controlul expresiei
TRANSCRIPT
-
7/29/2019 Controlul Expresiei
1/6
08.11.200
Controlul
expresiei
genice
REGLAREA
EXPRESIEI GENICE
!!! Alegerea genei pentru transcripie!!! Activarea secvenei de ADN
!!! Controlul activitii ARN-polimerazei II
!!! Controlul cantitii i calitii ARNm i proteinei
sintetizate
Organism pluricelular:
Peste 200 de tipuri de celule
diferite esuturi organe
Toate celulele somatice ale
unui organism sunt genetic
identice (au aceeaicantitate de ADN, aceleaigene), provenind de lacelula zigot prin mitoze
succesive)
Particularitile genomului uman
Genomul nuclear (n)
3,2 Gb
~ 35000 gene
Genomul mitocondrial
16,6 kb
37 de gene
ADN genic
25%
ADN extragenic
75%
ADNcodant
10%
ADNnecodant
90%
Secvene unicesau n numrmic de copii
60%
Secvenemoderat sau
nalt repititive
40%
Clasificarea genelor nucleare
1. n dependen de produsul genic:
gene de cl.I pentru ARNr
gene de cl. II pentru ARNm i proteinegene de cl.III pentru ARNt, ARNr, ARNsn
2. n dependen de locul activitii:
gene active n toate celulele
gene active n anumite celule, esuturi3. n dependen de perioada ontogenetic
gene active pe tot parcursul vieii
gene active numai prenatal
gene active numai la pubertate
gene active numai la adult
4. n dependen de interaciunea cu factorii de mediu;
gene stabile
gene plastice
5. n dependen de gradul de expresie:
gene normomorfe
gene hipomorfe
gene hipermorfe
gene amorfe
6. n dependen de numrul de copii n genom:
gene unicale
gene repetate n tandem sau dispersate
-
7/29/2019 Controlul Expresiei
2/6
08.11.200
7. n dependen de funcia produilor genici:
enzime - 31,2%;
modulatori ai proteinelor sintetizate - 13, 6 %
receptori;
factori de transcripie;
proteinele matricei intracelulare i matricei extracelulare;
ansportori membranari i proteine canal;
molecule semnalizare celular;
hormoni;
Ig.
50%
Fiecare celul a organismului conine setul complet degene (30-40000 perechi gene pentru 46 mol. ADNnuclear)
Expresia genic numai 10% din toate genele
Expresie continuGene ARNr
Gene ARNt
Gene housekeeping
Expresie temporaldependent:
- de esut;
- de perioada
ontogenetic;
- de perioada ciclului
celular;
- de factorii de mediu
Non-expresie
pseudogene
!!! Exist mecanisme de reglare a expresiei genelor
La procariote
!!! DAR, la eucariote:
-genomul nuclear este enorm i este puternic compactizat(ADN+ proteine histone, proteine nehistone);
-recunoaterea i activarea unei secvene scurte denucleotide (unei gene) este dificil;
-exist mecanisme de reglare multiple, la diferite nivele deexpresie a genelor (pretranscripional, transcripional,processing ARNm, translaie, etc.):
! etapa principal la nivelul iniierii transcripiei;
! mecanismul principal interaciunea unor factori proteici la
secvenele reglatoare ale acizilor nucleici;
! factorii proteici reglatori sunt produii unor gene situate la
distan, pe alte molecule de ADN (factori trans-reglatori)
-
7/29/2019 Controlul Expresiei
3/6
08.11.200
FACTORII REGLATORI AI EXPRESIEI GENICE
CIS-genici
a) Boxe pentruiniierea
transcripieib) Boxe specifice de
esut
c) Boxe RE induse
prin hormoni, ioni,
AMPc
d) Enhancers,silencers
TRANS-genici
a) Factori proteicide transcripiegenerali
b) Factori proteicide transcripiespecifici de
esut
c) Factori proteicide transcripieinuctibili
d) Enh, sil.
