curs microarray - tdm | acasă microarray.pdf · introducere în notiuni de biologie moleculara,...

5
Fondul Social European Investeşte în OAMENI! Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013 1 Curs microarray Cluj-Napoca, Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca Privire de ansamblu Relaţia dintre ştiinţă şi societate a evoluat considerabil în ultimii ani. Genomica și biotehnologiile medicale sunt din acest punct de vedere strâns corelate cu relația cu pacientul sau cu populația de interes. Utilizarea tehnologiilor “state of the art “ – microarray- în abordarea și elucidarea diagnosticului, a predictiei si al raspunsului la terapie sta la baza stabilirii premiselor pentru medicina personalizata. Cursul de microarray isi propune sa prezinte si sa ofere cursantilor noile perspective si abordari ale diagnosticului molecular transcriptomic utilizand tehnologia microarray pangenomica ca suport principal al medicinei personalizate. Cursul are drept scop creearea premizelor pentru integrarea cunostintelor si abilitatilor dobandite in practica de rutina a fiecarui participant. Scopul programului de instruire Formarea de specialisti in domeniul tehnologiei microarray ca suport al genomicii functionale pentru aplicatii biomedicale. Cui se adreseaza Medicilor de laborator, biologilor, (bio)chimistilor, (bio)fizicienilor care utilizeaza sau intentioneaza sa utilizeze tehnologia microarray in laboratoarele din unitatile medicale. Tematici abordate Introducere în notiuni de biologie moleculara, conceptul de genomica functionala si tehnologia microarray Aplicatiile reactiei microarray ca suport al diagnosticului molecular Metode de instruire Cursuri teoretice Demonstratii practice efectuate pe baza notiunilor teoretice Lucrari practice efectuate de cursanti Prelucrarea si interpretarea rezultatelor obtinute. Exercitii si discutii pe tematica predata Competente dobandite Abilitatea de a utiliza:

Upload: leduong

Post on 11-Feb-2018

218 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

Page 1: Curs microarray - TDM | Acasă microarray.pdf · Introducere în notiuni de biologie moleculara, ... Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica,

Fondul Social European Investeşte în OAMENI!

Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013

1

Curs microarray Cluj-Napoca, Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca

Privire de ansamblu Relaţia dintre ştiinţă şi societate a evoluat considerabil în ultimii ani. Genomica și

biotehnologiile medicale sunt din acest punct de vedere strâns corelate cu relația cu

pacientul sau cu populația de interes. Utilizarea tehnologiilor “state of the art “ –

microarray- în abordarea și elucidarea diagnosticului, a predictiei si al raspunsului la

terapie sta la baza stabilirii premiselor pentru medicina personalizata.

Cursul de microarray isi propune sa prezinte si sa ofere cursantilor noile perspective

si abordari ale diagnosticului molecular transcriptomic utilizand tehnologia

microarray pangenomica ca suport principal al medicinei personalizate. Cursul are

drept scop creearea premizelor pentru integrarea cunostintelor si abilitatilor dobandite

in practica de rutina a fiecarui participant.

Scopul programului de instruire Formarea de specialisti in domeniul tehnologiei microarray ca suport al genomicii

functionale pentru aplicatii biomedicale.

Cui se adreseaza Medicilor de laborator, biologilor, (bio)chimistilor, (bio)fizicienilor care utilizeaza

sau intentioneaza sa utilizeze tehnologia microarray in laboratoarele din unitatile

medicale.

Tematici abordate Introducere în notiuni de biologie moleculara, conceptul de genomica functionala si

tehnologia microarray

Aplicatiile reactiei microarray ca suport al diagnosticului molecular

Metode de instruire Cursuri teoretice

Demonstratii practice efectuate pe baza notiunilor teoretice

Lucrari practice efectuate de cursanti

Prelucrarea si interpretarea rezultatelor obtinute.

Exercitii si discutii pe tematica predata

Competente dobandite Abilitatea de a utiliza:

Page 2: Curs microarray - TDM | Acasă microarray.pdf · Introducere în notiuni de biologie moleculara, ... Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica,

Fondul Social European Investeşte în OAMENI!

Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013

2

- metode diferite de extractie pentru acizii nucleici (ARN) in vederea utilizarii

lor in studiile de genomica functionala;

- utilizarea tehnologiei microarray ca suport al studiilor de genomica

functionala

- utilizarea tehnologiilor bazate pe PCR (qRT-PCR , PCR array);

Capacitatea de a evalua si interpreta rezultatele investigatiilor genetice in context

clinic, in diferite domenii medicale.

