asparagus, structura aminoacizilor · structura aminoacizilor (ionizată) este ilustrată în...

14
Biochimie - Curs 2 - 2019 Aminoacizii Aminoacizii sunt compuși biochimici cu masă moleculară mică și importanţă deosebită pentru organismul uman. Aceştia sunt elemente structurale de bază care intră în componenţa proteinelor, compuşi cu proprietăți biologice remarcabile. Aminoacizii au fost obţinuţi din proteine prin hidroliza acidă (HCl 6M) a legăturilor peptidice. De asemenea, aminoacizii sunt precursori ai hormonilor (tiroxina) sau moleculelor cu funcţii specializate (dopamina-neurotransmiţător). Primul aminoacid descoperit a fost asparagina (în rădăcina şi tulpina sparanghelului; 1806). Ultimul aminoacid, treonina, a fost descoperit în 1938. La început aminoacizii au fost denumiţi în funcţie de sursa de provenienţă (asparagina din Asparagus, glutamatul din gluten şi tirozina din brânza - “tyros”= brânză) sau după alte proprietăţi (glicina-“Glykos”- dulce). Aminoacizii sunt prezenți în sânge sau alte fluide biologice atât în formă liberă t şi combinată. De asemenea, aminoacizii sunt precursori ai hormonilor, zaharurilor, purinelor, pirimidinelor, porfirinelor, vitaminelor sau aminelor cu rol fiziologic. Structura aminoacizilor Structura aminoacizilor (ionizată) este ilustrată în figura 1. Proprietăţile chimice și fizice ale aminoacizilor sunt dictate de grupările care sunt grefate pe atomul de carbon din poziţia . La acest atom de carbon se disting următoarele grupări: a) gruparea amino - grupare protonată (-NH3 + ) în condiţii fiziologice (pH 7); b) gruparea carboxil - grupare deprotonată (-COO - ) în condiţii fiziologice; c) catena laterală - conferă proprietăţi specifice aminoacizilor, fiind responsabilă şi de asimetria atomului de carbon din poziţia . Până în prezent se cunosc 22 de aminoacizi care sunt elemente structurale de bază ale proteinelor, dintre care numai 20 sunt criptate de către codul genetic universal. Ceilalți doi, selenocisteina (abreviată Sec, descoperită în 1986) și pirolizina (abreviată Pyl, descoperită în 2002, prezentă doar în componența proteinelor din bacterii sau arhee) fuzionează cu ADN-ul de transfer care este capabil să formeze perechi de baze cu codonii de stop ai ARN-ului mesager în timpul procesului de translație. Doar în această situație acești doi aminoacizi pot fi încorporați în proteine. Configuraţia celor 21 de aminoacizi existenţi în proteinele umane (excepţie face aminoacidul glicina) este L (Figura 1, structura generală ionizată a unui aminoacid la pH neutru). Figura 1. Configurația L- și D- a aminoacizilor Deși în procesul de translație (copierea informației de pe ARN-ul mesager sub formă de secvență proteică) se utilizează doar 21 de aminoacizi se cunosc peste 140 de aminoacizi care apar în proteine. Este important de subliniat faptul că numărul aminoacizilor care nu apar în proteine (neproteinogeni) este cu mult mai ridicat. Unii dintre aceştia apar numai în plante sau în anumite microorganisme. În natură aminoacizii

Upload: others

Post on 09-Sep-2019

59 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Biochimie - Curs 2 - 2019

Aminoacizii

Aminoacizii sunt compuși biochimici cu masă moleculară mică și importanţă

deosebită pentru organismul uman. Aceştia sunt elemente structurale de bază care intră în

componenţa proteinelor, compuşi cu proprietăți biologice remarcabile. Aminoacizii au

fost obţinuţi din proteine prin hidroliza acidă (HCl 6M) a legăturilor peptidice. De

asemenea, aminoacizii sunt precursori ai hormonilor (tiroxina) sau moleculelor cu funcţii

specializate (dopamina-neurotransmiţător). Primul aminoacid descoperit a fost asparagina

(în rădăcina şi tulpina sparanghelului; 1806). Ultimul aminoacid, treonina, a fost

descoperit în 1938. La început aminoacizii au fost denumiţi în funcţie de sursa de

provenienţă (asparagina din Asparagus, glutamatul din gluten şi tirozina din brânza -

“tyros”= brânză) sau după alte proprietăţi (glicina-“Glykos”- dulce).

Aminoacizii sunt prezenți în sânge sau alte fluide biologice atât în formă liberă

cât şi combinată. De asemenea, aminoacizii sunt precursori ai hormonilor, zaharurilor,

purinelor, pirimidinelor, porfirinelor, vitaminelor sau aminelor cu rol fiziologic.

