curs microarray - tdm | acasă microarray.pdf · introducere în notiuni de biologie moleculara,...
TRANSCRIPT
Fondul Social European Investeşte în OAMENI!
Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013
1
Curs microarray Cluj-Napoca, Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca
Privire de ansamblu Relaţia dintre ştiinţă şi societate a evoluat considerabil în ultimii ani. Genomica și
biotehnologiile medicale sunt din acest punct de vedere strâns corelate cu relația cu
pacientul sau cu populația de interes. Utilizarea tehnologiilor “state of the art “ –
microarray- în abordarea și elucidarea diagnosticului, a predictiei si al raspunsului la
terapie sta la baza stabilirii premiselor pentru medicina personalizata.
Cursul de microarray isi propune sa prezinte si sa ofere cursantilor noile perspective
si abordari ale diagnosticului molecular transcriptomic utilizand tehnologia
microarray pangenomica ca suport principal al medicinei personalizate. Cursul are
drept scop creearea premizelor pentru integrarea cunostintelor si abilitatilor dobandite
in practica de rutina a fiecarui participant.
Scopul programului de instruire Formarea de specialisti in domeniul tehnologiei microarray ca suport al genomicii
functionale pentru aplicatii biomedicale.
Cui se adreseaza Medicilor de laborator, biologilor, (bio)chimistilor, (bio)fizicienilor care utilizeaza
sau intentioneaza sa utilizeze tehnologia microarray in laboratoarele din unitatile
medicale.
Tematici abordate Introducere în notiuni de biologie moleculara, conceptul de genomica functionala si
tehnologia microarray
Aplicatiile reactiei microarray ca suport al diagnosticului molecular
Metode de instruire Cursuri teoretice
Demonstratii practice efectuate pe baza notiunilor teoretice
Lucrari practice efectuate de cursanti
Prelucrarea si interpretarea rezultatelor obtinute.
Exercitii si discutii pe tematica predata
Competente dobandite Abilitatea de a utiliza:
Fondul Social European Investeşte în OAMENI!
Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013
2
- metode diferite de extractie pentru acizii nucleici (ARN) in vederea utilizarii
lor in studiile de genomica functionala;
- utilizarea tehnologiei microarray ca suport al studiilor de genomica
functionala
- utilizarea tehnologiilor bazate pe PCR (qRT-PCR , PCR array);
Capacitatea de a evalua si interpreta rezultatele investigatiilor genetice in context
clinic, in diferite domenii medicale.
INFORMATII PRACTICE
CALENDARUL CURSURILOR
2011
Seria I Nr locuri 23-29 mai 2011 20
Seria II Nr locuri 11-17 iulie 2011 20
2012
Seria I Nr locuri 12-18 martie 2012 20
Seria II Nr locuri 4-10 iunie 2012 20
2013
Seria I Nr locuri 8-14 aprilie 2013 20
Seria II Nr locuri 13-19 iunie 2013 20
LOCUL DE DESFASURARE
Cursurile teoretice si aplicatiile practice se vor desfasura in cadrul Institutului
Oncologic “I. Chiricuta” si in Departametul de Genomica Functionala si Patologie
Experimantala, str Republicii nr 34-36, Cluj-Napoca.
Inscrierea si selectia cursantiilor Inscrierea la curs se face prin completarea aplicatiei on-line
Fondul Social European Investeşte în OAMENI!
Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013
3
In cazul in care numarul inscrierilor depaseste numarul de locuri alocat se va realiza
selectia cursantilor.
Candidatii selectati vor fi anuntati individual prin e-mail, urmand ca inscrierea finala
sa se realizeze in urma confirmarii participarii de catre fiecare cursant selectat.
Evaluarea cursantilor Evaluarea cursantilor se va realiza prin teste grila, atat pentru partea teoretica, cat si
pentru cea practica, pe baza carora se vor acorda calificative.
Alte informatii Participarea la curs include accesul gratuit la materialele de curs, pauzele de cafea si
masa de pranz pe durata cursului, precum si cheltuielile de transport si cazare pentru
cursantii care nu au domiciliul in Cluj-Napoca. Tematica detaliata si materialele de
curs vor fi disponibile la inceperea cursului.
Contact: [email protected]
GRUPUL DE EXPERTI
Neagoe Ioana – Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca
Balacescu Ovidiu - Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca
Irimie Alexandru - Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca
Balacescu Loredana - Institutul Oncologic “I. Chiricuta” Cluj-Napoca
INVITATI STRAINI
Lazar Vladimir- Institute Gustave Roussy Villejuiff, Franta.
George Calin – Institutul MD Anderson, USA
Fondul Social European Investeşte în OAMENI!
Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013
4
PROGRAM CURS MICROARRAY
(Seria 1 mai 2011)
Ziua 1
Curs teoretic: - notiuni de biologie moleculara (ADN, ARN, Proteine)
- tehnici de biologie moleculara: (PCR, electroforeza, qRT-PCR, PCR array;
Wetsern blot)
Curs practic: - extractia de ARN din probe biologice (tesut, sange) prin metoda clasica si cu
kituri de extractie;
Ziua 2
Curs teoretic: - ciclul celular, proliferare celulara, patologie moleculara; conceptul de
genomica functionala.; reactia microarray (notiuni introductive, etape)
- aplicatiile nanotehnologiilor in genomica functionala (Bioanalizor 2100,
Nanaodrop ND 1000);
Curs practic: - evaluare calitativa si cantitativa ARN total (Bioanalizor 2100, Nanodrop
ND-1000); Sinteza de sonde microarray (partea 1);
Ziua 3
Curs teoretic: - tipuri de reactii microarray, design, etape; analiza preliminara a datelor
microarray;
Curs practic: - sinteza de sonde microarray (cARN-Cy) (partea a-2a) ; hibridarea sondelor
microarrray pe lame microarray WHG (Agilent 4x44k);
Ziua 4
Curs teoretic: - studii de bioinformatica utilizand date microarray (normalizare, clusterizare);
aplicatii ale reactiei microarray in domeniul medical;
Curs practic: - spalarea si scanarea lamelor microarray; analiza de calitate (Feature
Extraction);
Fondul Social European Investeşte în OAMENI!
Proiect cofinanţat din Fondul Social European Programul Operaţional Sectorial Dezvoltarea Resurselor Umane 2007-2013
5
Ziua 5
Curs teoretic: - identificarea genelor de interes din studiile de microarray si integrarea
acestora in caile de semnalizare moleculara; validarea datelor microarray
prin recatia de PCR cantitativ (qRT-PCR);
Curs practic: - analiza bioinformatica a datelor microarray - clusterizare moleculara;
identificarea genelor de interes din studiile de microarray si integrarea
acestora in caile de semnalizare moleculara. (Gene Spring; Ingenuity);
Ziua 6
Curs teoretic: - intregrarea datelor clinice si biologice in patologia tinta.
Curs practic: - discutia unor articole stiintifice ce utilizeaza date microarray;
Ziua 7
Parte teoretica: - Masa rotunda; concluzii;
Curs practic: - evaluarea cunostiinte dobandite;