INFORMATII PRACTICE

CALENDARUL CURSURILOR

2011

Seria I Nr locuri 23-29 mai 2011 20

Seria II Nr locuri 11-17 iulie 2011 20

2012

Seria I Nr locuri 12-18 martie 2012 20

Seria II Nr locuri 4-10 iunie 2012 20

2013

Seria I Nr locuri 8-14 aprilie 2013 20

Seria II Nr locuri 13-19 iunie 2013 20

LOCUL DE DESFASURARE

Cursurile teoretice si aplicatiile practice se vor desfasura in cadrul Institutului

Oncologic “I. Chiricuta” si in Departametul de Genomica Functionala si Patologie

Experimantala, str Republicii nr 34-36, Cluj-Napoca.

Inscrierea si selectia cursantiilor Inscrierea la curs se face prin completarea aplicatiei on-line

Page 3: Curs microarray - TDM | Acasă microarray.pdf · Introducere în notiuni de biologie moleculara, ... Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica,

Fondul Social European Investeşte în OAMENI!

Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013

3

In cazul in care numarul inscrierilor depaseste numarul de locuri alocat se va realiza

selectia cursantilor.

Candidatii selectati vor fi anuntati individual prin e-mail, urmand ca inscrierea finala

sa se realizeze in urma confirmarii participarii de catre fiecare cursant selectat.

Evaluarea cursantilor Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica, cat si

pentru cea practica, pe baza carora se vor acorda calificative.

Alte informatii Participarea la curs include accesul gratuit la materialele de curs, pauzele de cafea si

masa de pranz pe durata cursului, precum si cheltuielile de transport si cazare pentru

cursantii care nu au domiciliul in Cluj-Napoca. Tematica detaliata si materialele de

curs vor fi disponibile la inceperea cursului.

Contact: [email protected]

GRUPUL DE EXPERTI

Neagoe Ioana – Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca

Balacescu Ovidiu - Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca

Irimie Alexandru - Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca

Balacescu Loredana - Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca

INVITATI STRAINI

Lazar Vladimir- Institute Gustave Roussy Villejuiff, Franta.

George Calin – Institutul MD Anderson, USA

Page 4: Curs microarray - TDM | Acasă microarray.pdf · Introducere în notiuni de biologie moleculara, ... Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica,

Fondul Social European Investeşte în OAMENI!

Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013

4

PROGRAM CURS MICROARRAY

(Seria 1 mai 2011)

Ziua 1

Curs teoretic: - notiuni de biologie moleculara (ADN, ARN, Proteine)

- tehnici de biologie moleculara: (PCR, electroforeza, qRT-PCR, PCR array;

Wetsern blot)

Curs practic: - extractia de ARN din probe biologice (tesut, sange) prin metoda clasica si cu

kituri de extractie;

Ziua 2

Curs teoretic: - ciclul celular, proliferare celulara, patologie moleculara; conceptul de

genomica functionala.; reactia microarray (notiuni introductive, etape)

- aplicatiile nanotehnologiilor in genomica functionala (Bioanalizor 2100,

Nanaodrop ND 1000);

Curs practic: - evaluare calitativa si cantitativa ARN total (Bioanalizor 2100, Nanodrop

ND-1000); Sinteza de sonde microarray (partea 1);

Ziua 3

Curs teoretic: - tipuri de reactii microarray, design, etape; analiza preliminara a datelor

microarray;

Curs practic: - sinteza de sonde microarray (cARN-Cy) (partea a-2a) ; hibridarea sondelor

microarrray pe lame microarray WHG (Agilent 4x44k);

Ziua 4

Curs teoretic: - studii de bioinformatica utilizand date microarray (normalizare, clusterizare);

aplicatii ale reactiei microarray in domeniul medical;

Curs practic: - spalarea si scanarea lamelor microarray; analiza de calitate (Feature

Extraction);

Page 5: Curs microarray - TDM | Acasă microarray.pdf · Introducere în notiuni de biologie moleculara, ... Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica,

Fondul Social European Investeşte în OAMENI!

Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013

5

Ziua 5

Curs teoretic: - identificarea genelor de interes din studiile de microarray si integrarea

acestora in caile de semnalizare moleculara; validarea datelor microarray

prin recatia de PCR cantitativ (qRT-PCR);

Curs practic: - analiza bioinformatica a datelor microarray - clusterizare moleculara;

identificarea genelor de interes din studiile de microarray si integrarea

acestora in caile de semnalizare moleculara. (Gene Spring; Ingenuity);

Ziua 6

Curs teoretic: - intregrarea datelor clinice si biologice in patologia tinta.

Curs practic: - discutia unor articole stiintifice ce utilizeaza date microarray;

Ziua 7

Parte teoretica: - Masa rotunda; concluzii;

Curs practic: - evaluarea cunostiinte dobandite;