Structura aminoacizilor

Structura aminoacizilor (ionizată) este ilustrată în figura 1. Proprietăţile chimice și

fizice ale aminoacizilor sunt dictate de grupările care sunt grefate pe atomul de carbon

din poziţia . La acest atom de carbon se disting următoarele grupări:

a) gruparea amino - grupare protonată (-NH3+) în condiţii fiziologice (pH 7);

b) gruparea carboxil - grupare deprotonată (-COO-) în condiţii fiziologice;

c) catena laterală - conferă proprietăţi specifice aminoacizilor, fiind responsabilă şi

de asimetria atomului de carbon din poziţia .

Până în prezent se cunosc 22 de aminoacizi care sunt elemente structurale de bază ale

proteinelor, dintre care numai 20 sunt criptate de către codul genetic universal. Ceilalți

doi, selenocisteina (abreviată Sec, descoperită în 1986) și pirolizina (abreviată Pyl,

descoperită în 2002, prezentă doar în componența proteinelor din bacterii sau arhee)

fuzionează cu ADN-ul de transfer care este capabil să formeze perechi de baze cu codonii

de stop ai ARN-ului mesager în timpul procesului de translație. Doar în această situație

acești doi aminoacizi pot fi încorporați în proteine. Configuraţia celor 21 de aminoacizi

existenţi în proteinele umane (excepţie face aminoacidul glicina) este L (Figura 1,

structura generală ionizată a unui aminoacid la pH neutru).

Figura 1. Configurația L- și D- a aminoacizilor

Deși în procesul de translație (copierea informației de pe ARN-ul mesager sub

formă de secvență proteică) se utilizează doar 21 de aminoacizi se cunosc peste 140 de

aminoacizi care apar în proteine. Este important de subliniat faptul că numărul

aminoacizilor care nu apar în proteine (neproteinogeni) este cu mult mai ridicat. Unii

dintre aceştia apar numai în plante sau în anumite microorganisme. În natură aminoacizii

Biochimie - Curs 2 - 2019

există şi în configuraţia D. De exemplu, D-alanina, acizii D-glutamic şi D-aspartic intră

în componenţa peptidelor din peretele bacterian. Fluidul intracelular al unor viermi

marini şi nevertebrate conţine drept componentă principală D-aminoacizii, iar în unele

crustacee marine cantitatea acestora poate depăşi 1%. De asemenea, acidul D-aspartic, D-

asparagina, acidul D-glutamic, D-glutamina, D-serina și D-alanina au fost detectați în

majoritatea plantelor, în timp ce D-prolina, D-valina, D-leucina and D-lizina doar în

unele plante (angiosperme dicotiledonate). Proteinele metabolice stabile din mamifere

conţin cantităţi însemnate de acid D-aspartic rezultat în urma procesului de racemizare:

concentraţia acidului D-aspartic în materia albă creierului atinge circa 3%, iar în proteina

bazică din măduva spinării până la 10%.

Laptele, carnea şi diversele cereale nu conţin cantităţi substanţiale de D-

aminoacizi. În decursul procesării, aminocizii din aceste alimente suferă adesea

fenomenul de racemizare. Mai mult, concentrația D-aminoacizilor din probele de lapte

(bio) creşte substanţial în decursul stocării la 4 oC. Astfel, se recomandă determinarea

conţinutului de D-alanină pentru a monitoriza eventualele contaminări ale laptelui cu

bacterii.

Concentrația aminoacizilor în sângele total este de 5-8 mg/ml. S-a constatat o

creștere a concentrației aminoacizilor în sânge în cazul afecțiunile acute ale

parenchimului hepatic, icterelelor, cirozelor, leucemiilor, nefritelor sau intoxicațiilor cu

arsen sau fosfor. Variațiile patologice ale acestora sunt corelate în multe situații cu erorile

metabolice înnăscute, încadrându-se în sindroamele cu severitate ridicată și pot fi asociate

în unele cazuri cu debilitate mintală. Hiperaminoacidimiile se produc prin inhibiția

sistemului de transport tubular (în care nivelul plasmatic al aminoacizilor rămâne

neschimbat) sau datorită unui deficit enzimatic strict localizat. O creștere a nivelului total

de aminoacizi din sânge poate fi pusă pe seama: eclapsiei (afecțiune care survine, în

general, la sfârșitul perioadei de sarcină, caracterizată prin convulsii asociate cu

hipertensiune arterială), intoleranței la fructoză, cetoacidozei, insuficiențelor renale sau

instalării sindromului Reye (care apare la copii cu vârstele între 4-12 ani cărora le-a fost

administrată aspirină; se manifestă prin meningită, encefalită, disfuncții ale ficatului).

