Personal - Biochimie
Lab biochimie (locatie)
secre
taria
t
Chim
ie
anorg
anic
a
Amf
P3
Lab
BC
H
sca
ri
Sala pasilor pierdutiIntrare
UNI
xerox
ho
l
ho
lC
h. A
na
l
Ch
. An
al
?
PB
Discipline biologice
Biochimie
Biologie
celulara
Genetica
Imunologie
Microbiologie
Farmacologie
Fiziologie
Bibliografie curs
Bibliografie curs
Bibliografie curs
Bibliografie curs
Bibliografie curs
Bibliografie curs
Bibliografie curs
Bibliografie laborator
Bibliografie laborator
Referat literatura
LUCRARI DE LABORATOR
Reguli in laboratorul de biochimie. Echipamente si aparatura.
Preparare soluțiilor tampon. Seminar aminoacizi (1)
Estimarea concentraţiei proteinelor. Metoda spectrofotometrică
directă și Bradford. Seminar aminoacizi (2)
Electroforeza ADN-ului
Test enzime și acizi nucleici
Separarea proteinelor prin electroforeza. Test aminoacizi.
Teste preliminare pentru detectia
medicamentelor sau drogurilor
ilicite.
Test proteine. Seminar toxicologie
Extractia catalazei din sursele vegetale.
Influenta pH-ului, temperaturii și a
inhibitorilor asupra reacției enzimatice
Test proteine. Seminar enzime și acizi
nucleici
Teste preliminare pentru determinarea
alcaloizilor nocivi
Test toxicologie
BIO
CH
IMIE
D
ES
CR
IPT
IVA
BIO
CH
IMIE
S
I T
OX
ICO
LO
GIE
Materiale curs/laborator https://robi74ro.wordpress.com/studenti/
Dozarea bilirubinei totale din ser sau din plasma
Seminar proteine
Curs 1
Notiuni
introductive
Tipuri de energieFotosinteza
Transferul
en. potentiale
Notiunea
de biochimie
Tematica lucrarilor
de laboratorpH-ul in sistemele
biologice
Energia Bibliografie (curs/laborator)
Legaturi
Covalente
Necovalente
Interactiuni
intre proteine
(complementaritatea)
Procese redox
celulare
En. de activare
Curs 2
Exemple
cisteina (redox)
histidina (crom. afinitate)
Aminoacizi
Clasificari
catenă
(nepolari/polari)
încărcare (pI)
(ne)esentiali
dupa sinteza
metabolică
Structura generala
Modificari
postranslationale
Derivati biologic activi
(dopamina, histamina
tiroxina)
Importanta
Aminoacizi
neproteinogeni
Configuratia (L/D)
Curs 3
Conformații
fura/piranozică
semiscaun
plic, răsucită
Conjugati
ai zaharurilor
Acidul gluconic/glucuronic
deoxizaharuriImportanță
Monozaharide
si derivatii
acestora
Clasificare (cetoze/hexoze)
Intoleranța la fructoză
Anomerii glucozeiLegaturi O(N) glicozidice
Aminozaharuri/derivati
Polialcooli1,5-anhidro-
D-glucitolul
Deoxiriboza, Fucoza
Curs 3
Curs 3
Testul Fehling
Intoleranta la lactoza
Inversia zaharozeiOligozaharidele
conjugate
(antigeni)
Ciclodextrine
Dizaharide
Lactoza
Zaharoza
Trehaloza
Maltoza
Celobioza
Oligozaharide
si
polizaharide
Trizaharide
Panoza
Izopanoza
Lactozaharoza
Tetrazaharide
Stahioza
Indulcitori
artificiali
Amidon
Glicogen
Celuloza
Chitina
Homopolizaharide
Heparina
Heteropolizaharide
Trigliceride
Glicerofosfolipide
fosfolipaze
Alti esteri
ai ac. grași
Sterolii (colesterol etc)
și derivații
Hormoni
Importanță
Lipide
Ceramidele
Sfingomielinele
Cerebrozide
Gangliozide
Straturi
bilipidice
Difuzia lipidelor
Distribuția lipidelor
în membrane
Acizi grași/reacții
Plasmogenii
Curs 4
Curs 5
Clasificare
Vitamina AVariante
Conversia provitaminei A
și a esterilor retinoici
Tipuri de carotenoizi
Retinoide
Adsorbția și transportul vitaminei A
Funcțiile vitaminei A
Ciclul vederii
Necesar/deficiente de vitamina A
Liposolubile
Funcțiile
Vitaminele
Terminologie
Vitamina DVariante (D2/D3) și derivații
Funcțiile calcitriolului/cuantificare
Deficiențele vitaminei D
Liposolubile
Tocoferoli/tocotrienoli
Adsorbția, transportul și
stocarea
Funcțiile vitaminei E
