universitatea din București, Facultatea de Chimie). Din 2008 am demarat o

activitate de cercetare independentă la Universitatea din București, în plină eră post-


2

genomică, în care multe genomuri inclusive cel uman fuseseră deja secvențializate. Fiind

angajată într-un mediu științific aproape exclusiv dedicat chimiei, dar fiind constant fascinată

de versatilitatea celulelor de S. cerevisiae, am încercat să aduc acest microorganism docil pe

tărâmul cercetărilor din domeniul chimiei. Grație primului contract de cercetare câștigat ca

cercetător principal în 2007, am reușit să echipez primul laborator de biologie moleculară din

Facultatea de Chimie și să inițiez activitatea unui grup de cercetare cu orientare spre studii în

care S. cerevisiae era actorul principal. Acest grup este alcătuit preponderant din tineri

cerecetători și studenți chimiști care necesită o continuă inițiere și formare în tehnici

complementare de biochimie și biologie moleculară. Activitatea mea de cerectător

independent este prezentată pe scurt în rândurile care urmează.

Activitatea prezentă

1. Manipularea celulelor de S. cerevisiae pentru bioremedierea

metalelor grele

În bioremediere, unul din factorii cheie este obținerea organismelor capabile de a

acumula substanțele poluante în așa fel încât să le separe de mediul contaminat. Obținerea

celulelor de S. cerevisiae hiperacumulatoare de metale grele (un fenotip caracteristic unui

grup restrâns de plante) a reprezentat scopul principal al cercetărilor noastre, scop urmărit

prin următoarele metode.

1.1.Manipularea toleranței celulelor de S. cerevisiae față de metalele grele, ca o primă etapă în

bioremediere prin intermediul celulelor în dezvoltare. În acest sens, principalul obiectiv a

fost obținerea celulelor hiperacumulatoare prin manipulalrea chimică și genetică a

celulelor de de S. cerevisiae, un organism prietenos cu mediul, dar care are tendințe foarte

slabe de a hiperacumula metale. Acest dezavantaj a putut fi surmontat prin utilizarea

celulelor kamikaze (celule hiperacumulatoare care mor în proces); conceptul de celule

kamikaze a fost utilizat în premieră de grupul nostru (Ruta et al., 2010).

1.2.Super-exprimarea genelor care codifică proteine trans-membranare implicate în co-

transportul metalelor grele și al anumitor liganzi chelatori. Prin super-exprimarea genei

PHO84 (care codifică proteina care co-transportă fosfat anorganic și ioni metalici

divalenți), în diferite fundaluri genetice de S. cerevisiae am reușit obținerea unor linii cu

adevărat hiperacumulatoare, capabile să acumuleze metale în concentrații de peste 1000

de ori concentrațiile din mediu (Ofiteru et al. 2012 ).

2. Noi aspecte privind mecanismele moleculare implicate în răspunsul

celular față de condițiile de stres oxidativ

Unul din efectele secundare dăunătoare ale metalelor grele asupra celulei vii este

reprezentat de inducerea stresului oxidativ. Prin urmare, am încercat să evidențiem noi


3

aspecte legate de răspunsul celular în stresul oxidativ și să identificăm noi compuși cu

activitate chemo-protectoare împotriva unui astfel de stres.

2.1.Mecanisme moleculare implicate în răspunsul celular față de stresul metalic și oxidativ. În

această direcție, studiile au fost direcționate către condiții în care pot fi determinate

răspunsurile celulare mediate de calciu sau răspunsuri determinate de apariția proteinelor

incorect pliate în celule de S. cerevisiae. Studiile sunt încă în derulare, iar cel mai notabil

rezultat a fost descrierea răspunsului celular mediat de calciu în condiții de stres oxidativ

exogen (Popa et al. 2010). Un alt rezultat important a fost identificarea unor antioxidanți

cunoscuți (antocianidine) ca inhibitori ai stresului oxidativ produs de ionii de cadmiu

(Oprea et al., manuscris în lucru).

2.2.Analiza pe scară largă (screening) a unor colecții de substanțe chimice prin prisma

activității lor atât antioxidante cât și pro-oxidante utilizând linii celulare de S. cerevisiae

deficiente în răspunsul față de stresul oxidativ. Deoarece cercetări recente demonstrează

că antioxidanții au un efect dublu, atât benefic cât și toxic, am inițiat studii prin care să

identificăm condițiile în care anumiți antioxidanți devin toxici, utilizând colecții de linii

nul-mutante de S. cerevisiae ce prezintă defecte în răspunsul față de stresul oxidativ

(Mitrica et al, 2012).