Scăderea concentrației totale a aminoacizilor din sânge poate fi datorată: unei hiperfuncții

cortico-suprarenaliane, bolii Hartnup (boală autozomală recesivă în care nivelele alaninei,

valinei, treoninei, leucinei, fenil alaninei, tirozinei, histidinei sau glicinei sunt mai

scăzute; de asemenea scăderea concentrației de triptofan pot conduce la deficiențe ale

vitaminei B3 care se manifestă prin dermatite), malnutriție, sindrom nefrotic, boala

Huntington (afecțiune neurodegenerativă rară, moștenită genetic; apar disfuncţiile motorii

tipice - mişcări spasmodice şi involuntare ale braţelor, picioarelor, toracelui şi feţei;

simptomele timpurii pot fi și pierderea motivaţiei şi o modificare a stării emoţionale

depresie), artrită reumatoidă sau febră Phlebotomus (provocată de musca de nisip

Phlebotomus рарраtasif; simptomele sunt: instalarea oboselii, pierderea în greutate, febră

urmată de un focar de leziuni ale pielii).

Fenilcetonuria (idioția fenilpiruvică) este cauzată de un defect genetic al unei

enzime care catalizează transformarea fenilalaninei în tirozină. Drept rezultat, în fluxul

sangvin se acumulează o cantitate apreciabilă de fenilalanină și produșii acesteia de

metabolizare (acid fenilpiruvic, acid fenilacetic și acid fenillactic). Concentrația ridicată

de fenilalanină inhibă o altă enzimă, fapt care va induce diminuarea sintezei melaninei

(un pigment de la nivelul pielii, părului, țesutului pigmentat care stă la baza irisului

Biochimie - Curs 2 - 2019

ochiului și peretelui de dincolo de urechea internă). Drept urmare bolnavii de

fenilcetonurie au următoarele trăsături: tenul deschis, părul blond și ochi albaștri.

Majoritatea aminoacizilor care intră în componența proteinelor se regăsesc în

urină, sub formă liberă. Conținutul zilnic de aminoacizi totali din urină este de 1-3 g.

Aminoacizii cei mai reprezentativi sunt: glicina, histidina și derivații metilați (1-metil-

histidina și 3-metil-histidina), glutamina, serina, alanina, acidul -amino-butiric. În mod

frecvent în urină se găsesc glicina, tirozina, leucina sau histidina. Zilnic se elimină

aproximativ 210 mg histidină, 140 mg glicină și 100 mg taurină. Un aport proteic

alimentar ridicat determină o creștere a cantității de histidină, treonină, lizină sau tirozină.

Hiperaciduriile renale pot fi de mai multe tipuri:

a) fiziologice: hiperacidurii globale, care apar îndeosebi la sugar și prematur;

datorate sistemelor enzimatice de transport deficitare; hiperaciduria și

histinuria ce apar în săptămâna a 5-a de sarcină;

b) patologice – ce depind de mecanismele fiziopatologice:

o aminoacidurii renale, prin tulburarea reabsorbției tubulare, cu nivel

sangvin normal;

o aminoacidurii prerenale cu nivel crescut de aminoacizi atât la nivel

sangvin cât și în urină.

Hiperaciduriile renale se caracterizează prin alterarea absorbției unui singur

aminoacid (glicocoluria) sau a unui grup de aminoacizi (cistina, lizina, arginina și

ornitina-cistinuria; acidul glutamic, acidul aspartic - aminoaciduria dicarboxilică;

metionina, tirozina, fenilalanina, acidul -hidroxibutiric - malabsorbţia metioninei).

Boala urinei cu miros de sirop de arțar (MSUD- eng. Maple Syrup Urine

Disease) este o boală cauzată de un deficit al enzimei care catalizează decarboxilarea

oxidativă a aminoacizilor cu catena ramificată (valină, leucină și izoleucină) atât în sânge

cât și în urină alături de metaboliți (cetoacizii derivați din aceștia) imprimând urinei un

miros de sirop de arțar. Deficitul în metabolizarea acestor aminoacizi induce apariția unor

leziuni nervoase, întârzierea dezvoltării mentale sau în cazul formelor severe chiar la

deces. În condițiile în care boala este depistată în primele luni de viață se impune o

alimentație săracă în valină, leucină și izoleucină, iar șansele de redresare a pacientului

sunt ridicate.

Concentrația aminoacizilor din lichidul cefalorahidian (LCR) este mai scăzută

decât cea plasmatică. LCR conține majoritatea aminoacizilor prezenți în plasmă și țesutul

nervos (cu excepția 1- și 3-metil histidinei respectiv a cisteinei). Determinarea nivelului

aminoacizilor poate furniza informații importante legate de diferențierea meningitei

tuberculoase de cea aseptică. Dacă în ambele tipuri de meningită nivelul aminoacizilor

aspartic, glutamic, GABA (acid -aminobutiric), glicinei, triptofanului sunt ridicate, în

cazul meningitei tuberculoase scade nivelul de taurină și crește concentrația fenilalaninei

din LCR.