Deficiențele vitaminei E
Utilizările terapeutice
Vitamina E
Curs 6
B5 Derivați
Deficiențe
Vitamina KDescoperire
Variante (K1, K2, K3)
Transportul vitaminei K
Rol coenzimatic
Deficiență/toxicitate K3
Antagoniști
Liposolubile
VitamineleB1 (beri-beri)Carență, determinare
Hidrosolubile
B2 (Riboflavina)Ciclul redox al
glutationului
Deficiențe, surse
B3 (Pelagra)Variante, rol metabolic
Forme active NAD+ și NADP+
B6 Variante
Rol metabolic
B7 Interacțiunea cu streptavidina
Rol metabolic
B9 Rol metabolic (metilare)
Derivați
Deficiențe
B12 Rol
Carențe
C Rol în biosinteză
Carențe
Cursuri 7-8
Tehnici de separare
și caracterizarePrepararea extractului
Precipitarea
Dializa/Ultrafiltrarea
(Ultra)centrifugarea
Separarea cromatografică
Verificarea purității
SDS-PAGE
ESI-MS
Proteine
Structura primarăDeterminarea structurii
Nivele de organizare
Structura secundară-helix, -pliată
Structuri supersecundare
Motive structurale
cheii grecești
, și ,
Structura terțiarăDifracție cu raze X
RMN
Structura cuaternarăDimeri
Hexameri
Curs 8
Aplicații
Enzime de
restrictie
Specificitatea
Nomenclatura
IstoricFermentație
Digestia
Inhibitori enzimaticiacyclovir
viagra
Dezvoltarea
enzimologiei
mecanistice
EnzimeHemoglobina
Curs 9
Terminologie
Enzime în
industria
detergenților
Clasificarea
enzimelor
Puterea cataliticăH. pylori
Lipaze
Celulaze
Amilaze
Avantajele
folosirii
enzimelor
Enzime
Proprietăți
(Stereo)specificitate
Izoenzime (LDH)
Act. catalitică-factoriIoni metalici
Cofactori organici
Denumirea științifică6 clase (TGO, TGP)
Denumirea uzuală
Curs 10
Imunitatea
Reticularea
antigenilor
Structura
anticorpilorIgM, IgA, IgG
Tipuri de imunitate
TerminologieEpitop
Paratop
Imunitatea
Anticorpii
Sistemul imunitar
Celulele sistemului
imunitar
Teoria selecției
clonelor
Componentele sistemului
imunitar
Răspunsul la antigen
Interacțiunea
anticorp-antigen
Anticorpi monoclonaliObținere, terapii
Tehnica ELISA
Hepatita C, hormoni
HIV, alergeni
Detecție
Curs 11
Izolarea ADN-ului
Ribozomi
(ARNr)
Replicarea
semiconservativă
Baze purinice/pirimidinice
ARNm
ARNt
Acizii nucleici
Localizarea ADN-ului
Componența ADN-ului
Perechi de baze
Structura ADN-ului
Tipuri de ADN
ARN-ul
Proprietățile
ADN-ului
Factori care influențează
stabilitatea ADN-ului
etape
componență amestec
ADN polimeraze
aplicații
Reacția PCR
Balizele
moleculare
biosinteza
proteinelor
Curs 12
Fracționarea
acizilor nucleici
Boli asociate
cu repetiții
de trinucleotide
Structura
cromozomilor
Interacțiuni ADN-proteină
Boala Huntington
Ataxia Friedreich
Acizii nucleici
cromozomi
Technica
Southern Blotting
Exoni/introni
Controlul copierii
Informației geneticerepresori
factori de transcripție
Modificarea ADN-ului
Interacțiuni ligand-receptor-ADNCromatina
Histonele
Nucleozomii
Modificări structurale
ale cromatinei
Cursuri 13-14
Tipuri substante toxice
Ramurile toxicologiei
Actiunea la nivel
de tesut etc
Toxicologie
Intoxicatii
Toxicocinetica
Distributie, depozitare,
acumulare
Metabolismul
substantelor toxice
Eliminarea
substantelor toxiceRelatia
structura-activitate
Factori determinanti
ai toxicitatii
Combaterea
efectelor toxice
Favorizarea
eliminarii
Actiunea la nivel
celular
Actiunea la nivel
molecular
Evolutia organismelor
Studiul metabolismului
Modificari biologice
Modificarea starii
de sanatate
Tehnicile moderne
Vizeaza
Elemente esentiale vietii
H, O, N, C – 99% (masa celulara)
Elementele (urme)– esentiale functii proteine (enzime)
Lehninger’s Principles of Biochemistry-D.L.Nelson, C. Lehninger
–W.H.Freeman-2004
Hemoglobina - 0,3% Fe
Biochimia Chimia vietii
?
