controlul expresiei

Upload: -

Post on 14-Apr-2018

269 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 7/29/2019 Controlul Expresiei

    1/6

    08.11.200

    Controlul

    expresiei

    genice

    REGLAREA

    EXPRESIEI GENICE

    !!! Alegerea genei pentru transcripie!!! Activarea secvenei de ADN

    !!! Controlul activitii ARN-polimerazei II

    !!! Controlul cantitii i calitii ARNm i proteinei

    sintetizate

    Organism pluricelular:

    Peste 200 de tipuri de celule

    diferite esuturi organe

    Toate celulele somatice ale

    unui organism sunt genetic

    identice (au aceeaicantitate de ADN, aceleaigene), provenind de lacelula zigot prin mitoze

    succesive)

    Particularitile genomului uman

    Genomul nuclear (n)

    3,2 Gb

    ~ 35000 gene

    Genomul mitocondrial

    16,6 kb

    37 de gene

    ADN genic

    25%

    ADN extragenic

    75%

    ADNcodant

    10%

    ADNnecodant

    90%

    Secvene unicesau n numrmic de copii

    60%

    Secvenemoderat sau

    nalt repititive

    40%

    Clasificarea genelor nucleare

    1. n dependen de produsul genic:

    gene de cl.I pentru ARNr

    gene de cl. II pentru ARNm i proteinegene de cl.III pentru ARNt, ARNr, ARNsn

    2. n dependen de locul activitii:

    gene active n toate celulele

    gene active n anumite celule, esuturi3. n dependen de perioada ontogenetic

    gene active pe tot parcursul vieii

    gene active numai prenatal

    gene active numai la pubertate

    gene active numai la adult

    4. n dependen de interaciunea cu factorii de mediu;

    gene stabile

    gene plastice

    5. n dependen de gradul de expresie:

    gene normomorfe

    gene hipomorfe

    gene hipermorfe

    gene amorfe

    6. n dependen de numrul de copii n genom:

    gene unicale

    gene repetate n tandem sau dispersate

  • 7/29/2019 Controlul Expresiei

    2/6

    08.11.200

    7. n dependen de funcia produilor genici:

    enzime - 31,2%;

    modulatori ai proteinelor sintetizate - 13, 6 %

    receptori;

    factori de transcripie;

    proteinele matricei intracelulare i matricei extracelulare;

    ansportori membranari i proteine canal;

    molecule semnalizare celular;

    hormoni;

    Ig.

    50%

    Fiecare celul a organismului conine setul complet degene (30-40000 perechi gene pentru 46 mol. ADNnuclear)

    Expresia genic numai 10% din toate genele

    Expresie continuGene ARNr

    Gene ARNt

    Gene housekeeping

    Expresie temporaldependent:

    - de esut;

    - de perioada

    ontogenetic;

    - de perioada ciclului

    celular;

    - de factorii de mediu

    Non-expresie

    pseudogene

    !!! Exist mecanisme de reglare a expresiei genelor

    La procariote

    !!! DAR, la eucariote:

    -genomul nuclear este enorm i este puternic compactizat(ADN+ proteine histone, proteine nehistone);

    -recunoaterea i activarea unei secvene scurte denucleotide (unei gene) este dificil;

    -exist mecanisme de reglare multiple, la diferite nivele deexpresie a genelor (pretranscripional, transcripional,processing ARNm, translaie, etc.):

    ! etapa principal la nivelul iniierii transcripiei;

    ! mecanismul principal interaciunea unor factori proteici la

    secvenele reglatoare ale acizilor nucleici;

    ! factorii proteici reglatori sunt produii unor gene situate la

    distan, pe alte molecule de ADN (factori trans-reglatori)

  • 7/29/2019 Controlul Expresiei

    3/6

    08.11.200

    FACTORII REGLATORI AI EXPRESIEI GENICE

    CIS-genici

    a) Boxe pentruiniierea

    transcripieib) Boxe specifice de

    esut

    c) Boxe RE induse

    prin hormoni, ioni,

    AMPc

    d) Enhancers,silencers

    TRANS-genici

    a) Factori proteicide transcripiegenerali

    b) Factori proteicide transcripiespecifici de

    esut

    c) Factori proteicide transcripieinuctibili

    d) Enh, sil.