Determinarea aminoacizilor în laboratorul clinic se efectuează prin metoda

Sorensen sau metode fotometrice (cu acid 1,2-naftachinon-4-sulfonic) sau fluorimetrice

(în prezență de tioli și o-dibenzaldehidă). În cazul separării aminoacizilor prin

cromatografia în strat subțire sau HPLC (cromatografie de lichide de înaltă performanță)

aminoacizii pot fi detectați prin reacția cu ninhidrina (colorație violet – purpura lui

Ruhemann, doar prolina conduce la un produs colorat în galben sau verde-în funcție de

pH) sau izatina (colorație albastră intensă cu prolina, roșie cu valina și roz cu alanina).

Biochimie - Curs 2 - 2019

Clasificarea aminoacizilor

Aminoacizii pot fi clasificaţi după următoarele criterii:

- proprietăţile chimice;

- utilitatea acestora în biosinteza proteinelor;

- necesitatea biosintezei acestora pentru organism;

- implicarea lor ca substrat în procesul de gluconeogeneză.

Catena laterală determină diferenţele dintre proprietăţile chimice ale

aminoacizilor

În funcţie de natura catenei laterale se disting:

a) catene laterale alifatice sau aromatice nepolare:

- aminoacizii alifatici: glicina, alanina, valina, leucina, izoleucina, metionina;

Glicina este aminoacidul cu structura cea mai simplă, având în catena laterală un

atom de hidrogen. Drept rezultat glicina este singurul aminoacid care nu este chiral (pe

atomul de carbon din poziția sunt grefați doi atomi de hidrogen) și este întâlnit de

obicei la suprafața proteinelor datorită flexibilității pe care o conferă lanțului proteic. De

asemenea, glicina este un aminoacid abundent în proteinele fibrilare. Glicina are funcție

de neurotransmițător și este intermediar metabolic în cadrul biosintezei bazelor azotate

din acizii nucleici.

Alanina, valina, leucina şi izoleucina posedă catene laterale hidrocarbonate (de la

gruparea metil din alanină la grupările butiril izomere din izoleucină şi leucină). Ultimii

trei aminoacizi constituie o sursă de energie în cazul suprasolicitării musculare. Acești

aminoacizi hidrofobi sunt localizați în special în interiorul structurii 3D a proteinelor.

Alanina este unul dintre aminoacizii care se găsesc în proteine, frecvența de

apariție în aceste macromolecule fiind depășită doar de leucină. Există o controversă

legată de faptul că leucina este un aminoacid care stimulează direct sinteza proteinelor în

mușchi. Mai mult excedentul de leucină poate fi periculos și poate induce diareea,

apariția dermatitelor, instalarea demenței și uneori decesul. Izoleucina posedă un centru

chiral suplimentar pe catena laterală.

Metionina este un aminoacid nepolar care intervine (sub formă formilată; fiind

inserat primul în lanțul proteic) în cadrul biosintezei proteinelor din bacterii, mitocondrii

Biochimie - Curs 2 - 2019

și cloroplaste. Este codat de codonul de start AUG localizat pe ARN-ul mesager.

Metionina este un intermediar în biosinteza carnitinei, taurinei sau fosfatidilcolinei.

Metionina este un precursor al S-adenozil-metioninei (SAM), o moleculă

importantă în metabolismul celular al mamiferelor. Acest compus este folosit în reacțiile

de metilare (de transfer al grupării –CH3).

- aromatici: fenilalanina, tirozina şi triptofanul;

Resturile aromatice (fenilalanina, tirozina şi triptofanul) pot fi detectate prin

spectroscopie în domeniul UV (250-300 nm). Această proprietate este folosită în special

pentru estimarea concentraţiei peptidelor sau proteinelor care conţin aceste resturi sau

pentru studiul împachetării acestor macromolecule.

Fenilalanina este un aminoacid nepolar și un precursor metabolic al tirozinei.

Boala genetică numită fenilcetonurie are drept consecință metabolizarea defectuoasă a

fenilalaninei.

Triptofanul este un aminoacid esențial care conține un rest indolic. Acest

aminoacid este precursor an serotoninei, niacinei și hormonului auxină (în plante).

Tirozina este un aminoacid neesențial care poate fi fosforilat în proteine în cadrul

proceselor de semnalizare. În celulele dopaminergice ale creierului o enzimă (tirozin

hidroxilaza) convertește tirozina la L-DOPA, un intermediar precursor al dopaminei. Mai

mult, dopamina este un precursor al norepinefrinei, epinefrinei, hormonilor tiroidieni și

melaninei.