sinteza
degradare
mecanisme
Structura
ch, 3D
interactiune
energetica
Informatia
genetica
Biochimia
Structura moleculelor
Functia moleculelor
Interactiunea dintre
molecule
Structuri ordonate
Nivele de organizare dintr-un organism
Pratt-Essential Biochemistry-2014
Relatia biochimie-medicina
M. Laberge-Biochemistry-Chelsea House, NY, 2008
Filozofia antica
Cele patru elemente si proprietati
propuse de Aristotel
https://www.learner.org/courses/chemistry/visuals/visual
s.html?dis=U&num=Ym5WdElUQS9NaW89
Biochimie
Aminoacizi
Zaharuri
Lipide
Nucleotide
Energia
Tipuri de energie
cinetica termica
https://www.blendspace.com/
Principiul I al termodinamicii
Trasformarea
energiei potentialeFotosinteza
Legaturile chimice
Covalente Orientare precisa
NH3
C2H4
Legătura
covalentă
Energia
(Kcal/Mol)
Legătura
covalentă
Energia
(Kcal/Mol)
C≡C 213 C−O 86
C=O 174 C−C 83
C=C 146 C−Cl 81
C−F 103 S−H 81
O−H 111 C−N 73
C−H 99 C−S 62
N−H 93 O−O 35
Grupari functionale
Grupari functionale
https://www.visionlearning.com/en/
library/Biology/2/Lipids/207
slideplayer.com
Grupari functionale
http://www.differencebetween.net/
science/health/
Dipol momentul
Electronegativitatea
Distributia electronica in legatura peptidica
http://plantcellbiology.masters.grkraj.org
Legaturile de hidrogen
Legaturi necovalente stabilizeaza biomoleculele
Legaturile de hidrogen
H2O(l)
proteina
Lehninger’s Principles of Biochemistry
W.H.Freeman-2004
Legaturi ionice Interactiuni van der Waals
raza
covalenta
raza
van der Waals
Legaturi necovalente
http://www.u-helmich.de/
Interactii hidrofobe
www.nature.com
Interactii hidrofobe
Legaturi necovalente
Magnitudinea interactiunilor
Interactii care apar in proteine
https://www.fastbleep.com/biology-notes/
Interactii care apar in proteine
Aminoacizi hidrofobi (negru) implicati
in procesul de impachetarea proteinelor
K. Ahern, I. Rajagopolan & T. Tan
Biochemistry Free For All, version 1.0 (pdf), 2016
Complementaritatea biomoleculelor
Proteina A Proteina B
Complex stabil
Proteina A Proteina B
Complex instabil
Specificitatea interactiunilor
Acta Crystallogr D Biol Crystallogr.
2011 Sep 1; 67(Pt 9): 813–821.
Resturi implicate in legaturi de
hidrogen (verde)
gr. ureido (biotina)-resturi avidina
KD = 10-15 M
Complementaritatea biomoleculelor
Specificitatea interactiunilor
J.D. Fernstrom et al. , Mechanism of
sweetness, The Journal of nutrition, May,
2012,1S-8S.
http://slideplayer.com/slide/6856383/
KD = 210 x 10-6 M
REBA-receptor
Complementaritatea biomoleculelor
Specificitatea interactiunilor
Ionizarea gruparilor/pH-ul
pH-ul in sistemele biologice
https://www.phreshproducts.com/learn/charts/
http://altered-states.net/barry/update178/
Dezechilibrele de pH:
•dereglări hormonale
•deficiențe ale sistemului imunitar
•probleme structurale (oase)
•digestie/eliminare incetinită
•supraproducție microorganisme
•apariția tumorilor.
pH-ul in sistemele biologice
pH-ul in diferite compartimente subcelulare
Joseph R. Casey, Sergio Grinstein & John Orlowski
Nature Reviews Molecular Cell Biology 11, 50-61(2010)
pH-ul in sistemele biologice
pH-ul sangeluiEsential of Medical Biochemistry
with clinical casesN.V.Bhagavan, Chu-Eun Ha
pH < 6,8 formarea H2CO3
pH > 7,8 disocierea H2CO3
deces
Sistemele tampon sanguine:
– Bicarbonat • Plasmatic
• Eritrocitar
– Non-bicarbonat • Hemoglobina şi
oxihemoglobina
• proteinele plasmatice
• fosfatul organic şi
• fosfatul anorganic
pH-ul in sistemele biologice
Esential of Medical Biochemistry
with clinical casesN.V.Bhagavan, Chu-Eun Ha
Echilibru chimic
ADN
ARN
Acizi nucleici
pKa
Directia unei reactiii
Energia libera
Essential Cell Biology (2004 Garland Science)
Ener. rezultata
Sinteza macromolecule
metaboliti
Deplasarea celulei
Transportul moleculelor
Energie electrica
Procese celulare → redox
http://www.tutorvista.com/
Energia de activare si viteza de reactie
Reducerea Ea Cresterea ratei de reactie
http://ib.bioninja.com.au/