EPI-genici
(negenetici)
a) Modificareahistonelor
(metilare,acetilare,
fosforilare,
ubiquitinare
b) Metilarea ADN
c) Variaii nconfiguraiaADN
Nivele de reglare a EG
Pretranscripional decondensarea cromatinei, eliberareaADN de histone (epigenetic, reversibil, potenial ereditar)
Transcripional identificarea promotorului, formareacomplexului de iniiere, rata de transcripie
Posttranscripional procesarea ARNm, alegerea variantei despl ic ing, controlul transferului ARNm n citoplasm
Translaional selectarea matriei, formarea complexuluideiniiere, controlul calitii polipeptidului, stabilitatea ARNm
Posttranslaional modificarea posttranslaional apolipeptidului, direcionarea proteinelor
TP
Transcripie
Transferul RNP n citoplasm
Etapele expresiei genelor de clasa IIE E E EI I IADN
proARNm
Processing-ul ARNmARNm 7MeGppp AAAAAAAAAAAAA..........
Translaie
Conformaia proteinei
7MeGppp AAAAAAAAAAAAA..........
Protein
Reglarea la nivel pretranscripional1. Modificarea histonelor:
-metilarea H3 (Lys4) expresie activ a genei-metilarea H3 (Lys9) atenuarea transcripiei-acetilarea histonelor relaxarea cromatinei, facilitareatranscripiei-dezacetilarea histonelor condensarea cromatinei,inactivarea transcripiei-fosforilarea H1 supracondensarea cromatinei-defosforilarea H1 decondensarea cromatinei
2. Metilarea ADN (insulele 5MeCpG, frecvent n promotor) inactivarea transcripiei.!!! Metilarea ADN dezacetilarea histonelor represiatranscripiei
3. Modificri n configuraia ADN:helixul B helix Z represie genic (excepie promotor)
Control pretranscripional
Controlul la distan a expresiei genice:!!! Organizarea funcional a cromozomilor ndomenii cromatidiene cu expresiei genicdiferite, evitnd efectul activator sau inhibitora Enhancerilor sau Silencerilor unei gene
asupra altor gene.
1) Efectul de poziie a genelor pe cromozom2) Reglarea coordonat a expresiei genelor(LCR- l ocus cont ro l region) Sac vitelin Ficat
Mduva roiea oaselor isplin
Control expresiei temporale i spaiale
ale genelor globinelor
crs.16
crs.11
-
7/29/2019 Controlul Expresiei
4/6
08.11.200
Exemplu metilare - demetilareReglarea la nivel transcripional
!!! Formarea complexului de iniiere atranscripiei:
!!! Interaciunea factorilor proteici trans-
reglatori cu secvenelecis-reglatoare ale
promotorului (selectarea promotorului la
genele cu mai muli promotori)
!!! Reglarea activitii ARN polimerazei:- direcionarea;- alegerea +1
- alegerea catenei transcrise
!!! Controlul ratei de transcripie
!!! Activarea genei prin inducie hormonal itransducie
-
7/29/2019 Controlul Expresiei
5/6
08.11.200
Factorii de translaie i mecanismul lor de aciune
Iniierea
eIF-2 - Activeaz complexul Met-ARNtmet
eIF-3 - Asigur unirea subunitii 40S la CAP-ul ARNm
eIF-4A- Recunoate CAP-ul i asigur denaturareapalindroamelordin secvena lider a ARNm
eIF-4B - Asigur stabilitatea moleculei ARNm i previneformarea buclelor
eIF-5 - Este o GTP-az ce asigur unirea subunitii 60S lacomplexul de iniiere
eIF-6 - Previne legarea prematur a subunitii 60S lasubunitatea 40S
Elongarea
eEF-1 - Asigur unirea aminoacil-ARNt la ribozom;
eEF-1 - Asigur hidroliza GTP;
eEF-2 - Asigur translocarea ribozomului;
Terminarea
Factorii de terminare sunt nc puin studiai laeucariote, dar mecanismul general este asemntorprocariotelor
RF-1 - Recunoate codonii STOP UAA i UAG
RF-2 - Recunoate codonii STOP UGA i UAA
RF-3 - Asigur specificitatea RF-1 i RF-2.
-
7/29/2019 Controlul Expresiei
6/6
08.11.200