Fluorescenţa proteinelor (polimeri care au drept unităţi structurale aminoacizii)

este în general obţinută prin excitarea aminoacizilor aromatici la lungimi de undă mai

mari de 280 nm (dat fiind faptul că fluorescenţa fenil alaninei este mai mică şi maximul

de absorbţie al acestui aminoacid este în jurul valorii de 260 nm se preferă excitarea la

valori mai mari ale absorbanţei). Proteinele absorb la 280 nm datorită triptofanului şi

tirozinei. În schimb, la lungimi de undă mai mari de 295 nm, absorbţia este atribuită în

special triptofanului. Astfel, triptofanul trebuie excitat la 295-305 nm pentru a emite

specific la lungimi de undă mai mari. Maximele de emisie ale tirozinei şi triptofanului

(aminoacizi individuali) în soluţie apoasă sunt la lungimile de undă de 303 respectiv 348

nm (triptofanul deşi puţin abundent în proteine are proprietăţi fluorescente atribuite

nucleului indolic).

- heterociclici: prolina (singurul aminoacid care are o grupare amino secundară),

triptofanul și histidina (vezi catene laterale încărcate pozitiv)

Biochimie - Curs 2 - 2019

Prolina este cel mai puțin flexibil aminoacid dintre prezenți în proteine. Prezența

prolinei afectează structura secundară (desface elementele secundare de tip helix și β

pliat). Hidroxilarea prolinelor din colagen (din oase, tendoane sau ligamente) imprimă o

stabilitate conformațională acestei proteine.

b) catene laterale neîncărcate (serina, treonina, asparagina, glutamina, cisteina,

selenocisteina). Grupările -OH din catena laterală a aminoacizilor (serina,

treonina – aminoacizi alifatici polari, tirozina – aminoacid aromatic – grupare

fenolică) pot fi implicate în legături de hidrogen.

Serina este un precursor al multor compuși celulari: purinelor, pirimidinelor,

sfingolipidelor, folatului și a unor aminoacizilor (glicină, cisteină și triptofan). Gruparea

hidroxilică a serinei din proteine este țintă pentru fosforilare prin intermediul kinazelor.

Treonin kinazele sunt parte integrantă a sistemelor de semnalizare celulară.

Serina face parte din triada catalitică a serin proteazelor (tripsină, chimotripsină).

În proteine, atât pe treonina cât și pe serină, pot fi grefate resturi de zaharuri

(reacția de glicozilare la gruparea –OH are loc în aparatul Golgi).

Pe catena laterală mai pot fi prezente şi alte grupări: -SH (cisteina), -SeH (seleno-

cisteina), tioeterică (metionina) sau amidică (glutamina, asparagina).

Cisteina este singurul aminoacid care are o grupare tiolică în catena laterală. Este

neesențial pentru adulți dar esențial pentru bebeluși. Grupările tiolice din două molecule

de cisteină poate fi oxidate la una disulfidică. În organismul uman cisteina poate fi

biosintetizată din metionină. În plus, acest aminoacid este o componentă a proteinelor,

peptidelor (glutation). De asemenea, poate regla activitatea unor enzime (de exemplu din

cadrul biosintezei melaninei).

Biochimie - Curs 2 - 2019

Selenocisteina este un aminoacid codat de tripletul UGA (care este şi tripletul de

oprire în sinteza proteică). Acest aminoacid este mult mai reactiv decât cisteina.

Înlocuirea atomului de S cu Se în unele enzime (catalizatori biochimici care sunt

implicaţi în unele reacţii redox) determină o creştere semnificativă (cu peste 100 de ori) a

vitezei reacţiei catalizate de acestea.

Asparagina este un aminoacid neesențial. Gruparea amidică din catena laterală

imprimă un caracter polar acestui aminoacid. Asparagina este implicată în formarea

acrilamidei în cazul alimentelor gătite la temperaturi ridicate (când reacționează cu

grupările carbonilice). De asemenea, asparagina este convertită în acid malic în cadrul

ciclului acidului citric.

Glutamina care nu este în mod normal esențial, dar în anumite situații poate fi

necesar pentru atleții care depun eforturi intensive sau pentru persoanele care sunt

afectate de boli gastro-intestinale. Glutamina este cel mai abundent aminoacid din sânge

(respectiv mușchii scheletici) și unul dintre puținii care poate traversa bariera hemato-

encefalică. Acest aminoacid susține creșterea și multiplicarea celulelor sistemului

imunitar. În reticulul endoplasmatic acest aminoacid poate fi glicozilat (la gruparea

amidică din catena laterală).

c) catene laterale încărcate:

- pozitiv (lizina, arginina, histidina-imidazolul are un pKa de aproximativ 6 în

consecinţă heterociclul din catena laterală este deprotonat, iar nucleul imidazolic încărcat

negativ, la valori ale pH-ului mai mari decât 7-8);

Biochimie - Curs 2 - 2019

Lizina asistă absorbția calciului din tractul gastro-intestinal promovând astfel

biosinteza colagenului. Histamina și carnozina (substanță ce anihilează radicalii liberi)

sunt biosintetizate pornind de la acest aminoacid. Lizina este un aminoacid esențial care

poate fi modificat postranslațional (după biosinteza proteică) pentru a forma acetilizină,

hidroxilizină și metillizină. De asemenea, acest aminoacid poate fi ubichitinat (legat de o

proteină de dimensiuni relativ mici numită ubichitină), biotinilat (legat de o vitamină),

carboxilat sau cuplat cu alte proteine (“sumoilare”, “pupilare”).