2.3.Analiza pe scară largă (screening) a unor colecții de compuși coordinativi ai metalelor

tranziționale cu potențială activitate SOD-mimetică. Recent am pus la punct un test rapid

și eficient de screening al activității compușilor coordinativi pentru determinarea

potențialei lor acțiuni SOD-mimetice. Prin teste complementare am stabilit că un compus

coodinativ de Cu(II) prezintă activitate SOD-mimetică în celule de S. cerevisiae care nu

exprimă Cu,Zn-SOD, același compus având însă activitate SOD-modulatoare în celule

normale. (Dumitru et al., 2012).

Proiecte de viitor

Toate planurile de viitor prezentate mai jos se bazează pe rezultate preliminare și

presupun activitatea întregului grup din subdepartamentul de Biochimie din Facultatea de

Chimie (Universitatea din București), independent sau în colaborare cu grupul de Chimie

Organică din același departament sau cu grupuri din alte Instituții (de exemplu Institutul de

Biochimie al Academiei Române). Activitatea de cercetare se va desfășura cu precădere în

laboratoarele Facultății de Chimie și va avea permanent în vedere atragerea de noi fonduri de

cercetare precum și de noi tineri cercetători.

3.1. Evidențierea a noi mecanisme moleculare implicate în biochimia

calciului, pornind de la un fenotip calciu-dependent al unor celule de

S. cerevisiae cu o morfologie specială

Prin supra-exprimarea unei gene care codifică un anumit tip de canale de calciu în S.

ceveisiae, am obținut celule cu morfologie anormală, celule care reprezintă punctul de plecare

într-o serie de studii menite să identifice noi componente moleculare implicate în homeostazia


4

calciului celular sau în alte procese dependente de calciu. În acest scop, sunt propuse spre

experimentare două tipuri de screening (genomic și chemo-genomic).

3.2. Screening-ul unor colecții de substanțe chimice prin intermediul unor

tehnici genomice (chemo-genomică)

Serii de substanțe chimice aparținând unor anumite clase de compuși vor fi analizate

pe colecții genomice de S. cerevisiae alcătuite din nul-mutanți (linii haploide sau diploide

heterozigote) utilizând tehnici HIP-HOP și microarray.

3.3. Screening-ul unor interacții între compuși chimici și proteine-țintă cu

ajutorul biotehnologiilor ce utilizează celule de S. cerevisiae (sistemul

“yeast two hybrid” și sistemul “yeast cell surface display”)

Teoretic, orice interacție dintre subunitățile unei proteine oligomere poate fi

evidențiată prin clonarea genelor care codifică protomerii respectivi în vectorii specifici unui

sistem de tip “yeast two hybrid”. Prin exprimarea lor în linii celulare de S. cerevisiae

modificate astfel încât să poată “raporta” aceste interacții, influența compușilor asupra acestei

interacții poate fi determinată prin analiza cantitativă a sistemului raportor. Intenția noastră

este să utilizăm un astfel de sistem pentru a analiza pe scară largă o serie de colecții de

compuși chimici care ar interacționa (amplificând sau atenuând) interacția fizică dintre

protomerii unei proteine oligomere țintă. Alternativ, vom efectua screening-uri pe colecții de

compuși chimici prin monitorizarea interacției lor cu proteine-țintă (în special enzime)

exprimate la suprafața celulelor de S. cerevisiae prin procedura “arming technology”.

3.4. Obținerea de noi linii hiperacumulatoare de metale grele prin legarea

unor peptide sau proteine cu afinitate mare pentru metale de fața

interioară a membranelor citoplasmtice

Pornind de la un plasmid specific celulelor de S. cerevisiae care atunci când este

exprimat în celule leagă țintit proteina verde fluorecentă (GFP) de fața internă a membranei

citoplasmatice, avem ca obiectiv obținerea unor produși de fuziune între gena pentru GFP

modificată și (i) secvențe nucleotidice proiectate pentru codificarea de oligopeptide cu

afinitate mare pentru ioni metalici divalenți sau (ii) gene care codifică proteine care leagă

metale, în scopul ancorării lor pe fața internă a membrane celulare.

europass curriculum vitae - biochim.ro · cv - farcasanu ileana cornelia – engleza . 2. cv ......

Documents