ce? de ce? cu ce? cum?marius.mihasan/teaching/pdfs/sd_bio/references.pdf · ce este o citare?...
TRANSCRIPT
Ce este o citare?
Citare bibliografică – referință sau notă de subsol către sursa ideii
(o carte, articol, pagină web, nanopublicație, intrare în bază de date sau alt element publicat).
O citare - suficiente detalii pentru a putea identifica în mod unicsursa bibliografică.
Ce conține o citare?
1 – expresie alfa-numerică amplasată în text care face referință la lucrarea citată
2 – intrarea bibliografică corespunzătoare amplasată e la finalul lucrării, în lista de referințe bibliografice
De ce folosim citări?
1. Pentru a atribuii ideile autorului original;2. Pentru a permite cititorului să determine în mod independent dacă referințele suportă ideile enunțate;
3. Pentru a permită evaluarea calității și validității textului;
4. Pentru a evalua impactul unui idei sau al unui autor.
De ce formatăm citările?
https://www.youtube.com/watch?v=gW7a1PB3S-I
Un format ce poate fi citit automat de calculator
Indexarea automată a lucrărilor publicate
=
Lowry
SDS-PAGE
Bradford
Sanger
RNA
https://www.nature.com/news/the-top-100-papers-1.16224
WB
ClustaW
BLAST: 12, 14Neighbor-joining and bootstrap: 20, 41BLAST: 12, 14
https://www.nature.com/news/polopoly_fs/7.21245!/file/GoogleScholartop100.xlsx
În câte feluri pot fi scrise citările?
3 sisteme de citare în text:
2. Harvard – textul alfanumeric ce identifica citarea (Autor, an) este între paranteze rotunde. În general, referințele sunt listate în ordine alfabetică la final.
3. “Citation-name” – numere ca indici la locul citării, referințele sunt ordonate alfabetic după numele autorului la final.
1. Vancouver – numere consecutive între paranteze sau ca indici (sau ambele). Referințele sunt listate la final în ordinea apariției lor în text.
În câte feluri pot fi scrise citările?
Pentru fiecare sistem exista stiluri variate de formatare a referințelor
The Chicago Manual of style BlueBookAPA style – the American Psychological AssociationACS style - The American Chemical SocietyAIP style - The American Institute of PhysicsAMS style The American Mathematical SocietyASME style – The American Society of Mechanical EngineersThe ICMJE style - The International Committee of Medical Journal Editors (ICMJE) - folosit de MEDLINE/PubMed.etc. etc. etc. etc.
Stilurile se referă la modul specific de scriere, ordinea și semnele ce despart câmpurile cu informații dintr-o referință bibliografică
În câte feluri pot fi scrise citările?
Collier TJ, Kanaan NM, Kordower JH. Ageing as a primary risk factor for Parkinson’s disease: evidence from studies of non-human primates. Nat Rev Neurosci. 2011;12:359–66.
Boylen, C.W. Survival of Arthrobacter crystallopoietes during prolonged periods of extreme desiccation. J. Bacteriol. 113 (1973) 33-37
Fiecare editură (grup de reviste) are propriul stil de scriere a referințelor
Există o manieră simplă de schimbare a stilului unei citări?
NUExistă însă modalități prin care munca se poate ușura –
soft-uri pentru referințe bibliografice
Câte pachete soft pentru referințe bibliografice există?
reference management / citation management / personal bibliographic management software
30 de programe listate pe Wikipedia
Contra-cost Gratuite
Care sunt etapele în utilizarea unui soft pentru referințe bibliografice?
Colectarea manuală / semiautomată a
referințelor
Salvarea și stocarea referințelor într-un format convenabil –
o bază de date personală (on- sau
off-line)
Utilizarea referințelor în editor text,
aplicarea de stiluri
Ce trebuie să știu despre importul referințelor bibliografice?
1. O referință bibliografică poate fi descărcată sub forma unui fișier cu extensie specifică
Ce trebuie să știu despre importul referințelor bibliografice?