Arginina este un aminoacid care poate fi esențial sau neesențial. Copii născuți

prematur nu pot sintetiza arginina. În plus, traumele chirurgicale, septicemiile și arsurile

induc o nevoie crescută de arginină. Acest aminoacid conține o grupare complexă numită

guanidinică a cărei constantă pKa este de peste 12, fapt care îi conferă o încărcare

pozitivă la pH-ul celular. Arginina induce dilatarea vaselor de sânge (reduce presiunea

sangvină) și producerea de monoxid de azot (NO). Acest aminoacid joacă un rol

important în balanța azotului.

- negativ (grupările carboxilice aflate pe catena laterală a resturilor aspartat şi

glutamat au valori ale pKa-ului de 3,9 şi 4,3; sunt foarte polare – încărcate negativ în

condiţii fiziologice). Aceste grupări sunt implicate în interacţii electrostatice cu grupări

încărcate pozitiv, punţi de hidrogen etc.

Acidul aspartic este un aminoacid neesențial

(produs prin transaminarea oxaloacetatului).

Acidul glutamic este un aminoacid neesențial

(produs prin transaminarea cetoglutaratului)

care are rol și de neurotransmițător.

Ambii aminoacizi constituie o sursă

energetică rapidă.

Nou-născuții preferă gustul de acid glutamic,

aminoacid care se află în concentrație mare

în laptele matern.

Aminoacizii cu catene laterale alifatice sau aromatice nepolare cu excepţia glicinei sunt

hidrofobi, iar cei care posedă catene laterale încărcate sunt hidrofili. Aminoacizii polari

care au catene laterale neîncărcate au încărcări intermediare (atât hidrofobi cât şi

hidrofili).

În funcţie de aminoacizii care intră în compoziţia proteinelor se disting:

a) aminoacizi proteinogeni-aminoacizii care intră în compoziţia proteinelor (vezi

exemplele de mai sus);

b) aminoacizi neproteinogeni-aminoacizii care nu intră în compoziţia proteinelor:

- ornitina (un precursor al citrulinei în mitocondrii) şi citrulina (un precursor al

argininei în citozol; în această reacție se produc și oxizi de azot – molecule semnal

în sistemul cardiovascular, în neuroni sau în sistemul imunitar) apar în decursul

ciclului ureei. Sinteza și eliminarea ureei este esențială pentru eliminarea

metaboliților toxici cu azot (concentrația mare de amoniac poate conduce la

encefalopatie hepatică; alcaloza poate induce apariția unor boli la nivelul unor

organe) din organism;

Biochimie - Curs 2 - 2019

Esentiali Neesentiali

Arginina

Histidina

Izoleucina

Leucina

Lizina

Metionina

Fenil-alanina

Treonina

Triptofan

Valina

Alanina

Aspartat

Cisteina

Glutamat

Arginina

Asparagina

Glutamina

Glicina

Prolina

Serina

Tirosina

Citrulina

- homocisteina este un aminoacid intermediar care provine din metabolismul

metioninei (un nivel crescut de homocisteină în sânge poate fi un indicator al

aterosclerozei și al trombozei). Hiperhomocisteinemia (un nivel plasmatic >12-15

μmol/L) poate fi asociată cu defecte genetice ale enzimelor implicate în

metabolismul homocisteinei. Într-unul dintre defecte pacienții prezintă retard

mental, tromboembolism arterial și dezvoltă ateroscleroză precoce.

- 5-hidroxi-triptofanul – un precursor al serotoninei şi un intermediar în metabo-

lismul triptofanului;

- homoserina este un intermediar al catabolismului metioninei;

- taurina, aminoacid cu grupare sulfonică, intră în componenţa acizilor biliari (un

nivel crescut ale acidului taurocolic în serul fetal, în colestaza obstetrică, poate

induce instalarea unei aritmii fetale respectiv a decesului intrauterin subit);

- -Alanina este parte integrantă a coenzimei A.

Aminoacizii esenţiali nu pot fi sintetizaţi de

organismul uman

Aminoacizii care nu pot fi sintetizaţi de organismul

uman, şi ca atare pot fi suplimentaţi prin aport alimentar,

poartă denumirea de aminoacizi esenţiali. Pentru

organismul uman sunt esenţiali: valina, leucina,

izoleucina, fenilalanina, triptofanul, lizina, metionina şi

treonina (Tabelul 1). Ceilalţi aminoacizi, pot fi sintetizaţi

de organismul uman plecând de la acizii esenţiali, prin

scindarea proteinelor sau de la alți metaboliți şi sunt

Tabelul 1

Biochimie - Curs 2 - 2019

denumiţi neesenţiali. De exemplu, alanina este sintetizată în organism plecând de la

piruvat și din acest motiv este considerat un aminoacid neesențial.