    EPI-genici

    (negenetici)

    a) Modificareahistonelor

    (metilare,acetilare,

    fosforilare,

    ubiquitinare

    b) Metilarea ADN

    c) Variaii nconfiguraiaADN

    Nivele de reglare a EG

    Pretranscripional decondensarea cromatinei, eliberareaADN de histone (epigenetic, reversibil, potenial ereditar)

    Transcripional identificarea promotorului, formareacomplexului de iniiere, rata de transcripie

    Posttranscripional procesarea ARNm, alegerea variantei despl ic ing, controlul transferului ARNm n citoplasm

    Translaional selectarea matriei, formarea complexuluideiniiere, controlul calitii polipeptidului, stabilitatea ARNm

    Posttranslaional modificarea posttranslaional apolipeptidului, direcionarea proteinelor

    TP

    Transcripie

    Transferul RNP n citoplasm

    Etapele expresiei genelor de clasa IIE E E EI I IADN

    proARNm

    Processing-ul ARNmARNm 7MeGppp AAAAAAAAAAAAA..........

    Translaie

    Conformaia proteinei

    7MeGppp AAAAAAAAAAAAA..........

    Protein

    Reglarea la nivel pretranscripional1. Modificarea histonelor:

    -metilarea H3 (Lys4) expresie activ a genei-metilarea H3 (Lys9) atenuarea transcripiei-acetilarea histonelor relaxarea cromatinei, facilitareatranscripiei-dezacetilarea histonelor condensarea cromatinei,inactivarea transcripiei-fosforilarea H1 supracondensarea cromatinei-defosforilarea H1 decondensarea cromatinei

    2. Metilarea ADN (insulele 5MeCpG, frecvent n promotor) inactivarea transcripiei.!!! Metilarea ADN dezacetilarea histonelor represiatranscripiei

    3. Modificri n configuraia ADN:helixul B helix Z represie genic (excepie promotor)

    Control pretranscripional

    Controlul la distan a expresiei genice:!!! Organizarea funcional a cromozomilor ndomenii cromatidiene cu expresiei genicdiferite, evitnd efectul activator sau inhibitora Enhancerilor sau Silencerilor unei gene

    asupra altor gene.

    1) Efectul de poziie a genelor pe cromozom2) Reglarea coordonat a expresiei genelor(LCR- l ocus cont ro l region) Sac vitelin Ficat

    Mduva roiea oaselor isplin

    Control expresiei temporale i spaiale

    ale genelor globinelor

    crs.16

    crs.11

  • 7/29/2019 Controlul Expresiei

    4/6

    08.11.200

    Exemplu metilare - demetilareReglarea la nivel transcripional

    !!! Formarea complexului de iniiere atranscripiei:

    !!! Interaciunea factorilor proteici trans-

    reglatori cu secvenelecis-reglatoare ale

    promotorului (selectarea promotorului la

    genele cu mai muli promotori)

    !!! Reglarea activitii ARN polimerazei:- direcionarea;- alegerea +1

    - alegerea catenei transcrise

    !!! Controlul ratei de transcripie

    !!! Activarea genei prin inducie hormonal itransducie

  • 7/29/2019 Controlul Expresiei

    5/6

    08.11.200

    Factorii de translaie i mecanismul lor de aciune

    Iniierea

    eIF-2 - Activeaz complexul Met-ARNtmet

    eIF-3 - Asigur unirea subunitii 40S la CAP-ul ARNm

    eIF-4A- Recunoate CAP-ul i asigur denaturareapalindroamelordin secvena lider a ARNm

    eIF-4B - Asigur stabilitatea moleculei ARNm i previneformarea buclelor

    eIF-5 - Este o GTP-az ce asigur unirea subunitii 60S lacomplexul de iniiere

    eIF-6 - Previne legarea prematur a subunitii 60S lasubunitatea 40S

    Elongarea

    eEF-1 - Asigur unirea aminoacil-ARNt la ribozom;

    eEF-1 - Asigur hidroliza GTP;

    eEF-2 - Asigur translocarea ribozomului;

    Terminarea

    Factorii de terminare sunt nc puin studiai laeucariote, dar mecanismul general este asemntorprocariotelor

    RF-1 - Recunoate codonii STOP UAA i UAG

    RF-2 - Recunoate codonii STOP UGA i UAA

    RF-3 - Asigur specificitatea RF-1 i RF-2.

  • 7/29/2019 Controlul Expresiei

    6/6

    08.11.200