TY - JOURT1 - Evidence of a plasmid-encoded oxidative xylose-catabolic pathway in Arthrobacter nicotinovorans pAO1AU - Mihasan, MariusAU - Stefan, MariusAU - Hritcu, LucianAU - Artenie, VladAU - Brandsch, RoderichJO - Research in MicrobiologyVL - 164IS - 1SP - 22EP - 30PY - 2013DA - 2013/01/01/SN - 0923-2508DO - https://doi.org/10.1016/j.resmic.2012.10.003UR - http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0923250812001374KW - pAO1KW - MegaplasmidKW - -xyloseKW - Oxidative pathwayER -
Fișierul de tip RIS este în general universal valabil, majoritatea programelor îl pot utiliza
Ce trebuie să știu despre importul referințelor bibliografice?
2. WOS și Pubmed folosesc formate proprii, însă articolele sunt cel mai frecvent prezente și în celelalte baze de date
Ce trebuie să știu despre importul referințelor bibliografice?
3. Unele programe sunt capabile să colecteze o referință bibliografică direct dintr-o pagina web......
...... sau se integreză în baze de date cunoscute.
Endnote Web poate prelua din ISI Web of Science (WOS)
Mendeley Web Importer
Zotero Connector
Ce trebuie să știu despre importul referințelor bibliografice?
4. Unele programe pot căuta direct în baze de date un anumit articol după autor, titlu, etc.
4600 de resurse
30 resurse
400 Resurse la instalare, se poate extinde la peste 6000
Câteva cataloage, dar bazele de date importante sunt prezente
Nu au facilități de căutare directă în bazele de date
Câteva cataloage, dar bazele de date importante sunt prezente
800 resurse
Ce trebuie să știu despre baza de date cu referințe?
1. Poate fi stocată pe calculatorul pe care rulează aplicația......
...... sau în cloud, asociat unui cont al utilizatorului.
3 GB 2 GB 15 GB 300 mb
Au avantajul că baza de date nu se pierde în caz de accidente, poate fi accesată de oriunde
Ce trebuie să știu despre baza de date cu referințe?
2. Poate conține un număr variat de tipuri de documente (article, book, book chapter, abstract, thesis, nanopublication, database entry etc), iar la fiecare tip de document un număr variabil de câmpuri cu informații (Ex. autor, an, data publicării, pagină, DOI, site web, etc)
20 tipuri de documentePână la 55 de câmpuri pe document
21 tipuri de documentePână la 60 de câmpuri pe document
Tipurile de documente esențiale pentru mine:1. Articol;2. Carte3. Capitol/parte dintr-o carte când are autori diferiți de
editorii cărții;4. Patent;5. Teză;6. Pagină web;7. Conferință;8. Software/intrare în bază de date (GenBank, PDB, etc);
Ce trebuie să știu despre integrarea cu editorul de text?
1. Majoritatea programelor au funcția ”cite while you write” dar pot apare probleme de compatibilitate între diverse versiuni ale editoarelor text (Word 2011 vs Word 2016, OpenOffice vsLibreoffice, Windows vs Linux vs OSX);2. Elementul cheie este disponibilitatea stilurilor de formatare a referințelor utilizate în conformitate cu revista vizată.
500 de stiluri predefinitePot fi instalate până la 6000
stiluri suplimentare
16 stiluri predefinitePot fi instalate până la 8000
stiluri suplimentare
Abilitatea de a crea propriul stil este un mare avantaj
DANU
Unde se găsesc stiluri?
1. Pe site-ul revistei – în general pentru EndNote.2. http://citationstyles.org/
Sauhttp://editor.citationstyles.org
Cum se folosește un program pentru citări?
1. Se alcătuiește baza de date personală prin adăugarea referințelor dorite (import de fișiere ris, copiere automată din pagina web, căutare din soft). Acestea se adaugă pe măsură ce sunt necesare/ dorite/ descoperite.
3. Se inserează bibliografia la finalul manuscrisului și se alege stilul de formatare. Toate citările și referințele corespunzătoare vor fi formatate uniform dacă intrările corespunzătoare din baza de date sunt corecte.
2. Se scrie manuscrisul și se inserează citările la locul lor în text folosind instrumentul specific softului ales.
4. Dacă este necesară reformatarea, se schimbă stilul. Toate citările și referințele corespunzătoare vor fi formatate uniform conform noului stil.