Aminoacizii esenţiali se găsesc atât în proteinele de origine vegetală cât şi în cele

de origine animală. Compoziţia în aminoacizi diferă de la o proteină la alta. Clasificarea

în aminoacizi esenţiali şi neesenţiali este relativă. Aminoacizii esențiali pot varia de la un

organism la altul, pot fi determinați de vârsta etc. Aminoacizii care sunt în mod normal

neesențiali pot fi necesari în anumite situații. Indivizii care nu sintetizează cantități

suficiente de arginină, cisteină, glutamină, prolină, selenocisteină, serină și tirozină,

datorită unor maladii, au nevoie de suplimente alimentare care conțin acești aminoacizi.

Din scheletul atomilor de carbon al unor aminoacizi poate fi sintetizată glucoza

Scheletul hidrocarbonat al unor aminoacizi poate fi utilizat la sinteza glucozei.

Aceşti aminoacizi (cu excepţia leucinei şi lizinei) se numesc aminoacizi glucogeni, iar

restul aminoacizi cetogeni deoarece sunt transformaţi în corpii cetonici (excretați în

urină).

Proprietăţile acido-bazice ale aminoacizilor

Aminoacizii sunt amfoliţi

Aminoacizii pot ceda sau accepta protoni şi ca atare pot să se comporte asemeni

acizilor şi bazelor (amfolit).

Gruparea amino poate fi protonată:

Valoarea constantei de aciditate, pKa, a acestei reacţii este de 9-10,5 (în funcţie de catena

laterală a aminoacidului). În majoritatea condiţiilor fiziologice de pH gruparea amino este

protonată, dar gruparea carboxil din aminoacizi

este deprotonată:

Valoarea constantei de aciditate, pKa, pentru reacţia de deprotonare a grupării carboxil

este de 1,7-2,4. Acest fapt dictează o încărcare negativă a acestei grupări la valori

fiziologice ale pH-ului.

Proprietăţile acido-bazice ale grupărilor din catena laterală

De asemenea, grupările disociabile din catena laterală a aminoacizilor au valori

specifice ale pKa-ului şi pot contribui la proprietatea de amfolit a acestora. O importanţă

deosebită o are nucleul imidazolic din catena laterală a histidinei (cu un pKa = 6). Din

acest motiv unele resturi de histidină din enzime iau parte la diverse reacţii (fixarea

oxigenului în hemoglobină, proteazele posedă 3 resturi catalitice în situsul activ – cisteină

sau serină, histidină și acid glutamic). Mai mult, biologia moleculară modernă permite

producerea artificială a unor proteine care posedă la unul din capetele lanțului proteic o

secvență de 6-10 histidine (6-10 nuclee imidazolice), proprietate care permite izolarea

prin cromatografie de afinitate a acestora (prin interacțiune cu o matrice pe care sunt

grefați/complexați ionii metalici: Ni2+, Co2+ sau Zn2+).

Cisteina ionizează la pH bazic (pKa = 8,3) sau poate fi oxidată la cistină, acest

fapt conferă resturilor de cisteină un rol deosebit în împachetarea tridimensională a

proteinelor.

Biochimie - Curs 2 - 2019

De asemenea, tirozina, un aminoacid aromatic, posedă gruparea fenolică ce ionizează la

valori mari ale pH-ului (pKa =10,1).

Punctul izoelectric

Dacă la valori mici ale pH-ului (pH 1) toate grupările disociabile sunt protonate

şi aminoacizii sunt încărcaţi pozitiv, la valori mari ale pH-ului (pH 11) toate grupările

funcţionale sunt deprotonate: grupărea carboxil încărcată negativ și gruparea amino

neprotonată.

Există însă şi situaţii în care la anumite valori ale pH-ului gruparea carboxilică

este parţial ionizată (reacţie de echilibru), pe când gruparea amino este protonată.

Valoarea pH-ului la care încărcarea netă a aminoacidului este zero poartă numele de

punct izoelectric.

Biochimie - Curs 2 - 2019

În cazul aminoacizilor dicarboxilici punctul izoelectric are valori mai mici comparativ cu

cei monocarboxilici (pIaspartic = 2,97). În schimb, acizii diaminocarboxilici posedă puncte

izoelectrice mai ridicate (pIlizină = 9,74) comparativ cu cei monoamino carboxilici.

Aminoacidul lizină este un compus întâlnit în proteinele care interacţionează cu acizii

nucleici.

Derivaţii aminoacizilor

Modificarea catenei laterale a proteinelor

Codul genetic “universal” care este aproape identic în toate organismele se referă

doar la cei 21 de aminoacizi standard. Există însă şi alţi aminoacizi care intră în

componenţa unor proteine. În cele mai multe cazuri aceşti aminoacizi apar datorită

modificărilor pe care le suferă un aminoacid standard după ce lanţul polipeptidic a fost

sintetizat – modificări post-traslaţionale. Cele mai comune modificări constau într-o

simplă modificare a catenei laterale: hidroxilarea (lizină, prolină sau histidină), metilarea,

acetilarea, carboxilarea sau fosforilarea (serinei, treoninei sau tirozinei).

4-hidroxi-prolina este întâlnită în proteinele din peretele celular al plantelor sau în

colagen, o proteină din ţesutul conjuctiv (alături de 5-hidroxi-lizina). Prezența acestui

aminoacid hidroxilat induce apariția unor legături de hidrogen suplimentare, legături care

imprimă o stabilitate mai mare moleculei de colagen. -carboxi-glutamatul, este un

aminoacid care intră în componenţa protrombinei (proteina implicată în coagularea

sângelui) sau în alte proteine care complexează ionii de Ca2+ (datorită celor două grupări

carboxil prezente în catena laterală).

1-Metil-lizina şi 3-metil-histidina, sunt aminoacizi care se află în catena miozinei, o

proteină din muşchiul cardiac. -hidroxi-lizina are două funcţii importante în colagen:

serveşte la ataşarea de zaharuri (galactoza sau glucozil-galactoza) sau joacă un rol

important în stabilizarea intra sau intermoleculară (resturile de lisină sau -hidroxi-lisină

sunt dezaminate oxidativ în pozitia unde formează grupări aldehidice, grupări care pot

fi reticulate cu resturile de lizină intacte).

Biochimie - Curs 2 - 2019

De asemenea, pe catena laterală a aminoacizilor din componenţa proteinelor pot fi ataşate

grupări voluminoase (lipide, carbohidraţi – în cazul glicoproteinelor acestea pot avea

resturile de zahar atașate de catena laterală a asparaginei, treoninei sau serinei). Grupările

N- sau C- terminale din lanţurile polipeptidice/proteice pot fi modificate chimic. Aceste

modificări sunt importante pentru funcţia proteinelor.

Aminoacizii şi derivaţii biologic activi ai acestora

Cei 20 de aminoacizi standard suferă adesea transformări chimice. Aceste

transformări au drept rezultat obţinerea altor aminoacizi sau a unor compuşi înrudiţi şi

sunt parte integrantă a transformărilor care au loc în sinteza celulară sau în procesele de

degradare. De asemenea, aminocizii pot fi utilizaţi la: transportul azotului sub forma

grupelor amino, sursa de energie (în urma oxidării) sau la comunicarea dintre celule.

Alte roluri ale aminoacizilor şi derivaţilor acestora:

glicina, acidul -amino-butiric (AGAB, un produs rezultat prin decarboxilarea

acidului glutamic), dopamina (un compus rezultat prin decarboxilarea hidroxi-

tirozinei) sunt compuşi eliberaţi de celula nervoasă cu scopul de a modifica

comportamentul celulelor vecine (neurotransmiţători);

- antagoniştii dopaminei (medicamente care interferă cu dopamina la legarea

acestui compus la receptorii aferenţi) sunt utilizaţi pentru tratarea schizofreniei şi

a unor boli mentale similare. O persoană cu schizofrenie poate posedă un sistem

dopaminic hiperactiv. Din acest motiv folosirea antagoniştilor dopaminei pot ajuta

la reglarea acestui sistem prin reducerea activităţii dopaminei;

- cocaina şi alte medicamente în exces pot afecta funcţiile dopaminei (prin

stimularea sau blocarea receptorilor dopaminei).

histamina (produsul de decarboxilare al histidinei) este un potenţial mediator local

pentru reacţiile alergice, poate fi implicată în mecanismul de apărare împotriva

substanţelor exogene (sistemul imunitar) sau are funcţii de reglare a tractului

gastro-intestinal (controlează nivelul de acid gastric), a sistemului nervos central

cât şi a ritmului somn/trezire.

tiroxina (un alt derivat la tirozinei) este un hormon tiroidian (conţine iod) care

reduce presiunea sangvină, pulsul, temperatura sau greutatea vertebratelor.

Tiroxina se obține în urma reacției de iodurare a tirozinei urmată de condensarea

oxidativă a două molecule de diiodo-tirozină.

Biochimie - Curs 2 - 2019

Triiodo-tironina este un derivat cu funcții și structură asemănătoare tiroxinei

(hormon care posedă grefați doar trei atomi de iod în structură). Cei doi derivați

se leagă de proteina numită tiroglobulină. Acest complex poate fi scindat, iar

derivații pot interacționa cu proteinele plasmatice și astfel transportați la celulele

periferice, unde se leagă de ADN-ul celulei inducând o creștere a ratei

metabolismului zaharurilor și proteinelor.

Compuşi derivaţi de la aminoacizi care

posedă proprietăţi biologice